MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-2

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020261	CT	3	6	2152	2157	0 %	50 %	0 %	50 %	449306369
2	NC_020261	AT	3	6	2420	2425	50 %	50 %	0 %	0 %	449306369
3	NC_020261	CG	3	6	2565	2570	0 %	0 %	50 %	50 %	449306370
4	NC_020261	TA	3	6	3039	3044	50 %	50 %	0 %	0 %	449306371
5	NC_020261	TG	3	6	3959	3964	0 %	50 %	50 %	0 %	449306372
6	NC_020261	GA	3	6	4285	4290	50 %	0 %	50 %	0 %	449306372
7	NC_020261	CT	3	6	4598	4603	0 %	50 %	0 %	50 %	449306372
8	NC_020261	AG	3	6	5593	5598	50 %	0 %	50 %	0 %	449306373
9	NC_020261	TA	3	6	5828	5833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020261	AT	3	6	5882	5887	50 %	50 %	0 %	0 %	449306374
11	NC_020261	GC	3	6	8689	8694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020261	CT	3	6	9073	9078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020261	CA	3	6	9733	9738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020261	TC	3	6	9973	9978	0 %	50 %	0 %	50 %	449306377
15	NC_020261	GA	3	6	10233	10238	50 %	0 %	50 %	0 %	449306378
16	NC_020261	CG	4	8	11380	11387	0 %	0 %	50 %	50 %	449306379
17	NC_020261	GA	3	6	12124	12129	50 %	0 %	50 %	0 %	449306379
18	NC_020261	AG	3	6	12759	12764	50 %	0 %	50 %	0 %	449306379
19	NC_020261	CG	3	6	12973	12978	0 %	0 %	50 %	50 %	449306379
20	NC_020261	CG	3	6	13540	13545	0 %	0 %	50 %	50 %	449306379
21	NC_020261	GC	3	6	13964	13969	0 %	0 %	50 %	50 %	449306380
22	NC_020261	CT	3	6	17128	17133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020261	CT	3	6	17636	17641	0 %	50 %	0 %	50 %	449306383
24	NC_020261	AG	3	6	19119	19124	50 %	0 %	50 %	0 %	449306384
25	NC_020261	AT	3	6	21073	21078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020261	CT	3	6	21902	21907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020261	AT	3	6	22501	22506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020261	CG	3	6	23089	23094	0 %	0 %	50 %	50 %	449306387
29	NC_020261	AT	3	6	23560	23565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020261	CT	3	6	23665	23670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020261	GC	4	8	24149	24156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020261	GC	4	8	24178	24185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020261	CA	3	6	24598	24603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020261	GC	3	6	24694	24699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020261	TG	3	6	24748	24753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020261	AC	3	6	25590	25595	50 %	0 %	0 %	50 %	449306388
37	NC_020261	GA	3	6	25982	25987	50 %	0 %	50 %	0 %	449306389
38	NC_020261	CG	3	6	27553	27558	0 %	0 %	50 %	50 %	449306390
39	NC_020261	GC	3	6	29661	29666	0 %	0 %	50 %	50 %	449306391
40	NC_020261	GC	4	8	31541	31548	0 %	0 %	50 %	50 %	449306395
41	NC_020261	GC	3	6	31632	31637	0 %	0 %	50 %	50 %	449306395
42	NC_020261	AT	3	6	32201	32206	50 %	50 %	0 %	0 %	449306396
43	NC_020261	CG	3	6	32600	32605	0 %	0 %	50 %	50 %	449306397
44	NC_020261	AC	3	6	33232	33237	50 %	0 %	0 %	50 %	449306397
45	NC_020261	TA	3	6	33565	33570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020261	CA	3	6	34076	34081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020261	GA	3	6	35662	35667	50 %	0 %	50 %	0 %	449306400
48	NC_020261	TC	3	6	35930	35935	0 %	50 %	0 %	50 %	449306400
49	NC_020261	TC	3	6	36023	36028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020261	GT	3	6	36308	36313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020261	AT	3	6	36363	36368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020261	TA	3	6	39676	39681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020261	CA	3	6	40552	40557	50 %	0 %	0 %	50 %	449306408
54	NC_020261	CA	3	6	40620	40625	50 %	0 %	0 %	50 %	449306408
55	NC_020261	GA	3	6	41057	41062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020261	CA	3	6	41953	41958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020261	GA	3	6	42518	42523	50 %	0 %	50 %	0 %	449306410
58	NC_020261	CG	3	6	43303	43308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020261	GA	3	6	43530	43535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020261	CG	3	6	43648	43653	0 %	0 %	50 %	50 %	449306413
61	NC_020261	TA	3	6	43663	43668	50 %	50 %	0 %	0 %	449306413
62	NC_020261	GC	3	6	43856	43861	0 %	0 %	50 %	50 %	449306413
63	NC_020261	TC	3	6	43923	43928	0 %	50 %	0 %	50 %	449306413
64	NC_020261	GT	4	8	45158	45165	0 %	50 %	50 %	0 %	449306414
65	NC_020261	CG	3	6	45204	45209	0 %	0 %	50 %	50 %	449306414
66	NC_020261	GC	3	6	45329	45334	0 %	0 %	50 %	50 %	449306414
67	NC_020261	GC	3	6	46775	46780	0 %	0 %	50 %	50 %	449306415
68	NC_020261	GC	3	6	46985	46990	0 %	0 %	50 %	50 %	449306415
69	NC_020261	AG	3	6	47118	47123	50 %	0 %	50 %	0 %	449306415
70	NC_020261	GA	3	6	47589	47594	50 %	0 %	50 %	0 %	449306415
71	NC_020261	CG	3	6	49467	49472	0 %	0 %	50 %	50 %	449306417
72	NC_020261	GA	3	6	49672	49677	50 %	0 %	50 %	0 %	449306417
73	NC_020261	CT	3	6	49841	49846	0 %	50 %	0 %	50 %	449306417
74	NC_020261	AT	3	6	50674	50679	50 %	50 %	0 %	0 %	449306419
75	NC_020261	CA	3	6	51805	51810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.