MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT11

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020250	GATA	2	8	6	13	50 %	25 %	25 %	0 %	449092688
2	NC_020250	ATTA	2	8	257	264	50 %	50 %	0 %	0 %	449092689
3	NC_020250	GATA	2	8	297	304	50 %	25 %	25 %	0 %	449092689
4	NC_020250	ATGA	2	8	305	312	50 %	25 %	25 %	0 %	449092689
5	NC_020250	ATTT	2	8	516	523	25 %	75 %	0 %	0 %	449092691
6	NC_020250	TTTG	2	8	682	689	0 %	75 %	25 %	0 %	449092692
7	NC_020250	ATTA	2	8	745	752	50 %	50 %	0 %	0 %	449092692
8	NC_020250	ATTT	2	8	759	766	25 %	75 %	0 %	0 %	449092693
9	NC_020250	AGGA	2	8	1018	1025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020250	GGTA	2	8	1120	1127	25 %	25 %	50 %	0 %	449092694
11	NC_020250	ACAA	2	8	1920	1927	75 %	0 %	0 %	25 %	449092694
12	NC_020250	AGAA	2	8	2031	2038	75 %	0 %	25 %	0 %	449092694
13	NC_020250	GGGA	2	8	2310	2317	25 %	0 %	75 %	0 %	449092694
14	NC_020250	TTTG	2	8	2475	2482	0 %	75 %	25 %	0 %	449092695
15	NC_020250	GGAT	2	8	2693	2700	25 %	25 %	50 %	0 %	449092695
16	NC_020250	TGCT	2	8	2987	2994	0 %	50 %	25 %	25 %	449092695
17	NC_020250	AGGT	2	8	3826	3833	25 %	25 %	50 %	0 %	449092695
18	NC_020250	TTAC	2	8	4326	4333	25 %	50 %	0 %	25 %	449092697
19	NC_020250	TTGT	2	8	4371	4378	0 %	75 %	25 %	0 %	449092697
20	NC_020250	AATG	2	8	4417	4424	50 %	25 %	25 %	0 %	449092697
21	NC_020250	TTGG	2	8	4455	4462	0 %	50 %	50 %	0 %	449092698
22	NC_020250	TTAT	2	8	4549	4556	25 %	75 %	0 %	0 %	449092698
23	NC_020250	TGTT	2	8	4609	4616	0 %	75 %	25 %	0 %	449092698
24	NC_020250	TTAT	2	8	4640	4647	25 %	75 %	0 %	0 %	449092698
25	NC_020250	GTTT	2	8	4904	4911	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020250	GAAT	2	8	5248	5255	50 %	25 %	25 %	0 %	449092700
27	NC_020250	GCTA	2	8	5443	5450	25 %	25 %	25 %	25 %	449092700
28	NC_020250	GTTT	2	8	5889	5896	0 %	75 %	25 %	0 %	449092702
29	NC_020250	AAGG	2	8	6489	6496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020250	AATA	2	8	6551	6558	75 %	25 %	0 %	0 %	449092703
31	NC_020250	TTCA	2	8	6847	6854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020250	CTTC	2	8	6907	6914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020250	GTAT	2	8	7680	7687	25 %	50 %	25 %	0 %	449092705
34	NC_020250	TTTA	2	8	8197	8204	25 %	75 %	0 %	0 %	449092706
35	NC_020250	GTTA	2	8	8276	8283	25 %	50 %	25 %	0 %	449092706
36	NC_020250	GTAT	2	8	8377	8384	25 %	50 %	25 %	0 %	449092707
37	NC_020250	TTTA	2	8	8535	8542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020250	GTTT	2	8	9183	9190	0 %	75 %	25 %	0 %	449092709
39	NC_020250	GAAA	2	8	9497	9504	75 %	0 %	25 %	0 %	449092710
40	NC_020250	TTTG	2	8	9556	9563	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020250	ATGA	2	8	10016	10023	50 %	25 %	25 %	0 %	449092711
42	NC_020250	GTTT	2	8	10518	10525	0 %	75 %	25 %	0 %	449092712
43	NC_020250	ATTT	2	8	10730	10737	25 %	75 %	0 %	0 %	449092712
44	NC_020250	CAAG	2	8	11033	11040	50 %	0 %	25 %	25 %	449092712
45	NC_020250	AAAG	2	8	11164	11171	75 %	0 %	25 %	0 %	449092712
46	NC_020250	CAAA	2	8	11200	11207	75 %	0 %	0 %	25 %	449092712
47	NC_020250	CTTC	2	8	11598	11605	0 %	50 %	0 %	50 %	449092713

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.