MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT11

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020250	TTG	2	6	154	159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092688
2	NC_020250	GAT	2	6	194	199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092688
3	NC_020250	TTG	2	6	219	224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092689
4	NC_020250	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092690
5	NC_020250	TTC	2	6	341	346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092690
6	NC_020250	GTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092690
7	NC_020250	TAA	2	6	402	407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092690
8	NC_020250	CAC	2	6	415	420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449092690
9	NC_020250	GAA	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092691
10	NC_020250	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092691
11	NC_020250	ACA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092691
12	NC_020250	CAA	2	6	657	662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092692
13	NC_020250	TGA	2	6	736	741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092692
14	NC_020250	TAT	2	6	849	854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092693
15	NC_020250	ATC	2	6	924	929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092693
16	NC_020250	AAT	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092694
17	NC_020250	ATT	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092694
18	NC_020250	TAC	2	6	1457	1462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092694
19	NC_020250	ATA	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092694
20	NC_020250	GAT	2	6	1553	1558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092694
21	NC_020250	AGA	2	6	1594	1599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092694
22	NC_020250	TAA	2	6	1600	1605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092694
23	NC_020250	ACC	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449092694
24	NC_020250	TGG	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092694
25	NC_020250	GGT	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092694
26	NC_020250	AAG	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092694
27	NC_020250	AAC	2	6	1896	1901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092694
28	NC_020250	ACC	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449092694
29	NC_020250	GAA	2	6	2047	2052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092694
30	NC_020250	AGA	2	6	2071	2076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092694
31	NC_020250	GAA	2	6	2369	2374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092694
32	NC_020250	TTG	2	6	2404	2409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092694
33	NC_020250	TAG	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092695
34	NC_020250	TGG	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092695
35	NC_020250	ATT	2	6	2825	2830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092695
36	NC_020250	TCC	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449092695
37	NC_020250	AGA	2	6	3006	3011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092695
38	NC_020250	AAT	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092695
39	NC_020250	TGA	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092695
40	NC_020250	TTG	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092695
41	NC_020250	GAA	2	6	3369	3374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092695
42	NC_020250	TGA	2	6	3384	3389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092695
43	NC_020250	TGT	2	6	3648	3653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092695
44	NC_020250	TTG	2	6	3794	3799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092695
45	NC_020250	GTT	2	6	3816	3821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092695
46	NC_020250	TAT	2	6	3911	3916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092696
47	NC_020250	TGG	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092696
48	NC_020250	ATG	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092696
49	NC_020250	GTA	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092697
50	NC_020250	ATT	2	6	4163	4168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092697
51	NC_020250	TGG	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092697
52	NC_020250	GGT	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092697
53	NC_020250	CAT	2	6	4410	4415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092697
54	NC_020250	ACG	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092698
55	NC_020250	CAT	3	9	4618	4626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092698
56	NC_020250	AGT	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092698
57	NC_020250	TGG	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092698
58	NC_020250	TTA	2	6	4708	4713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092699
59	NC_020250	GTT	2	6	4729	4734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092699
60	NC_020250	AGA	2	6	4776	4781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092699
61	NC_020250	ATT	2	6	5156	5161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092700
62	NC_020250	AGA	2	6	5164	5169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092700
63	NC_020250	TGA	2	6	5266	5271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092700
64	NC_020250	CGT	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449092700
65	NC_020250	GAA	2	6	5392	5397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092700
66	NC_020250	ATT	2	6	5408	5413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092700
67	NC_020250	ATT	2	6	5432	5437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092700
68	NC_020250	AAT	2	6	5457	5462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092700
69	NC_020250	AGA	3	9	5510	5518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092701
70	NC_020250	ACA	2	6	5594	5599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092701
71	NC_020250	AGA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092701
72	NC_020250	GTT	2	6	5811	5816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092701
73	NC_020250	GAA	2	6	5909	5914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092702
74	NC_020250	TTA	2	6	6097	6102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092702
75	NC_020250	GTT	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092702
76	NC_020250	CAT	2	6	6141	6146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092702
77	NC_020250	TGA	2	6	6148	6153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092702
78	NC_020250	TTA	2	6	6220	6225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092702
79	NC_020250	ATG	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092702
80	NC_020250	AGA	2	6	6279	6284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092702
81	NC_020250	CCG	2	6	6396	6401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449092702
82	NC_020250	AGA	2	6	6520	6525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092703
83	NC_020250	AGA	2	6	6536	6541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092703
84	NC_020250	GAA	3	9	6618	6626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092703
85	NC_020250	CAT	2	6	6651	6656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092703
86	NC_020250	AAT	2	6	6694	6699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092703
87	NC_020250	TGA	2	6	7444	7449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092704
88	NC_020250	TTG	2	6	7580	7585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092705
89	NC_020250	GAT	2	6	7740	7745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092705
90	NC_020250	GTG	2	6	7766	7771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092705
91	NC_020250	TAT	2	6	7865	7870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092705
92	NC_020250	AAT	2	6	7914	7919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092705
93	NC_020250	TAT	2	6	7977	7982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092706
94	NC_020250	GAT	2	6	7989	7994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092706
95	NC_020250	TAT	2	6	8033	8038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092706
96	NC_020250	TTA	2	6	8047	8052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092706
97	NC_020250	TAA	2	6	8143	8148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092706
98	NC_020250	TAA	2	6	8207	8212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092706
99	NC_020250	TGT	2	6	8362	8367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092707
100	NC_020250	ACA	2	6	8369	8374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092707
101	NC_020250	AAT	2	6	8492	8497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092707
102	NC_020250	ATA	2	6	8659	8664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092708
103	NC_020250	AGA	2	6	8692	8697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092708
104	NC_020250	GAA	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092708
105	NC_020250	GAA	2	6	9017	9022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092709
106	NC_020250	ATT	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092709
107	NC_020250	TGA	2	6	9112	9117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092709
108	NC_020250	TTA	2	6	9123	9128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092709
109	NC_020250	GAA	2	6	9146	9151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092709
110	NC_020250	AGG	2	6	9234	9239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092709
111	NC_020250	GTT	2	6	9307	9312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092710
112	NC_020250	TAT	2	6	9356	9361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092710
113	NC_020250	TAA	3	9	9525	9533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092710
114	NC_020250	TTA	2	6	9986	9991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092711
115	NC_020250	TTG	2	6	10025	10030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092711
116	NC_020250	GAA	2	6	10412	10417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092712
117	NC_020250	ATT	2	6	10457	10462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092712
118	NC_020250	TGA	2	6	10594	10599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092712
119	NC_020250	AGA	2	6	10646	10651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092712
120	NC_020250	TGT	2	6	10681	10686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092712
121	NC_020250	GTT	2	6	10766	10771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092712
122	NC_020250	AGA	2	6	10783	10788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092712
123	NC_020250	AAC	2	6	10890	10895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092712
124	NC_020250	GAA	2	6	10919	10924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092712
125	NC_020250	TAT	2	6	10936	10941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092712
126	NC_020250	AAT	2	6	10943	10948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092712
127	NC_020250	TGT	2	6	10963	10968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092712
128	NC_020250	TGT	2	6	11130	11135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092712
129	NC_020250	GAT	3	9	11153	11161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092712
130	NC_020250	AAT	2	6	11298	11303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092712
131	NC_020250	ATA	2	6	11518	11523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092713
132	NC_020250	ATA	2	6	11569	11574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092713
133	NC_020250	TTG	2	6	11662	11667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092713
134	NC_020250	TAT	2	6	11675	11680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092713

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.