MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT73

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020249	TTTTAA	2	12	753	764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086466
2	NC_020249	ATGAAA	2	12	2740	2751	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449086468
3	NC_020249	TCTTAA	2	12	4489	4500	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086469
4	NC_020249	GTAGCT	2	12	5370	5381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449086469
5	NC_020249	TACTTC	2	12	6980	6991	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	449086469
6	NC_020249	ACGGTT	2	12	8217	8228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449086470
7	NC_020249	CGTATT	2	12	10449	10460	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	449086472
8	NC_020249	ATTAAA	2	12	10745	10756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086472
9	NC_020249	TTAAAA	2	12	13057	13068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086474
10	NC_020249	CATTAT	2	12	13896	13907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020249	TTCTTT	2	12	14246	14257	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	449086475
12	NC_020249	TTTCTC	2	12	14990	15001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086476
13	NC_020249	ATTTTT	2	12	15319	15330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	449086476
14	NC_020249	ATTTAT	2	12	23978	23989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020249	CGTATT	2	12	26638	26649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	449086483
16	NC_020249	TTCATA	2	12	26774	26785	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086483
17	NC_020249	ATTGTA	2	12	35434	35445	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020249	TTAAAA	2	12	37294	37305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086494
19	NC_020249	TAGATT	2	12	40333	40344	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449086496
20	NC_020249	TATACA	2	12	41966	41977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	449086497
21	NC_020249	TATGCA	2	12	43427	43438	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449086500
22	NC_020249	TTTACA	2	12	46728	46739	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086505
23	NC_020249	CTACAG	2	12	48947	48958	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	449086506
24	NC_020249	TCAACA	2	12	49167	49178	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	449086506
25	NC_020249	ATCCAA	2	12	49622	49633	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	449086506
26	NC_020249	GATTAT	2	12	51514	51525	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449086509
27	NC_020249	ATGTTT	2	12	56529	56540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	449086513
28	NC_020249	ATTTCA	2	12	57887	57898	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020249	GTTGAA	2	12	59879	59890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086523
30	NC_020249	AATTTT	2	12	60038	60049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020249	GAACAA	2	12	60193	60204	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	449086524
32	NC_020249	AGGGAA	2	12	68161	68172	50 %	0 %	50 %	0 %	449086533
33	NC_020249	AGAAAC	2	12	73360	73371	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	449086535
34	NC_020249	GAAAAT	2	12	76818	76829	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449086538

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.