MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT73

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020249	ATCA	2	8	53	60	50 %	25 %	0 %	25 %	449086466
2	NC_020249	GAAT	2	8	628	635	50 %	25 %	25 %	0 %	449086466
3	NC_020249	CTTT	2	8	1628	1635	0 %	75 %	0 %	25 %	449086467
4	NC_020249	TTTA	2	8	1987	1994	25 %	75 %	0 %	0 %	449086467
5	NC_020249	ATAC	2	8	2086	2093	50 %	25 %	0 %	25 %	449086467
6	NC_020249	ATTA	2	8	2223	2230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020249	AGGA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020249	CTTT	2	8	2380	2387	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020249	ATTT	2	8	2986	2993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020249	TTCC	2	8	3556	3563	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
11	NC_020249	GACA	2	8	3973	3980	50 %	0 %	25 %	25 %	449086469
12	NC_020249	GTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	50 %	0 %	449086469
13	NC_020249	CCCA	2	8	4945	4952	25 %	0 %	0 %	75 %	449086469
14	NC_020249	CTAA	2	8	5550	5557	50 %	25 %	0 %	25 %	449086469
15	NC_020249	AAAG	2	8	5602	5609	75 %	0 %	25 %	0 %	449086469
16	NC_020249	TTAA	2	8	6795	6802	50 %	50 %	0 %	0 %	449086469
17	NC_020249	TTCT	2	8	6964	6971	0 %	75 %	0 %	25 %	449086469
18	NC_020249	CATT	2	8	7020	7027	25 %	50 %	0 %	25 %	449086469
19	NC_020249	TACT	2	8	7208	7215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020249	CAGC	2	8	7602	7609	25 %	0 %	25 %	50 %	449086470
21	NC_020249	TCTT	2	8	8335	8342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020249	TTAA	2	8	8593	8600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020249	TCCT	2	8	8698	8705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020249	GGTT	2	8	8825	8832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020249	TTTA	2	8	9109	9116	25 %	75 %	0 %	0 %	449086471
26	NC_020249	ATAG	2	8	9164	9171	50 %	25 %	25 %	0 %	449086471
27	NC_020249	TTTA	2	8	9640	9647	25 %	75 %	0 %	0 %	449086471
28	NC_020249	TTCT	2	8	10047	10054	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020249	TATC	2	8	10937	10944	25 %	50 %	0 %	25 %	449086472
30	NC_020249	AAAG	2	8	11507	11514	75 %	0 %	25 %	0 %	449086472
31	NC_020249	AATA	2	8	11675	11682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020249	GTAT	2	8	11728	11735	25 %	50 %	25 %	0 %	449086473
33	NC_020249	ATAA	2	8	11826	11833	75 %	25 %	0 %	0 %	449086473
34	NC_020249	GAAA	2	8	12185	12192	75 %	0 %	25 %	0 %	449086473
35	NC_020249	ATTC	2	8	13186	13193	25 %	50 %	0 %	25 %	449086474
36	NC_020249	TGAT	2	8	13761	13768	25 %	50 %	25 %	0 %	449086474
37	NC_020249	ATTT	2	8	13956	13963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020249	TAAT	2	8	14390	14397	50 %	50 %	0 %	0 %	449086475
39	NC_020249	TTCC	2	8	14649	14656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020249	AAAT	2	8	14933	14940	75 %	25 %	0 %	0 %	449086476
41	NC_020249	ATTT	2	8	15049	15056	25 %	75 %	0 %	0 %	449086476
42	NC_020249	ATGA	2	8	15556	15563	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
43	NC_020249	GAAA	2	8	15588	15595	75 %	0 %	25 %	0 %	449086476
44	NC_020249	TTTA	2	8	15734	15741	25 %	75 %	0 %	0 %	449086476
45	NC_020249	GAAT	2	8	15770	15777	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
46	NC_020249	TTTA	2	8	15796	15803	25 %	75 %	0 %	0 %	449086476
47	NC_020249	AGAT	2	8	16034	16041	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
48	NC_020249	GATT	2	8	16119	16126	25 %	50 %	25 %	0 %	449086476
49	NC_020249	GAAT	2	8	17060	17067	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
50	NC_020249	CAAG	2	8	17113	17120	50 %	0 %	25 %	25 %	449086476
51	NC_020249	TTTG	2	8	17253	17260	0 %	75 %	25 %	0 %	449086476
52	NC_020249	GAAT	2	8	17697	17704	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
53	NC_020249	GGAA	2	8	18173	18180	50 %	0 %	50 %	0 %	449086477
54	NC_020249	TTCT	2	8	18392	18399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020249	AGCT	2	8	18404	18411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020249	GTCA	2	8	18587	18594	25 %	25 %	25 %	25 %	449086478
57	NC_020249	AGGT	2	8	18939	18946	25 %	25 %	50 %	0 %	449086478
58	NC_020249	CTCC	2	8	19456	19463	0 %	25 %	0 %	75 %	449086478
59	NC_020249	AAAG	2	8	19852	19859	75 %	0 %	25 %	0 %	449086478
60	NC_020249	ATTG	2	8	20372	20379	25 %	50 %	25 %	0 %	449086479
61	NC_020249	TTTA	2	8	20387	20394	25 %	75 %	0 %	0 %	449086479
62	NC_020249	GATT	2	8	21225	21232	25 %	50 %	25 %	0 %	449086479
63	NC_020249	TGCT	2	8	22073	22080	0 %	50 %	25 %	25 %	449086479
64	NC_020249	TTTG	2	8	22107	22114	0 %	75 %	25 %	0 %	449086479
65	NC_020249	CATA	2	8	22540	22547	50 %	25 %	0 %	25 %	449086479
66	NC_020249	CCAG	2	8	22832	22839	25 %	0 %	25 %	50 %	449086479
67	NC_020249	TCGA	2	8	23315	23322	25 %	25 %	25 %	25 %	449086480
68	NC_020249	TCAT	2	8	23430	23437	25 %	50 %	0 %	25 %	449086480
69	NC_020249	GATA	2	8	23441	23448	50 %	25 %	25 %	0 %	449086480
70	NC_020249	TATT	2	8	23938	23945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020249	CTTT	2	8	24277	24284	0 %	75 %	0 %	25 %	449086481
72	NC_020249	GGAG	2	8	24673	24680	25 %	0 %	75 %	0 %	449086481
73	NC_020249	ACCT	2	8	25190	25197	25 %	25 %	0 %	50 %	449086481
74	NC_020249	TGAC	2	8	25542	25549	25 %	25 %	25 %	25 %	449086481
75	NC_020249	CTAG	2	8	25723	25730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020249	AGAA	2	8	25737	25744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020249	ATTA	2	8	25885	25892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020249	TTCT	2	8	26243	26250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020249	AGTA	2	8	26389	26396	50 %	25 %	25 %	0 %	449086483
80	NC_020249	GTAT	2	8	26951	26958	25 %	50 %	25 %	0 %	449086483
81	NC_020249	AGAT	2	8	27023	27030	50 %	25 %	25 %	0 %	449086483
82	NC_020249	GAAT	2	8	27095	27102	50 %	25 %	25 %	0 %	449086483
83	NC_020249	ACCA	2	8	28091	28098	50 %	0 %	0 %	50 %	449086485
84	NC_020249	ACTG	2	8	28917	28924	25 %	25 %	25 %	25 %	449086485
85	NC_020249	TTTA	2	8	29294	29301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020249	ATTG	2	8	29381	29388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020249	CATC	2	8	30564	30571	25 %	25 %	0 %	50 %	449086488
88	NC_020249	AAAG	2	8	30750	30757	75 %	0 %	25 %	0 %	449086488
89	NC_020249	GCAC	2	8	31315	31322	25 %	0 %	25 %	50 %	449086488
90	NC_020249	TTGT	2	8	32188	32195	0 %	75 %	25 %	0 %	449086489
91	NC_020249	ATAG	2	8	32634	32641	50 %	25 %	25 %	0 %	449086489
92	NC_020249	ATTT	2	8	32950	32957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020249	CATT	2	8	33362	33369	25 %	50 %	0 %	25 %	449086490
94	NC_020249	CCAT	2	8	33425	33432	25 %	25 %	0 %	50 %	449086490
95	NC_020249	CCTA	2	8	33493	33500	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020249	TCCA	2	8	34098	34105	25 %	25 %	0 %	50 %	449086491
97	NC_020249	ATTT	2	8	34235	34242	25 %	75 %	0 %	0 %	449086492
98	NC_020249	TATT	2	8	34348	34355	25 %	75 %	0 %	0 %	449086492
99	NC_020249	AACT	2	8	34817	34824	50 %	25 %	0 %	25 %	449086492
100	NC_020249	ACTA	2	8	35025	35032	50 %	25 %	0 %	25 %	449086492
101	NC_020249	AAAC	2	8	35238	35245	75 %	0 %	0 %	25 %	449086492
102	NC_020249	AATA	2	8	35912	35919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020249	GTAT	2	8	35965	35972	25 %	50 %	25 %	0 %	449086493
104	NC_020249	ATAA	2	8	36063	36070	75 %	25 %	0 %	0 %	449086493
105	NC_020249	GAAA	2	8	36422	36429	75 %	0 %	25 %	0 %	449086493
106	NC_020249	ATTC	2	8	37423	37430	25 %	50 %	0 %	25 %	449086494
107	NC_020249	TGAT	2	8	37998	38005	25 %	50 %	25 %	0 %	449086494
108	NC_020249	CAGA	2	8	38749	38756	50 %	0 %	25 %	25 %	449086495
109	NC_020249	CTTT	2	8	39067	39074	0 %	75 %	0 %	25 %	449086495
110	NC_020249	AAGA	2	8	39124	39131	75 %	0 %	25 %	0 %	449086495
111	NC_020249	GGTG	2	8	39603	39610	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020249	ATTA	2	8	39887	39894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020249	AAGA	2	8	39912	39919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020249	TGGC	2	8	40277	40284	0 %	25 %	50 %	25 %	449086496
115	NC_020249	GATT	2	8	40483	40490	25 %	50 %	25 %	0 %	449086496
116	NC_020249	CTAA	2	8	41019	41026	50 %	25 %	0 %	25 %	449086497
117	NC_020249	AATT	2	8	41125	41132	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
118	NC_020249	AGTC	2	8	41711	41718	25 %	25 %	25 %	25 %	449086497
119	NC_020249	GTTA	2	8	42038	42045	25 %	50 %	25 %	0 %	449086497
120	NC_020249	CTTT	2	8	42136	42143	0 %	75 %	0 %	25 %	449086497
121	NC_020249	CCAG	2	8	42273	42280	25 %	0 %	25 %	50 %	449086497
122	NC_020249	AATA	2	8	42461	42468	75 %	25 %	0 %	0 %	449086498
123	NC_020249	ATTC	2	8	42720	42727	25 %	50 %	0 %	25 %	449086498
124	NC_020249	GAGG	2	8	42797	42804	25 %	0 %	75 %	0 %	449086498
125	NC_020249	ATTT	2	8	43001	43008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020249	GAAA	2	8	43180	43187	75 %	0 %	25 %	0 %	449086499
127	NC_020249	TTTA	2	8	43326	43333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020249	GGAG	2	8	43416	43423	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020249	ATTT	2	8	43486	43493	25 %	75 %	0 %	0 %	449086500
130	NC_020249	TGAT	2	8	44098	44105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020249	ATAA	2	8	44371	44378	75 %	25 %	0 %	0 %	449086502
132	NC_020249	AAAG	2	8	44549	44556	75 %	0 %	25 %	0 %	449086503
133	NC_020249	TGAA	2	8	44851	44858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020249	TGAT	2	8	45038	45045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020249	TTGT	2	8	45696	45703	0 %	75 %	25 %	0 %	449086504
136	NC_020249	TTTA	2	8	46532	46539	25 %	75 %	0 %	0 %	449086505
137	NC_020249	TATT	2	8	47243	47250	25 %	75 %	0 %	0 %	449086506
138	NC_020249	GTAC	2	8	47797	47804	25 %	25 %	25 %	25 %	449086506
139	NC_020249	AAGA	2	8	48052	48059	75 %	0 %	25 %	0 %	449086506
140	NC_020249	TAAA	2	8	48629	48636	75 %	25 %	0 %	0 %	449086506
141	NC_020249	TCCT	2	8	49151	49158	0 %	50 %	0 %	50 %	449086506
142	NC_020249	GGAT	2	8	49194	49201	25 %	25 %	50 %	0 %	449086506
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.