MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT73

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020249	ATCA	2	8	53	60	50 %	25 %	0 %	25 %	449086466
2	NC_020249	GAAT	2	8	628	635	50 %	25 %	25 %	0 %	449086466
3	NC_020249	CTTT	2	8	1628	1635	0 %	75 %	0 %	25 %	449086467
4	NC_020249	TTTA	2	8	1987	1994	25 %	75 %	0 %	0 %	449086467
5	NC_020249	ATAC	2	8	2086	2093	50 %	25 %	0 %	25 %	449086467
6	NC_020249	TTCC	2	8	3556	3563	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
7	NC_020249	GACA	2	8	3973	3980	50 %	0 %	25 %	25 %	449086469
8	NC_020249	GTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	50 %	0 %	449086469
9	NC_020249	CCCA	2	8	4945	4952	25 %	0 %	0 %	75 %	449086469
10	NC_020249	CTAA	2	8	5550	5557	50 %	25 %	0 %	25 %	449086469
11	NC_020249	AAAG	2	8	5602	5609	75 %	0 %	25 %	0 %	449086469
12	NC_020249	TTAA	2	8	6795	6802	50 %	50 %	0 %	0 %	449086469
13	NC_020249	TTCT	2	8	6964	6971	0 %	75 %	0 %	25 %	449086469
14	NC_020249	CATT	2	8	7020	7027	25 %	50 %	0 %	25 %	449086469
15	NC_020249	CAGC	2	8	7602	7609	25 %	0 %	25 %	50 %	449086470
16	NC_020249	TTTA	2	8	9109	9116	25 %	75 %	0 %	0 %	449086471
17	NC_020249	ATAG	2	8	9164	9171	50 %	25 %	25 %	0 %	449086471
18	NC_020249	TTTA	2	8	9640	9647	25 %	75 %	0 %	0 %	449086471
19	NC_020249	TATC	2	8	10937	10944	25 %	50 %	0 %	25 %	449086472
20	NC_020249	AAAG	2	8	11507	11514	75 %	0 %	25 %	0 %	449086472
21	NC_020249	GTAT	2	8	11728	11735	25 %	50 %	25 %	0 %	449086473
22	NC_020249	ATAA	2	8	11826	11833	75 %	25 %	0 %	0 %	449086473
23	NC_020249	GAAA	2	8	12185	12192	75 %	0 %	25 %	0 %	449086473
24	NC_020249	ATTC	2	8	13186	13193	25 %	50 %	0 %	25 %	449086474
25	NC_020249	TGAT	2	8	13761	13768	25 %	50 %	25 %	0 %	449086474
26	NC_020249	TAAT	2	8	14390	14397	50 %	50 %	0 %	0 %	449086475
27	NC_020249	AAAT	2	8	14933	14940	75 %	25 %	0 %	0 %	449086476
28	NC_020249	ATTT	2	8	15049	15056	25 %	75 %	0 %	0 %	449086476
29	NC_020249	ATGA	2	8	15556	15563	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
30	NC_020249	GAAA	2	8	15588	15595	75 %	0 %	25 %	0 %	449086476
31	NC_020249	TTTA	2	8	15734	15741	25 %	75 %	0 %	0 %	449086476
32	NC_020249	GAAT	2	8	15770	15777	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
33	NC_020249	TTTA	2	8	15796	15803	25 %	75 %	0 %	0 %	449086476
34	NC_020249	AGAT	2	8	16034	16041	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
35	NC_020249	GATT	2	8	16119	16126	25 %	50 %	25 %	0 %	449086476
36	NC_020249	GAAT	2	8	17060	17067	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
37	NC_020249	CAAG	2	8	17113	17120	50 %	0 %	25 %	25 %	449086476
38	NC_020249	TTTG	2	8	17253	17260	0 %	75 %	25 %	0 %	449086476
39	NC_020249	GAAT	2	8	17697	17704	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
40	NC_020249	GGAA	2	8	18173	18180	50 %	0 %	50 %	0 %	449086477
41	NC_020249	GTCA	2	8	18587	18594	25 %	25 %	25 %	25 %	449086478
42	NC_020249	AGGT	2	8	18939	18946	25 %	25 %	50 %	0 %	449086478
43	NC_020249	CTCC	2	8	19456	19463	0 %	25 %	0 %	75 %	449086478
44	NC_020249	AAAG	2	8	19852	19859	75 %	0 %	25 %	0 %	449086478
45	NC_020249	ATTG	2	8	20372	20379	25 %	50 %	25 %	0 %	449086479
46	NC_020249	TTTA	2	8	20387	20394	25 %	75 %	0 %	0 %	449086479
47	NC_020249	GATT	2	8	21225	21232	25 %	50 %	25 %	0 %	449086479
48	NC_020249	TGCT	2	8	22073	22080	0 %	50 %	25 %	25 %	449086479
49	NC_020249	TTTG	2	8	22107	22114	0 %	75 %	25 %	0 %	449086479
50	NC_020249	CATA	2	8	22540	22547	50 %	25 %	0 %	25 %	449086479
51	NC_020249	CCAG	2	8	22832	22839	25 %	0 %	25 %	50 %	449086479
52	NC_020249	TCGA	2	8	23315	23322	25 %	25 %	25 %	25 %	449086480
53	NC_020249	TCAT	2	8	23430	23437	25 %	50 %	0 %	25 %	449086480
54	NC_020249	GATA	2	8	23441	23448	50 %	25 %	25 %	0 %	449086480
55	NC_020249	CTTT	2	8	24277	24284	0 %	75 %	0 %	25 %	449086481
56	NC_020249	GGAG	2	8	24673	24680	25 %	0 %	75 %	0 %	449086481
57	NC_020249	ACCT	2	8	25190	25197	25 %	25 %	0 %	50 %	449086481
58	NC_020249	TGAC	2	8	25542	25549	25 %	25 %	25 %	25 %	449086481
59	NC_020249	AGTA	2	8	26389	26396	50 %	25 %	25 %	0 %	449086483
60	NC_020249	GTAT	2	8	26951	26958	25 %	50 %	25 %	0 %	449086483
61	NC_020249	AGAT	2	8	27023	27030	50 %	25 %	25 %	0 %	449086483
62	NC_020249	GAAT	2	8	27095	27102	50 %	25 %	25 %	0 %	449086483
63	NC_020249	ACCA	2	8	28091	28098	50 %	0 %	0 %	50 %	449086485
64	NC_020249	ACTG	2	8	28917	28924	25 %	25 %	25 %	25 %	449086485
65	NC_020249	CATC	2	8	30564	30571	25 %	25 %	0 %	50 %	449086488
66	NC_020249	AAAG	2	8	30750	30757	75 %	0 %	25 %	0 %	449086488
67	NC_020249	GCAC	2	8	31315	31322	25 %	0 %	25 %	50 %	449086488
68	NC_020249	TTGT	2	8	32188	32195	0 %	75 %	25 %	0 %	449086489
69	NC_020249	ATAG	2	8	32634	32641	50 %	25 %	25 %	0 %	449086489
70	NC_020249	CATT	2	8	33362	33369	25 %	50 %	0 %	25 %	449086490
71	NC_020249	CCAT	2	8	33425	33432	25 %	25 %	0 %	50 %	449086490
72	NC_020249	TCCA	2	8	34098	34105	25 %	25 %	0 %	50 %	449086491
73	NC_020249	ATTT	2	8	34235	34242	25 %	75 %	0 %	0 %	449086492
74	NC_020249	TATT	2	8	34348	34355	25 %	75 %	0 %	0 %	449086492
75	NC_020249	AACT	2	8	34817	34824	50 %	25 %	0 %	25 %	449086492
76	NC_020249	ACTA	2	8	35025	35032	50 %	25 %	0 %	25 %	449086492
77	NC_020249	AAAC	2	8	35238	35245	75 %	0 %	0 %	25 %	449086492
78	NC_020249	GTAT	2	8	35965	35972	25 %	50 %	25 %	0 %	449086493
79	NC_020249	ATAA	2	8	36063	36070	75 %	25 %	0 %	0 %	449086493
80	NC_020249	GAAA	2	8	36422	36429	75 %	0 %	25 %	0 %	449086493
81	NC_020249	ATTC	2	8	37423	37430	25 %	50 %	0 %	25 %	449086494
82	NC_020249	TGAT	2	8	37998	38005	25 %	50 %	25 %	0 %	449086494
83	NC_020249	CAGA	2	8	38749	38756	50 %	0 %	25 %	25 %	449086495
84	NC_020249	CTTT	2	8	39067	39074	0 %	75 %	0 %	25 %	449086495
85	NC_020249	AAGA	2	8	39124	39131	75 %	0 %	25 %	0 %	449086495
86	NC_020249	TGGC	2	8	40277	40284	0 %	25 %	50 %	25 %	449086496
87	NC_020249	GATT	2	8	40483	40490	25 %	50 %	25 %	0 %	449086496
88	NC_020249	CTAA	2	8	41019	41026	50 %	25 %	0 %	25 %	449086497
89	NC_020249	AATT	2	8	41125	41132	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
90	NC_020249	AGTC	2	8	41711	41718	25 %	25 %	25 %	25 %	449086497
91	NC_020249	GTTA	2	8	42038	42045	25 %	50 %	25 %	0 %	449086497
92	NC_020249	CTTT	2	8	42136	42143	0 %	75 %	0 %	25 %	449086497
93	NC_020249	CCAG	2	8	42273	42280	25 %	0 %	25 %	50 %	449086497
94	NC_020249	AATA	2	8	42461	42468	75 %	25 %	0 %	0 %	449086498
95	NC_020249	ATTC	2	8	42720	42727	25 %	50 %	0 %	25 %	449086498
96	NC_020249	GAGG	2	8	42797	42804	25 %	0 %	75 %	0 %	449086498
97	NC_020249	GAAA	2	8	43180	43187	75 %	0 %	25 %	0 %	449086499
98	NC_020249	ATTT	2	8	43486	43493	25 %	75 %	0 %	0 %	449086500
99	NC_020249	ATAA	2	8	44371	44378	75 %	25 %	0 %	0 %	449086502
100	NC_020249	AAAG	2	8	44549	44556	75 %	0 %	25 %	0 %	449086503
101	NC_020249	TTGT	2	8	45696	45703	0 %	75 %	25 %	0 %	449086504
102	NC_020249	TTTA	2	8	46532	46539	25 %	75 %	0 %	0 %	449086505
103	NC_020249	TATT	2	8	47243	47250	25 %	75 %	0 %	0 %	449086506
104	NC_020249	GTAC	2	8	47797	47804	25 %	25 %	25 %	25 %	449086506
105	NC_020249	AAGA	2	8	48052	48059	75 %	0 %	25 %	0 %	449086506
106	NC_020249	TAAA	2	8	48629	48636	75 %	25 %	0 %	0 %	449086506
107	NC_020249	TCCT	2	8	49151	49158	0 %	50 %	0 %	50 %	449086506
108	NC_020249	GGAT	2	8	49194	49201	25 %	25 %	50 %	0 %	449086506
109	NC_020249	AGAA	2	8	51270	51277	75 %	0 %	25 %	0 %	449086509
110	NC_020249	GAAG	2	8	51310	51317	50 %	0 %	50 %	0 %	449086509
111	NC_020249	TTTA	2	8	52023	52030	25 %	75 %	0 %	0 %	449086510
112	NC_020249	AATT	2	8	52132	52139	50 %	50 %	0 %	0 %	449086510
113	NC_020249	AAAG	2	8	52166	52173	75 %	0 %	25 %	0 %	449086510
114	NC_020249	TATT	2	8	53199	53206	25 %	75 %	0 %	0 %	449086510
115	NC_020249	AATT	2	8	53389	53396	50 %	50 %	0 %	0 %	449086510
116	NC_020249	TTTA	2	8	53804	53811	25 %	75 %	0 %	0 %	449086511
117	NC_020249	TCAT	2	8	53961	53968	25 %	50 %	0 %	25 %	449086511
118	NC_020249	TGCT	2	8	54161	54168	0 %	50 %	25 %	25 %	449086511
119	NC_020249	AAGG	2	8	54233	54240	50 %	0 %	50 %	0 %	449086511
120	NC_020249	TTCT	2	8	54300	54307	0 %	75 %	0 %	25 %	449086511
121	NC_020249	TAAT	2	8	55073	55080	50 %	50 %	0 %	0 %	449086512
122	NC_020249	GGAA	2	8	55859	55866	50 %	0 %	50 %	0 %	449086513
123	NC_020249	TTAC	2	8	56134	56141	25 %	50 %	0 %	25 %	449086513
124	NC_020249	ATTT	2	8	58171	58178	25 %	75 %	0 %	0 %	449086516
125	NC_020249	AAGG	2	8	58622	58629	50 %	0 %	50 %	0 %	449086518
126	NC_020249	CTTT	2	8	58932	58939	0 %	75 %	0 %	25 %	449086519
127	NC_020249	AGAA	2	8	59220	59227	75 %	0 %	25 %	0 %	449086521
128	NC_020249	GAAA	2	8	60417	60424	75 %	0 %	25 %	0 %	449086525
129	NC_020249	GGCA	2	8	60499	60506	25 %	0 %	50 %	25 %	449086525
130	NC_020249	ATTG	2	8	60705	60712	25 %	50 %	25 %	0 %	449086526
131	NC_020249	TTTA	2	8	61280	61287	25 %	75 %	0 %	0 %	449086527
132	NC_020249	GAAA	2	8	61671	61678	75 %	0 %	25 %	0 %	449086527
133	NC_020249	CGTT	2	8	61795	61802	0 %	50 %	25 %	25 %	449086527
134	NC_020249	TTTA	2	8	61934	61941	25 %	75 %	0 %	0 %	449086527
135	NC_020249	TGAA	2	8	62042	62049	50 %	25 %	25 %	0 %	449086527
136	NC_020249	TGGA	2	8	62698	62705	25 %	25 %	50 %	0 %	449086527
137	NC_020249	TTTG	2	8	62998	63005	0 %	75 %	25 %	0 %	449086527
138	NC_020249	AATG	2	8	63235	63242	50 %	25 %	25 %	0 %	449086527
139	NC_020249	ATTA	2	8	63613	63620	50 %	50 %	0 %	0 %	449086527
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.