MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT73

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020249	ACC	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020249	TAT	2	6	2189	2194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020249	TAA	2	6	2210	2215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020249	TTA	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020249	ATG	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020249	TTC	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020249	TAA	2	6	2444	2449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020249	TAA	2	6	2574	2579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020249	TTA	2	6	3014	3019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020249	TAC	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020249	ACA	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020249	TGC	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020249	TTA	2	6	7067	7072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020249	ATA	2	6	7093	7098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020249	TAC	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020249	TTA	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020249	ATT	2	6	8315	8320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020249	TAA	2	6	8388	8393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020249	AGA	2	6	8691	8696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020249	GTG	2	6	8920	8925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020249	GTG	2	6	9053	9058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020249	AGT	2	6	9059	9064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020249	GGT	2	6	11720	11725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020249	ATT	2	6	13942	13947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020249	TAA	2	6	13970	13975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020249	GTA	2	6	13992	13997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020249	AAG	2	6	14004	14009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020249	TTG	2	6	14695	14700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020249	ATT	2	6	14714	14719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020249	AAT	2	6	14766	14771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020249	ACT	2	6	14798	14803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020249	TAT	2	6	14849	14854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020249	TCC	2	6	23903	23908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020249	ACA	2	6	24003	24008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020249	TGT	2	6	24021	24026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020249	ATT	2	6	24027	24032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020249	AAT	2	6	24067	24072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020249	AAG	2	6	25824	25829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020249	ATA	3	9	25909	25917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020249	TAC	2	6	25984	25989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020249	TTC	2	6	26000	26005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020249	GAG	2	6	27677	27682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020249	GTA	2	6	27745	27750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020249	GCA	2	6	27765	27770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020249	GGA	2	6	27781	27786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020249	AGG	2	6	27822	27827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020249	TGA	2	6	29181	29186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020249	GCT	2	6	29201	29206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020249	TCA	2	6	29327	29332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020249	TTC	2	6	29402	29407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020249	CTC	2	6	29433	29438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020249	CTA	2	6	29846	29851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020249	TCC	2	6	29992	29997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_020249	TAA	2	6	30044	30049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020249	TAA	2	6	30058	30063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020249	TCC	2	6	30132	30137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_020249	AGC	2	6	30204	30209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020249	TAG	2	6	30231	30236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020249	GGC	2	6	30243	30248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020249	GTT	2	6	30280	30285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020249	ATT	2	6	31614	31619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020249	CTA	2	6	31755	31760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020249	CTT	3	9	32829	32837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020249	CAT	2	6	32861	32866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020249	TGA	2	6	33021	33026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020249	ATA	2	6	33044	33049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020249	TAT	2	6	33216	33221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020249	CAA	2	6	35466	35471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020249	TAA	2	6	35534	35539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020249	GTT	2	6	35680	35685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020249	ACA	2	6	35686	35691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020249	TAA	2	6	35720	35725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020249	GAA	2	6	35780	35785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020249	TTG	2	6	35795	35800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020249	GGA	2	6	35834	35839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020249	GGT	2	6	35957	35962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020249	TGA	2	6	38128	38133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020249	TAA	2	6	38156	38161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020249	AAG	2	6	38232	38237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020249	TAG	2	6	38253	38258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020249	AGG	2	6	38276	38281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020249	TAG	2	6	38317	38322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020249	ATA	2	6	38412	38417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020249	ATA	2	6	39522	39527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020249	TTC	2	6	39762	39767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020249	TTA	2	6	39808	39813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020249	TGA	2	6	39877	39882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020249	ATA	2	6	39969	39974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020249	ATA	2	6	43302	43307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020249	TAG	2	6	44032	44037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020249	CTT	2	6	44050	44055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020249	TCA	2	6	44079	44084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020249	TAT	2	6	44484	44489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020249	TAT	3	9	44492	44500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020249	TGG	2	6	44867	44872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020249	GCC	2	6	44934	44939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_020249	CGA	2	6	44967	44972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020249	GAT	2	6	45031	45036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020249	TTC	2	6	45116	45121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020249	GTC	2	6	45199	45204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020249	ATT	2	6	45254	45259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020249	GGT	2	6	45307	45312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020249	TAT	2	6	45885	45890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020249	GGA	2	6	45918	45923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020249	ATA	2	6	47207	47212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020249	GGA	2	6	47213	47218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020249	GAA	2	6	50288	50293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020249	GTG	2	6	51939	51944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020249	TCC	2	6	56607	56612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020249	TAA	2	6	56620	56625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020249	CTA	2	6	56629	56634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020249	GAA	2	6	56650	56655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020249	TCA	2	6	56666	56671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020249	ACT	2	6	56691	56696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020249	AGG	2	6	56741	56746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020249	GAG	2	6	56849	56854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020249	TTC	2	6	56894	56899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020249	AGA	2	6	56984	56989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020249	ATG	2	6	57809	57814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020249	TAG	2	6	57837	57842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020249	TCT	2	6	57932	57937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020249	GTA	2	6	59153	59158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020249	TAT	2	6	59789	59794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020249	TTA	2	6	59802	59807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020249	AGG	2	6	60325	60330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020249	TGG	2	6	63739	63744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020249	AGG	2	6	63747	63752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020249	AGG	2	6	66041	66046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020249	TAA	2	6	66616	66621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020249	AAT	2	6	74666	74671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020249	CAA	2	6	76008	76013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020249	GCC	2	6	76046	76051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_020249	CTA	2	6	76058	76063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020249	GCT	2	6	76085	76090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020249	AGG	2	6	76156	76161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020249	TTA	2	6	76241	76246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020249	ATA	2	6	76279	76284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020249	GAG	2	6	76288	76293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020249	TAT	2	6	77205	77210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020249	TGT	2	6	77229	77234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020249	AAT	2	6	77269	77274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.