MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT73

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020249	TA	3	6	810	815	50 %	50 %	0 %	0 %	449086467
2	NC_020249	AT	3	6	973	978	50 %	50 %	0 %	0 %	449086467
3	NC_020249	TA	3	6	2414	2419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020249	TA	3	6	2478	2483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020249	TA	3	6	2607	2612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020249	AT	3	6	2698	2703	50 %	50 %	0 %	0 %	449086468
7	NC_020249	CA	3	6	3070	3075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020249	TC	3	6	3682	3687	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
9	NC_020249	TC	3	6	4383	4388	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
10	NC_020249	GC	3	6	4639	4644	0 %	0 %	50 %	50 %	449086469
11	NC_020249	TC	3	6	6528	6533	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
12	NC_020249	CT	3	6	6701	6706	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
13	NC_020249	TA	4	8	7317	7324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020249	AT	3	6	8188	8193	50 %	50 %	0 %	0 %	449086470
15	NC_020249	GT	3	6	8258	8263	0 %	50 %	50 %	0 %	449086470
16	NC_020249	AT	4	8	8584	8591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020249	TA	3	6	9123	9128	50 %	50 %	0 %	0 %	449086471
18	NC_020249	AT	3	6	9689	9694	50 %	50 %	0 %	0 %	449086471
19	NC_020249	AT	3	6	9789	9794	50 %	50 %	0 %	0 %	449086471
20	NC_020249	AT	3	6	10370	10375	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
21	NC_020249	TA	3	6	10502	10507	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
22	NC_020249	TA	3	6	10734	10739	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
23	NC_020249	TA	3	6	10767	10772	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
24	NC_020249	CG	3	6	10927	10932	0 %	0 %	50 %	50 %	449086472
25	NC_020249	AT	3	6	11052	11057	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
26	NC_020249	GT	4	8	11555	11562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020249	AT	3	6	12843	12848	50 %	50 %	0 %	0 %	449086473
28	NC_020249	TA	3	6	13006	13011	50 %	50 %	0 %	0 %	449086473
29	NC_020249	AG	3	6	14022	14027	50 %	0 %	50 %	0 %	449086475
30	NC_020249	AT	3	6	14455	14460	50 %	50 %	0 %	0 %	449086475
31	NC_020249	TC	3	6	14589	14594	0 %	50 %	0 %	50 %	449086475
32	NC_020249	CA	4	8	14669	14676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020249	TA	3	6	15020	15025	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
34	NC_020249	AT	3	6	15135	15140	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
35	NC_020249	TA	3	6	15512	15517	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
36	NC_020249	TA	3	6	15695	15700	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
37	NC_020249	TA	3	6	15854	15859	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
38	NC_020249	AG	3	6	16440	16445	50 %	0 %	50 %	0 %	449086476
39	NC_020249	TA	3	6	16823	16828	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
40	NC_020249	AT	3	6	17556	17561	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
41	NC_020249	AT	3	6	18056	18061	50 %	50 %	0 %	0 %	449086477
42	NC_020249	TC	3	6	18611	18616	0 %	50 %	0 %	50 %	449086478
43	NC_020249	AT	3	6	18715	18720	50 %	50 %	0 %	0 %	449086478
44	NC_020249	TA	3	6	19079	19084	50 %	50 %	0 %	0 %	449086478
45	NC_020249	AT	3	6	19397	19402	50 %	50 %	0 %	0 %	449086478
46	NC_020249	AT	3	6	20241	20246	50 %	50 %	0 %	0 %	449086479
47	NC_020249	CA	3	6	20256	20261	50 %	0 %	0 %	50 %	449086479
48	NC_020249	GT	3	6	20732	20737	0 %	50 %	50 %	0 %	449086479
49	NC_020249	TA	3	6	21479	21484	50 %	50 %	0 %	0 %	449086479
50	NC_020249	AC	3	6	23524	23529	50 %	0 %	0 %	50 %	449086480
51	NC_020249	AT	3	6	24074	24079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020249	AT	3	6	24734	24739	50 %	50 %	0 %	0 %	449086481
53	NC_020249	AT	3	6	25051	25056	50 %	50 %	0 %	0 %	449086481
54	NC_020249	GA	3	6	25520	25525	50 %	0 %	50 %	0 %	449086481
55	NC_020249	TG	3	6	26825	26830	0 %	50 %	50 %	0 %	449086483
56	NC_020249	AT	3	6	26898	26903	50 %	50 %	0 %	0 %	449086483
57	NC_020249	TC	3	6	26927	26932	0 %	50 %	0 %	50 %	449086483
58	NC_020249	AC	3	6	26945	26950	50 %	0 %	0 %	50 %	449086483
59	NC_020249	TA	3	6	27016	27021	50 %	50 %	0 %	0 %	449086483
60	NC_020249	TA	3	6	27242	27247	50 %	50 %	0 %	0 %	449086483
61	NC_020249	GA	3	6	27618	27623	50 %	0 %	50 %	0 %	449086484
62	NC_020249	AG	3	6	29130	29135	50 %	0 %	50 %	0 %	449086485
63	NC_020249	AT	4	8	29475	29482	50 %	50 %	0 %	0 %	449086486
64	NC_020249	AT	3	6	29623	29628	50 %	50 %	0 %	0 %	449086486
65	NC_020249	AC	3	6	30295	30300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020249	AT	3	6	31634	31639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020249	TA	4	8	31739	31746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020249	TA	3	6	32735	32740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020249	CT	3	6	32742	32747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020249	AT	3	6	33093	33098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020249	AT	4	8	33470	33477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020249	TA	3	6	33486	33491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020249	TA	3	6	33499	33504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020249	AT	3	6	33646	33651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020249	AT	3	6	33738	33743	50 %	50 %	0 %	0 %	449086491
76	NC_020249	CG	3	6	34758	34763	0 %	0 %	50 %	50 %	449086492
77	NC_020249	TG	3	6	34865	34870	0 %	50 %	50 %	0 %	449086492
78	NC_020249	AT	3	6	37080	37085	50 %	50 %	0 %	0 %	449086493
79	NC_020249	TA	3	6	37243	37248	50 %	50 %	0 %	0 %	449086493
80	NC_020249	CA	3	6	39188	39193	50 %	0 %	0 %	50 %	449086495
81	NC_020249	TA	4	8	39697	39704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020249	TA	3	6	39711	39716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020249	TA	3	6	39800	39805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020249	TA	3	6	39860	39865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020249	GC	3	6	40006	40011	0 %	0 %	50 %	50 %	449086496
86	NC_020249	AT	3	6	40658	40663	50 %	50 %	0 %	0 %	449086496
87	NC_020249	TA	3	6	40966	40971	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
88	NC_020249	AT	3	6	41257	41262	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
89	NC_020249	AT	3	6	41304	41309	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
90	NC_020249	AT	3	6	41374	41379	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
91	NC_020249	CG	3	6	41804	41809	0 %	0 %	50 %	50 %	449086497
92	NC_020249	TA	4	8	42070	42077	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
93	NC_020249	TG	3	6	42388	42393	0 %	50 %	50 %	0 %	449086498
94	NC_020249	TA	3	6	42396	42401	50 %	50 %	0 %	0 %	449086498
95	NC_020249	AT	3	6	43021	43026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020249	TA	3	6	43067	43072	50 %	50 %	0 %	0 %	449086499
97	NC_020249	TG	3	6	45144	45149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020249	TA	3	6	45343	45348	50 %	50 %	0 %	0 %	449086504
99	NC_020249	GT	3	6	45508	45513	0 %	50 %	50 %	0 %	449086504
100	NC_020249	TA	3	6	45589	45594	50 %	50 %	0 %	0 %	449086504
101	NC_020249	AT	3	6	45672	45677	50 %	50 %	0 %	0 %	449086504
102	NC_020249	TA	3	6	45711	45716	50 %	50 %	0 %	0 %	449086504
103	NC_020249	AT	3	6	45875	45880	50 %	50 %	0 %	0 %	449086504
104	NC_020249	AT	3	6	47541	47546	50 %	50 %	0 %	0 %	449086506
105	NC_020249	TA	3	6	47653	47658	50 %	50 %	0 %	0 %	449086506
106	NC_020249	AT	3	6	47995	48000	50 %	50 %	0 %	0 %	449086506
107	NC_020249	AT	3	6	48033	48038	50 %	50 %	0 %	0 %	449086506
108	NC_020249	AT	3	6	49037	49042	50 %	50 %	0 %	0 %	449086506
109	NC_020249	AG	3	6	50468	50473	50 %	0 %	50 %	0 %	449086508
110	NC_020249	TA	3	6	51123	51128	50 %	50 %	0 %	0 %	449086509
111	NC_020249	AG	3	6	51358	51363	50 %	0 %	50 %	0 %	449086509
112	NC_020249	AG	3	6	51429	51434	50 %	0 %	50 %	0 %	449086509
113	NC_020249	AT	3	6	51840	51845	50 %	50 %	0 %	0 %	449086509
114	NC_020249	CA	3	6	52050	52055	50 %	0 %	0 %	50 %	449086510
115	NC_020249	GA	3	6	52928	52933	50 %	0 %	50 %	0 %	449086510
116	NC_020249	AT	3	6	53050	53055	50 %	50 %	0 %	0 %	449086510
117	NC_020249	AT	3	6	56422	56427	50 %	50 %	0 %	0 %	449086513
118	NC_020249	AG	3	6	57471	57476	50 %	0 %	50 %	0 %	449086515
119	NC_020249	AT	3	6	57905	57910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020249	TA	3	6	57922	57927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020249	AG	3	6	58783	58788	50 %	0 %	50 %	0 %	449086519
122	NC_020249	AT	3	6	59393	59398	50 %	50 %	0 %	0 %	449086521
123	NC_020249	AT	3	6	59458	59463	50 %	50 %	0 %	0 %	449086521
124	NC_020249	GT	3	6	60373	60378	0 %	50 %	50 %	0 %	449086525
125	NC_020249	GA	3	6	60795	60800	50 %	0 %	50 %	0 %	449086526
126	NC_020249	TA	3	6	61070	61075	50 %	50 %	0 %	0 %	449086527
127	NC_020249	TA	3	6	61337	61342	50 %	50 %	0 %	0 %	449086527
128	NC_020249	GA	3	6	61949	61954	50 %	0 %	50 %	0 %	449086527
129	NC_020249	GA	3	6	62410	62415	50 %	0 %	50 %	0 %	449086527
130	NC_020249	AG	3	6	62509	62514	50 %	0 %	50 %	0 %	449086527
131	NC_020249	AT	3	6	62627	62632	50 %	50 %	0 %	0 %	449086527
132	NC_020249	TA	3	6	62658	62663	50 %	50 %	0 %	0 %	449086527
133	NC_020249	TG	3	6	63141	63146	0 %	50 %	50 %	0 %	449086527
134	NC_020249	AT	3	6	63827	63832	50 %	50 %	0 %	0 %	449086528
135	NC_020249	AT	3	6	65742	65747	50 %	50 %	0 %	0 %	449086530
136	NC_020249	AG	3	6	65771	65776	50 %	0 %	50 %	0 %	449086530
137	NC_020249	TA	3	6	66086	66091	50 %	50 %	0 %	0 %	449086532
138	NC_020249	AT	3	6	67553	67558	50 %	50 %	0 %	0 %	449086533
139	NC_020249	AT	3	6	67964	67969	50 %	50 %	0 %	0 %	449086533
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142	NC_020249	GT	4	8	70355	70362	0 %	50 %	50 %	0 %	449086535
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144	NC_020249	GT	3	6	73724	73729	0 %	50 %	50 %	0 %	449086536
145	NC_020249	TA	3	6	73963	73968	50 %	50 %	0 %	0 %	449086536
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.