MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT73

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020249	TA	3	6	810	815	50 %	50 %	0 %	0 %	449086467
2	NC_020249	AT	3	6	973	978	50 %	50 %	0 %	0 %	449086467
3	NC_020249	AT	3	6	2698	2703	50 %	50 %	0 %	0 %	449086468
4	NC_020249	TC	3	6	3682	3687	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
5	NC_020249	TC	3	6	4383	4388	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
6	NC_020249	GC	3	6	4639	4644	0 %	0 %	50 %	50 %	449086469
7	NC_020249	TC	3	6	6528	6533	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
8	NC_020249	CT	3	6	6701	6706	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
9	NC_020249	AT	3	6	8188	8193	50 %	50 %	0 %	0 %	449086470
10	NC_020249	GT	3	6	8258	8263	0 %	50 %	50 %	0 %	449086470
11	NC_020249	TA	3	6	9123	9128	50 %	50 %	0 %	0 %	449086471
12	NC_020249	AT	3	6	9689	9694	50 %	50 %	0 %	0 %	449086471
13	NC_020249	AT	3	6	9789	9794	50 %	50 %	0 %	0 %	449086471
14	NC_020249	AT	3	6	10370	10375	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
15	NC_020249	TA	3	6	10502	10507	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
16	NC_020249	TA	3	6	10734	10739	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
17	NC_020249	TA	3	6	10767	10772	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
18	NC_020249	CG	3	6	10927	10932	0 %	0 %	50 %	50 %	449086472
19	NC_020249	AT	3	6	11052	11057	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
20	NC_020249	AT	3	6	12843	12848	50 %	50 %	0 %	0 %	449086473
21	NC_020249	TA	3	6	13006	13011	50 %	50 %	0 %	0 %	449086473
22	NC_020249	AG	3	6	14022	14027	50 %	0 %	50 %	0 %	449086475
23	NC_020249	AT	3	6	14455	14460	50 %	50 %	0 %	0 %	449086475
24	NC_020249	TC	3	6	14589	14594	0 %	50 %	0 %	50 %	449086475
25	NC_020249	TA	3	6	15020	15025	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
26	NC_020249	AT	3	6	15135	15140	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
27	NC_020249	TA	3	6	15512	15517	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
28	NC_020249	TA	3	6	15695	15700	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
29	NC_020249	TA	3	6	15854	15859	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
30	NC_020249	AG	3	6	16440	16445	50 %	0 %	50 %	0 %	449086476
31	NC_020249	TA	3	6	16823	16828	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
32	NC_020249	AT	3	6	17556	17561	50 %	50 %	0 %	0 %	449086476
33	NC_020249	AT	3	6	18056	18061	50 %	50 %	0 %	0 %	449086477
34	NC_020249	TC	3	6	18611	18616	0 %	50 %	0 %	50 %	449086478
35	NC_020249	AT	3	6	18715	18720	50 %	50 %	0 %	0 %	449086478
36	NC_020249	TA	3	6	19079	19084	50 %	50 %	0 %	0 %	449086478
37	NC_020249	AT	3	6	19397	19402	50 %	50 %	0 %	0 %	449086478
38	NC_020249	AT	3	6	20241	20246	50 %	50 %	0 %	0 %	449086479
39	NC_020249	CA	3	6	20256	20261	50 %	0 %	0 %	50 %	449086479
40	NC_020249	GT	3	6	20732	20737	0 %	50 %	50 %	0 %	449086479
41	NC_020249	TA	3	6	21479	21484	50 %	50 %	0 %	0 %	449086479
42	NC_020249	AC	3	6	23524	23529	50 %	0 %	0 %	50 %	449086480
43	NC_020249	AT	3	6	24734	24739	50 %	50 %	0 %	0 %	449086481
44	NC_020249	AT	3	6	25051	25056	50 %	50 %	0 %	0 %	449086481
45	NC_020249	GA	3	6	25520	25525	50 %	0 %	50 %	0 %	449086481
46	NC_020249	TG	3	6	26825	26830	0 %	50 %	50 %	0 %	449086483
47	NC_020249	AT	3	6	26898	26903	50 %	50 %	0 %	0 %	449086483
48	NC_020249	TC	3	6	26927	26932	0 %	50 %	0 %	50 %	449086483
49	NC_020249	AC	3	6	26945	26950	50 %	0 %	0 %	50 %	449086483
50	NC_020249	TA	3	6	27016	27021	50 %	50 %	0 %	0 %	449086483
51	NC_020249	TA	3	6	27242	27247	50 %	50 %	0 %	0 %	449086483
52	NC_020249	GA	3	6	27618	27623	50 %	0 %	50 %	0 %	449086484
53	NC_020249	AG	3	6	29130	29135	50 %	0 %	50 %	0 %	449086485
54	NC_020249	AT	4	8	29475	29482	50 %	50 %	0 %	0 %	449086486
55	NC_020249	AT	3	6	29623	29628	50 %	50 %	0 %	0 %	449086486
56	NC_020249	AT	3	6	33738	33743	50 %	50 %	0 %	0 %	449086491
57	NC_020249	CG	3	6	34758	34763	0 %	0 %	50 %	50 %	449086492
58	NC_020249	TG	3	6	34865	34870	0 %	50 %	50 %	0 %	449086492
59	NC_020249	AT	3	6	37080	37085	50 %	50 %	0 %	0 %	449086493
60	NC_020249	TA	3	6	37243	37248	50 %	50 %	0 %	0 %	449086493
61	NC_020249	CA	3	6	39188	39193	50 %	0 %	0 %	50 %	449086495
62	NC_020249	GC	3	6	40006	40011	0 %	0 %	50 %	50 %	449086496
63	NC_020249	AT	3	6	40658	40663	50 %	50 %	0 %	0 %	449086496
64	NC_020249	TA	3	6	40966	40971	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
65	NC_020249	AT	3	6	41257	41262	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
66	NC_020249	AT	3	6	41304	41309	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
67	NC_020249	AT	3	6	41374	41379	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
68	NC_020249	CG	3	6	41804	41809	0 %	0 %	50 %	50 %	449086497
69	NC_020249	TA	4	8	42070	42077	50 %	50 %	0 %	0 %	449086497
70	NC_020249	TG	3	6	42388	42393	0 %	50 %	50 %	0 %	449086498
71	NC_020249	TA	3	6	42396	42401	50 %	50 %	0 %	0 %	449086498
72	NC_020249	TA	3	6	43067	43072	50 %	50 %	0 %	0 %	449086499
73	NC_020249	TA	3	6	45343	45348	50 %	50 %	0 %	0 %	449086504
74	NC_020249	GT	3	6	45508	45513	0 %	50 %	50 %	0 %	449086504
75	NC_020249	TA	3	6	45589	45594	50 %	50 %	0 %	0 %	449086504
76	NC_020249	AT	3	6	45672	45677	50 %	50 %	0 %	0 %	449086504
77	NC_020249	TA	3	6	45711	45716	50 %	50 %	0 %	0 %	449086504
78	NC_020249	AT	3	6	45875	45880	50 %	50 %	0 %	0 %	449086504
79	NC_020249	AT	3	6	47541	47546	50 %	50 %	0 %	0 %	449086506
80	NC_020249	TA	3	6	47653	47658	50 %	50 %	0 %	0 %	449086506
81	NC_020249	AT	3	6	47995	48000	50 %	50 %	0 %	0 %	449086506
82	NC_020249	AT	3	6	48033	48038	50 %	50 %	0 %	0 %	449086506
83	NC_020249	AT	3	6	49037	49042	50 %	50 %	0 %	0 %	449086506
84	NC_020249	AG	3	6	50468	50473	50 %	0 %	50 %	0 %	449086508
85	NC_020249	TA	3	6	51123	51128	50 %	50 %	0 %	0 %	449086509
86	NC_020249	AG	3	6	51358	51363	50 %	0 %	50 %	0 %	449086509
87	NC_020249	AG	3	6	51429	51434	50 %	0 %	50 %	0 %	449086509
88	NC_020249	AT	3	6	51840	51845	50 %	50 %	0 %	0 %	449086509
89	NC_020249	CA	3	6	52050	52055	50 %	0 %	0 %	50 %	449086510
90	NC_020249	GA	3	6	52928	52933	50 %	0 %	50 %	0 %	449086510
91	NC_020249	AT	3	6	53050	53055	50 %	50 %	0 %	0 %	449086510
92	NC_020249	AT	3	6	56422	56427	50 %	50 %	0 %	0 %	449086513
93	NC_020249	AG	3	6	57471	57476	50 %	0 %	50 %	0 %	449086515
94	NC_020249	AG	3	6	58783	58788	50 %	0 %	50 %	0 %	449086519
95	NC_020249	AT	3	6	59393	59398	50 %	50 %	0 %	0 %	449086521
96	NC_020249	AT	3	6	59458	59463	50 %	50 %	0 %	0 %	449086521
97	NC_020249	GT	3	6	60373	60378	0 %	50 %	50 %	0 %	449086525
98	NC_020249	GA	3	6	60795	60800	50 %	0 %	50 %	0 %	449086526
99	NC_020249	TA	3	6	61070	61075	50 %	50 %	0 %	0 %	449086527
100	NC_020249	TA	3	6	61337	61342	50 %	50 %	0 %	0 %	449086527
101	NC_020249	GA	3	6	61949	61954	50 %	0 %	50 %	0 %	449086527
102	NC_020249	GA	3	6	62410	62415	50 %	0 %	50 %	0 %	449086527
103	NC_020249	AG	3	6	62509	62514	50 %	0 %	50 %	0 %	449086527
104	NC_020249	AT	3	6	62627	62632	50 %	50 %	0 %	0 %	449086527
105	NC_020249	TA	3	6	62658	62663	50 %	50 %	0 %	0 %	449086527
106	NC_020249	TG	3	6	63141	63146	0 %	50 %	50 %	0 %	449086527
107	NC_020249	AT	3	6	63827	63832	50 %	50 %	0 %	0 %	449086528
108	NC_020249	AT	3	6	65742	65747	50 %	50 %	0 %	0 %	449086530
109	NC_020249	AG	3	6	65771	65776	50 %	0 %	50 %	0 %	449086530
110	NC_020249	TA	3	6	66086	66091	50 %	50 %	0 %	0 %	449086532
111	NC_020249	AT	3	6	67553	67558	50 %	50 %	0 %	0 %	449086533
112	NC_020249	AT	3	6	67964	67969	50 %	50 %	0 %	0 %	449086533
113	NC_020249	AT	3	6	69428	69433	50 %	50 %	0 %	0 %	449086534
114	NC_020249	TA	3	6	70285	70290	50 %	50 %	0 %	0 %	449086535
115	NC_020249	GT	4	8	70355	70362	0 %	50 %	50 %	0 %	449086535
116	NC_020249	AG	3	6	71924	71929	50 %	0 %	50 %	0 %	449086535
117	NC_020249	GT	3	6	73724	73729	0 %	50 %	50 %	0 %	449086536
118	NC_020249	TA	3	6	73963	73968	50 %	50 %	0 %	0 %	449086536
119	NC_020249	AT	3	6	74547	74552	50 %	50 %	0 %	0 %	449086536
120	NC_020249	GT	3	6	74972	74977	0 %	50 %	50 %	0 %	449086537
121	NC_020249	GA	3	6	76771	76776	50 %	0 %	50 %	0 %	449086538
122	NC_020249	GA	3	6	77026	77031	50 %	0 %	50 %	0 %	449086539

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.