MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020248	GAAAA	2	10	3358	3367	80 %	0 %	20 %	0 %	449070645
2	NC_020248	AGGAG	2	10	4415	4424	40 %	0 %	60 %	0 %	449070645
3	NC_020248	TGTTT	2	10	6762	6771	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020248	AACAT	2	10	7326	7335	60 %	20 %	0 %	20 %	449070647
5	NC_020248	ATAAA	2	10	13047	13056	80 %	20 %	0 %	0 %	449070649
6	NC_020248	AACTC	2	10	13491	13500	40 %	20 %	0 %	40 %	449070649
7	NC_020248	GTTTT	2	10	13561	13570	0 %	80 %	20 %	0 %	449070649
8	NC_020248	GAAAC	2	10	14329	14338	60 %	0 %	20 %	20 %	449070650
9	NC_020248	AACAA	2	10	15358	15367	80 %	0 %	0 %	20 %	449070650
10	NC_020248	AATAG	2	10	17070	17079	60 %	20 %	20 %	0 %	449070652
11	NC_020248	AGTGT	2	10	21118	21127	20 %	40 %	40 %	0 %	449070655
12	NC_020248	GCCAC	2	10	29443	29452	20 %	0 %	20 %	60 %	449070659
13	NC_020248	ATTTT	2	10	32425	32434	20 %	80 %	0 %	0 %	449070664
14	NC_020248	ATAAA	2	10	34282	34291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020248	AAGGA	2	10	38576	38585	60 %	0 %	40 %	0 %	449070669
16	NC_020248	CCATA	2	10	38783	38792	40 %	20 %	0 %	40 %	449070669
17	NC_020248	CTTTA	2	10	38949	38958	20 %	60 %	0 %	20 %	449070669
18	NC_020248	CTTTC	2	10	43212	43221	0 %	60 %	0 %	40 %	449070674
19	NC_020248	ACAAA	2	10	43874	43883	80 %	0 %	0 %	20 %	449070675
20	NC_020248	TATGG	2	10	44284	44293	20 %	40 %	40 %	0 %	449070676
21	NC_020248	TTGTC	2	10	45143	45152	0 %	60 %	20 %	20 %	449070676
22	NC_020248	TCTTT	2	10	46092	46101	0 %	80 %	0 %	20 %	449070678
23	NC_020248	AGCCC	2	10	47089	47098	20 %	0 %	20 %	60 %	449070679
24	NC_020248	TCAAA	2	10	47444	47453	60 %	20 %	0 %	20 %	449070679
25	NC_020248	TCTAT	2	10	49563	49572	20 %	60 %	0 %	20 %	449070681
26	NC_020248	TTTGG	2	10	51477	51486	0 %	60 %	40 %	0 %	449070681
27	NC_020248	TTTTG	2	10	52483	52492	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020248	TTTTC	2	10	55331	55340	0 %	80 %	0 %	20 %	449070684
29	NC_020248	GTAAG	2	10	57379	57388	40 %	20 %	40 %	0 %	449070687
30	NC_020248	TTAAT	2	10	57951	57960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020248	TCTTT	2	10	59395	59404	0 %	80 %	0 %	20 %	449070690
32	NC_020248	AAAAT	2	10	60201	60210	80 %	20 %	0 %	0 %	449070691
33	NC_020248	TAGTT	2	10	62802	62811	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020248	GAATG	2	10	62818	62827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020248	GACGC	2	10	63158	63167	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_020248	TCCTA	2	10	64869	64878	20 %	40 %	0 %	40 %	449070693
37	NC_020248	AGAAA	2	10	70121	70130	80 %	0 %	20 %	0 %	449070697
38	NC_020248	GGATA	2	10	70928	70937	40 %	20 %	40 %	0 %	449070699
39	NC_020248	CACTT	2	10	71111	71120	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_020248	ATAGC	2	10	74366	74375	40 %	20 %	20 %	20 %	449070703
41	NC_020248	GCACA	2	10	77199	77208	40 %	0 %	20 %	40 %	449070705
42	NC_020248	AATTT	2	10	77723	77732	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020248	AAAGA	2	10	78152	78161	80 %	0 %	20 %	0 %	449070706
44	NC_020248	AGTTC	2	10	79156	79165	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020248	CGTAT	2	10	81525	81534	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020248	GAAAA	2	10	82734	82743	80 %	0 %	20 %	0 %	449070709
47	NC_020248	AGGAA	2	10	84733	84742	60 %	0 %	40 %	0 %	449070711
48	NC_020248	CTTTT	2	10	85622	85631	0 %	80 %	0 %	20 %	449070713
49	NC_020248	CAAAG	2	10	87093	87102	60 %	0 %	20 %	20 %	449070715
50	NC_020248	AACAA	2	10	87260	87269	80 %	0 %	0 %	20 %	449070715
51	NC_020248	AGAAA	2	10	87330	87339	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020248	AAGTT	2	10	87450	87459	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020248	AAAGA	2	10	89167	89176	80 %	0 %	20 %	0 %	449070717
54	NC_020248	TTTTC	2	10	90182	90191	0 %	80 %	0 %	20 %	449070717
55	NC_020248	AGGAT	2	10	90705	90714	40 %	20 %	40 %	0 %	449070717
56	NC_020248	ATAAC	2	10	90791	90800	60 %	20 %	0 %	20 %	449070717
57	NC_020248	TGGCA	2	10	93276	93285	20 %	20 %	40 %	20 %	449070718
58	NC_020248	AATTA	2	10	93939	93948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020248	TGTTT	2	10	95000	95009	0 %	80 %	20 %	0 %	449070720
60	NC_020248	TCACC	2	10	96574	96583	20 %	20 %	0 %	60 %	449070721
61	NC_020248	AAAAT	2	10	96709	96718	80 %	20 %	0 %	0 %	449070721
62	NC_020248	TTAAT	2	10	97753	97762	40 %	60 %	0 %	0 %	449070722
63	NC_020248	ATTTG	2	10	98930	98939	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020248	AAAAT	2	10	99648	99657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020248	ATTAC	2	10	102876	102885	40 %	40 %	0 %	20 %	449070730
66	NC_020248	CTACA	2	10	103250	103259	40 %	20 %	0 %	40 %	449070730
67	NC_020248	AATTA	2	10	104797	104806	60 %	40 %	0 %	0 %	449070732
68	NC_020248	CTATA	2	10	105787	105796	40 %	40 %	0 %	20 %	449070733
69	NC_020248	CTTTT	2	10	108326	108335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020248	AGCTT	2	10	108437	108446	20 %	40 %	20 %	20 %	449070737
71	NC_020248	GTTTG	2	10	108744	108753	0 %	60 %	40 %	0 %	449070737
72	NC_020248	AGTTA	2	10	115547	115556	40 %	40 %	20 %	0 %	449070751
73	NC_020248	AGTTT	2	10	116037	116046	20 %	60 %	20 %	0 %	449070753
74	NC_020248	TTTGC	2	10	116952	116961	0 %	60 %	20 %	20 %	449070755
75	NC_020248	TTTAC	2	10	119148	119157	20 %	60 %	0 %	20 %	449070758
76	NC_020248	AATTA	2	10	122040	122049	60 %	40 %	0 %	0 %	449070761
77	NC_020248	CTTTT	2	10	122836	122845	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_020248	GAGAT	2	10	123392	123401	40 %	20 %	40 %	0 %	449070762
79	NC_020248	GTCAA	2	10	124711	124720	40 %	20 %	20 %	20 %	449070764
80	NC_020248	TAGGG	2	10	127183	127192	20 %	20 %	60 %	0 %	449070767
81	NC_020248	AACTT	2	10	128115	128124	40 %	40 %	0 %	20 %	449070767
82	NC_020248	TTCTT	2	10	131319	131328	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020248	TGTCA	2	10	132000	132009	20 %	40 %	20 %	20 %	449070770
84	NC_020248	AAAAG	2	10	135406	135415	80 %	0 %	20 %	0 %	449070772
85	NC_020248	TAAAA	2	10	135687	135696	80 %	20 %	0 %	0 %	449070772
86	NC_020248	GATTT	2	10	137946	137955	20 %	60 %	20 %	0 %	449070774
87	NC_020248	TTGTT	2	10	138288	138297	0 %	80 %	20 %	0 %	449070774
88	NC_020248	AAGAA	2	10	138769	138778	80 %	0 %	20 %	0 %	449070774
89	NC_020248	TTCTT	2	10	139361	139370	0 %	80 %	0 %	20 %	449070776
90	NC_020248	CTTTG	2	10	141266	141275	0 %	60 %	20 %	20 %	449070778
91	NC_020248	AGAAA	2	10	143304	143313	80 %	0 %	20 %	0 %	449070781
92	NC_020248	AAAGA	2	10	145969	145978	80 %	0 %	20 %	0 %	449070783
93	NC_020248	TTTTA	2	10	148151	148160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020248	TACTC	2	10	149601	149610	20 %	40 %	0 %	40 %	449070791
95	NC_020248	CGTTT	2	10	149648	149657	0 %	60 %	20 %	20 %	449070791
96	NC_020248	ATTTT	2	10	149788	149797	20 %	80 %	0 %	0 %	449070791
97	NC_020248	ACCAT	2	10	151825	151834	40 %	20 %	0 %	40 %	449070792
98	NC_020248	CAGAA	2	10	152790	152799	60 %	0 %	20 %	20 %	449070793
99	NC_020248	TTCAT	2	10	153360	153369	20 %	60 %	0 %	20 %	449070793
100	NC_020248	AAAGG	2	10	154190	154199	60 %	0 %	40 %	0 %	449070794
101	NC_020248	ATAGG	2	10	155880	155889	40 %	20 %	40 %	0 %	449070796
102	NC_020248	TTTGA	2	10	155966	155975	20 %	60 %	20 %	0 %	449070796
103	NC_020248	AAGGT	2	10	160908	160917	40 %	20 %	40 %	0 %	449070799
104	NC_020248	GGGGC	2	10	161997	162006	0 %	0 %	80 %	20 %	449070801
105	NC_020248	AGCAT	2	10	163286	163295	40 %	20 %	20 %	20 %	449070804
106	NC_020248	TAAAT	2	10	164474	164483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020248	AAATG	2	10	166400	166409	60 %	20 %	20 %	0 %	449070805
108	NC_020248	GGGGA	2	10	168175	168184	20 %	0 %	80 %	0 %	449070806
109	NC_020248	TTTTC	2	10	169215	169224	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_020248	CTGTT	2	10	169694	169703	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020248	AATGA	2	10	169729	169738	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020248	ATTTT	2	10	173189	173198	20 %	80 %	0 %	0 %	449070814
113	NC_020248	GAGAG	2	10	173206	173215	40 %	0 %	60 %	0 %	449070814
114	NC_020248	CAAAA	2	10	173536	173545	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_020248	CGCAT	2	10	173906	173915	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_020248	CTAAG	2	10	181154	181163	40 %	20 %	20 %	20 %	449070821
117	NC_020248	TTTTC	2	10	181754	181763	0 %	80 %	0 %	20 %	449070821
118	NC_020248	GGTAC	2	10	183749	183758	20 %	20 %	40 %	20 %	449070823
119	NC_020248	AGGGA	2	10	186935	186944	40 %	0 %	60 %	0 %	449070827
120	NC_020248	AATGT	2	10	187344	187353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020248	AGGAA	2	10	187958	187967	60 %	0 %	40 %	0 %	449070828
122	NC_020248	TTCTT	2	10	188337	188346	0 %	80 %	0 %	20 %	449070828
123	NC_020248	GATAA	2	10	190980	190989	60 %	20 %	20 %	0 %	449070828
124	NC_020248	CCCTT	2	10	193183	193192	0 %	40 %	0 %	60 %	449070830
125	NC_020248	TTTTA	2	10	193884	193893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020248	AGTTA	2	10	194174	194183	40 %	40 %	20 %	0 %	449070831
127	NC_020248	TTATT	2	10	194194	194203	20 %	80 %	0 %	0 %	449070831
128	NC_020248	CCCTA	2	10	195246	195255	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_020248	AGGGT	2	10	197117	197126	20 %	20 %	60 %	0 %	449070833
130	NC_020248	TGGAT	2	10	197558	197567	20 %	40 %	40 %	0 %	449070833
131	NC_020248	CTAAA	2	10	197615	197624	60 %	20 %	0 %	20 %	449070833
132	NC_020248	CTTTA	2	10	197918	197927	20 %	60 %	0 %	20 %	449070833
133	NC_020248	AAAAT	2	10	198095	198104	80 %	20 %	0 %	0 %	449070833
134	NC_020248	GTTTT	2	10	198597	198606	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020248	ATTAA	2	10	201019	201028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020248	TTGGT	2	10	201395	201404	0 %	60 %	40 %	0 %	449070837
137	NC_020248	AGCAA	2	10	203871	203880	60 %	0 %	20 %	20 %	449070839
138	NC_020248	ATGTG	2	10	204257	204266	20 %	40 %	40 %	0 %	449070840
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402	NC_020248	ATTAA	2	10	591801	591810	60 %	40 %	0 %	0 %	449071179
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