MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 3005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020248	AAGG	2	8	267	274	50 %	0 %	50 %	0 %	449070642
2	NC_020248	GCGT	2	8	589	596	0 %	25 %	50 %	25 %	449070642
3	NC_020248	TTAA	2	8	1354	1361	50 %	50 %	0 %	0 %	449070643
4	NC_020248	AGAT	2	8	2544	2551	50 %	25 %	25 %	0 %	449070643
5	NC_020248	TGTT	2	8	2843	2850	0 %	75 %	25 %	0 %	449070644
6	NC_020248	GAAG	2	8	2954	2961	50 %	0 %	50 %	0 %	449070644
7	NC_020248	AGTA	2	8	2984	2991	50 %	25 %	25 %	0 %	449070644
8	NC_020248	TTTG	2	8	3302	3309	0 %	75 %	25 %	0 %	449070645
9	NC_020248	TCCT	2	8	3328	3335	0 %	50 %	0 %	50 %	449070645
10	NC_020248	GAAA	2	8	5257	5264	75 %	0 %	25 %	0 %	449070645
11	NC_020248	AATC	2	8	5416	5423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020248	CGAG	2	8	5528	5535	25 %	0 %	50 %	25 %	449070646
13	NC_020248	TAAT	2	8	6733	6740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020248	GAAT	2	8	6853	6860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020248	AGAA	2	8	6965	6972	75 %	0 %	25 %	0 %	449070647
16	NC_020248	TCCC	2	8	7282	7289	0 %	25 %	0 %	75 %	449070647
17	NC_020248	GTAG	2	8	7316	7323	25 %	25 %	50 %	0 %	449070647
18	NC_020248	AATA	2	8	8013	8020	75 %	25 %	0 %	0 %	449070648
19	NC_020248	ATGA	2	8	8484	8491	50 %	25 %	25 %	0 %	449070648
20	NC_020248	TGGA	2	8	8672	8679	25 %	25 %	50 %	0 %	449070648
21	NC_020248	CTGT	2	8	8682	8689	0 %	50 %	25 %	25 %	449070648
22	NC_020248	ATTT	2	8	9404	9411	25 %	75 %	0 %	0 %	449070648
23	NC_020248	AAAG	2	8	10228	10235	75 %	0 %	25 %	0 %	449070648
24	NC_020248	AAGT	2	8	10527	10534	50 %	25 %	25 %	0 %	449070648
25	NC_020248	AGGG	2	8	10766	10773	25 %	0 %	75 %	0 %	449070648
26	NC_020248	TAAG	2	8	10776	10783	50 %	25 %	25 %	0 %	449070648
27	NC_020248	AAAG	2	8	11069	11076	75 %	0 %	25 %	0 %	449070649
28	NC_020248	AGTA	2	8	11727	11734	50 %	25 %	25 %	0 %	449070649
29	NC_020248	TCTT	2	8	12008	12015	0 %	75 %	0 %	25 %	449070649
30	NC_020248	TAAT	2	8	12149	12156	50 %	50 %	0 %	0 %	449070649
31	NC_020248	CAAA	2	8	12460	12467	75 %	0 %	0 %	25 %	449070649
32	NC_020248	AGAT	2	8	12570	12577	50 %	25 %	25 %	0 %	449070649
33	NC_020248	AAGA	2	8	12581	12588	75 %	0 %	25 %	0 %	449070649
34	NC_020248	ACTT	2	8	12703	12710	25 %	50 %	0 %	25 %	449070649
35	NC_020248	CACT	2	8	12800	12807	25 %	25 %	0 %	50 %	449070649
36	NC_020248	GCAA	2	8	13328	13335	50 %	0 %	25 %	25 %	449070649
37	NC_020248	GAAA	2	8	13748	13755	75 %	0 %	25 %	0 %	449070649
38	NC_020248	AGAT	2	8	14317	14324	50 %	25 %	25 %	0 %	449070650
39	NC_020248	TTGT	2	8	14367	14374	0 %	75 %	25 %	0 %	449070650
40	NC_020248	GGAT	2	8	14951	14958	25 %	25 %	50 %	0 %	449070650
41	NC_020248	CCCA	2	8	15422	15429	25 %	0 %	0 %	75 %	449070650
42	NC_020248	TAAA	2	8	17026	17033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020248	AGAA	2	8	17166	17173	75 %	0 %	25 %	0 %	449070652
44	NC_020248	TCTT	2	8	17436	17443	0 %	75 %	0 %	25 %	449070652
45	NC_020248	TTTC	2	8	17683	17690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020248	GTCA	2	8	17839	17846	25 %	25 %	25 %	25 %	449070653
47	NC_020248	AAGC	2	8	18230	18237	50 %	0 %	25 %	25 %	449070653
48	NC_020248	ATTA	2	8	18370	18377	50 %	50 %	0 %	0 %	449070653
49	NC_020248	ATTA	2	8	18991	18998	50 %	50 %	0 %	0 %	449070654
50	NC_020248	GTTT	2	8	19264	19271	0 %	75 %	25 %	0 %	449070654
51	NC_020248	TTTG	2	8	19504	19511	0 %	75 %	25 %	0 %	449070654
52	NC_020248	TGCC	2	8	19536	19543	0 %	25 %	25 %	50 %	449070654
53	NC_020248	GCGT	2	8	19668	19675	0 %	25 %	50 %	25 %	449070654
54	NC_020248	TTTG	2	8	20196	20203	0 %	75 %	25 %	0 %	449070654
55	NC_020248	TGGT	2	8	20448	20455	0 %	50 %	50 %	0 %	449070655
56	NC_020248	TAAA	2	8	21088	21095	75 %	25 %	0 %	0 %	449070655
57	NC_020248	TATG	2	8	21587	21594	25 %	50 %	25 %	0 %	449070655
58	NC_020248	CAAT	2	8	22280	22287	50 %	25 %	0 %	25 %	449070656
59	NC_020248	AGAA	2	8	22697	22704	75 %	0 %	25 %	0 %	449070656
60	NC_020248	TGAT	2	8	22904	22911	25 %	50 %	25 %	0 %	449070656
61	NC_020248	ACTT	2	8	23761	23768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020248	TGTC	2	8	24056	24063	0 %	50 %	25 %	25 %	449070657
63	NC_020248	AGCT	2	8	24169	24176	25 %	25 %	25 %	25 %	449070657
64	NC_020248	AATT	2	8	24628	24635	50 %	50 %	0 %	0 %	449070657
65	NC_020248	ATAA	2	8	24695	24702	75 %	25 %	0 %	0 %	449070657
66	NC_020248	TCTG	2	8	24927	24934	0 %	50 %	25 %	25 %	449070657
67	NC_020248	TAGT	2	8	24984	24991	25 %	50 %	25 %	0 %	449070657
68	NC_020248	TTGC	2	8	25252	25259	0 %	50 %	25 %	25 %	449070657
69	NC_020248	GAAC	2	8	25440	25447	50 %	0 %	25 %	25 %	449070657
70	NC_020248	GAGT	2	8	25624	25631	25 %	25 %	50 %	0 %	449070657
71	NC_020248	TCAT	2	8	25788	25795	25 %	50 %	0 %	25 %	449070657
72	NC_020248	TCTT	2	8	26013	26020	0 %	75 %	0 %	25 %	449070657
73	NC_020248	GTTT	2	8	26077	26084	0 %	75 %	25 %	0 %	449070657
74	NC_020248	TAAA	2	8	26470	26477	75 %	25 %	0 %	0 %	449070657
75	NC_020248	TTAA	2	8	26594	26601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020248	TATT	2	8	26651	26658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020248	ATTA	2	8	26663	26670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020248	TGGT	2	8	27325	27332	0 %	50 %	50 %	0 %	449070658
79	NC_020248	AATC	2	8	27719	27726	50 %	25 %	0 %	25 %	449070658
80	NC_020248	AATT	2	8	27956	27963	50 %	50 %	0 %	0 %	449070658
81	NC_020248	GAAA	2	8	28148	28155	75 %	0 %	25 %	0 %	449070658
82	NC_020248	AAAT	2	8	28805	28812	75 %	25 %	0 %	0 %	449070658
83	NC_020248	GGCA	2	8	29083	29090	25 %	0 %	50 %	25 %	449070658
84	NC_020248	AGGG	2	8	29428	29435	25 %	0 %	75 %	0 %	449070659
85	NC_020248	GAAT	2	8	29622	29629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020248	AGAA	2	8	29787	29794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020248	ACCA	2	8	30235	30242	50 %	0 %	0 %	50 %	449070660
88	NC_020248	GTTT	2	8	31405	31412	0 %	75 %	25 %	0 %	449070662
89	NC_020248	TTTC	2	8	31645	31652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020248	TCTA	2	8	32049	32056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020248	AATT	2	8	32370	32377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020248	TTAA	2	8	32410	32417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020248	TTGT	2	8	32452	32459	0 %	75 %	25 %	0 %	449070664
94	NC_020248	TAGA	2	8	32658	32665	50 %	25 %	25 %	0 %	449070664
95	NC_020248	TTTA	2	8	33112	33119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020248	AAGG	2	8	33383	33390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020248	TTAA	2	8	33512	33519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020248	AGAT	2	8	33555	33562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020248	TGAA	2	8	34014	34021	50 %	25 %	25 %	0 %	449070666
100	NC_020248	GTAC	2	8	34092	34099	25 %	25 %	25 %	25 %	449070666
101	NC_020248	GATA	2	8	34128	34135	50 %	25 %	25 %	0 %	449070666
102	NC_020248	TCTT	2	8	34391	34398	0 %	75 %	0 %	25 %	449070667
103	NC_020248	AGGA	2	8	35343	35350	50 %	0 %	50 %	0 %	449070667
104	NC_020248	TAAT	2	8	36131	36138	50 %	50 %	0 %	0 %	449070668
105	NC_020248	CGCT	2	8	36847	36854	0 %	25 %	25 %	50 %	449070668
106	NC_020248	TCAA	2	8	37780	37787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020248	AAAG	2	8	38200	38207	75 %	0 %	25 %	0 %	449070669
108	NC_020248	TAAT	2	8	38216	38223	50 %	50 %	0 %	0 %	449070669
109	NC_020248	TCAA	2	8	38352	38359	50 %	25 %	0 %	25 %	449070669
110	NC_020248	TTTA	2	8	38685	38692	25 %	75 %	0 %	0 %	449070669
111	NC_020248	CTTT	2	8	38815	38822	0 %	75 %	0 %	25 %	449070669
112	NC_020248	AGCG	2	8	39004	39011	25 %	0 %	50 %	25 %	449070669
113	NC_020248	CCTG	2	8	40300	40307	0 %	25 %	25 %	50 %	449070671
114	NC_020248	GAAA	2	8	41241	41248	75 %	0 %	25 %	0 %	449070671
115	NC_020248	AGCA	2	8	41412	41419	50 %	0 %	25 %	25 %	449070671
116	NC_020248	CTGT	2	8	41880	41887	0 %	50 %	25 %	25 %	449070671
117	NC_020248	TCTT	2	8	41920	41927	0 %	75 %	0 %	25 %	449070671
118	NC_020248	GAAG	2	8	42331	42338	50 %	0 %	50 %	0 %	449070671
119	NC_020248	AATA	2	8	42362	42369	75 %	25 %	0 %	0 %	449070671
120	NC_020248	GAAA	2	8	43499	43506	75 %	0 %	25 %	0 %	449070675
121	NC_020248	GTCG	2	8	44197	44204	0 %	25 %	50 %	25 %	449070676
122	NC_020248	TTAA	2	8	44227	44234	50 %	50 %	0 %	0 %	449070676
123	NC_020248	ATCA	2	8	44816	44823	50 %	25 %	0 %	25 %	449070676
124	NC_020248	ATGA	2	8	45094	45101	50 %	25 %	25 %	0 %	449070676
125	NC_020248	TAAA	2	8	45993	46000	75 %	25 %	0 %	0 %	449070677
126	NC_020248	GAAA	2	8	46975	46982	75 %	0 %	25 %	0 %	449070679
127	NC_020248	TCTT	2	8	47081	47088	0 %	75 %	0 %	25 %	449070679
128	NC_020248	GCTT	2	8	47610	47617	0 %	50 %	25 %	25 %	449070679
129	NC_020248	AAGA	2	8	48052	48059	75 %	0 %	25 %	0 %	449070680
130	NC_020248	TGTT	2	8	48462	48469	0 %	75 %	25 %	0 %	449070680
131	NC_020248	ATAA	2	8	49530	49537	75 %	25 %	0 %	0 %	449070681
132	NC_020248	TAAA	2	8	49699	49706	75 %	25 %	0 %	0 %	449070681
133	NC_020248	AAGC	2	8	49728	49735	50 %	0 %	25 %	25 %	449070681
134	NC_020248	CCAA	2	8	49752	49759	50 %	0 %	0 %	50 %	449070681
135	NC_020248	TTCC	2	8	49899	49906	0 %	50 %	0 %	50 %	449070681
136	NC_020248	AACA	2	8	50876	50883	75 %	0 %	0 %	25 %	449070681
137	NC_020248	AAAG	2	8	52606	52613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020248	TTTA	2	8	52616	52623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020248	GAAG	2	8	52720	52727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020248	TGCC	2	8	52972	52979	0 %	25 %	25 %	50 %	449070682
141	NC_020248	TTCA	2	8	53473	53480	25 %	50 %	0 %	25 %	449070682
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143	NC_020248	CATA	2	8	54321	54328	50 %	25 %	0 %	25 %	449070683
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