MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 15682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020248	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020248	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020248	CGA	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070642
4	NC_020248	AGA	2	6	189	194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070642
5	NC_020248	CTT	2	6	226	231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070642
6	NC_020248	TCT	2	6	332	337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070642
7	NC_020248	TAT	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070642
8	NC_020248	ATG	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070642
9	NC_020248	TGT	2	6	641	646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070642
10	NC_020248	ATG	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070642
11	NC_020248	ACA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070642
12	NC_020248	AGC	2	6	965	970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070642
13	NC_020248	GTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070642
14	NC_020248	AGC	3	9	1001	1009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070642
15	NC_020248	CTA	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070642
16	NC_020248	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070642
17	NC_020248	CTT	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070642
18	NC_020248	TTC	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020248	GAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020248	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
21	NC_020248	ACA	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070643
22	NC_020248	ATG	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
23	NC_020248	TTA	2	6	1513	1518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070643
24	NC_020248	TAG	2	6	1577	1582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
25	NC_020248	TAG	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
26	NC_020248	CTA	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070643
27	NC_020248	TTC	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
28	NC_020248	ATA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070643
29	NC_020248	CTT	2	6	2057	2062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
30	NC_020248	GAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070643
31	NC_020248	TGA	2	6	2129	2134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
32	NC_020248	GAT	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
33	NC_020248	GTT	2	6	2183	2188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070643
34	NC_020248	CTT	2	6	2207	2212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
35	NC_020248	TAA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070643
36	NC_020248	GAA	2	6	2416	2421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070643
37	NC_020248	AGT	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070644
38	NC_020248	TTA	2	6	2658	2663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
39	NC_020248	TCC	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070644
40	NC_020248	TTC	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070644
41	NC_020248	TTA	2	6	2805	2810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
42	NC_020248	AGA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070644
43	NC_020248	TAT	2	6	2974	2979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
44	NC_020248	TAT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
45	NC_020248	TAT	2	6	3060	3065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020248	ATT	3	9	3075	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020248	TTG	3	9	3084	3092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020248	GAA	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
49	NC_020248	ATG	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
50	NC_020248	AGT	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
51	NC_020248	CTT	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070645
52	NC_020248	CAA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070645
53	NC_020248	ATG	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
54	NC_020248	ATC	2	6	3781	3786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070645
55	NC_020248	TGG	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070645
56	NC_020248	AGA	2	6	4145	4150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
57	NC_020248	TAA	2	6	4211	4216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070645
58	NC_020248	GAA	2	6	4248	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
59	NC_020248	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070645
60	NC_020248	TAA	2	6	4315	4320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070645
61	NC_020248	AGA	2	6	4435	4440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
62	NC_020248	CTT	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070645
63	NC_020248	ATG	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
64	NC_020248	GAT	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
65	NC_020248	GCT	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070645
66	NC_020248	GAA	2	6	4811	4816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
67	NC_020248	AAG	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
68	NC_020248	TGG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070645
69	NC_020248	AAG	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
70	NC_020248	AGA	2	6	5114	5119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
71	NC_020248	TTA	2	6	5134	5139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070645
72	NC_020248	CAA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070645
73	NC_020248	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020248	TTG	2	6	5351	5356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020248	AGA	2	6	5522	5527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070646
76	NC_020248	TGG	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070646
77	NC_020248	TAT	2	6	5623	5628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070646
78	NC_020248	GTT	2	6	5669	5674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
79	NC_020248	CAA	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070646
80	NC_020248	GAT	2	6	5712	5717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
81	NC_020248	TGT	2	6	5732	5737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
82	NC_020248	GGA	2	6	5754	5759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070646
83	NC_020248	CAA	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070646
84	NC_020248	TGA	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
85	NC_020248	GAT	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
86	NC_020248	TGT	3	9	5985	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
87	NC_020248	TGA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
88	NC_020248	GCT	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070646
89	NC_020248	TGC	2	6	6224	6229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070646
90	NC_020248	TGA	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
91	NC_020248	GAA	2	6	6276	6281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070646
92	NC_020248	GAG	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070646
93	NC_020248	TTC	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070646
94	NC_020248	CCT	2	6	6306	6311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070646
95	NC_020248	CTT	2	6	6352	6357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070646
96	NC_020248	GTT	2	6	6394	6399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
97	NC_020248	ACA	2	6	6551	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020248	ATA	2	6	6591	6596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020248	CAA	2	6	6635	6640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020248	GAA	2	6	6882	6887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020248	GAA	2	6	6911	6916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070647
102	NC_020248	CAT	2	6	6917	6922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070647
103	NC_020248	ACA	2	6	6935	6940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070647
104	NC_020248	GTG	2	6	6989	6994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070647
105	NC_020248	TGT	2	6	7014	7019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070647
106	NC_020248	TTC	2	6	7105	7110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070647
107	NC_020248	GTT	2	6	7116	7121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070647
108	NC_020248	CAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070647
109	NC_020248	AGA	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070647
110	NC_020248	TAA	2	6	7254	7259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070647
111	NC_020248	TTG	2	6	7303	7308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070647
112	NC_020248	CTC	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070647
113	NC_020248	GGA	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070647
114	NC_020248	TGA	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070647
115	NC_020248	ATT	2	6	7780	7785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070647
116	NC_020248	TGC	2	6	7858	7863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070647
117	NC_020248	TTC	2	6	7893	7898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070647
118	NC_020248	TTG	2	6	8055	8060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070648
119	NC_020248	TGC	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070648
120	NC_020248	AAG	2	6	8170	8175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
121	NC_020248	TTA	2	6	8254	8259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070648
122	NC_020248	CTT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070648
123	NC_020248	GAA	2	6	8344	8349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
124	NC_020248	TTC	2	6	8379	8384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070648
125	NC_020248	TTC	2	6	8504	8509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070648
126	NC_020248	AGG	2	6	8711	8716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070648
127	NC_020248	CCT	2	6	8768	8773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070648
128	NC_020248	AAG	2	6	8816	8821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
129	NC_020248	GTT	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070648
130	NC_020248	GAA	2	6	8890	8895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
131	NC_020248	CAT	2	6	8939	8944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070648
132	NC_020248	TTC	2	6	9024	9029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070648
133	NC_020248	GAA	2	6	9085	9090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
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233	NC_020248	AAT	2	6	17010	17015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_020248	TGA	2	6	19095	19100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070654
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257	NC_020248	ATA	2	6	19566	19571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070654
258	NC_020248	GAA	2	6	19574	19579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070654
259	NC_020248	TCA	2	6	19629	19634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070654
260	NC_020248	CTT	2	6	19652	19657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070654
261	NC_020248	CAA	2	6	19701	19706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070654
262	NC_020248	CGT	2	6	19802	19807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070654
263	NC_020248	TGC	2	6	19840	19845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070654
264	NC_020248	GTT	2	6	19878	19883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070654
265	NC_020248	GTT	2	6	20027	20032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070654
266	NC_020248	TAC	2	6	20086	20091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070654
267	NC_020248	ATC	2	6	20137	20142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070654
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269	NC_020248	AGA	2	6	20226	20231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070654
270	NC_020248	GTT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_020248	TCC	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_020248	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_020248	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_020248	AAT	2	6	20400	20405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_020248	AGT	2	6	20474	20479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070655
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279	NC_020248	CCT	2	6	20673	20678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070655
280	NC_020248	GCA	2	6	20790	20795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070655
281	NC_020248	TTC	2	6	20909	20914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070655
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290	NC_020248	AAG	2	6	21541	21546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070655
291	NC_020248	CTT	2	6	21574	21579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070655
292	NC_020248	TAA	2	6	21723	21728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_020248	TAA	2	6	21787	21792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_020248	TTA	2	6	21815	21820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070656
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333	NC_020248	TGA	3	9	23844	23852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
334	NC_020248	AAG	2	6	23889	23894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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374	NC_020248	ATT	2	6	26532	26537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
375	NC_020248	TTC	2	6	26611	26616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
376	NC_020248	TTA	2	6	26694	26699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070658
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378	NC_020248	TTA	2	6	26820	26825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070658
379	NC_020248	TGA	2	6	26906	26911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070658
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381	NC_020248	ACA	2	6	27110	27115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070658
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