MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 13874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020248	CGA	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070642
2	NC_020248	AGA	2	6	189	194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070642
3	NC_020248	CTT	2	6	226	231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070642
4	NC_020248	TCT	2	6	332	337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070642
5	NC_020248	TAT	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070642
6	NC_020248	ATG	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070642
7	NC_020248	TGT	2	6	641	646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070642
8	NC_020248	ATG	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070642
9	NC_020248	ACA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070642
10	NC_020248	AGC	2	6	965	970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070642
11	NC_020248	GTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070642
12	NC_020248	AGC	3	9	1001	1009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070642
13	NC_020248	CTA	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070642
14	NC_020248	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070642
15	NC_020248	CTT	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070642
16	NC_020248	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
17	NC_020248	ACA	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070643
18	NC_020248	ATG	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
19	NC_020248	TTA	2	6	1513	1518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070643
20	NC_020248	TAG	2	6	1577	1582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
21	NC_020248	TAG	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
22	NC_020248	CTA	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070643
23	NC_020248	TTC	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
24	NC_020248	ATA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070643
25	NC_020248	CTT	2	6	2057	2062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
26	NC_020248	GAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070643
27	NC_020248	TGA	2	6	2129	2134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
28	NC_020248	GAT	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070643
29	NC_020248	GTT	2	6	2183	2188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070643
30	NC_020248	CTT	2	6	2207	2212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070643
31	NC_020248	TAA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070643
32	NC_020248	GAA	2	6	2416	2421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070643
33	NC_020248	AGT	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070644
34	NC_020248	TTA	2	6	2658	2663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
35	NC_020248	TCC	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070644
36	NC_020248	TTC	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070644
37	NC_020248	TTA	2	6	2805	2810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
38	NC_020248	AGA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070644
39	NC_020248	TAT	2	6	2974	2979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
40	NC_020248	TAT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070644
41	NC_020248	GAA	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
42	NC_020248	ATG	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
43	NC_020248	AGT	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
44	NC_020248	CTT	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070645
45	NC_020248	CAA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070645
46	NC_020248	ATG	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
47	NC_020248	ATC	2	6	3781	3786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070645
48	NC_020248	TGG	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070645
49	NC_020248	AGA	2	6	4145	4150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
50	NC_020248	TAA	2	6	4211	4216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070645
51	NC_020248	GAA	2	6	4248	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
52	NC_020248	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070645
53	NC_020248	TAA	2	6	4315	4320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070645
54	NC_020248	AGA	2	6	4435	4440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
55	NC_020248	CTT	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070645
56	NC_020248	ATG	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
57	NC_020248	GAT	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070645
58	NC_020248	GCT	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070645
59	NC_020248	GAA	2	6	4811	4816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
60	NC_020248	AAG	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
61	NC_020248	TGG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070645
62	NC_020248	AAG	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
63	NC_020248	AGA	2	6	5114	5119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070645
64	NC_020248	TTA	2	6	5134	5139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070645
65	NC_020248	CAA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070645
66	NC_020248	AGA	2	6	5522	5527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070646
67	NC_020248	TGG	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070646
68	NC_020248	TAT	2	6	5623	5628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070646
69	NC_020248	GTT	2	6	5669	5674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
70	NC_020248	CAA	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070646
71	NC_020248	GAT	2	6	5712	5717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
72	NC_020248	TGT	2	6	5732	5737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
73	NC_020248	GGA	2	6	5754	5759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070646
74	NC_020248	CAA	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070646
75	NC_020248	TGA	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
76	NC_020248	GAT	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
77	NC_020248	TGT	3	9	5985	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
78	NC_020248	TGA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
79	NC_020248	GCT	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070646
80	NC_020248	TGC	2	6	6224	6229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070646
81	NC_020248	TGA	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070646
82	NC_020248	GAA	2	6	6276	6281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070646
83	NC_020248	GAG	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070646
84	NC_020248	TTC	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070646
85	NC_020248	CCT	2	6	6306	6311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070646
86	NC_020248	CTT	2	6	6352	6357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070646
87	NC_020248	GTT	2	6	6394	6399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070646
88	NC_020248	GAA	2	6	6911	6916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070647
89	NC_020248	CAT	2	6	6917	6922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070647
90	NC_020248	ACA	2	6	6935	6940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070647
91	NC_020248	GTG	2	6	6989	6994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070647
92	NC_020248	TGT	2	6	7014	7019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070647
93	NC_020248	TTC	2	6	7105	7110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070647
94	NC_020248	GTT	2	6	7116	7121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070647
95	NC_020248	CAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070647
96	NC_020248	AGA	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070647
97	NC_020248	TAA	2	6	7254	7259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070647
98	NC_020248	TTG	2	6	7303	7308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070647
99	NC_020248	CTC	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070647
100	NC_020248	GGA	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070647
101	NC_020248	TGA	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070647
102	NC_020248	ATT	2	6	7780	7785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070647
103	NC_020248	TGC	2	6	7858	7863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070647
104	NC_020248	TTC	2	6	7893	7898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070647
105	NC_020248	TTG	2	6	8055	8060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070648
106	NC_020248	TGC	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070648
107	NC_020248	AAG	2	6	8170	8175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
108	NC_020248	TTA	2	6	8254	8259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070648
109	NC_020248	CTT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070648
110	NC_020248	GAA	2	6	8344	8349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
111	NC_020248	TTC	2	6	8379	8384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070648
112	NC_020248	TTC	2	6	8504	8509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070648
113	NC_020248	AGG	2	6	8711	8716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070648
114	NC_020248	CCT	2	6	8768	8773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070648
115	NC_020248	AAG	2	6	8816	8821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
116	NC_020248	GTT	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070648
117	NC_020248	GAA	2	6	8890	8895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
118	NC_020248	CAT	2	6	8939	8944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070648
119	NC_020248	TTC	2	6	9024	9029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070648
120	NC_020248	GAA	2	6	9085	9090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
121	NC_020248	GAG	2	6	9146	9151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070648
122	NC_020248	AGT	2	6	9251	9256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070648
123	NC_020248	TTA	2	6	9443	9448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070648
124	NC_020248	AGA	2	6	9692	9697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
125	NC_020248	GTT	2	6	9738	9743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070648
126	NC_020248	CTT	2	6	9977	9982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070648
127	NC_020248	GCA	2	6	9998	10003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070648
128	NC_020248	CCA	2	6	10041	10046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070648
129	NC_020248	ATG	2	6	10139	10144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070648
130	NC_020248	TCT	2	6	10147	10152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070648
131	NC_020248	GAA	2	6	10255	10260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070648
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257	NC_020248	GAG	3	9	20602	20610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070655
258	NC_020248	CCT	2	6	20673	20678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070655
259	NC_020248	GCA	2	6	20790	20795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070655
260	NC_020248	TTC	2	6	20909	20914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070655
261	NC_020248	GTA	2	6	20920	20925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070655
262	NC_020248	GCA	2	6	20979	20984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070655
263	NC_020248	ATT	2	6	21018	21023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070655
264	NC_020248	GTT	2	6	21072	21077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070655
265	NC_020248	TAG	2	6	21235	21240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070655
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285	NC_020248	ATA	2	6	22621	22626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070656
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288	NC_020248	CAA	2	6	22705	22710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070656
289	NC_020248	GCG	2	6	22717	22722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449070656
290	NC_020248	GTG	4	12	22745	22756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070656
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298	NC_020248	AAG	2	6	23048	23053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070656
299	NC_020248	AAG	2	6	23075	23080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070656
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