MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020248	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020248	AG	3	6	17699	17704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020248	TC	3	6	31845	31850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020248	TC	3	6	37741	37746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020248	TA	3	6	52213	52218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020248	GA	3	6	61834	61839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020248	AG	3	6	62122	62127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020248	TC	3	6	62574	62579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020248	TG	3	6	63292	63297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020248	GT	3	6	68152	68157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020248	GA	3	6	78837	78842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020248	AG	3	6	79170	79175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020248	AG	3	6	81194	81199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020248	CT	3	6	81374	81379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020248	AC	3	6	81721	81726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020248	GA	3	6	97046	97051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020248	GA	3	6	98949	98954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020248	AG	3	6	101757	101762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020248	TC	3	6	108237	108242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020248	AG	3	6	112327	112332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020248	TA	3	6	114009	114014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020248	AT	3	6	123169	123174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020248	TA	4	8	124015	124022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020248	TA	4	8	125283	125290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020248	TG	4	8	128386	128393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020248	AC	3	6	128520	128525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020248	AT	3	6	130197	130202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020248	TA	3	6	130480	130485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020248	CT	3	6	130576	130581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020248	CT	3	6	130707	130712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020248	GA	3	6	134319	134324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020248	TC	3	6	154640	154645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020248	AG	3	6	158047	158052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020248	AG	3	6	169502	169507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020248	AG	3	6	169684	169689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020248	TA	3	6	173129	173134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020248	AG	3	6	173173	173178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020248	AT	3	6	175368	175373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020248	AG	3	6	179435	179440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020248	CT	3	6	193674	193679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020248	AC	3	6	199195	199200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020248	AT	3	6	208254	208259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020248	AT	3	6	210319	210324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020248	AT	3	6	215399	215404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020248	GA	3	6	215459	215464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020248	GT	3	6	215499	215504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020248	CT	3	6	215536	215541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020248	AG	3	6	215763	215768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020248	TC	3	6	215822	215827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020248	AG	3	6	222883	222888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020248	AT	3	6	228351	228356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020248	GA	3	6	231412	231417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020248	CG	3	6	231469	231474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020248	TA	4	8	232211	232218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020248	AG	3	6	236955	236960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020248	AT	3	6	237025	237030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020248	AG	3	6	241052	241057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020248	AG	3	6	244018	244023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020248	AG	3	6	253869	253874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020248	GT	3	6	261558	261563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020248	TC	3	6	266666	266671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020248	AT	4	8	266704	266711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020248	TC	3	6	267806	267811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020248	TG	3	6	267949	267954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020248	TG	3	6	276732	276737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020248	GT	3	6	277574	277579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020248	AG	3	6	281351	281356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020248	TC	3	6	282072	282077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020248	TA	3	6	282121	282126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020248	GT	3	6	297798	297803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020248	GA	3	6	298531	298536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020248	TG	3	6	298688	298693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020248	CA	3	6	299805	299810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020248	AT	3	6	301277	301282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020248	TC	3	6	301583	301588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020248	TG	3	6	307845	307850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020248	AC	3	6	310689	310694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020248	TA	3	6	310996	311001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020248	AT	3	6	311140	311145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020248	TA	3	6	311445	311450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020248	AG	3	6	312224	312229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020248	GA	3	6	312681	312686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020248	AG	3	6	313567	313572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020248	AG	3	6	313682	313687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020248	GA	3	6	313732	313737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020248	AC	3	6	319236	319241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020248	TC	3	6	319626	319631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020248	GA	3	6	319776	319781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020248	AG	3	6	320024	320029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020248	TG	3	6	320849	320854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020248	AC	3	6	321706	321711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020248	TA	3	6	321726	321731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020248	TG	3	6	324649	324654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020248	GA	3	6	324695	324700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020248	TA	3	6	327466	327471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020248	AG	3	6	327612	327617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020248	TC	3	6	337079	337084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020248	TA	3	6	339071	339076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020248	AC	3	6	339121	339126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020248	TA	3	6	340071	340076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020248	GT	3	6	342498	342503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020248	TG	3	6	344022	344027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020248	CT	3	6	345573	345578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020248	TA	3	6	345646	345651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020248	TA	3	6	347062	347067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020248	TA	3	6	351230	351235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020248	CT	4	8	353847	353854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020248	TA	3	6	357340	357345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020248	AT	3	6	362531	362536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020248	TA	3	6	365171	365176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020248	AG	3	6	366177	366182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020248	AT	3	6	369575	369580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020248	TG	3	6	369826	369831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020248	CT	3	6	371155	371160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020248	TA	3	6	381702	381707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020248	TA	3	6	396300	396305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020248	TA	3	6	407424	407429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020248	TC	3	6	416357	416362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020248	AG	3	6	417445	417450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020248	AT	3	6	417460	417465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020248	AG	3	6	417491	417496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020248	AT	3	6	420238	420243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020248	GA	3	6	424572	424577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020248	GA	3	6	433186	433191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020248	AG	3	6	433349	433354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020248	TA	3	6	434968	434973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020248	GA	3	6	435304	435309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020248	TC	3	6	439836	439841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020248	AG	3	6	441819	441824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020248	CT	3	6	441890	441895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020248	GA	3	6	442463	442468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020248	TA	3	6	443004	443009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020248	CT	3	6	444286	444291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020248	TC	3	6	449917	449922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020248	TG	3	6	455245	455250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020248	AG	3	6	455394	455399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020248	CT	4	8	458276	458283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020248	AG	3	6	465083	465088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020248	AG	3	6	471657	471662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020248	AC	3	6	474428	474433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020248	AG	3	6	474489	474494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020248	AG	3	6	475955	475960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020248	TA	3	6	476035	476040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020248	AT	3	6	476579	476584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020248	AG	3	6	476610	476615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020248	CT	3	6	482448	482453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020248	AG	4	8	484436	484443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020248	TC	3	6	486010	486015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020248	TA	3	6	488774	488779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020248	GA	3	6	499293	499298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020248	AG	3	6	501790	501795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020248	AG	3	6	502137	502142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020248	GT	3	6	505186	505191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.