MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I

Total Repeats: 894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020247	AAAC	2	8	3166	3173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020247	TATG	2	8	3634	3641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020247	ATAA	2	8	3690	3697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020247	ATGG	2	8	4143	4150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020247	CATA	2	8	4284	4291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020247	ACAA	2	8	7636	7643	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020247	CTAT	2	8	8255	8262	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020247	TGCC	2	8	14686	14693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020247	TTAG	2	8	18425	18432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020247	AACG	2	8	24211	24218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020247	TAAA	2	8	24256	24263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020247	CATA	2	8	24479	24486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020247	TGTT	2	8	25592	25599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020247	AAAT	2	8	29445	29452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020247	ACTC	2	8	32302	32309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020247	ATGA	2	8	32331	32338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020247	ATTC	2	8	34119	34126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020247	CTAG	2	8	48119	48126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020247	TTTA	2	8	48363	48370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020247	TACT	2	8	48696	48703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020247	TAGA	2	8	49329	49336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020247	TTTA	2	8	55657	55664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020247	GGAG	2	8	72324	72331	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020247	ATTT	2	8	72476	72483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020247	CTAA	2	8	72736	72743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020247	AAAT	2	8	76747	76754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020247	TAAA	2	8	80444	80451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020247	TAAA	2	8	84867	84874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020247	TAAA	2	8	89471	89478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020247	TTTA	2	8	89632	89639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020247	TATG	2	8	90882	90889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020247	CATT	2	8	94873	94880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020247	ATTT	2	8	99630	99637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020247	AGTA	2	8	101499	101506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020247	ATGT	2	8	103827	103834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020247	AATT	2	8	107323	107330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020247	TTAT	2	8	108756	108763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020247	ATAG	2	8	112088	112095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020247	AGTA	2	8	113626	113633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020247	AATA	2	8	120575	120582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020247	CCAT	2	8	120594	120601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020247	AAAG	2	8	128486	128493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020247	ATAA	2	8	130477	130484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020247	AAAT	2	8	132300	132307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020247	TTTG	2	8	157831	157838	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020247	AAAT	2	8	168669	168676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020247	AATT	2	8	168687	168694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020247	AGAA	2	8	168711	168718	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020247	ATTT	2	8	168759	168766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020247	ATAA	2	8	172563	172570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020247	ATTT	2	8	172623	172630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020247	AAAT	2	8	184133	184140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020247	TAAA	2	8	184153	184160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020247	CTCA	2	8	184892	184899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020247	AAGA	2	8	185904	185911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020247	CTAT	2	8	186080	186087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020247	CTTT	2	8	200895	200902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020247	AAAT	2	8	201605	201612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020247	ATGT	2	8	201616	201623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020247	TATT	2	8	201704	201711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020247	TTTA	2	8	204059	204066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020247	TTAT	2	8	206250	206257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020247	TTTA	2	8	206349	206356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020247	TAAA	2	8	208273	208280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020247	TATC	2	8	208742	208749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020247	AAAT	2	8	212840	212847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020247	AATT	2	8	214425	214432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020247	TTTC	2	8	217011	217018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020247	ATTA	2	8	227725	227732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020247	AGTT	2	8	243556	243563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020247	ATTT	2	8	244804	244811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020247	TAAA	2	8	245020	245027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020247	ATTT	2	8	245029	245036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020247	AAAT	2	8	248157	248164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020247	TAAA	2	8	248567	248574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020247	ATAA	2	8	248635	248642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020247	CTAA	2	8	248666	248673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020247	TAAC	2	8	252962	252969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020247	ATTG	2	8	253056	253063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020247	TAAA	2	8	253466	253473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020247	ATAA	2	8	254504	254511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020247	AAAT	2	8	257148	257155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020247	CTAA	2	8	257307	257314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020247	TTCC	2	8	258491	258498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020247	GATA	2	8	267698	267705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020247	TTTA	2	8	267719	267726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020247	GTAA	2	8	276610	276617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020247	ATTA	2	8	277365	277372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020247	TAAA	2	8	281807	281814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020247	TAAA	2	8	281819	281826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020247	TTAT	2	8	283171	283178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020247	AATA	2	8	287410	287417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020247	AAGT	2	8	295143	295150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020247	ATGT	2	8	295337	295344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020247	TATT	2	8	296888	296895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020247	TGTT	2	8	298588	298595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020247	AATA	2	8	301584	301591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020247	TAAG	2	8	303084	303091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020247	GAAA	2	8	305870	305877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020247	ATTA	2	8	306192	306199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020247	TTAA	2	8	311791	311798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020247	CTTT	2	8	315453	315460	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020247	TTTA	2	8	325204	325211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020247	AATT	2	8	329397	329404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020247	TAGA	2	8	331607	331614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020247	AGAA	2	8	332860	332867	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020247	AAAT	2	8	333856	333863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020247	TAAG	2	8	348394	348401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020247	TCTT	2	8	348417	348424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020247	TTAA	2	8	348433	348440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020247	ATTT	2	8	369633	369640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020247	TTAG	2	8	371578	371585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020247	TTAA	2	8	371784	371791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020247	AATA	2	8	371882	371889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020247	TAAA	2	8	371957	371964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020247	GTAC	2	8	376068	376075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020247	AGGG	2	8	383501	383508	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020247	TTAA	2	8	393996	394003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020247	TGAT	2	8	394009	394016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020247	ATGC	2	8	394725	394732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020247	TTAT	2	8	395061	395068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020247	AAAC	2	8	403335	403342	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020247	TTCT	2	8	403399	403406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020247	GAAA	2	8	403437	403444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020247	ACAA	2	8	403561	403568	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020247	CAAA	3	12	403573	403584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020247	TAGC	2	8	408185	408192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020247	AATA	2	8	408422	408429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020247	TAAC	2	8	410886	410893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020247	ATTT	2	8	411002	411009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020247	CCTT	2	8	411204	411211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020247	TGAC	2	8	413709	413716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020247	ATTT	2	8	415367	415374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020247	GCCC	2	8	415654	415661	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_020247	TATT	2	8	417166	417173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020247	TTTC	2	8	417674	417681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020247	GAAA	2	8	417887	417894	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020247	AAAG	2	8	424000	424007	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020247	AAAG	2	8	424286	424293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020247	TTAT	2	8	424611	424618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020247	TAAT	2	8	424867	424874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020247	ATAG	2	8	424965	424972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020247	CAAT	2	8	425030	425037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_020247	AGTT	2	8	425107	425114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020247	AGTG	2	8	425315	425322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020247	ATAA	2	8	425454	425461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020247	AGCT	2	8	425647	425654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020247	AAGA	2	8	430287	430294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020247	ATGT	2	8	430427	430434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020247	CTAA	2	8	435497	435504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_020247	TCAA	2	8	438198	438205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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