MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I

Total Repeats: 4108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020247	ATT	2	6	59	64	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020247	TCT	2	6	3070	3075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020247	TTA	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020247	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020247	TCT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020247	TTA	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020247	TTG	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020247	TTG	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020247	TAA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020247	AAC	2	6	4168	4173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020247	TTA	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020247	TAA	2	6	4237	4242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020247	AGA	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020247	GAA	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020247	AGA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020247	ATA	2	6	7711	7716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020247	TTA	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020247	TAC	2	6	8341	8346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020247	ATT	2	6	10146	10151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020247	ATA	2	6	10166	10171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020247	TCA	2	6	10192	10197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020247	ATA	2	6	12176	12181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020247	GAT	2	6	12239	12244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020247	ATA	2	6	14283	14288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020247	AAT	3	9	14697	14705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020247	AAT	2	6	14747	14752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020247	ACT	2	6	20081	20086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020247	TAT	2	6	24239	24244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020247	TAT	2	6	24272	24277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020247	ATA	2	6	24366	24371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020247	TGA	2	6	24467	24472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020247	TAT	2	6	24490	24495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020247	ATA	2	6	28065	28070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020247	ATT	2	6	29482	29487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020247	ATT	2	6	29495	29500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020247	TAA	2	6	29532	29537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020247	TAT	2	6	29602	29607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020247	CTT	2	6	32193	32198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020247	ATT	2	6	32252	32257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020247	ATT	2	6	33729	33734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020247	ATT	2	6	33753	33758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020247	AAT	2	6	33764	33769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020247	ATA	2	6	33795	33800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020247	ATA	2	6	33813	33818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020247	AAC	2	6	33882	33887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020247	ATT	2	6	34093	34098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020247	GTA	2	6	34176	34181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020247	ATT	2	6	34766	34771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020247	TTA	2	6	41071	41076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020247	TAT	2	6	41107	41112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020247	AAT	2	6	41562	41567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020247	CAA	2	6	41636	41641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020247	ATG	2	6	42139	42144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020247	ATG	2	6	42165	42170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020247	GCC	2	6	48038	48043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_020247	ACC	2	6	48060	48065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_020247	TTA	2	6	48135	48140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020247	TTG	2	6	48143	48148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020247	ATT	2	6	48267	48272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020247	AAT	2	6	48314	48319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020247	TTA	2	6	48656	48661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020247	TGA	2	6	49079	49084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020247	AAT	2	6	49156	49161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020247	ACC	2	6	49187	49192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_020247	ATC	2	6	49214	49219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020247	CAA	2	6	49223	49228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020247	ATC	2	6	49302	49307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020247	ATT	2	6	49393	49398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020247	ATA	2	6	51967	51972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020247	TAG	2	6	55670	55675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020247	AGT	2	6	60781	60786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020247	ATT	2	6	72161	72166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020247	ATC	2	6	72282	72287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020247	TCG	2	6	72402	72407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020247	AGG	2	6	72417	72422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020247	ATA	2	6	72560	72565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020247	TAA	2	6	72790	72795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020247	TCA	2	6	72796	72801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020247	ATT	2	6	72839	72844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020247	TCA	2	6	72874	72879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020247	TTA	2	6	72896	72901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020247	ATA	2	6	76766	76771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020247	ATA	2	6	76956	76961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020247	ATA	2	6	76970	76975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020247	TAA	2	6	77035	77040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020247	CTT	2	6	80984	80989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020247	TAA	2	6	81018	81023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020247	ATA	2	6	82651	82656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020247	TAA	3	9	84917	84925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020247	ATA	2	6	84996	85001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020247	GAA	2	6	86096	86101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020247	ATG	2	6	86121	86126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020247	GTT	2	6	86131	86136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020247	ATA	2	6	89304	89309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020247	AAT	2	6	89310	89315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020247	AGA	2	6	89373	89378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020247	ATT	2	6	89610	89615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020247	GTA	2	6	90737	90742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020247	TTA	2	6	90752	90757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020247	GTA	2	6	90781	90786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020247	AAT	2	6	90836	90841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020247	GGT	2	6	92799	92804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020247	TTA	2	6	92834	92839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020247	TGA	2	6	97326	97331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020247	ATG	2	6	97351	97356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020247	ATA	2	6	101923	101928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020247	AGT	2	6	103107	103112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020247	ATT	2	6	103155	103160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020247	TTA	2	6	103200	103205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020247	TTC	2	6	103646	103651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020247	AAT	2	6	103680	103685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020247	GTT	2	6	103693	103698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020247	ATT	2	6	103730	103735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020247	TAA	2	6	103741	103746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020247	TAA	2	6	107394	107399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020247	TAT	2	6	109657	109662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020247	AGG	2	6	109709	109714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020247	AAC	2	6	112037	112042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020247	AAT	2	6	112172	112177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020247	AAG	2	6	112247	112252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020247	TTA	2	6	119041	119046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020247	TAA	2	6	120453	120458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020247	ACT	2	6	120497	120502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020247	TAA	2	6	120514	120519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020247	GAG	2	6	120645	120650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020247	GAA	2	6	120667	120672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020247	CAG	2	6	120685	120690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020247	GAA	2	6	120803	120808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020247	TAA	2	6	120856	120861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020247	AAG	2	6	120882	120887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020247	GAA	2	6	120939	120944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020247	TCG	2	6	120951	120956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020247	TGT	2	6	120961	120966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020247	CCA	2	6	121167	121172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_020247	AGT	2	6	123988	123993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020247	TAC	2	6	125316	125321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020247	AGT	2	6	128478	128483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020247	TAT	2	6	128522	128527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020247	CTT	2	6	129985	129990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020247	TCA	2	6	130013	130018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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