MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sulfolobus acidocaldarius N8

Total Repeats: 29121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020246	ATT	2	6	59	64	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020246	AGG	2	6	336	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066048
3	NC_020246	AAG	2	6	344	349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066048
4	NC_020246	GAG	2	6	455	460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066048
5	NC_020246	TAG	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066048
6	NC_020246	ACT	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066048
7	NC_020246	ATG	2	6	717	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066048
8	NC_020246	TGC	2	6	808	813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066048
9	NC_020246	GCT	2	6	869	874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066048
10	NC_020246	ATA	2	6	926	931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066048
11	NC_020246	AGA	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066048
12	NC_020246	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066048
13	NC_020246	ATA	2	6	1145	1150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066048
14	NC_020246	GGA	2	6	1166	1171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066048
15	NC_020246	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066049
16	NC_020246	GAG	3	9	1326	1334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066049
17	NC_020246	TAT	3	9	1426	1434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066049
18	NC_020246	AGA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066049
19	NC_020246	TAG	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066049
20	NC_020246	ATT	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066050
21	NC_020246	AAT	2	6	1766	1771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066050
22	NC_020246	TAG	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066050
23	NC_020246	AGT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066050
24	NC_020246	ATA	3	9	1914	1922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066050
25	NC_020246	TGC	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066050
26	NC_020246	TAA	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066050
27	NC_020246	TGC	2	6	2159	2164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066050
28	NC_020246	ATT	2	6	2259	2264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066050
29	NC_020246	TAA	2	6	2371	2376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066050
30	NC_020246	TTA	2	6	2448	2453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066050
31	NC_020246	TGA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066050
32	NC_020246	TTA	2	6	2771	2776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066051
33	NC_020246	CAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066051
34	NC_020246	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066051
35	NC_020246	TTA	2	6	2932	2937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066051
36	NC_020246	ATA	2	6	2946	2951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066051
37	NC_020246	TCT	2	6	3070	3075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020246	TTA	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020246	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020246	TCT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020246	TTA	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020246	TAG	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066052
43	NC_020246	TTG	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020246	TTG	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020246	TAA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020246	AAT	2	6	3923	3928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066053
47	NC_020246	TCC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066053
48	NC_020246	AAC	2	6	4168	4173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020246	TTA	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020246	TAA	2	6	4237	4242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020246	AGA	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020246	ATA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066054
53	NC_020246	GAA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066054
54	NC_020246	ACT	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066055
55	NC_020246	TCT	2	6	4562	4567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066055
56	NC_020246	AAT	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066055
57	NC_020246	TCC	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066055
58	NC_020246	TCT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066055
59	NC_020246	TCT	2	6	4921	4926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066055
60	NC_020246	TTC	2	6	4927	4932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066055
61	NC_020246	CTT	2	6	5028	5033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066055
62	NC_020246	CTA	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066055
63	NC_020246	GTA	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066055
64	NC_020246	CTC	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066056
65	NC_020246	CTT	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066056
66	NC_020246	AGT	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066056
67	NC_020246	CTT	2	6	5734	5739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066056
68	NC_020246	AAT	2	6	5757	5762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066056
69	NC_020246	TCT	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066056
70	NC_020246	TGA	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066056
71	NC_020246	CAT	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066056
72	NC_020246	ATT	2	6	6352	6357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066057
73	NC_020246	TGG	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066057
74	NC_020246	ATG	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066057
75	NC_020246	ATA	2	6	6472	6477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066057
76	NC_020246	TTG	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066057
77	NC_020246	TCC	2	6	6596	6601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066057
78	NC_020246	GAT	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066057
79	NC_020246	AAT	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066057
80	NC_020246	AAT	2	6	6650	6655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066057
81	NC_020246	CTA	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066057
82	NC_020246	GAA	2	6	6714	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066057
83	NC_020246	TTA	2	6	6803	6808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066057
84	NC_020246	ATG	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066057
85	NC_020246	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066057
86	NC_020246	TCC	2	6	7005	7010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066057
87	NC_020246	TTC	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066057
88	NC_020246	GGT	2	6	7081	7086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066057
89	NC_020246	AGA	2	6	7246	7251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066057
90	NC_020246	GGA	2	6	7282	7287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066057
91	NC_020246	GTT	2	6	7386	7391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066057
92	NC_020246	AAT	2	6	7476	7481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066057
93	NC_020246	ATC	2	6	7491	7496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066057
94	NC_020246	TAT	4	12	7545	7556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066057
95	NC_020246	AGA	2	6	7568	7573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066057
96	NC_020246	GAA	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020246	AGA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020246	ATA	2	6	7711	7716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020246	CAT	2	6	7816	7821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066058
100	NC_020246	AAC	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066058
101	NC_020246	GAT	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066058
102	NC_020246	TTC	2	6	7964	7969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066058
103	NC_020246	TCT	2	6	7992	7997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066058
104	NC_020246	ATA	2	6	8006	8011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066058
105	NC_020246	TAT	2	6	8104	8109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066058
106	NC_020246	TTC	2	6	8151	8156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066058
107	NC_020246	TTA	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020246	TAC	2	6	8341	8346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020246	TAA	2	6	8408	8413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066059
110	NC_020246	TGG	2	6	8418	8423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066059
111	NC_020246	AAG	2	6	8441	8446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066059
112	NC_020246	GTA	2	6	8482	8487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066059
113	NC_020246	TTG	2	6	8497	8502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066059
114	NC_020246	TTC	2	6	8603	8608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066059
115	NC_020246	TGG	2	6	8672	8677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066059
116	NC_020246	TAC	2	6	8767	8772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066059
117	NC_020246	GAA	2	6	8778	8783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066059
118	NC_020246	GTT	2	6	8973	8978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066059
119	NC_020246	TCA	2	6	9098	9103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066060
120	NC_020246	CTC	2	6	9136	9141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066060
121	NC_020246	AGT	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066060
122	NC_020246	AAT	2	6	9236	9241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066060
123	NC_020246	TCC	2	6	9263	9268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066060
124	NC_020246	CAG	2	6	9321	9326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066060
125	NC_020246	ACT	2	6	9410	9415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066060
126	NC_020246	AAG	2	6	9582	9587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066061
127	NC_020246	ATT	2	6	9672	9677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066061
128	NC_020246	CTC	2	6	9769	9774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066061
129	NC_020246	ATC	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066061
130	NC_020246	GAA	2	6	9802	9807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066061
131	NC_020246	AAT	3	9	9828	9836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066061
132	NC_020246	TTC	2	6	9889	9894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066061
133	NC_020246	TGA	3	9	10009	10017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066061
134	NC_020246	TTA	2	6	10078	10083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066061
135	NC_020246	ATT	3	9	10089	10097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066061
136	NC_020246	CAT	2	6	10124	10129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066061
137	NC_020246	ATT	2	6	10146	10151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020246	ATA	2	6	10166	10171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020246	TCA	2	6	10192	10197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020246	AGA	2	6	10245	10250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066062
141	NC_020246	CTA	2	6	10254	10259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066062
142	NC_020246	CAG	2	6	10344	10349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066062
143	NC_020246	AAG	2	6	10350	10355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066062
144	NC_020246	AAT	2	6	10774	10779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066062
145	NC_020246	TGA	2	6	10861	10866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066062
146	NC_020246	CTC	2	6	10890	10895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066062
147	NC_020246	AAT	2	6	11082	11087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066063
148	NC_020246	AAG	2	6	11101	11106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066063
149	NC_020246	GTT	2	6	11151	11156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066063
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153	NC_020246	TTC	2	6	11443	11448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066063
154	NC_020246	ATT	2	6	11685	11690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066063
155	NC_020246	TAG	2	6	11749	11754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066064
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158	NC_020246	ATA	2	6	12176	12181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020246	GAT	2	6	12239	12244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020246	TAA	2	6	12302	12307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066065
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162	NC_020246	CTT	2	6	12610	12615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066065
163	NC_020246	TAG	2	6	12659	12664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066065
164	NC_020246	TAG	2	6	12732	12737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066065
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192	NC_020246	AAT	2	6	14634	14639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066068
193	NC_020246	AAT	3	9	14697	14705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_020246	AAT	2	6	14747	14752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_020246	ATA	2	6	14853	14858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066069
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258	NC_020246	ACT	2	6	19023	19028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066073
259	NC_020246	CAA	2	6	19165	19170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066073
260	NC_020246	TGC	2	6	19178	19183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066073
261	NC_020246	GTG	2	6	19209	19214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066073
262	NC_020246	AAT	2	6	19241	19246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066073
263	NC_020246	TTG	2	6	19248	19253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066073
264	NC_020246	ATA	2	6	19297	19302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066073
265	NC_020246	TCT	2	6	19445	19450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066073
266	NC_020246	AAT	2	6	19497	19502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066073
267	NC_020246	TCC	2	6	19511	19516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066073
268	NC_020246	AAC	2	6	19517	19522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066073
269	NC_020246	TCT	2	6	19533	19538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066073
270	NC_020246	ACT	2	6	19629	19634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066073
271	NC_020246	AAT	2	6	19675	19680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066074
272	NC_020246	TTG	2	6	19809	19814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066074
273	NC_020246	AAT	2	6	19960	19965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066074
274	NC_020246	ACT	2	6	20081	20086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_020246	TTA	2	6	20106	20111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066075
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277	NC_020246	ATG	2	6	20241	20246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066075
278	NC_020246	GGT	2	6	20249	20254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066075
279	NC_020246	ATA	2	6	20367	20372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066075
280	NC_020246	AGG	2	6	20395	20400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066075
281	NC_020246	ATA	2	6	20447	20452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066075
282	NC_020246	TAC	2	6	20504	20509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066075
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284	NC_020246	TAG	2	6	20553	20558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066075
285	NC_020246	GAG	3	9	20559	20567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066075
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287	NC_020246	ATA	2	6	20760	20765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066075
288	NC_020246	AGG	2	6	20772	20777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066075
289	NC_020246	TAA	3	9	20802	20810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066075
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291	NC_020246	AAG	2	6	21014	21019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066075
292	NC_020246	TAT	2	6	21163	21168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066076
293	NC_020246	TTA	2	6	21285	21290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066076
294	NC_020246	TTG	2	6	21343	21348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066076
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300	NC_020246	ACT	2	6	21926	21931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066076
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303	NC_020246	ATC	2	6	22297	22302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066077
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333	NC_020246	TAT	2	6	24239	24244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_020246	TAT	2	6	24272	24277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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336	NC_020246	TGA	2	6	24467	24472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
337	NC_020246	TAT	2	6	24490	24495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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346	NC_020246	CTC	2	6	25231	25236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066082
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353	NC_020246	ATT	2	6	25814	25819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066083
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363	NC_020246	ATT	2	6	26372	26377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066083
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367	NC_020246	TCA	2	6	26949	26954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066084
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369	NC_020246	TAA	2	6	27070	27075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066085
370	NC_020246	CTA	2	6	27089	27094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066085
371	NC_020246	TAG	2	6	27150	27155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066085
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373	NC_020246	ATA	2	6	27324	27329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066085
374	NC_020246	ACT	2	6	27472	27477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066085
375	NC_020246	TTA	2	6	27545	27550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066085
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377	NC_020246	CTC	2	6	27570	27575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066085
378	NC_020246	TCA	2	6	27821	27826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066086
379	NC_020246	ATT	2	6	27878	27883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066086
380	NC_020246	CCA	2	6	27927	27932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066086
381	NC_020246	ATA	2	6	28065	28070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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