MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Korea 1168P

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020245	CGTCGG	2	12	66728	66739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020245	CAACGG	2	12	76250	76261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020245	TCACCT	2	12	80470	80481	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020245	GCCGCG	2	12	181162	181173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020245	GGTCGC	2	12	343322	343333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020245	ATAGTC	2	12	544120	544131	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020245	ACCAGT	2	12	592130	592141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020245	CGCCGT	2	12	721144	721155	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020245	CTAGTC	2	12	761580	761591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020245	CCGGCG	2	12	865273	865284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020245	ACCGGG	2	12	871994	872005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020245	GCGGCC	2	12	908883	908894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020245	ACAGCA	2	12	910256	910267	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020245	CATCGT	2	12	914076	914087	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020245	CTGGGT	2	12	925094	925105	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020245	CAGTCG	2	12	932905	932916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020245	TCGGGT	2	12	966363	966374	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020245	CAACGG	2	12	1030166	1030177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020245	GATCGA	2	12	1030217	1030228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020245	GACTGC	2	12	1034621	1034632	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020245	CGCCGG	2	12	1053487	1053498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020245	GGCGCA	2	12	1095285	1095296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020245	TTCCGT	2	12	1163297	1163308	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020245	TAGCCA	2	12	1197881	1197892	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020245	AGGCCA	2	12	1341347	1341358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020245	TCGACA	2	12	1368799	1368810	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020245	CCGAGT	2	12	1416779	1416790	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020245	CACGCG	2	12	1521852	1521863	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020245	ATATTC	2	12	1556883	1556894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020245	GCCCCT	2	12	1629998	1630009	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_020245	GCCCCT	2	12	1633495	1633506	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_020245	CGAGTG	2	12	1765581	1765592	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020245	GGCGCC	2	12	1811806	1811817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020245	TAGCGG	2	12	1902597	1902608	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020245	ACCGCA	2	12	1904533	1904544	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020245	GGTGAT	2	12	2012900	2012911	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020245	TTCGGC	2	12	2026809	2026820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020245	AGAGGG	2	12	2046943	2046954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020245	ACCGTG	2	12	2113425	2113436	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020245	GCTGGG	2	12	2116056	2116067	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020245	CGCGAG	2	12	2148334	2148345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020245	CGGCTC	2	12	2211459	2211470	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020245	ATAGAA	2	12	2316743	2316754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020245	CTCAAC	2	12	2359235	2359246	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020245	CCGCTG	2	12	2379716	2379727	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020245	CACCGC	2	12	2388174	2388185	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_020245	GCGTCG	2	12	2440659	2440670	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020245	CACGTG	2	12	2650195	2650206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020245	GAGGTC	2	12	2653810	2653821	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020245	CCGGCA	2	12	2667839	2667850	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020245	TCAAAC	2	12	2727778	2727789	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020245	GCACCC	2	12	2755838	2755849	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_020245	CGACGG	2	12	2804775	2804786	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020245	GCCCGA	2	12	2811869	2811880	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020245	GTATTG	2	12	2850302	2850313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020245	CCGTTG	2	12	2860247	2860258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020245	GGCGCC	2	12	2879927	2879938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020245	GGTGTG	2	12	2896787	2896798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020245	CATATT	2	12	2938412	2938423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020245	CCGGCA	2	12	3002253	3002264	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020245	GACATC	2	12	3045302	3045313	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020245	ACGGCG	2	12	3046853	3046864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020245	GTCAAT	2	12	3063430	3063441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020245	TCGCCG	2	12	3215069	3215080	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020245	TCGCCG	2	12	3215126	3215137	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020245	TCGCCG	2	12	3215183	3215194	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020245	TCGCCG	2	12	3215240	3215251	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020245	TCGCCG	2	12	3215297	3215308	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020245	CGCCAC	2	12	3231319	3231330	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020245	CGCCGG	2	12	3234693	3234704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020245	CGTAGG	2	12	3304884	3304895	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020245	TGTACA	2	12	3354135	3354146	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020245	ACCAAC	2	12	3359484	3359495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020245	CCGTTG	2	12	3381182	3381193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020245	GCTCCT	2	12	3408784	3408795	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020245	CTGTCA	2	12	3423496	3423507	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020245	GTGCCG	2	12	3522529	3522540	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020245	GCCTCC	2	12	3562022	3562033	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_020245	GTGCCG	2	12	3621681	3621692	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020245	GTGCCG	2	12	3657844	3657855	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020245	GCGCAG	2	12	3771430	3771441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020245	TGTACA	2	12	3790778	3790789	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_020245	TCCTCT	2	12	3867053	3867064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020245	TCGGAG	2	12	3890620	3890631	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020245	CCGCTC	2	12	3894649	3894660	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020245	CGTTGG	2	12	3907289	3907300	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020245	CGGCCG	2	12	3911429	3911440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020245	GGCGAG	2	12	4086146	4086157	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020245	TGGCGG	2	12	4173719	4173730	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020245	GGGTTG	2	12	4298526	4298537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.