MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus subtilis XF-1

Total Repeats: 3165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020244	ATACC	2	10	113	122	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020244	ACAGC	2	10	4248	4257	40 %	0 %	20 %	40 %	449092718
3	NC_020244	AGTGA	2	10	4754	4763	40 %	20 %	40 %	0 %	449092718
4	NC_020244	AAGGG	2	10	6037	6046	40 %	0 %	60 %	0 %	449092720
5	NC_020244	TTACC	2	10	7997	8006	20 %	40 %	0 %	40 %	449092721
6	NC_020244	CTGGA	2	10	8676	8685	20 %	20 %	40 %	20 %	449092721
7	NC_020244	TCGTG	2	10	11103	11112	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020244	GGACG	2	10	11976	11985	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020244	TTTCT	2	10	15100	15109	0 %	80 %	0 %	20 %	449092722
10	NC_020244	CTTGT	2	10	15334	15343	0 %	60 %	20 %	20 %	449092722
11	NC_020244	ATAAA	2	10	15790	15799	80 %	20 %	0 %	0 %	449092722
12	NC_020244	TTTCT	2	10	16099	16108	0 %	80 %	0 %	20 %	449092723
13	NC_020244	CTTGT	2	10	16333	16342	0 %	60 %	20 %	20 %	449092723
14	NC_020244	ATAAA	2	10	16789	16798	80 %	20 %	0 %	0 %	449092723
15	NC_020244	TAAAG	2	10	17385	17394	60 %	20 %	20 %	0 %	449092724
16	NC_020244	AAAGC	2	10	22135	22144	60 %	0 %	20 %	20 %	449092728
17	NC_020244	TGCTG	2	10	22269	22278	0 %	40 %	40 %	20 %	449092728
18	NC_020244	GGAAA	2	10	25139	25148	60 %	0 %	40 %	0 %	449092731
19	NC_020244	GGTGC	2	10	27143	27152	0 %	20 %	60 %	20 %	449092733
20	NC_020244	GAAAT	2	10	29041	29050	60 %	20 %	20 %	0 %	449092734
21	NC_020244	GAAGC	2	10	30877	30886	40 %	0 %	40 %	20 %	449092737
22	NC_020244	GAAAA	2	10	31323	31332	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020244	TCGTG	2	10	32570	32579	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020244	GGACG	2	10	33443	33452	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020244	TCGAT	2	10	37494	37503	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020244	ATGAT	2	10	37968	37977	40 %	40 %	20 %	0 %	449092739
27	NC_020244	CTGAA	2	10	38331	38340	40 %	20 %	20 %	20 %	449092739
28	NC_020244	TGATT	2	10	38392	38401	20 %	60 %	20 %	0 %	449092739
29	NC_020244	AACTG	2	10	39106	39115	40 %	20 %	20 %	20 %	449092740
30	NC_020244	ATTTT	2	10	39555	39564	20 %	80 %	0 %	0 %	449092740
31	NC_020244	CAACA	2	10	42779	42788	60 %	0 %	0 %	40 %	449092744
32	NC_020244	AGATT	2	10	44187	44196	40 %	40 %	20 %	0 %	449092747
33	NC_020244	GACAT	2	10	45251	45260	40 %	20 %	20 %	20 %	449092749
34	NC_020244	TGACA	2	10	49156	49165	40 %	20 %	20 %	20 %	449092752
35	NC_020244	ATAGG	2	10	49801	49810	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020244	GAAAG	2	10	50559	50568	60 %	0 %	40 %	0 %	449092753
37	NC_020244	GAAGA	2	10	50614	50623	60 %	0 %	40 %	0 %	449092753
38	NC_020244	CAAAG	2	10	50785	50794	60 %	0 %	20 %	20 %	449092753
39	NC_020244	GAAAA	2	10	53349	53358	80 %	0 %	20 %	0 %	449092756
40	NC_020244	GAATT	2	10	54879	54888	40 %	40 %	20 %	0 %	449092759
41	NC_020244	AGGTG	2	10	58443	58452	20 %	20 %	60 %	0 %	449092763
42	NC_020244	TGAAG	2	10	58617	58626	40 %	20 %	40 %	0 %	449092763
43	NC_020244	CATCT	2	10	58679	58688	20 %	40 %	0 %	40 %	449092763
44	NC_020244	GCCAA	2	10	60420	60429	40 %	0 %	20 %	40 %	449092765
45	NC_020244	GGAAT	2	10	60843	60852	40 %	20 %	40 %	0 %	449092766
46	NC_020244	ACTTC	2	10	61887	61896	20 %	40 %	0 %	40 %	449092768
47	NC_020244	GGAAG	2	10	62681	62690	40 %	0 %	60 %	0 %	449092768
48	NC_020244	AACGG	2	10	63846	63855	40 %	0 %	40 %	20 %	449092768
49	NC_020244	AAAGA	2	10	63960	63969	80 %	0 %	20 %	0 %	449092768
50	NC_020244	GAAGA	2	10	64842	64851	60 %	0 %	40 %	0 %	449092768
51	NC_020244	GGTCG	2	10	65385	65394	0 %	20 %	60 %	20 %	449092769
52	NC_020244	ACAAA	2	10	70658	70667	80 %	0 %	0 %	20 %	449092775
53	NC_020244	CTTGG	2	10	72523	72532	0 %	40 %	40 %	20 %	449092777
54	NC_020244	TGGAA	2	10	75113	75122	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020244	ATGAA	2	10	75819	75828	60 %	20 %	20 %	0 %	449092779
56	NC_020244	ATGAA	2	10	76882	76891	60 %	20 %	20 %	0 %	449092780
57	NC_020244	TTATT	2	10	78259	78268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020244	AAAGT	2	10	80290	80299	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020244	GGGCG	2	10	80767	80776	0 %	0 %	80 %	20 %	449092783
60	NC_020244	TTAAA	2	10	83061	83070	60 %	40 %	0 %	0 %	449092786
61	NC_020244	TTGAA	2	10	88400	88409	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020244	ATGCG	2	10	89241	89250	20 %	20 %	40 %	20 %	449092794
63	NC_020244	CGAGA	2	10	89829	89838	40 %	0 %	40 %	20 %	449092794
64	NC_020244	TCGTG	2	10	92883	92892	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020244	GGACG	2	10	93576	93585	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020244	AATAG	2	10	97310	97319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020244	TCGTG	2	10	98739	98748	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020244	GGACG	2	10	99432	99441	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020244	TATAA	2	10	102552	102561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020244	GAACA	2	10	105151	105160	60 %	0 %	20 %	20 %	449092799
71	NC_020244	GCTGA	2	10	107959	107968	20 %	20 %	40 %	20 %	449092800
72	NC_020244	TGTCT	2	10	109314	109323	0 %	60 %	20 %	20 %	449092801
73	NC_020244	ATTGA	2	10	109423	109432	40 %	40 %	20 %	0 %	449092801
74	NC_020244	AAAAG	2	10	109479	109488	80 %	0 %	20 %	0 %	449092801
75	NC_020244	CTTAT	2	10	110226	110235	20 %	60 %	0 %	20 %	449092802
76	NC_020244	CAAGA	2	10	110429	110438	60 %	0 %	20 %	20 %	449092802
77	NC_020244	ACATG	2	10	112289	112298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_020244	AGAAA	2	10	114696	114705	80 %	0 %	20 %	0 %	449092806
79	NC_020244	ACCAA	2	10	116240	116249	60 %	0 %	0 %	40 %	449092808
80	NC_020244	TACAG	2	10	116423	116432	40 %	20 %	20 %	20 %	449092808
81	NC_020244	GACAG	2	10	116729	116738	40 %	0 %	40 %	20 %	449092809
82	NC_020244	GAAAC	2	10	117263	117272	60 %	0 %	20 %	20 %	449092809
83	NC_020244	TGAAA	2	10	118339	118348	60 %	20 %	20 %	0 %	449092811
84	NC_020244	TGACA	2	10	121082	121091	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020244	TTACG	2	10	121203	121212	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020244	TAATC	2	10	121828	121837	40 %	40 %	0 %	20 %	449092816
87	NC_020244	TTGAA	2	10	121928	121937	40 %	40 %	20 %	0 %	449092817
88	NC_020244	ACGAT	2	10	123976	123985	40 %	20 %	20 %	20 %	449092819
89	NC_020244	CGTAA	2	10	125456	125465	40 %	20 %	20 %	20 %	449092819
90	NC_020244	AACTG	2	10	125740	125749	40 %	20 %	20 %	20 %	449092819
91	NC_020244	GTGAA	2	10	126907	126916	40 %	20 %	40 %	0 %	449092820
92	NC_020244	GCAAA	2	10	128858	128867	60 %	0 %	20 %	20 %	449092820
93	NC_020244	ATCAA	2	10	129117	129126	60 %	20 %	0 %	20 %	449092820
94	NC_020244	GTAAA	2	10	130372	130381	60 %	20 %	20 %	0 %	449092820
95	NC_020244	CAATT	2	10	132434	132443	40 %	40 %	0 %	20 %	449092824
96	NC_020244	TTTCA	2	10	136264	136273	20 %	60 %	0 %	20 %	449092826
97	NC_020244	CAAAA	2	10	136685	136694	80 %	0 %	0 %	20 %	449092827
98	NC_020244	AATCA	2	10	138012	138021	60 %	20 %	0 %	20 %	449092829
99	NC_020244	AAAGT	2	10	141289	141298	60 %	20 %	20 %	0 %	449092835
100	NC_020244	CAAAC	2	10	145282	145291	60 %	0 %	0 %	40 %	449092844
101	NC_020244	GAAAC	2	10	147105	147114	60 %	0 %	20 %	20 %	449092846
102	NC_020244	TAAAT	2	10	148133	148142	60 %	40 %	0 %	0 %	449092848
103	NC_020244	ATGGA	2	10	153858	153867	40 %	20 %	40 %	0 %	449092857
104	NC_020244	TTGTG	2	10	155091	155100	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020244	TGCTT	2	10	155870	155879	0 %	60 %	20 %	20 %	449092860
106	NC_020244	TTGGG	2	10	156036	156045	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020244	TCCAT	2	10	157022	157031	20 %	40 %	0 %	40 %	449092861
108	NC_020244	GGAGC	2	10	158344	158353	20 %	0 %	60 %	20 %	449092863
109	NC_020244	AAAGC	2	10	158448	158457	60 %	0 %	20 %	20 %	449092863
110	NC_020244	ATCCA	2	10	158525	158534	40 %	20 %	0 %	40 %	449092863
111	NC_020244	TCGTG	2	10	163289	163298	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_020244	GGACG	2	10	163982	163991	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020244	AATTG	2	10	167374	167383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020244	AATAG	2	10	167468	167477	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020244	TCGTG	2	10	168897	168906	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020244	GGACG	2	10	169590	169599	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020244	TCGTG	2	10	173894	173903	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020244	GGACG	2	10	174586	174595	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020244	CAATA	2	10	178140	178149	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020244	TTTTC	2	10	178181	178190	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020244	TAAAA	2	10	178202	178211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020244	CTTGC	2	10	184420	184429	0 %	40 %	20 %	40 %	449092873
123	NC_020244	TGCGA	2	10	185133	185142	20 %	20 %	40 %	20 %	449092874
124	NC_020244	CTGTC	2	10	185577	185586	0 %	40 %	20 %	40 %	449092874
125	NC_020244	GTTTT	2	10	185687	185696	0 %	80 %	20 %	0 %	449092874
126	NC_020244	TTGTT	2	10	186407	186416	0 %	80 %	20 %	0 %	449092875
127	NC_020244	AATGG	2	10	187018	187027	40 %	20 %	40 %	0 %	449092875
128	NC_020244	GATTT	2	10	188123	188132	20 %	60 %	20 %	0 %	449092876
129	NC_020244	TCCAT	2	10	189822	189831	20 %	40 %	0 %	40 %	449092877
130	NC_020244	TTCCG	2	10	189840	189849	0 %	40 %	20 %	40 %	449092877
131	NC_020244	TGCAA	2	10	190556	190565	40 %	20 %	20 %	20 %	449092877
132	NC_020244	GAAAG	2	10	191099	191108	60 %	0 %	40 %	0 %	449092878
133	NC_020244	AATTG	2	10	191388	191397	40 %	40 %	20 %	0 %	449092878
134	NC_020244	GCTTT	2	10	192220	192229	0 %	60 %	20 %	20 %	449092878
135	NC_020244	CCCCT	2	10	192356	192365	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
136	NC_020244	TTATT	2	10	192376	192385	20 %	80 %	0 %	0 %	449092879
137	NC_020244	AAAAC	2	10	192462	192471	80 %	0 %	0 %	20 %	449092879
138	NC_020244	TGCTT	2	10	195236	195245	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_020244	ATAAA	2	10	195255	195264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020244	CTGAG	2	10	197652	197661	20 %	20 %	40 %	20 %	449092885
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142	NC_020244	CTTGT	2	10	201159	201168	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_020244	AGCGG	2	10	339319	339328	20 %	0 %	60 %	20 %	449093014
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264	NC_020244	ATCGA	2	10	359608	359617	40 %	20 %	20 %	20 %	449093029
265	NC_020244	TTATC	2	10	362680	362689	20 %	60 %	0 %	20 %	449093033
266	NC_020244	AGCTG	2	10	363430	363439	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_020244	ATTCC	2	10	364318	364327	20 %	40 %	0 %	40 %	449093035
268	NC_020244	GATCT	2	10	366837	366846	20 %	40 %	20 %	20 %	449093038
269	NC_020244	CTTTC	2	10	367341	367350	0 %	60 %	0 %	40 %	449093038
270	NC_020244	TGACA	2	10	367560	367569	40 %	20 %	20 %	20 %	449093038
271	NC_020244	GCTGA	2	10	371973	371982	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
272	NC_020244	ACCGG	2	10	372769	372778	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
273	NC_020244	ATTTG	2	10	373724	373733	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020244	ATTTG	2	10	374522	374531	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
275	NC_020244	GCATT	2	10	377176	377185	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
276	NC_020244	AATAC	2	10	377698	377707	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
277	NC_020244	GTACC	2	10	378983	378992	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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279	NC_020244	GACGA	2	10	385359	385368	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
280	NC_020244	TTGCA	2	10	388351	388360	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
281	NC_020244	TAAAA	2	10	391771	391780	80 %	20 %	0 %	0 %	449093045
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301	NC_020244	ATCAG	2	10	420106	420115	40 %	20 %	20 %	20 %	449093071
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342	NC_020244	CGCTG	2	10	499519	499528	0 %	20 %	40 %	40 %	449093150
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365	NC_020244	CAGTA	2	10	527712	527721	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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367	NC_020244	CAGTA	2	10	528043	528052	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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369	NC_020244	AAAGA	2	10	528429	528438	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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375	NC_020244	TATGT	2	10	533296	533305	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_020244	ACAAA	2	10	534296	534305	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
380	NC_020244	AATTA	2	10	534755	534764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
381	NC_020244	TTTAC	2	10	534917	534926	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
382	NC_020244	GATTC	2	10	536755	536764	20 %	40 %	20 %	20 %	449093185
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384	NC_020244	CTTTT	2	10	539707	539716	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
385	NC_020244	TTCAT	2	10	542346	542355	20 %	60 %	0 %	20 %	449093190
386	NC_020244	ATCAA	2	10	544017	544026	60 %	20 %	0 %	20 %	449093191
387	NC_020244	AAATC	2	10	544071	544080	60 %	20 %	0 %	20 %	449093191
388	NC_020244	TTATG	2	10	546449	546458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
389	NC_020244	ATAAA	2	10	546552	546561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_020244	ATTGA	2	10	547064	547073	40 %	40 %	20 %	0 %	449093192
391	NC_020244	GCCCA	2	10	548808	548817	20 %	0 %	20 %	60 %	449093194
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393	NC_020244	TTATT	2	10	553539	553548	20 %	80 %	0 %	0 %	449093198
394	NC_020244	TGAAG	2	10	553894	553903	40 %	20 %	40 %	0 %	449093198
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396	NC_020244	GACTA	2	10	556024	556033	40 %	20 %	20 %	20 %	449093201
397	NC_020244	CCACG	2	10	556970	556979	20 %	0 %	20 %	60 %	449093202
398	NC_020244	TTTCG	2	10	557951	557960	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
399	NC_020244	TCCTG	2	10	558299	558308	0 %	40 %	20 %	40 %	449093204
400	NC_020244	TCAAA	2	10	559906	559915	60 %	20 %	0 %	20 %	449093206
401	NC_020244	CTCTT	2	10	561028	561037	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
402	NC_020244	TTTTA	2	10	561068	561077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_020244	GATAT	2	10	563200	563209	40 %	40 %	20 %	0 %	449093210
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