MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT7

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020243	ACA	2	6	113	118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020243	AGT	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020243	ATC	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020243	TGC	2	6	643	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020243	ATC	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020243	CAC	2	6	740	745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_020243	TTC	2	6	834	839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086549
8	NC_020243	TCA	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086550
9	NC_020243	TAA	2	6	1014	1019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086550
10	NC_020243	TTC	2	6	1298	1303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086550
11	NC_020243	ATA	2	6	1427	1432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086550
12	NC_020243	TGT	2	6	1447	1452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086550
13	NC_020243	TGA	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086550
14	NC_020243	AAT	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086550
15	NC_020243	TTA	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086550
16	NC_020243	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086550
17	NC_020243	CAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086550
18	NC_020243	TCT	2	6	1849	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086550
19	NC_020243	CCG	2	6	2056	2061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449086550
20	NC_020243	ATT	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086551
21	NC_020243	AAC	2	6	2309	2314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086551
22	NC_020243	ATA	3	9	2620	2628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086552
23	NC_020243	ACA	2	6	2643	2648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086552
24	NC_020243	AAG	2	6	2665	2670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086552
25	NC_020243	AGG	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020243	ACT	2	6	2906	2911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020243	GAA	2	6	2954	2959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020243	GGA	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020243	TTA	2	6	3228	3233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020243	CAA	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020243	ATT	2	6	3311	3316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020243	GTA	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020243	GAA	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020243	TCA	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020243	TAT	2	6	3615	3620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020243	CCT	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020243	ATT	2	6	3691	3696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086553
38	NC_020243	ACA	2	6	3720	3725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086553
39	NC_020243	ATC	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086553
40	NC_020243	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086553
41	NC_020243	GTT	2	6	3979	3984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020243	AAT	2	6	3990	3995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020243	CTT	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086554
44	NC_020243	TGT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086554
45	NC_020243	TCA	3	9	4123	4131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086554
46	NC_020243	ATC	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086554
47	NC_020243	AGA	2	6	4419	4424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086554
48	NC_020243	TCT	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086554
49	NC_020243	GAC	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086554
50	NC_020243	TTG	2	6	4608	4613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086554
51	NC_020243	AAC	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086554
52	NC_020243	ACA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086554
53	NC_020243	ACA	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086554
54	NC_020243	AAT	2	6	5100	5105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086554
55	NC_020243	CTT	2	6	5222	5227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086554
56	NC_020243	CCG	2	6	5306	5311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_020243	GAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020243	CAT	2	6	5511	5516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020243	CTC	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_020243	ACT	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086555
61	NC_020243	GTG	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020243	TCA	2	6	6060	6065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020243	CCA	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_020243	TCA	2	6	6333	6338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020243	ATT	2	6	6373	6378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020243	TAC	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020243	GTT	2	6	6672	6677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020243	ATT	2	6	6867	6872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020243	TTG	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020243	AAC	2	6	7124	7129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020243	ACT	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020243	ACT	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020243	TAA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020243	TCA	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020243	CAT	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020243	TAA	2	6	7612	7617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.