MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT8_1

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020241	TTG	2	6	98	103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092660
2	NC_020241	ATG	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092660
3	NC_020241	TTA	2	6	407	412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092661
4	NC_020241	ATA	2	6	916	921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092662
5	NC_020241	TAA	2	6	965	970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092662
6	NC_020241	TCT	2	6	993	998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092662
7	NC_020241	GAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092662
8	NC_020241	AAT	2	6	1090	1095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092662
9	NC_020241	TAG	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092663
10	NC_020241	ATT	2	6	1601	1606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
11	NC_020241	ATT	2	6	1641	1646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
12	NC_020241	AAC	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092664
13	NC_020241	AGA	3	9	1694	1702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
14	NC_020241	TAT	2	6	1719	1724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
15	NC_020241	TAT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
16	NC_020241	AGA	2	6	1925	1930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
17	NC_020241	TGA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092664
18	NC_020241	TAT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
19	NC_020241	TCA	2	6	1994	1999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092664
20	NC_020241	TTA	2	6	2004	2009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
21	NC_020241	AGA	2	6	2135	2140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
22	NC_020241	TAA	2	6	2159	2164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092664
23	NC_020241	TCT	2	6	2264	2269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092664
24	NC_020241	AAG	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
25	NC_020241	TTA	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
26	NC_020241	GAA	2	6	2532	2537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
27	NC_020241	GAA	2	6	2556	2561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
28	NC_020241	TTA	2	6	2619	2624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
29	NC_020241	ATG	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092664
30	NC_020241	ACA	2	6	2684	2689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092665
31	NC_020241	AAT	2	6	2711	2716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092665
32	NC_020241	ATG	2	6	2730	2735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092665
33	NC_020241	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092665
34	NC_020241	CAA	2	6	2759	2764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092665
35	NC_020241	AAT	2	6	2881	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
36	NC_020241	GGA	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092666
37	NC_020241	AAT	2	6	3016	3021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
38	NC_020241	AAC	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092666
39	NC_020241	ATA	2	6	3052	3057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
40	NC_020241	GAA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092666
41	NC_020241	TTG	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092666
42	NC_020241	TAA	2	6	3186	3191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
43	NC_020241	ATG	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092666
44	NC_020241	ACA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092666
45	NC_020241	TGG	2	6	3348	3353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092666
46	NC_020241	AAG	2	6	3386	3391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092666
47	NC_020241	TTA	2	6	3456	3461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092666
48	NC_020241	ATT	2	6	3614	3619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092667
49	NC_020241	TAG	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092667
50	NC_020241	TTG	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092670
51	NC_020241	TAG	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092670
52	NC_020241	GTG	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092670
53	NC_020241	CGG	2	6	4949	4954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449092671
54	NC_020241	ATT	2	6	5157	5162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092672
55	NC_020241	TGT	2	6	5285	5290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092672
56	NC_020241	TTG	2	6	5291	5296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092672
57	NC_020241	TGA	2	6	5435	5440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092672
58	NC_020241	GTG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092672
59	NC_020241	ACA	2	6	5648	5653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092672
60	NC_020241	AGA	2	6	5660	5665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092672
61	NC_020241	GTC	2	6	5837	5842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449092672
62	NC_020241	AGA	2	6	5855	5860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092672
63	NC_020241	TGA	3	9	6131	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092672
64	NC_020241	GAA	2	6	6183	6188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092672
65	NC_020241	CAA	2	6	6189	6194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092672
66	NC_020241	GAG	2	6	6621	6626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092673
67	NC_020241	AGA	2	6	6809	6814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092674
68	NC_020241	AGA	3	9	6890	6898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092674
69	NC_020241	GGA	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092674
70	NC_020241	GAT	2	6	6987	6992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092674
71	NC_020241	GAC	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092674
72	NC_020241	TAA	2	6	7092	7097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092674
73	NC_020241	TCA	2	6	7190	7195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092674
74	NC_020241	GAA	2	6	7198	7203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092674
75	NC_020241	AAC	2	6	7210	7215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092674
76	NC_020241	ATT	2	6	7325	7330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092674
77	NC_020241	AAG	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092674
78	NC_020241	AAG	2	6	7508	7513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092674
79	NC_020241	GTC	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449092674
80	NC_020241	ATT	2	6	7569	7574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092674
81	NC_020241	ATT	2	6	7643	7648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092674
82	NC_020241	TAT	3	9	7798	7806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092675
83	NC_020241	ATT	2	6	7912	7917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092675

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.