MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pAW63

Total Repeats: 246

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020240	CTTT	2	8	308	315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020240	CCTT	2	8	640	647	0 %	50 %	0 %	50 %	449086378
3	NC_020240	TTAA	2	8	907	914	50 %	50 %	0 %	0 %	449086378
4	NC_020240	CTTC	2	8	1055	1062	0 %	50 %	0 %	50 %	449086378
5	NC_020240	ATTT	2	8	1228	1235	25 %	75 %	0 %	0 %	449086379
6	NC_020240	ACGT	2	8	2080	2087	25 %	25 %	25 %	25 %	449086380
7	NC_020240	TATT	2	8	2269	2276	25 %	75 %	0 %	0 %	449086380
8	NC_020240	TTGA	2	8	2352	2359	25 %	50 %	25 %	0 %	449086380
9	NC_020240	TAAA	2	8	2513	2520	75 %	25 %	0 %	0 %	449086380
10	NC_020240	CCTT	2	8	2525	2532	0 %	50 %	0 %	50 %	449086380
11	NC_020240	CCTT	2	8	2554	2561	0 %	50 %	0 %	50 %	449086380
12	NC_020240	ATTC	2	8	2562	2569	25 %	50 %	0 %	25 %	449086380
13	NC_020240	TTTC	2	8	2659	2666	0 %	75 %	0 %	25 %	449086381
14	NC_020240	TACC	2	8	2805	2812	25 %	25 %	0 %	50 %	449086381
15	NC_020240	TCCT	2	8	2866	2873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020240	ATTT	2	8	2879	2886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020240	TAGT	2	8	2908	2915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020240	CTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	0 %	25 %	449086382
19	NC_020240	TCTT	2	8	3454	3461	0 %	75 %	0 %	25 %	449086382
20	NC_020240	ATTT	2	8	3553	3560	25 %	75 %	0 %	0 %	449086382
21	NC_020240	TGAC	2	8	3702	3709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020240	CATA	2	8	3897	3904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020240	CATC	2	8	3931	3938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020240	GTTT	2	8	4549	4556	0 %	75 %	25 %	0 %	449086383
25	NC_020240	ATGA	2	8	4590	4597	50 %	25 %	25 %	0 %	449086383
26	NC_020240	ATTT	2	8	4802	4809	25 %	75 %	0 %	0 %	449086383
27	NC_020240	ATTG	2	8	4980	4987	25 %	50 %	25 %	0 %	449086383
28	NC_020240	TATC	2	8	6053	6060	25 %	50 %	0 %	25 %	449086383
29	NC_020240	ATTT	2	8	6170	6177	25 %	75 %	0 %	0 %	449086383
30	NC_020240	AAAC	2	8	6329	6336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020240	CATG	2	8	6809	6816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020240	ACTT	2	8	7388	7395	25 %	50 %	0 %	25 %	449086384
33	NC_020240	TGAA	3	12	8235	8246	50 %	25 %	25 %	0 %	449086384
34	NC_020240	AAAT	2	8	8545	8552	75 %	25 %	0 %	0 %	449086384
35	NC_020240	TTTC	2	8	8770	8777	0 %	75 %	0 %	25 %	449086384
36	NC_020240	TCCA	2	8	10244	10251	25 %	25 %	0 %	50 %	449086386
37	NC_020240	TTAT	2	8	10378	10385	25 %	75 %	0 %	0 %	449086387
38	NC_020240	TGAA	2	8	10834	10841	50 %	25 %	25 %	0 %	449086387
39	NC_020240	ATAA	2	8	10890	10897	75 %	25 %	0 %	0 %	449086387
40	NC_020240	CTTT	2	8	11060	11067	0 %	75 %	0 %	25 %	449086387
41	NC_020240	TTCT	2	8	11594	11601	0 %	75 %	0 %	25 %	449086388
42	NC_020240	ATTG	2	8	12393	12400	25 %	50 %	25 %	0 %	449086388
43	NC_020240	ATTT	2	8	12515	12522	25 %	75 %	0 %	0 %	449086388
44	NC_020240	GTTT	2	8	12605	12612	0 %	75 %	25 %	0 %	449086388
45	NC_020240	GTTT	2	8	12785	12792	0 %	75 %	25 %	0 %	449086388
46	NC_020240	GTTT	2	8	12875	12882	0 %	75 %	25 %	0 %	449086388
47	NC_020240	GTTT	2	8	12965	12972	0 %	75 %	25 %	0 %	449086388
48	NC_020240	TTTC	2	8	13256	13263	0 %	75 %	0 %	25 %	449086388
49	NC_020240	AGAT	2	8	13643	13650	50 %	25 %	25 %	0 %	449086388
50	NC_020240	TAAT	2	8	13661	13668	50 %	50 %	0 %	0 %	449086388
51	NC_020240	AAAC	2	8	13678	13685	75 %	0 %	0 %	25 %	449086388
52	NC_020240	TAAA	2	8	13919	13926	75 %	25 %	0 %	0 %	449086388
53	NC_020240	ATTT	2	8	14034	14041	25 %	75 %	0 %	0 %	449086388
54	NC_020240	ATTC	2	8	14187	14194	25 %	50 %	0 %	25 %	449086388
55	NC_020240	ACCC	2	8	14408	14415	25 %	0 %	0 %	75 %	449086388
56	NC_020240	ATCC	2	8	14656	14663	25 %	25 %	0 %	50 %	449086388
57	NC_020240	TGTA	2	8	15274	15281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020240	AGGA	2	8	15282	15289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020240	ATCT	2	8	15468	15475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020240	TTTC	2	8	15651	15658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020240	GCTT	2	8	15659	15666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020240	CTTT	2	8	16044	16051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020240	ATTC	2	8	16575	16582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020240	GAAA	2	8	17007	17014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020240	TACA	2	8	17377	17384	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020240	TCCC	2	8	17509	17516	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_020240	TTGA	2	8	17884	17891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020240	ATCA	2	8	17912	17919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020240	ATCA	2	8	19057	19064	50 %	25 %	0 %	25 %	449086389
70	NC_020240	TCTT	2	8	19136	19143	0 %	75 %	0 %	25 %	449086389
71	NC_020240	CTCA	2	8	19561	19568	25 %	25 %	0 %	50 %	449086389
72	NC_020240	TCTT	2	8	19615	19622	0 %	75 %	0 %	25 %	449086389
73	NC_020240	AGTA	2	8	20221	20228	50 %	25 %	25 %	0 %	449086389
74	NC_020240	ATAC	2	8	20690	20697	50 %	25 %	0 %	25 %	449086390
75	NC_020240	GACA	2	8	20986	20993	50 %	0 %	25 %	25 %	449086391
76	NC_020240	CTTT	2	8	21041	21048	0 %	75 %	0 %	25 %	449086391
77	NC_020240	AGGT	2	8	21348	21355	25 %	25 %	50 %	0 %	449086392
78	NC_020240	ATTA	2	8	21880	21887	50 %	50 %	0 %	0 %	449086393
79	NC_020240	TTTC	2	8	22999	23006	0 %	75 %	0 %	25 %	449086394
80	NC_020240	TTTA	2	8	23181	23188	25 %	75 %	0 %	0 %	449086394
81	NC_020240	TCTT	2	8	24212	24219	0 %	75 %	0 %	25 %	449086395
82	NC_020240	AATC	2	8	24241	24248	50 %	25 %	0 %	25 %	449086395
83	NC_020240	TTAA	2	8	24368	24375	50 %	50 %	0 %	0 %	449086395
84	NC_020240	CTTT	2	8	24658	24665	0 %	75 %	0 %	25 %	449086396
85	NC_020240	TACT	2	8	24679	24686	25 %	50 %	0 %	25 %	449086396
86	NC_020240	CTCG	2	8	24915	24922	0 %	25 %	25 %	50 %	449086396
87	NC_020240	CAAA	2	8	25065	25072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020240	AAAC	2	8	25151	25158	75 %	0 %	0 %	25 %	449086397
89	NC_020240	ACTG	2	8	25164	25171	25 %	25 %	25 %	25 %	449086397
90	NC_020240	CCTA	2	8	25345	25352	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020240	GCTC	2	8	25389	25396	0 %	25 %	25 %	50 %	449086398
92	NC_020240	ACCA	2	8	25787	25794	50 %	0 %	0 %	50 %	449086399
93	NC_020240	TAAA	2	8	26075	26082	75 %	25 %	0 %	0 %	449086399
94	NC_020240	TAAC	2	8	26290	26297	50 %	25 %	0 %	25 %	449086399
95	NC_020240	TACT	2	8	26741	26748	25 %	50 %	0 %	25 %	449086399
96	NC_020240	ATTC	2	8	26906	26913	25 %	50 %	0 %	25 %	449086399
97	NC_020240	ACCA	2	8	27249	27256	50 %	0 %	0 %	50 %	449086399
98	NC_020240	ATTG	2	8	27777	27784	25 %	50 %	25 %	0 %	449086399
99	NC_020240	TAGT	2	8	29254	29261	25 %	50 %	25 %	0 %	449086399
100	NC_020240	TCAT	2	8	29338	29345	25 %	50 %	0 %	25 %	449086399
101	NC_020240	GTTT	2	8	29546	29553	0 %	75 %	25 %	0 %	449086399
102	NC_020240	CCGT	2	8	29869	29876	0 %	25 %	25 %	50 %	449086399
103	NC_020240	TAAA	2	8	30136	30143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020240	TTTA	2	8	30182	30189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020240	AAAT	2	8	30907	30914	75 %	25 %	0 %	0 %	449086401
106	NC_020240	ATGT	2	8	30953	30960	25 %	50 %	25 %	0 %	449086401
107	NC_020240	AATA	2	8	31019	31026	75 %	25 %	0 %	0 %	449086401
108	NC_020240	GTAA	2	8	31215	31222	50 %	25 %	25 %	0 %	449086402
109	NC_020240	TGTT	2	8	31478	31485	0 %	75 %	25 %	0 %	449086402
110	NC_020240	CTTT	2	8	31551	31558	0 %	75 %	0 %	25 %	449086402
111	NC_020240	TTCA	2	8	31918	31925	25 %	50 %	0 %	25 %	449086403
112	NC_020240	TAAA	2	8	32569	32576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020240	TCCA	2	8	32863	32870	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020240	TATT	2	8	32878	32885	25 %	75 %	0 %	0 %	449086405
115	NC_020240	CTTT	2	8	32893	32900	0 %	75 %	0 %	25 %	449086405
116	NC_020240	CATA	2	8	33096	33103	50 %	25 %	0 %	25 %	449086405
117	NC_020240	ATAC	2	8	33127	33134	50 %	25 %	0 %	25 %	449086405
118	NC_020240	ATCT	2	8	33199	33206	25 %	50 %	0 %	25 %	449086405
119	NC_020240	TTAC	2	8	33377	33384	25 %	50 %	0 %	25 %	449086406
120	NC_020240	ATCC	2	8	33390	33397	25 %	25 %	0 %	50 %	449086406
121	NC_020240	CAAC	2	8	33605	33612	50 %	0 %	0 %	50 %	449086406
122	NC_020240	ATTA	2	8	33888	33895	50 %	50 %	0 %	0 %	449086408
123	NC_020240	ATTA	2	8	34486	34493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020240	CAAA	2	8	34494	34501	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020240	TGCT	2	8	34909	34916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020240	ATTA	2	8	34920	34927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020240	TAAT	2	8	35853	35860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020240	ATTA	2	8	35863	35870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020240	CAAA	2	8	35871	35878	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020240	ATAA	2	8	37014	37021	75 %	25 %	0 %	0 %	449086414
131	NC_020240	CATT	2	8	37230	37237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020240	CAAA	2	8	37290	37297	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020240	ACTA	2	8	37493	37500	50 %	25 %	0 %	25 %	449086415
134	NC_020240	AGAA	2	8	37586	37593	75 %	0 %	25 %	0 %	449086415
135	NC_020240	TCGG	2	8	37944	37951	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020240	CATC	2	8	38589	38596	25 %	25 %	0 %	50 %	449086416
137	NC_020240	TTCA	2	8	39399	39406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020240	TACT	2	8	41235	41242	25 %	50 %	0 %	25 %	449086419
139	NC_020240	ATAC	2	8	41314	41321	50 %	25 %	0 %	25 %	449086419
140	NC_020240	TCTT	2	8	41597	41604	0 %	75 %	0 %	25 %	449086419
141	NC_020240	AGCT	2	8	41988	41995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020240	GTTT	2	8	42374	42381	0 %	75 %	25 %	0 %	449086420
143	NC_020240	CCAC	2	8	42511	42518	25 %	0 %	0 %	75 %	449086420
144	NC_020240	AAAG	2	8	42700	42707	75 %	0 %	25 %	0 %	449086420
145	NC_020240	TTTG	2	8	42736	42743	0 %	75 %	25 %	0 %	449086420
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.