MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pAW63

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020240	CTTT	2	8	308	315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020240	TCCT	2	8	2866	2873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020240	ATTT	2	8	2879	2886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020240	TAGT	2	8	2908	2915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020240	TGAC	2	8	3702	3709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020240	CATA	2	8	3897	3904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020240	CATC	2	8	3931	3938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020240	AAAC	2	8	6329	6336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020240	CATG	2	8	6809	6816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020240	TGTA	2	8	15274	15281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020240	AGGA	2	8	15282	15289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020240	ATCT	2	8	15468	15475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020240	TTTC	2	8	15651	15658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020240	GCTT	2	8	15659	15666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020240	CTTT	2	8	16044	16051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020240	ATTC	2	8	16575	16582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020240	GAAA	2	8	17007	17014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020240	TACA	2	8	17377	17384	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020240	TCCC	2	8	17509	17516	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_020240	TTGA	2	8	17884	17891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020240	ATCA	2	8	17912	17919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020240	CAAA	2	8	25065	25072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020240	CCTA	2	8	25345	25352	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020240	TAAA	2	8	30136	30143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020240	TTTA	2	8	30182	30189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020240	TAAA	2	8	32569	32576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020240	TCCA	2	8	32863	32870	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020240	ATTA	2	8	34486	34493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020240	CAAA	2	8	34494	34501	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020240	TGCT	2	8	34909	34916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020240	ATTA	2	8	34920	34927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020240	TAAT	2	8	35853	35860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020240	ATTA	2	8	35863	35870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020240	CAAA	2	8	35871	35878	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020240	CATT	2	8	37230	37237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020240	CAAA	2	8	37290	37297	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020240	TCGG	2	8	37944	37951	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020240	TTCA	2	8	39399	39406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020240	AGCT	2	8	41988	41995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020240	AATT	2	8	44262	44269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020240	TAAT	2	8	48562	48569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020240	TAAA	2	8	48621	48628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020240	AATG	2	8	48778	48785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020240	AATA	2	8	49526	49533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020240	AAAC	2	8	49540	49547	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020240	AATA	2	8	49548	49555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020240	CGTT	2	8	49574	49581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020240	AAAT	2	8	50429	50436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020240	TTTA	2	8	51306	51313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020240	AAAC	2	8	51651	51658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020240	TTTA	2	8	51812	51819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020240	TAAA	2	8	52161	52168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020240	TGCT	2	8	53600	53607	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020240	ATTT	2	8	54580	54587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020240	CTTA	2	8	54634	54641	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020240	AAAC	2	8	54679	54686	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020240	TATG	2	8	55952	55959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020240	TTTC	2	8	55978	55985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020240	TAAT	2	8	56179	56186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020240	TATT	2	8	56245	56252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020240	ATCA	2	8	56993	57000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020240	AAAT	2	8	57017	57024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020240	AAAG	2	8	57246	57253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020240	ATTT	2	8	64711	64718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020240	CTTT	2	8	65302	65309	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020240	ATAA	2	8	70703	70710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.