MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pAW63

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020240	CCTT	2	8	640	647	0 %	50 %	0 %	50 %	449086378
2	NC_020240	TTAA	2	8	907	914	50 %	50 %	0 %	0 %	449086378
3	NC_020240	CTTC	2	8	1055	1062	0 %	50 %	0 %	50 %	449086378
4	NC_020240	ATTT	2	8	1228	1235	25 %	75 %	0 %	0 %	449086379
5	NC_020240	ACGT	2	8	2080	2087	25 %	25 %	25 %	25 %	449086380
6	NC_020240	TATT	2	8	2269	2276	25 %	75 %	0 %	0 %	449086380
7	NC_020240	TTGA	2	8	2352	2359	25 %	50 %	25 %	0 %	449086380
8	NC_020240	TAAA	2	8	2513	2520	75 %	25 %	0 %	0 %	449086380
9	NC_020240	CCTT	2	8	2525	2532	0 %	50 %	0 %	50 %	449086380
10	NC_020240	CCTT	2	8	2554	2561	0 %	50 %	0 %	50 %	449086380
11	NC_020240	ATTC	2	8	2562	2569	25 %	50 %	0 %	25 %	449086380
12	NC_020240	TTTC	2	8	2659	2666	0 %	75 %	0 %	25 %	449086381
13	NC_020240	TACC	2	8	2805	2812	25 %	25 %	0 %	50 %	449086381
14	NC_020240	CTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	0 %	25 %	449086382
15	NC_020240	TCTT	2	8	3454	3461	0 %	75 %	0 %	25 %	449086382
16	NC_020240	ATTT	2	8	3553	3560	25 %	75 %	0 %	0 %	449086382
17	NC_020240	GTTT	2	8	4549	4556	0 %	75 %	25 %	0 %	449086383
18	NC_020240	ATGA	2	8	4590	4597	50 %	25 %	25 %	0 %	449086383
19	NC_020240	ATTT	2	8	4802	4809	25 %	75 %	0 %	0 %	449086383
20	NC_020240	ATTG	2	8	4980	4987	25 %	50 %	25 %	0 %	449086383
21	NC_020240	TATC	2	8	6053	6060	25 %	50 %	0 %	25 %	449086383
22	NC_020240	ATTT	2	8	6170	6177	25 %	75 %	0 %	0 %	449086383
23	NC_020240	ACTT	2	8	7388	7395	25 %	50 %	0 %	25 %	449086384
24	NC_020240	TGAA	3	12	8235	8246	50 %	25 %	25 %	0 %	449086384
25	NC_020240	AAAT	2	8	8545	8552	75 %	25 %	0 %	0 %	449086384
26	NC_020240	TTTC	2	8	8770	8777	0 %	75 %	0 %	25 %	449086384
27	NC_020240	TCCA	2	8	10244	10251	25 %	25 %	0 %	50 %	449086386
28	NC_020240	TTAT	2	8	10378	10385	25 %	75 %	0 %	0 %	449086387
29	NC_020240	TGAA	2	8	10834	10841	50 %	25 %	25 %	0 %	449086387
30	NC_020240	ATAA	2	8	10890	10897	75 %	25 %	0 %	0 %	449086387
31	NC_020240	CTTT	2	8	11060	11067	0 %	75 %	0 %	25 %	449086387
32	NC_020240	TTCT	2	8	11594	11601	0 %	75 %	0 %	25 %	449086388
33	NC_020240	ATTG	2	8	12393	12400	25 %	50 %	25 %	0 %	449086388
34	NC_020240	ATTT	2	8	12515	12522	25 %	75 %	0 %	0 %	449086388
35	NC_020240	GTTT	2	8	12605	12612	0 %	75 %	25 %	0 %	449086388
36	NC_020240	GTTT	2	8	12785	12792	0 %	75 %	25 %	0 %	449086388
37	NC_020240	GTTT	2	8	12875	12882	0 %	75 %	25 %	0 %	449086388
38	NC_020240	GTTT	2	8	12965	12972	0 %	75 %	25 %	0 %	449086388
39	NC_020240	TTTC	2	8	13256	13263	0 %	75 %	0 %	25 %	449086388
40	NC_020240	AGAT	2	8	13643	13650	50 %	25 %	25 %	0 %	449086388
41	NC_020240	TAAT	2	8	13661	13668	50 %	50 %	0 %	0 %	449086388
42	NC_020240	AAAC	2	8	13678	13685	75 %	0 %	0 %	25 %	449086388
43	NC_020240	TAAA	2	8	13919	13926	75 %	25 %	0 %	0 %	449086388
44	NC_020240	ATTT	2	8	14034	14041	25 %	75 %	0 %	0 %	449086388
45	NC_020240	ATTC	2	8	14187	14194	25 %	50 %	0 %	25 %	449086388
46	NC_020240	ACCC	2	8	14408	14415	25 %	0 %	0 %	75 %	449086388
47	NC_020240	ATCC	2	8	14656	14663	25 %	25 %	0 %	50 %	449086388
48	NC_020240	ATCA	2	8	19057	19064	50 %	25 %	0 %	25 %	449086389
49	NC_020240	TCTT	2	8	19136	19143	0 %	75 %	0 %	25 %	449086389
50	NC_020240	CTCA	2	8	19561	19568	25 %	25 %	0 %	50 %	449086389
51	NC_020240	TCTT	2	8	19615	19622	0 %	75 %	0 %	25 %	449086389
52	NC_020240	AGTA	2	8	20221	20228	50 %	25 %	25 %	0 %	449086389
53	NC_020240	ATAC	2	8	20690	20697	50 %	25 %	0 %	25 %	449086390
54	NC_020240	GACA	2	8	20986	20993	50 %	0 %	25 %	25 %	449086391
55	NC_020240	CTTT	2	8	21041	21048	0 %	75 %	0 %	25 %	449086391
56	NC_020240	AGGT	2	8	21348	21355	25 %	25 %	50 %	0 %	449086392
57	NC_020240	ATTA	2	8	21880	21887	50 %	50 %	0 %	0 %	449086393
58	NC_020240	TTTC	2	8	22999	23006	0 %	75 %	0 %	25 %	449086394
59	NC_020240	TTTA	2	8	23181	23188	25 %	75 %	0 %	0 %	449086394
60	NC_020240	TCTT	2	8	24212	24219	0 %	75 %	0 %	25 %	449086395
61	NC_020240	AATC	2	8	24241	24248	50 %	25 %	0 %	25 %	449086395
62	NC_020240	TTAA	2	8	24368	24375	50 %	50 %	0 %	0 %	449086395
63	NC_020240	CTTT	2	8	24658	24665	0 %	75 %	0 %	25 %	449086396
64	NC_020240	TACT	2	8	24679	24686	25 %	50 %	0 %	25 %	449086396
65	NC_020240	CTCG	2	8	24915	24922	0 %	25 %	25 %	50 %	449086396
66	NC_020240	AAAC	2	8	25151	25158	75 %	0 %	0 %	25 %	449086397
67	NC_020240	ACTG	2	8	25164	25171	25 %	25 %	25 %	25 %	449086397
68	NC_020240	GCTC	2	8	25389	25396	0 %	25 %	25 %	50 %	449086398
69	NC_020240	ACCA	2	8	25787	25794	50 %	0 %	0 %	50 %	449086399
70	NC_020240	TAAA	2	8	26075	26082	75 %	25 %	0 %	0 %	449086399
71	NC_020240	TAAC	2	8	26290	26297	50 %	25 %	0 %	25 %	449086399
72	NC_020240	TACT	2	8	26741	26748	25 %	50 %	0 %	25 %	449086399
73	NC_020240	ATTC	2	8	26906	26913	25 %	50 %	0 %	25 %	449086399
74	NC_020240	ACCA	2	8	27249	27256	50 %	0 %	0 %	50 %	449086399
75	NC_020240	ATTG	2	8	27777	27784	25 %	50 %	25 %	0 %	449086399
76	NC_020240	TAGT	2	8	29254	29261	25 %	50 %	25 %	0 %	449086399
77	NC_020240	TCAT	2	8	29338	29345	25 %	50 %	0 %	25 %	449086399
78	NC_020240	GTTT	2	8	29546	29553	0 %	75 %	25 %	0 %	449086399
79	NC_020240	CCGT	2	8	29869	29876	0 %	25 %	25 %	50 %	449086399
80	NC_020240	AAAT	2	8	30907	30914	75 %	25 %	0 %	0 %	449086401
81	NC_020240	ATGT	2	8	30953	30960	25 %	50 %	25 %	0 %	449086401
82	NC_020240	AATA	2	8	31019	31026	75 %	25 %	0 %	0 %	449086401
83	NC_020240	GTAA	2	8	31215	31222	50 %	25 %	25 %	0 %	449086402
84	NC_020240	TGTT	2	8	31478	31485	0 %	75 %	25 %	0 %	449086402
85	NC_020240	CTTT	2	8	31551	31558	0 %	75 %	0 %	25 %	449086402
86	NC_020240	TTCA	2	8	31918	31925	25 %	50 %	0 %	25 %	449086403
87	NC_020240	TATT	2	8	32878	32885	25 %	75 %	0 %	0 %	449086405
88	NC_020240	CTTT	2	8	32893	32900	0 %	75 %	0 %	25 %	449086405
89	NC_020240	CATA	2	8	33096	33103	50 %	25 %	0 %	25 %	449086405
90	NC_020240	ATAC	2	8	33127	33134	50 %	25 %	0 %	25 %	449086405
91	NC_020240	ATCT	2	8	33199	33206	25 %	50 %	0 %	25 %	449086405
92	NC_020240	TTAC	2	8	33377	33384	25 %	50 %	0 %	25 %	449086406
93	NC_020240	ATCC	2	8	33390	33397	25 %	25 %	0 %	50 %	449086406
94	NC_020240	CAAC	2	8	33605	33612	50 %	0 %	0 %	50 %	449086406
95	NC_020240	ATTA	2	8	33888	33895	50 %	50 %	0 %	0 %	449086408
96	NC_020240	ATAA	2	8	37014	37021	75 %	25 %	0 %	0 %	449086414
97	NC_020240	ACTA	2	8	37493	37500	50 %	25 %	0 %	25 %	449086415
98	NC_020240	AGAA	2	8	37586	37593	75 %	0 %	25 %	0 %	449086415
99	NC_020240	CATC	2	8	38589	38596	25 %	25 %	0 %	50 %	449086416
100	NC_020240	TACT	2	8	41235	41242	25 %	50 %	0 %	25 %	449086419
101	NC_020240	ATAC	2	8	41314	41321	50 %	25 %	0 %	25 %	449086419
102	NC_020240	TCTT	2	8	41597	41604	0 %	75 %	0 %	25 %	449086419
103	NC_020240	GTTT	2	8	42374	42381	0 %	75 %	25 %	0 %	449086420
104	NC_020240	CCAC	2	8	42511	42518	25 %	0 %	0 %	75 %	449086420
105	NC_020240	AAAG	2	8	42700	42707	75 %	0 %	25 %	0 %	449086420
106	NC_020240	TTTG	2	8	42736	42743	0 %	75 %	25 %	0 %	449086420
107	NC_020240	CATG	2	8	44523	44530	25 %	25 %	25 %	25 %	449086421
108	NC_020240	TATT	2	8	44571	44578	25 %	75 %	0 %	0 %	449086421
109	NC_020240	GATT	2	8	44958	44965	25 %	50 %	25 %	0 %	449086421
110	NC_020240	TTGA	2	8	45531	45538	25 %	50 %	25 %	0 %	449086422
111	NC_020240	TTGT	2	8	46886	46893	0 %	75 %	25 %	0 %	449086424
112	NC_020240	GTAA	2	8	47130	47137	50 %	25 %	25 %	0 %	449086424
113	NC_020240	TCCG	2	8	47249	47256	0 %	25 %	25 %	50 %	449086424
114	NC_020240	CTGA	2	8	47348	47355	25 %	25 %	25 %	25 %	449086424
115	NC_020240	ATTT	2	8	47519	47526	25 %	75 %	0 %	0 %	449086424
116	NC_020240	TCAC	2	8	48015	48022	25 %	25 %	0 %	50 %	449086424
117	NC_020240	TTCC	2	8	48058	48065	0 %	50 %	0 %	50 %	449086424
118	NC_020240	CATC	2	8	48136	48143	25 %	25 %	0 %	50 %	449086424
119	NC_020240	GATT	2	8	48177	48184	25 %	50 %	25 %	0 %	449086424
120	NC_020240	AGCT	2	8	48253	48260	25 %	25 %	25 %	25 %	449086424
121	NC_020240	TTCC	2	8	48942	48949	0 %	50 %	0 %	50 %	449086425
122	NC_020240	ATTT	2	8	48974	48981	25 %	75 %	0 %	0 %	449086425
123	NC_020240	CTTT	2	8	48982	48989	0 %	75 %	0 %	25 %	449086425
124	NC_020240	TTCT	2	8	49303	49310	0 %	75 %	0 %	25 %	449086425
125	NC_020240	TAAA	2	8	49962	49969	75 %	25 %	0 %	0 %	449086426
126	NC_020240	AAGA	2	8	50032	50039	75 %	0 %	25 %	0 %	449086427
127	NC_020240	CAAA	2	8	50486	50493	75 %	0 %	0 %	25 %	449086428
128	NC_020240	AATT	2	8	50766	50773	50 %	50 %	0 %	0 %	449086428
129	NC_020240	CTTT	2	8	51038	51045	0 %	75 %	0 %	25 %	449086428
130	NC_020240	TAAT	2	8	51463	51470	50 %	50 %	0 %	0 %	449086429
131	NC_020240	ATAA	2	8	51579	51586	75 %	25 %	0 %	0 %	449086429
132	NC_020240	AAGA	2	8	52388	52395	75 %	0 %	25 %	0 %	449086430
133	NC_020240	TTAC	2	8	52475	52482	25 %	50 %	0 %	25 %	449086430
134	NC_020240	CTTG	2	8	52826	52833	0 %	50 %	25 %	25 %	449086430
135	NC_020240	AAGA	2	8	53210	53217	75 %	0 %	25 %	0 %	449086430
136	NC_020240	AAAT	2	8	53640	53647	75 %	25 %	0 %	0 %	449086432
137	NC_020240	AACA	2	8	54056	54063	75 %	0 %	0 %	25 %	449086432
138	NC_020240	ACCA	2	8	54083	54090	50 %	0 %	0 %	50 %	449086432
139	NC_020240	ATGA	2	8	54207	54214	50 %	25 %	25 %	0 %	449086432
140	NC_020240	AAGG	2	8	54301	54308	50 %	0 %	50 %	0 %	449086432
141	NC_020240	AATT	2	8	54344	54351	50 %	50 %	0 %	0 %	449086432
142	NC_020240	AAAG	2	8	55385	55392	75 %	0 %	25 %	0 %	449086433
143	NC_020240	TAAC	2	8	55693	55700	50 %	25 %	0 %	25 %	449086433
144	NC_020240	ACGA	2	8	56344	56351	50 %	0 %	25 %	25 %	449086434
145	NC_020240	GAAC	2	8	56637	56644	50 %	0 %	25 %	25 %	449086434
146	NC_020240	TAAT	2	8	58772	58779	50 %	50 %	0 %	0 %	449086437
147	NC_020240	CCTT	2	8	58867	58874	0 %	50 %	0 %	50 %	449086437
148	NC_020240	CTAT	2	8	58975	58982	25 %	50 %	0 %	25 %	449086437
149	NC_020240	TTCC	2	8	59490	59497	0 %	50 %	0 %	50 %	449086437
150	NC_020240	TTGG	2	8	59756	59763	0 %	50 %	50 %	0 %	449086437
151	NC_020240	ATTC	2	8	60024	60031	25 %	50 %	0 %	25 %	449086437
152	NC_020240	AAAG	2	8	60147	60154	75 %	0 %	25 %	0 %	449086437
153	NC_020240	CCTT	2	8	60358	60365	0 %	50 %	0 %	50 %	449086437
154	NC_020240	CTTC	2	8	60521	60528	0 %	50 %	0 %	50 %	449086437
155	NC_020240	ATCC	2	8	60737	60744	25 %	25 %	0 %	50 %	449086437
156	NC_020240	TCAA	2	8	61440	61447	50 %	25 %	0 %	25 %	449086439
157	NC_020240	TAGT	2	8	61638	61645	25 %	50 %	25 %	0 %	449086439
158	NC_020240	TCTT	2	8	62850	62857	0 %	75 %	0 %	25 %	449086440
159	NC_020240	TCTT	2	8	62868	62875	0 %	75 %	0 %	25 %	449086440
160	NC_020240	AAAT	2	8	63024	63031	75 %	25 %	0 %	0 %	449086440
161	NC_020240	TCTT	2	8	64254	64261	0 %	75 %	0 %	25 %	449086441
162	NC_020240	TCAG	2	8	64265	64272	25 %	25 %	25 %	25 %	449086441
163	NC_020240	CTCA	2	8	64336	64343	25 %	25 %	0 %	50 %	449086441
164	NC_020240	CAGG	2	8	65242	65249	25 %	0 %	50 %	25 %	449086442
165	NC_020240	TTGA	2	8	66010	66017	25 %	50 %	25 %	0 %	449086443
166	NC_020240	ATCT	2	8	66717	66724	25 %	50 %	0 %	25 %	449086444
167	NC_020240	CATA	2	8	67261	67268	50 %	25 %	0 %	25 %	449086444
168	NC_020240	CTTT	2	8	67594	67601	0 %	75 %	0 %	25 %	449086445
169	NC_020240	GTTT	2	8	67738	67745	0 %	75 %	25 %	0 %	449086446
170	NC_020240	CTTT	2	8	68039	68046	0 %	75 %	0 %	25 %	449086446
171	NC_020240	CCAA	2	8	68197	68204	50 %	0 %	0 %	50 %	449086447
172	NC_020240	TATT	2	8	68216	68223	25 %	75 %	0 %	0 %	449086447
173	NC_020240	TAAA	2	8	68446	68453	75 %	25 %	0 %	0 %	449086447
174	NC_020240	ATTT	2	8	68497	68504	25 %	75 %	0 %	0 %	449086447
175	NC_020240	TTTA	2	8	68768	68775	25 %	75 %	0 %	0 %	449086448
176	NC_020240	TAAA	2	8	68962	68969	75 %	25 %	0 %	0 %	449086448
177	NC_020240	TAAT	2	8	69124	69131	50 %	50 %	0 %	0 %	449086448
178	NC_020240	ATTC	2	8	69200	69207	25 %	50 %	0 %	25 %	449086449
179	NC_020240	TAAA	2	8	69237	69244	75 %	25 %	0 %	0 %	449086449
180	NC_020240	TAAA	2	8	69285	69292	75 %	25 %	0 %	0 %	449086449

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.