MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pAW63

Total Repeats: 209

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020240	TCT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020240	CTT	2	6	87	92	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020240	TTC	2	6	108	113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020240	TCT	2	6	124	129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020240	TTA	2	6	136	141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020240	TCT	3	9	154	162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020240	TTC	2	6	203	208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020240	AAT	2	6	443	448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020240	CAT	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020240	TTC	2	6	1496	1501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020240	TTC	2	6	1611	1616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020240	CTC	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_020240	CAT	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020240	GTT	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020240	ATG	2	6	3622	3627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020240	GAA	2	6	3737	3742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020240	TGC	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020240	GAA	2	6	3879	3884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020240	TTA	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020240	ATA	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020240	ACC	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020240	TTG	2	6	4090	4095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020240	ACC	2	6	4109	4114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_020240	CAA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020240	AAT	3	9	4138	4146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020240	CAT	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020240	GTA	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020240	CCT	2	6	6264	6269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020240	AGT	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020240	CTA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020240	GTT	2	6	6833	6838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020240	TTG	2	6	6886	6891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020240	ATA	2	6	6968	6973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020240	ATA	2	6	7010	7015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020240	CCA	2	6	7071	7076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_020240	GGT	2	6	7100	7105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020240	CCA	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_020240	ATT	2	6	7217	7222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020240	ACC	2	6	7234	7239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020240	TCC	2	6	9259	9264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_020240	AAC	2	6	11166	11171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020240	TTG	2	6	11297	11302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020240	AAC	2	6	11401	11406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020240	TAT	3	9	11425	11433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020240	TGC	2	6	11456	11461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020240	TTC	2	6	11478	11483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020240	CCT	2	6	11519	11524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_020240	TCT	2	6	14960	14965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020240	GAA	2	6	14990	14995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020240	CTT	2	6	15015	15020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020240	TAA	2	6	15055	15060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020240	TTC	2	6	15142	15147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020240	TTG	2	6	15187	15192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020240	AAG	2	6	15239	15244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020240	GTT	2	6	15489	15494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020240	AAT	2	6	15556	15561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020240	TTC	2	6	15589	15594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020240	ATA	2	6	15617	15622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020240	GAT	2	6	15627	15632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020240	ATC	2	6	15757	15762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020240	GCT	2	6	15864	15869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020240	AAC	2	6	16057	16062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020240	AAT	2	6	16106	16111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020240	CTT	2	6	16117	16122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020240	TAA	2	6	16156	16161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020240	TCT	2	6	16169	16174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020240	TCA	2	6	16181	16186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020240	ATC	2	6	16540	16545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020240	TAA	2	6	16559	16564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020240	TTC	2	6	16628	16633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020240	AAT	2	6	16657	16662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020240	GTT	2	6	16720	16725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020240	CTT	2	6	16764	16769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020240	CAT	2	6	16860	16865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020240	ATA	2	6	17070	17075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020240	CCT	2	6	17118	17123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020240	CCA	2	6	17248	17253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_020240	TAA	2	6	17416	17421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020240	GGA	2	6	17736	17741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020240	CTT	2	6	17780	17785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020240	CTG	2	6	17800	17805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020240	CCT	2	6	17856	17861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_020240	ATA	2	6	17996	18001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020240	TTC	2	6	18089	18094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020240	GTA	2	6	18099	18104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020240	TAA	2	6	18197	18202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020240	GAA	2	6	18235	18240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020240	GTA	2	6	18338	18343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020240	GAA	2	6	18393	18398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020240	ATG	2	6	18467	18472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020240	TTA	2	6	18524	18529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020240	TTG	2	6	25096	25101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020240	ACA	2	6	25277	25282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020240	TCC	2	6	30009	30014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_020240	ATA	2	6	30087	30092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020240	AAT	2	6	30109	30114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020240	TTC	2	6	30253	30258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020240	CTG	2	6	30289	30294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020240	TCC	2	6	30412	30417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_020240	CTA	2	6	30504	30509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020240	TTA	2	6	31187	31192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020240	ATA	2	6	32543	32548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020240	ATT	2	6	32841	32846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020240	CCT	2	6	32849	32854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_020240	TTA	2	6	34453	34458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020240	AGC	2	6	34560	34565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020240	TTA	2	6	34603	34608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020240	ATC	2	6	34950	34955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020240	TAA	2	6	35925	35930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020240	AGC	2	6	35936	35941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020240	CTC	2	6	35954	35959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_020240	AAT	2	6	36218	36223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020240	TAA	2	6	36270	36275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020240	TTA	2	6	36306	36311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020240	CTT	2	6	36339	36344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020240	GCT	2	6	36350	36355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020240	TCA	2	6	37088	37093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020240	ACT	2	6	37129	37134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020240	GCA	2	6	37243	37248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020240	TCT	2	6	37326	37331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020240	GAT	2	6	38210	38215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020240	TTC	2	6	38652	38657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020240	TCA	2	6	38710	38715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020240	AAC	2	6	38753	38758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020240	TTC	2	6	38858	38863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020240	GAA	2	6	38869	38874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020240	AAG	2	6	38883	38888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020240	AAT	2	6	38906	38911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020240	ATT	2	6	38977	38982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020240	TCA	2	6	39004	39009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020240	AAG	2	6	39045	39050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020240	TAG	2	6	39112	39117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020240	TAA	2	6	39134	39139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020240	TAA	3	9	39372	39380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020240	AAC	2	6	39479	39484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020240	ATA	2	6	40961	40966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020240	AGT	2	6	41049	41054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020240	CAC	2	6	41855	41860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_020240	TAA	2	6	41888	41893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020240	CCT	2	6	43599	43604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020240	ACA	2	6	43620	43625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020240	AGC	2	6	43636	43641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020240	TAA	2	6	43659	43664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020240	AAG	2	6	43733	43738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020240	TAA	2	6	43777	43782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020240	AAG	2	6	43897	43902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020240	AGC	2	6	43964	43969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_020240	TAT	2	6	44044	44049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020240	TTG	2	6	44078	44083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020240	ACA	2	6	44095	44100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_020240	TTA	2	6	44419	44424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020240	ATA	2	6	46562	46567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_020240	ATT	2	6	48640	48645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_020240	CCT	2	6	49437	49442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_020240	ATT	2	6	49994	49999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_020240	TAA	2	6	52181	52186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020240	CAA	3	9	52210	52218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_020240	ATT	2	6	53554	53559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_020240	TTA	2	6	55922	55927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.