MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT77

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020239	TTTCAT	2	12	252	263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	449092564
2	NC_020239	GTATAT	2	12	384	395	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020239	TTAAAA	2	12	2239	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092566
4	NC_020239	ATTTAT	2	12	8055	8066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020239	TGCTCT	2	12	11117	11128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	449092576
6	NC_020239	TGCTGT	2	12	12050	12061	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	449092577
7	NC_020239	TATTAA	2	12	12762	12773	50 %	50 %	0 %	0 %	449092577
8	NC_020239	TTATTT	2	12	16065	16076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	449092582
9	NC_020239	ACCTGA	2	12	17528	17539	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	449092583
10	NC_020239	GCATTA	2	12	23368	23379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020239	ACAGTA	2	12	26578	26589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449092593
12	NC_020239	ACTACA	2	12	26605	26616	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	449092593
13	NC_020239	GGCGTG	2	12	27550	27561	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020239	GATAAA	4	24	28365	28388	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449092595
15	NC_020239	ATGAAT	2	12	28617	28628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449092595
16	NC_020239	GAAAAG	2	12	28717	28728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092595
17	NC_020239	AAAGGA	2	12	32312	32323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092599
18	NC_020239	GCAAAT	2	12	32482	32493	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449092599
19	NC_020239	AAATGT	2	12	32776	32787	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449092599
20	NC_020239	ATTTTA	2	12	33360	33371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092599
21	NC_020239	TTGAAA	2	12	33938	33949	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449092599
22	NC_020239	ATGAAA	2	12	34838	34849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449092601
23	NC_020239	TTTAAG	2	12	35586	35597	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449092602
24	NC_020239	AGAAAA	2	12	37283	37294	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	449092602
25	NC_020239	GTATCC	2	12	37937	37948	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	449092604
26	NC_020239	AAACTG	2	12	38033	38044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449092604
27	NC_020239	AAAATA	2	12	38297	38308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	449092604
28	NC_020239	GAAAAA	2	12	39376	39387	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	449092604
29	NC_020239	GAAAAA	2	12	39544	39555	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	449092604
30	NC_020239	ATGTAG	2	12	40475	40486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092605
31	NC_020239	ATATTT	2	12	40712	40723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092605
32	NC_020239	TCAAAT	2	12	41291	41302	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	449092606
33	NC_020239	GATATT	2	12	42853	42864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449092607
34	NC_020239	TTATGA	2	12	42930	42941	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449092607
35	NC_020239	GGTATT	2	12	44888	44899	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	449092609
36	NC_020239	AAGGAA	2	12	46616	46627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092611
37	NC_020239	TGAATA	2	12	48038	48049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449092615
38	NC_020239	TTTTAA	2	12	49485	49496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020239	AAAATG	2	12	50527	50538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449092619
40	NC_020239	TTAAAA	2	12	55418	55429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092623
41	NC_020239	TTTGCA	2	12	57444	57455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	449092626
42	NC_020239	AATGCA	2	12	57702	57713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020239	AGTTAG	2	12	59286	59297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092630
44	NC_020239	TTTGGA	2	12	62331	62342	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	449092637
45	NC_020239	AATTAG	2	12	67467	67478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449092646
46	NC_020239	AAATTT	2	12	68072	68083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020239	AATAAA	2	12	68921	68932	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	449092649
48	NC_020239	TAGAAA	2	12	69247	69258	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449092650
49	NC_020239	AATGTG	2	12	70712	70723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092653
50	NC_020239	ATCAGA	2	12	71190	71201	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449092653
51	NC_020239	TTTGGT	2	12	71658	71669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092654

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.