MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT77

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020239	GAACA	2	10	1585	1594	60 %	0 %	20 %	20 %	449092565
2	NC_020239	TTCAA	2	10	2516	2525	40 %	40 %	0 %	20 %	449092567
3	NC_020239	ATTCA	2	10	5838	5847	40 %	40 %	0 %	20 %	449092568
4	NC_020239	ATTTT	2	10	7132	7141	20 %	80 %	0 %	0 %	449092569
5	NC_020239	CTGTA	2	10	7376	7385	20 %	40 %	20 %	20 %	449092569
6	NC_020239	TAAGA	2	10	7940	7949	60 %	20 %	20 %	0 %	449092569
7	NC_020239	TTATT	2	10	8412	8421	20 %	80 %	0 %	0 %	449092570
8	NC_020239	AAATA	2	10	8856	8865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020239	AAATT	2	10	9877	9886	60 %	40 %	0 %	0 %	449092573
10	NC_020239	CATTT	2	10	11644	11653	20 %	60 %	0 %	20 %	449092577
11	NC_020239	TAATC	2	10	13731	13740	40 %	40 %	0 %	20 %	449092579
12	NC_020239	CAATG	2	10	13875	13884	40 %	20 %	20 %	20 %	449092579
13	NC_020239	CATTT	2	10	17645	17654	20 %	60 %	0 %	20 %	449092583
14	NC_020239	ATTTT	2	10	17994	18003	20 %	80 %	0 %	0 %	449092583
15	NC_020239	TAATA	2	10	18055	18064	60 %	40 %	0 %	0 %	449092583
16	NC_020239	CCTTC	2	10	19875	19884	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_020239	AAAAG	2	10	20716	20725	80 %	0 %	20 %	0 %	449092587
18	NC_020239	TTTAT	2	10	23916	23925	20 %	80 %	0 %	0 %	449092591
19	NC_020239	TCTTT	2	10	24080	24089	0 %	80 %	0 %	20 %	449092591
20	NC_020239	TTGGT	2	10	25056	25065	0 %	60 %	40 %	0 %	449092591
21	NC_020239	AATTA	2	10	25271	25280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020239	TAAAG	2	10	26065	26074	60 %	20 %	20 %	0 %	449092593
23	NC_020239	AAATA	2	10	27197	27206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020239	TTTGT	2	10	27461	27470	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020239	ATTTT	2	10	28041	28050	20 %	80 %	0 %	0 %	449092594
26	NC_020239	ATATT	2	10	28114	28123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020239	GAAAA	2	10	28393	28402	80 %	0 %	20 %	0 %	449092595
28	NC_020239	AAGAA	2	10	28607	28616	80 %	0 %	20 %	0 %	449092595
29	NC_020239	ATAAA	2	10	32904	32913	80 %	20 %	0 %	0 %	449092599
30	NC_020239	GTTGA	2	10	34151	34160	20 %	40 %	40 %	0 %	449092599
31	NC_020239	AGTTT	2	10	35061	35070	20 %	60 %	20 %	0 %	449092601
32	NC_020239	TAGTT	2	10	35765	35774	20 %	60 %	20 %	0 %	449092602
33	NC_020239	ATTTA	2	10	35971	35980	40 %	60 %	0 %	0 %	449092602
34	NC_020239	TGAAA	2	10	38373	38382	60 %	20 %	20 %	0 %	449092604
35	NC_020239	AATTC	2	10	39506	39515	40 %	40 %	0 %	20 %	449092604
36	NC_020239	ACGAG	2	10	43561	43570	40 %	0 %	40 %	20 %	449092608
37	NC_020239	TTAGT	2	10	45444	45453	20 %	60 %	20 %	0 %	449092609
38	NC_020239	ATCAT	2	10	46441	46450	40 %	40 %	0 %	20 %	449092610
39	NC_020239	TAAAA	2	10	46661	46670	80 %	20 %	0 %	0 %	449092611
40	NC_020239	CAAAG	2	10	47157	47166	60 %	0 %	20 %	20 %	449092613
41	NC_020239	ACCCT	2	10	48332	48341	20 %	20 %	0 %	60 %	449092615
42	NC_020239	TAAAG	2	10	48426	48435	60 %	20 %	20 %	0 %	449092615
43	NC_020239	ACGAA	2	10	49280	49289	60 %	0 %	20 %	20 %	449092616
44	NC_020239	GGTAA	2	10	50352	50361	40 %	20 %	40 %	0 %	449092618
45	NC_020239	ATTAA	2	10	52144	52153	60 %	40 %	0 %	0 %	449092621
46	NC_020239	AAAAG	2	10	52158	52167	80 %	0 %	20 %	0 %	449092621
47	NC_020239	GGGAT	2	10	52716	52725	20 %	20 %	60 %	0 %	449092621
48	NC_020239	ATTGA	2	10	53392	53401	40 %	40 %	20 %	0 %	449092621
49	NC_020239	TATTT	2	10	54705	54714	20 %	80 %	0 %	0 %	449092623
50	NC_020239	TACTT	2	10	55012	55021	20 %	60 %	0 %	20 %	449092623
51	NC_020239	AATTT	2	10	57926	57935	40 %	60 %	0 %	0 %	449092627
52	NC_020239	ATTTT	2	10	58565	58574	20 %	80 %	0 %	0 %	449092629
53	NC_020239	GTAAA	2	10	58793	58802	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020239	ATTGT	2	10	59067	59076	20 %	60 %	20 %	0 %	449092630
55	NC_020239	GTTGA	2	10	59381	59390	20 %	40 %	40 %	0 %	449092631
56	NC_020239	AACCA	2	10	59523	59532	60 %	0 %	0 %	40 %	449092631
57	NC_020239	AAAGA	2	10	59592	59601	80 %	0 %	20 %	0 %	449092631
58	NC_020239	GAAAT	2	10	60779	60788	60 %	20 %	20 %	0 %	449092634
59	NC_020239	CATCC	2	10	64219	64228	20 %	20 %	0 %	60 %	449092642
60	NC_020239	GAAAA	2	10	68579	68588	80 %	0 %	20 %	0 %	449092649
61	NC_020239	CTTTC	2	10	69363	69372	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_020239	CTCTA	2	10	69579	69588	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_020239	GGTAT	2	10	69745	69754	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020239	ACAAA	2	10	69909	69918	80 %	0 %	0 %	20 %	449092651
65	NC_020239	TTAAA	2	10	71899	71908	60 %	40 %	0 %	0 %	449092654
66	NC_020239	AAACA	2	10	72562	72571	80 %	0 %	0 %	20 %	449092654
67	NC_020239	AAGAT	2	10	73540	73549	60 %	20 %	20 %	0 %	449092656
68	NC_020239	ATATA	2	10	74288	74297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020239	TTTAA	2	10	75028	75037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020239	TCAAA	2	10	75319	75328	60 %	20 %	0 %	20 %	449092658

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.