MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT77

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020239	GTAT	2	8	910	917	25 %	50 %	25 %	0 %	449092565
2	NC_020239	ATAA	2	8	1008	1015	75 %	25 %	0 %	0 %	449092565
3	NC_020239	GAAA	2	8	1367	1374	75 %	0 %	25 %	0 %	449092565
4	NC_020239	ATTC	2	8	2368	2375	25 %	50 %	0 %	25 %	449092566
5	NC_020239	GTCA	2	8	2664	2671	25 %	25 %	25 %	25 %	449092567
6	NC_020239	AGGT	2	8	3016	3023	25 %	25 %	50 %	0 %	449092567
7	NC_020239	CTCC	2	8	3533	3540	0 %	25 %	0 %	75 %	449092567
8	NC_020239	AAAG	2	8	3929	3936	75 %	0 %	25 %	0 %	449092567
9	NC_020239	ATTG	2	8	4449	4456	25 %	50 %	25 %	0 %	449092568
10	NC_020239	TTTA	2	8	4464	4471	25 %	75 %	0 %	0 %	449092568
11	NC_020239	GATT	2	8	5302	5309	25 %	50 %	25 %	0 %	449092568
12	NC_020239	TGCT	2	8	6150	6157	0 %	50 %	25 %	25 %	449092568
13	NC_020239	TTTG	2	8	6184	6191	0 %	75 %	25 %	0 %	449092568
14	NC_020239	CATA	2	8	6617	6624	50 %	25 %	0 %	25 %	449092568
15	NC_020239	CCAG	2	8	6909	6916	25 %	0 %	25 %	50 %	449092568
16	NC_020239	TCGA	2	8	7392	7399	25 %	25 %	25 %	25 %	449092569
17	NC_020239	TCAT	2	8	7507	7514	25 %	50 %	0 %	25 %	449092569
18	NC_020239	GATA	2	8	7518	7525	50 %	25 %	25 %	0 %	449092569
19	NC_020239	TGAT	2	8	8763	8770	25 %	50 %	25 %	0 %	449092570
20	NC_020239	ATAA	2	8	9028	9035	75 %	25 %	0 %	0 %	449092571
21	NC_020239	TAAT	2	8	9206	9213	50 %	50 %	0 %	0 %	449092572
22	NC_020239	ACAA	2	8	9357	9364	75 %	0 %	0 %	25 %	449092572
23	NC_020239	TAAA	2	8	9465	9472	75 %	25 %	0 %	0 %	449092572
24	NC_020239	ATTT	2	8	9913	9920	25 %	75 %	0 %	0 %	449092573
25	NC_020239	AAAG	2	8	10009	10016	75 %	0 %	25 %	0 %	449092574
26	NC_020239	TAAA	2	8	10427	10434	75 %	25 %	0 %	0 %	449092574
27	NC_020239	TAAA	2	8	11044	11051	75 %	25 %	0 %	0 %	449092575
28	NC_020239	TTGT	2	8	11175	11182	0 %	75 %	25 %	0 %	449092576
29	NC_020239	CAAA	2	8	11213	11220	75 %	0 %	0 %	25 %	449092576
30	NC_020239	ATAA	2	8	12397	12404	75 %	25 %	0 %	0 %	449092577
31	NC_020239	TATT	2	8	12446	12453	25 %	75 %	0 %	0 %	449092577
32	NC_020239	AATT	2	8	12931	12938	50 %	50 %	0 %	0 %	449092578
33	NC_020239	CAAC	2	8	13430	13437	50 %	0 %	0 %	50 %	449092578
34	NC_020239	CAAA	2	8	13814	13821	75 %	0 %	0 %	25 %	449092579
35	NC_020239	ACAA	2	8	13852	13859	75 %	0 %	0 %	25 %	449092579
36	NC_020239	AACA	2	8	13860	13867	75 %	0 %	0 %	25 %	449092579
37	NC_020239	TTGT	2	8	14364	14371	0 %	75 %	25 %	0 %	449092579
38	NC_020239	TTTA	2	8	14731	14738	25 %	75 %	0 %	0 %	449092580
39	NC_020239	TAGA	2	8	14966	14973	50 %	25 %	25 %	0 %	449092581
40	NC_020239	TTCT	2	8	15042	15049	0 %	75 %	0 %	25 %	449092581
41	NC_020239	TTTA	2	8	15388	15395	25 %	75 %	0 %	0 %	449092582
42	NC_020239	GTCT	2	8	15645	15652	0 %	50 %	25 %	25 %	449092582
43	NC_020239	AATG	2	8	15880	15887	50 %	25 %	25 %	0 %	449092582
44	NC_020239	ATTT	2	8	15928	15935	25 %	75 %	0 %	0 %	449092582
45	NC_020239	TAAA	2	8	17026	17033	75 %	25 %	0 %	0 %	449092583
46	NC_020239	TAAC	2	8	17308	17315	50 %	25 %	0 %	25 %	449092583
47	NC_020239	CAAA	2	8	17509	17516	75 %	0 %	0 %	25 %	449092583
48	NC_020239	TTTA	2	8	17561	17568	25 %	75 %	0 %	0 %	449092583
49	NC_020239	GAAA	2	8	17665	17672	75 %	0 %	25 %	0 %	449092583
50	NC_020239	AATG	2	8	17860	17867	50 %	25 %	25 %	0 %	449092583
51	NC_020239	ATTA	2	8	18331	18338	50 %	50 %	0 %	0 %	449092584
52	NC_020239	ATTA	2	8	18368	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	449092584
53	NC_020239	TTTC	2	8	18579	18586	0 %	75 %	0 %	25 %	449092584
54	NC_020239	AAGA	2	8	19089	19096	75 %	0 %	25 %	0 %	449092584
55	NC_020239	TTAA	2	8	19119	19126	50 %	50 %	0 %	0 %	449092584
56	NC_020239	CTTT	2	8	19343	19350	0 %	75 %	0 %	25 %	449092584
57	NC_020239	AAAT	2	8	19547	19554	75 %	25 %	0 %	0 %	449092585
58	NC_020239	TACA	2	8	20506	20513	50 %	25 %	0 %	25 %	449092586
59	NC_020239	AGTA	2	8	20813	20820	50 %	25 %	25 %	0 %	449092587
60	NC_020239	CTTT	2	8	21594	21601	0 %	75 %	0 %	25 %	449092588
61	NC_020239	CTTT	2	8	21830	21837	0 %	75 %	0 %	25 %	449092588
62	NC_020239	GTAA	2	8	21867	21874	50 %	25 %	25 %	0 %	449092588
63	NC_020239	GATG	2	8	22016	22023	25 %	25 %	50 %	0 %	449092588
64	NC_020239	TTGG	2	8	22075	22082	0 %	50 %	50 %	0 %	449092588
65	NC_020239	ATAG	2	8	22740	22747	50 %	25 %	25 %	0 %	449092589
66	NC_020239	ATTA	2	8	22790	22797	50 %	50 %	0 %	0 %	449092589
67	NC_020239	TATT	2	8	22957	22964	25 %	75 %	0 %	0 %	449092590
68	NC_020239	ACTA	2	8	23189	23196	50 %	25 %	0 %	25 %	449092590
69	NC_020239	TCTT	2	8	24199	24206	0 %	75 %	0 %	25 %	449092591
70	NC_020239	TCTT	2	8	24267	24274	0 %	75 %	0 %	25 %	449092591
71	NC_020239	TTCA	2	8	24405	24412	25 %	50 %	0 %	25 %	449092591
72	NC_020239	TACT	2	8	24529	24536	25 %	50 %	0 %	25 %	449092591
73	NC_020239	ATAA	2	8	24777	24784	75 %	25 %	0 %	0 %	449092591
74	NC_020239	TATC	2	8	25025	25032	25 %	50 %	0 %	25 %	449092591
75	NC_020239	TTAT	2	8	25857	25864	25 %	75 %	0 %	0 %	449092592
76	NC_020239	TATT	2	8	26485	26492	25 %	75 %	0 %	0 %	449092593
77	NC_020239	GTTT	2	8	26964	26971	0 %	75 %	25 %	0 %	449092593
78	NC_020239	TCTT	2	8	27900	27907	0 %	75 %	0 %	25 %	449092594
79	NC_020239	AACA	2	8	28237	28244	75 %	0 %	0 %	25 %	449092595
80	NC_020239	TAAA	2	8	28660	28667	75 %	25 %	0 %	0 %	449092595
81	NC_020239	AGAA	2	8	28693	28700	75 %	0 %	25 %	0 %	449092595
82	NC_020239	ATTC	2	8	28903	28910	25 %	50 %	0 %	25 %	449092595
83	NC_020239	TTTA	2	8	29135	29142	25 %	75 %	0 %	0 %	449092595
84	NC_020239	GAAT	2	8	29258	29265	50 %	25 %	25 %	0 %	449092595
85	NC_020239	GAAA	2	8	29420	29427	75 %	0 %	25 %	0 %	449092595
86	NC_020239	TGTT	2	8	29891	29898	0 %	75 %	25 %	0 %	449092597
87	NC_020239	TGAA	2	8	30839	30846	50 %	25 %	25 %	0 %	449092598
88	NC_020239	TAAA	2	8	30908	30915	75 %	25 %	0 %	0 %	449092598
89	NC_020239	ATAA	2	8	31024	31031	75 %	25 %	0 %	0 %	449092598
90	NC_020239	ATTC	2	8	31371	31378	25 %	50 %	0 %	25 %	449092598
91	NC_020239	AAAT	2	8	31380	31387	75 %	25 %	0 %	0 %	449092598
92	NC_020239	TGAA	2	8	31709	31716	50 %	25 %	25 %	0 %	449092598
93	NC_020239	AGAA	2	8	31749	31756	75 %	0 %	25 %	0 %	449092598
94	NC_020239	AGAA	2	8	32235	32242	75 %	0 %	25 %	0 %	449092598
95	NC_020239	AAAT	2	8	32326	32333	75 %	25 %	0 %	0 %	449092599
96	NC_020239	ATAA	2	8	32828	32835	75 %	25 %	0 %	0 %	449092599
97	NC_020239	AAGA	2	8	33044	33051	75 %	0 %	25 %	0 %	449092599
98	NC_020239	ATTA	2	8	33100	33107	50 %	50 %	0 %	0 %	449092599
99	NC_020239	TCCA	2	8	33517	33524	25 %	25 %	0 %	50 %	449092599
100	NC_020239	AACT	2	8	34053	34060	50 %	25 %	0 %	25 %	449092599
101	NC_020239	ATTT	2	8	35199	35206	25 %	75 %	0 %	0 %	449092601
102	NC_020239	AGAA	2	8	35424	35431	75 %	0 %	25 %	0 %	449092602
103	NC_020239	ACTG	2	8	36488	36495	25 %	25 %	25 %	25 %	449092602
104	NC_020239	GAAA	2	8	37357	37364	75 %	0 %	25 %	0 %	449092602
105	NC_020239	ATTA	2	8	37845	37852	50 %	50 %	0 %	0 %	449092604
106	NC_020239	AGAA	2	8	38046	38053	75 %	0 %	25 %	0 %	449092604
107	NC_020239	CAAT	2	8	38155	38162	50 %	25 %	0 %	25 %	449092604
108	NC_020239	AAAG	2	8	38365	38372	75 %	0 %	25 %	0 %	449092604
109	NC_020239	AACA	2	8	38713	38720	75 %	0 %	0 %	25 %	449092604
110	NC_020239	TAAA	2	8	38846	38853	75 %	25 %	0 %	0 %	449092604
111	NC_020239	TGAT	2	8	40028	40035	25 %	50 %	25 %	0 %	449092605
112	NC_020239	TAAA	2	8	41396	41403	75 %	25 %	0 %	0 %	449092606
113	NC_020239	GTTG	2	8	41516	41523	0 %	50 %	50 %	0 %	449092606
114	NC_020239	ACAT	2	8	41551	41558	50 %	25 %	0 %	25 %	449092606
115	NC_020239	TAAT	2	8	41960	41967	50 %	50 %	0 %	0 %	449092607
116	NC_020239	ATTT	2	8	42184	42191	25 %	75 %	0 %	0 %	449092607
117	NC_020239	AAGT	2	8	42447	42454	50 %	25 %	25 %	0 %	449092607
118	NC_020239	GAAC	2	8	42916	42923	50 %	0 %	25 %	25 %	449092607
119	NC_020239	AAAT	2	8	43079	43086	75 %	25 %	0 %	0 %	449092608
120	NC_020239	AAAC	2	8	43187	43194	75 %	0 %	0 %	25 %	449092608
121	NC_020239	AAAT	2	8	43524	43531	75 %	25 %	0 %	0 %	449092608
122	NC_020239	AAGA	2	8	44472	44479	75 %	0 %	25 %	0 %	449092608
123	NC_020239	AAAG	2	8	45205	45212	75 %	0 %	25 %	0 %	449092609
124	NC_020239	GTTT	2	8	45641	45648	0 %	75 %	25 %	0 %	449092610
125	NC_020239	TCTA	2	8	45650	45657	25 %	50 %	0 %	25 %	449092610
126	NC_020239	AATT	2	8	46017	46024	50 %	50 %	0 %	0 %	449092610
127	NC_020239	TTTC	2	8	46192	46199	0 %	75 %	0 %	25 %	449092610
128	NC_020239	GGAA	2	8	46257	46264	50 %	0 %	50 %	0 %	449092610
129	NC_020239	AGCA	2	8	46313	46320	50 %	0 %	25 %	25 %	449092610
130	NC_020239	GTTA	2	8	46452	46459	25 %	50 %	25 %	0 %	449092610
131	NC_020239	AAAG	2	8	47704	47711	75 %	0 %	25 %	0 %	449092614
132	NC_020239	TTTA	2	8	48000	48007	25 %	75 %	0 %	0 %	449092615
133	NC_020239	AAAC	2	8	48178	48185	75 %	0 %	0 %	25 %	449092615
134	NC_020239	AAAG	2	8	48190	48197	75 %	0 %	25 %	0 %	449092615
135	NC_020239	GAAT	2	8	48848	48855	50 %	25 %	25 %	0 %	449092615
136	NC_020239	TTAT	2	8	48929	48936	25 %	75 %	0 %	0 %	449092616
137	NC_020239	AATA	2	8	49062	49069	75 %	25 %	0 %	0 %	449092616
138	NC_020239	AGTA	2	8	49424	49431	50 %	25 %	25 %	0 %	449092616
139	NC_020239	CAAT	2	8	49783	49790	50 %	25 %	0 %	25 %	449092617
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.