MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT77

Total Repeats: 1052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020239	CTT	2	6	135	140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092564
2	NC_020239	ATA	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092564
3	NC_020239	TCA	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092564
4	NC_020239	TAT	2	6	425	430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020239	TTA	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020239	ATA	2	6	611	616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020239	AGA	2	6	681	686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020239	CAT	2	6	747	752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020239	TAA	2	6	761	766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020239	ATT	2	6	787	792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020239	ATT	2	6	796	801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020239	ATA	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020239	GGT	2	6	902	907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020239	TCT	2	6	1168	1173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092565
15	NC_020239	TGA	2	6	1283	1288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092565
16	NC_020239	TGG	2	6	1526	1531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092565
17	NC_020239	ATA	2	6	1555	1560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092565
18	NC_020239	GAA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092565
19	NC_020239	TCA	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092565
20	NC_020239	ACA	2	6	2057	2062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092565
21	NC_020239	AGA	2	6	2093	2098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092565
22	NC_020239	GAA	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092565
23	NC_020239	CAA	2	6	2212	2217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092566
24	NC_020239	AAC	2	6	2220	2225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092566
25	NC_020239	TAA	2	6	2292	2297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092566
26	NC_020239	GAA	2	6	2583	2588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092567
27	NC_020239	CGC	2	6	2717	2722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449092567
28	NC_020239	GCA	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092567
29	NC_020239	CGA	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092567
30	NC_020239	GGT	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092567
31	NC_020239	ATT	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092567
32	NC_020239	TCA	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092567
33	NC_020239	TTC	2	6	3665	3670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092567
34	NC_020239	GAT	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092567
35	NC_020239	ATC	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092567
36	NC_020239	TAA	2	6	3799	3804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092567
37	NC_020239	CTA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092567
38	NC_020239	GAA	2	6	3869	3874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092567
39	NC_020239	TCT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
40	NC_020239	TTC	2	6	4299	4304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
41	NC_020239	TAA	2	6	4349	4354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092568
42	NC_020239	TTA	2	6	4501	4506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092568
43	NC_020239	TTA	2	6	4679	4684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092568
44	NC_020239	TTC	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
45	NC_020239	CCA	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449092568
46	NC_020239	GAG	2	6	4784	4789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092568
47	NC_020239	CAA	2	6	4803	4808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092568
48	NC_020239	TTC	2	6	4860	4865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
49	NC_020239	ATG	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092568
50	NC_020239	AAG	2	6	4890	4895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092568
51	NC_020239	GTA	2	6	4930	4935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092568
52	NC_020239	AGA	3	9	5067	5075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092568
53	NC_020239	GAT	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092568
54	NC_020239	CAT	3	9	5156	5164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092568
55	NC_020239	GAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092568
56	NC_020239	CTT	2	6	5426	5431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
57	NC_020239	TCA	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092568
58	NC_020239	ATC	2	6	5640	5645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092568
59	NC_020239	ATG	2	6	5655	5660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092568
60	NC_020239	ATA	2	6	5730	5735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092568
61	NC_020239	TCA	3	9	5755	5763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092568
62	NC_020239	TCG	2	6	5888	5893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449092568
63	NC_020239	TAA	2	6	5913	5918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092568
64	NC_020239	GTT	2	6	5996	6001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092568
65	NC_020239	CTT	2	6	6005	6010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
66	NC_020239	TAA	2	6	6110	6115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092568
67	NC_020239	TCT	2	6	6125	6130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
68	NC_020239	TCA	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092568
69	NC_020239	GTA	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092568
70	NC_020239	TTG	2	6	6582	6587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092568
71	NC_020239	GAA	2	6	6629	6634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092568
72	NC_020239	TAT	2	6	6686	6691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092568
73	NC_020239	TTG	2	6	6705	6710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092568
74	NC_020239	TAA	2	6	6723	6728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092568
75	NC_020239	AGA	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092568
76	NC_020239	TTC	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
77	NC_020239	AGT	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092569
78	NC_020239	AGA	2	6	7253	7258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092569
79	NC_020239	TAA	2	6	7280	7285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092569
80	NC_020239	GAC	2	6	7314	7319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092569
81	NC_020239	TAA	2	6	7349	7354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092569
82	NC_020239	GTT	2	6	7451	7456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092569
83	NC_020239	CCT	2	6	7459	7464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449092569
84	NC_020239	AAT	2	6	7476	7481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092569
85	NC_020239	TTA	2	6	7588	7593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092569
86	NC_020239	CAA	2	6	7634	7639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092569
87	NC_020239	TTG	2	6	7704	7709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092569
88	NC_020239	CTA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092569
89	NC_020239	TCC	2	6	7980	7985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_020239	ACA	2	6	8080	8085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020239	TGT	2	6	8098	8103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020239	ATT	2	6	8104	8109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020239	AAT	2	6	8144	8149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020239	AGG	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092570
95	NC_020239	TGA	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092570
96	NC_020239	TAA	2	6	8268	8273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092570
97	NC_020239	ACA	2	6	8274	8279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092570
98	NC_020239	CAA	2	6	8314	8319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092570
99	NC_020239	GTG	2	6	8345	8350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092570
100	NC_020239	AGC	3	9	8385	8393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092570
101	NC_020239	TTA	2	6	8513	8518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092570
102	NC_020239	TGA	2	6	8520	8525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092570
103	NC_020239	GGA	2	6	8550	8555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092570
104	NC_020239	ATT	2	6	8562	8567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092570
105	NC_020239	GTA	2	6	8600	8605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092570
106	NC_020239	CAT	2	6	8695	8700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092570
107	NC_020239	GGT	2	6	8706	8711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092570
108	NC_020239	AAT	2	6	8823	8828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020239	ATA	2	6	8845	8850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020239	ATT	2	6	8878	8883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020239	TTC	3	9	8899	8907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092571
112	NC_020239	ATT	2	6	8917	8922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092571
113	NC_020239	ATA	2	6	8981	8986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092571
114	NC_020239	CCA	2	6	9004	9009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449092571
115	NC_020239	AAT	2	6	9092	9097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092571
116	NC_020239	ATA	4	12	9261	9272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092572
117	NC_020239	ATA	2	6	9297	9302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092572
118	NC_020239	TAG	2	6	9340	9345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092572
119	NC_020239	ATA	2	6	9346	9351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092572
120	NC_020239	ATA	2	6	9436	9441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092572
121	NC_020239	TAA	2	6	9572	9577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092572
122	NC_020239	TCC	2	6	9625	9630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_020239	AAT	2	6	9782	9787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020239	GAA	2	6	9979	9984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092573
125	NC_020239	TTA	2	6	10079	10084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092574
126	NC_020239	TAT	2	6	10167	10172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092574
127	NC_020239	CAA	2	6	10183	10188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092574
128	NC_020239	TTA	2	6	10329	10334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092574
129	NC_020239	ATT	3	9	10363	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092574
130	NC_020239	TTA	2	6	10403	10408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092574
131	NC_020239	TAA	2	6	10483	10488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020239	ATT	2	6	10508	10513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020239	TAA	2	6	10603	10608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020239	GAA	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_020239	ATA	2	6	19649	19654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_020239	TTA	2	6	19738	19743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_020239	ATT	2	6	19807	19812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_020239	TAA	2	6	19820	19825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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