MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT77

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020239	AT	3	6	300	305	50 %	50 %	0 %	0 %	449092564
2	NC_020239	TA	3	6	520	525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020239	AT	3	6	583	588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020239	TA	3	6	598	603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020239	AT	3	6	2025	2030	50 %	50 %	0 %	0 %	449092565
6	NC_020239	TA	3	6	2188	2193	50 %	50 %	0 %	0 %	449092565
7	NC_020239	TC	3	6	2688	2693	0 %	50 %	0 %	50 %	449092567
8	NC_020239	AT	3	6	2792	2797	50 %	50 %	0 %	0 %	449092567
9	NC_020239	TA	3	6	3156	3161	50 %	50 %	0 %	0 %	449092567
10	NC_020239	AT	3	6	3474	3479	50 %	50 %	0 %	0 %	449092567
11	NC_020239	AT	3	6	4318	4323	50 %	50 %	0 %	0 %	449092568
12	NC_020239	CA	3	6	4333	4338	50 %	0 %	0 %	50 %	449092568
13	NC_020239	GT	3	6	4809	4814	0 %	50 %	50 %	0 %	449092568
14	NC_020239	TA	3	6	5556	5561	50 %	50 %	0 %	0 %	449092568
15	NC_020239	AC	3	6	7601	7606	50 %	0 %	0 %	50 %	449092569
16	NC_020239	AT	3	6	8151	8156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020239	AT	3	6	9414	9419	50 %	50 %	0 %	0 %	449092572
18	NC_020239	AT	3	6	9670	9675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020239	AC	3	6	9744	9749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020239	AT	4	8	9761	9768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020239	TA	3	6	9774	9779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020239	TA	3	6	10256	10261	50 %	50 %	0 %	0 %	449092574
23	NC_020239	TA	3	6	10498	10503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020239	AT	3	6	10703	10708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020239	AC	3	6	10929	10934	50 %	0 %	0 %	50 %	449092575
26	NC_020239	AT	3	6	11555	11560	50 %	50 %	0 %	0 %	449092577
27	NC_020239	TA	3	6	11694	11699	50 %	50 %	0 %	0 %	449092577
28	NC_020239	AT	3	6	13257	13262	50 %	50 %	0 %	0 %	449092578
29	NC_020239	AT	3	6	14010	14015	50 %	50 %	0 %	0 %	449092579
30	NC_020239	CA	3	6	15708	15713	50 %	0 %	0 %	50 %	449092582
31	NC_020239	AT	4	8	15967	15974	50 %	50 %	0 %	0 %	449092582
32	NC_020239	AC	3	6	16192	16197	50 %	0 %	0 %	50 %	449092582
33	NC_020239	AT	3	6	16218	16223	50 %	50 %	0 %	0 %	449092582
34	NC_020239	TA	3	6	16865	16870	50 %	50 %	0 %	0 %	449092583
35	NC_020239	TA	3	6	17212	17217	50 %	50 %	0 %	0 %	449092583
36	NC_020239	TG	3	6	17298	17303	0 %	50 %	50 %	0 %	449092583
37	NC_020239	AT	3	6	18403	18408	50 %	50 %	0 %	0 %	449092584
38	NC_020239	TC	3	6	18869	18874	0 %	50 %	0 %	50 %	449092584
39	NC_020239	CT	3	6	19359	19364	0 %	50 %	0 %	50 %	449092584
40	NC_020239	AG	3	6	20421	20426	50 %	0 %	50 %	0 %	449092586
41	NC_020239	TC	3	6	22530	22535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020239	AT	3	6	22809	22814	50 %	50 %	0 %	0 %	449092589
43	NC_020239	TA	3	6	23280	23285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020239	AT	3	6	24046	24051	50 %	50 %	0 %	0 %	449092591
45	NC_020239	AG	3	6	24223	24228	50 %	0 %	50 %	0 %	449092591
46	NC_020239	CT	3	6	25188	25193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020239	TA	3	6	25226	25231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020239	AG	3	6	25296	25301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020239	AT	3	6	25657	25662	50 %	50 %	0 %	0 %	449092592
50	NC_020239	TG	3	6	26383	26388	0 %	50 %	50 %	0 %	449092593
51	NC_020239	TC	3	6	26637	26642	0 %	50 %	0 %	50 %	449092593
52	NC_020239	TA	3	6	26882	26887	50 %	50 %	0 %	0 %	449092593
53	NC_020239	TA	3	6	27393	27398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020239	AG	3	6	28311	28316	50 %	0 %	50 %	0 %	449092595
55	NC_020239	CT	4	8	29688	29695	0 %	50 %	0 %	50 %	449092596
56	NC_020239	TA	3	6	30062	30067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020239	GA	4	8	30388	30395	50 %	0 %	50 %	0 %	449092598
58	NC_020239	AT	3	6	30650	30655	50 %	50 %	0 %	0 %	449092598
59	NC_020239	AT	3	6	31471	31476	50 %	50 %	0 %	0 %	449092598
60	NC_020239	AG	3	6	31618	31623	50 %	0 %	50 %	0 %	449092598
61	NC_020239	AC	3	6	31785	31790	50 %	0 %	0 %	50 %	449092598
62	NC_020239	AG	4	8	32849	32856	50 %	0 %	50 %	0 %	449092599
63	NC_020239	GA	3	6	33196	33201	50 %	0 %	50 %	0 %	449092599
64	NC_020239	TG	3	6	33204	33209	0 %	50 %	50 %	0 %	449092599
65	NC_020239	TA	3	6	33401	33406	50 %	50 %	0 %	0 %	449092599
66	NC_020239	GA	3	6	34279	34284	50 %	0 %	50 %	0 %	449092599
67	NC_020239	GA	3	6	34911	34916	50 %	0 %	50 %	0 %	449092601
68	NC_020239	AT	3	6	35435	35440	50 %	50 %	0 %	0 %	449092602
69	NC_020239	GA	3	6	35734	35739	50 %	0 %	50 %	0 %	449092602
70	NC_020239	TA	3	6	35896	35901	50 %	50 %	0 %	0 %	449092602
71	NC_020239	AT	3	6	36341	36346	50 %	50 %	0 %	0 %	449092602
72	NC_020239	TA	3	6	36978	36983	50 %	50 %	0 %	0 %	449092602
73	NC_020239	TA	3	6	38171	38176	50 %	50 %	0 %	0 %	449092604
74	NC_020239	AT	3	6	38478	38483	50 %	50 %	0 %	0 %	449092604
75	NC_020239	TC	3	6	39032	39037	0 %	50 %	0 %	50 %	449092604
76	NC_020239	AG	3	6	39573	39578	50 %	0 %	50 %	0 %	449092604
77	NC_020239	GA	3	6	39889	39894	50 %	0 %	50 %	0 %	449092605
78	NC_020239	AT	3	6	39940	39945	50 %	50 %	0 %	0 %	449092605
79	NC_020239	TA	4	8	42521	42528	50 %	50 %	0 %	0 %	449092607
80	NC_020239	AT	4	8	43242	43249	50 %	50 %	0 %	0 %	449092608
81	NC_020239	AT	4	8	45024	45031	50 %	50 %	0 %	0 %	449092609
82	NC_020239	TA	3	6	45966	45971	50 %	50 %	0 %	0 %	449092610
83	NC_020239	AT	4	8	46127	46134	50 %	50 %	0 %	0 %	449092610
84	NC_020239	CT	3	6	46149	46154	0 %	50 %	0 %	50 %	449092610
85	NC_020239	TG	3	6	47037	47042	0 %	50 %	50 %	0 %	449092613
86	NC_020239	TA	3	6	47689	47694	50 %	50 %	0 %	0 %	449092614
87	NC_020239	TA	3	6	47742	47747	50 %	50 %	0 %	0 %	449092614
88	NC_020239	AT	3	6	48599	48604	50 %	50 %	0 %	0 %	449092615
89	NC_020239	AT	3	6	48935	48940	50 %	50 %	0 %	0 %	449092616
90	NC_020239	TA	3	6	49036	49041	50 %	50 %	0 %	0 %	449092616
91	NC_020239	GT	3	6	49091	49096	0 %	50 %	50 %	0 %	449092616
92	NC_020239	AT	3	6	49192	49197	50 %	50 %	0 %	0 %	449092616
93	NC_020239	TA	3	6	49265	49270	50 %	50 %	0 %	0 %	449092616
94	NC_020239	TC	3	6	49469	49474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020239	TA	3	6	49617	49622	50 %	50 %	0 %	0 %	449092617
96	NC_020239	AT	3	6	49667	49672	50 %	50 %	0 %	0 %	449092617
97	NC_020239	TA	3	6	50109	50114	50 %	50 %	0 %	0 %	449092618
98	NC_020239	AT	3	6	50132	50137	50 %	50 %	0 %	0 %	449092618
99	NC_020239	TA	3	6	50370	50375	50 %	50 %	0 %	0 %	449092618
100	NC_020239	TA	3	6	51013	51018	50 %	50 %	0 %	0 %	449092620
101	NC_020239	AT	3	6	51197	51202	50 %	50 %	0 %	0 %	449092620
102	NC_020239	AT	3	6	51316	51321	50 %	50 %	0 %	0 %	449092620
103	NC_020239	AT	3	6	51396	51401	50 %	50 %	0 %	0 %	449092620
104	NC_020239	AT	3	6	53899	53904	50 %	50 %	0 %	0 %	449092621
105	NC_020239	AT	3	6	54230	54235	50 %	50 %	0 %	0 %	449092622
106	NC_020239	CA	3	6	55272	55277	50 %	0 %	0 %	50 %	449092623
107	NC_020239	TA	3	6	55835	55840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020239	AG	3	6	55879	55884	50 %	0 %	50 %	0 %	449092624
109	NC_020239	AG	3	6	57309	57314	50 %	0 %	50 %	0 %	449092626
110	NC_020239	CT	3	6	57328	57333	0 %	50 %	0 %	50 %	449092626
111	NC_020239	GA	3	6	57722	57727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020239	TA	3	6	57971	57976	50 %	50 %	0 %	0 %	449092627
113	NC_020239	GT	3	6	58585	58590	0 %	50 %	50 %	0 %	449092629
114	NC_020239	AT	3	6	59239	59244	50 %	50 %	0 %	0 %	449092630
115	NC_020239	TA	3	6	59838	59843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020239	AT	3	6	60182	60187	50 %	50 %	0 %	0 %	449092632
117	NC_020239	AG	3	6	61091	61096	50 %	0 %	50 %	0 %	449092635
118	NC_020239	CT	3	6	61454	61459	0 %	50 %	0 %	50 %	449092635
119	NC_020239	AT	3	6	61773	61778	50 %	50 %	0 %	0 %	449092636
120	NC_020239	GT	3	6	62148	62153	0 %	50 %	50 %	0 %	449092637
121	NC_020239	AT	4	8	62488	62495	50 %	50 %	0 %	0 %	449092638
122	NC_020239	AT	3	6	63195	63200	50 %	50 %	0 %	0 %	449092640
123	NC_020239	GT	3	6	63390	63395	0 %	50 %	50 %	0 %	449092640
124	NC_020239	TA	3	6	64488	64493	50 %	50 %	0 %	0 %	449092643
125	NC_020239	TA	3	6	64522	64527	50 %	50 %	0 %	0 %	449092643
126	NC_020239	AT	3	6	64758	64763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020239	GA	3	6	64856	64861	50 %	0 %	50 %	0 %	449092644
128	NC_020239	AT	3	6	66028	66033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020239	TA	3	6	66565	66570	50 %	50 %	0 %	0 %	449092645
130	NC_020239	TA	3	6	66777	66782	50 %	50 %	0 %	0 %	449092645
131	NC_020239	AT	3	6	66821	66826	50 %	50 %	0 %	0 %	449092645
132	NC_020239	AG	3	6	67209	67214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020239	AT	3	6	67433	67438	50 %	50 %	0 %	0 %	449092646
134	NC_020239	AG	3	6	68277	68282	50 %	0 %	50 %	0 %	449092648
135	NC_020239	AG	3	6	68510	68515	50 %	0 %	50 %	0 %	449092649
136	NC_020239	CT	3	6	68529	68534	0 %	50 %	0 %	50 %	449092649
137	NC_020239	TC	3	6	68751	68756	0 %	50 %	0 %	50 %	449092649
138	NC_020239	CT	3	6	68812	68817	0 %	50 %	0 %	50 %	449092649
139	NC_020239	TA	3	6	68915	68920	50 %	50 %	0 %	0 %	449092649
140	NC_020239	AT	3	6	69081	69086	50 %	50 %	0 %	0 %	449092650
141	NC_020239	TA	3	6	69292	69297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020239	AC	3	6	70005	70010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020239	TA	3	6	70162	70167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020239	GT	4	8	70367	70374	0 %	50 %	50 %	0 %	449092652
145	NC_020239	GA	4	8	70510	70517	50 %	0 %	50 %	0 %	449092653
146	NC_020239	TA	3	6	70678	70683	50 %	50 %	0 %	0 %	449092653
147	NC_020239	TA	3	6	71322	71327	50 %	50 %	0 %	0 %	449092653
148	NC_020239	GA	3	6	71384	71389	50 %	0 %	50 %	0 %	449092653
149	NC_020239	TA	3	6	71704	71709	50 %	50 %	0 %	0 %	449092654
150	NC_020239	TA	3	6	72602	72607	50 %	50 %	0 %	0 %	449092654
151	NC_020239	AT	3	6	72950	72955	50 %	50 %	0 %	0 %	449092655
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.