MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT77

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020239	AT	3	6	300	305	50 %	50 %	0 %	0 %	449092564
2	NC_020239	AT	3	6	2025	2030	50 %	50 %	0 %	0 %	449092565
3	NC_020239	TA	3	6	2188	2193	50 %	50 %	0 %	0 %	449092565
4	NC_020239	TC	3	6	2688	2693	0 %	50 %	0 %	50 %	449092567
5	NC_020239	AT	3	6	2792	2797	50 %	50 %	0 %	0 %	449092567
6	NC_020239	TA	3	6	3156	3161	50 %	50 %	0 %	0 %	449092567
7	NC_020239	AT	3	6	3474	3479	50 %	50 %	0 %	0 %	449092567
8	NC_020239	AT	3	6	4318	4323	50 %	50 %	0 %	0 %	449092568
9	NC_020239	CA	3	6	4333	4338	50 %	0 %	0 %	50 %	449092568
10	NC_020239	GT	3	6	4809	4814	0 %	50 %	50 %	0 %	449092568
11	NC_020239	TA	3	6	5556	5561	50 %	50 %	0 %	0 %	449092568
12	NC_020239	AC	3	6	7601	7606	50 %	0 %	0 %	50 %	449092569
13	NC_020239	AT	3	6	9414	9419	50 %	50 %	0 %	0 %	449092572
14	NC_020239	TA	3	6	10256	10261	50 %	50 %	0 %	0 %	449092574
15	NC_020239	AC	3	6	10929	10934	50 %	0 %	0 %	50 %	449092575
16	NC_020239	AT	3	6	11555	11560	50 %	50 %	0 %	0 %	449092577
17	NC_020239	TA	3	6	11694	11699	50 %	50 %	0 %	0 %	449092577
18	NC_020239	AT	3	6	13257	13262	50 %	50 %	0 %	0 %	449092578
19	NC_020239	AT	3	6	14010	14015	50 %	50 %	0 %	0 %	449092579
20	NC_020239	CA	3	6	15708	15713	50 %	0 %	0 %	50 %	449092582
21	NC_020239	AT	4	8	15967	15974	50 %	50 %	0 %	0 %	449092582
22	NC_020239	AC	3	6	16192	16197	50 %	0 %	0 %	50 %	449092582
23	NC_020239	AT	3	6	16218	16223	50 %	50 %	0 %	0 %	449092582
24	NC_020239	TA	3	6	16865	16870	50 %	50 %	0 %	0 %	449092583
25	NC_020239	TA	3	6	17212	17217	50 %	50 %	0 %	0 %	449092583
26	NC_020239	TG	3	6	17298	17303	0 %	50 %	50 %	0 %	449092583
27	NC_020239	AT	3	6	18403	18408	50 %	50 %	0 %	0 %	449092584
28	NC_020239	TC	3	6	18869	18874	0 %	50 %	0 %	50 %	449092584
29	NC_020239	CT	3	6	19359	19364	0 %	50 %	0 %	50 %	449092584
30	NC_020239	AG	3	6	20421	20426	50 %	0 %	50 %	0 %	449092586
31	NC_020239	AT	3	6	22809	22814	50 %	50 %	0 %	0 %	449092589
32	NC_020239	AT	3	6	24046	24051	50 %	50 %	0 %	0 %	449092591
33	NC_020239	AG	3	6	24223	24228	50 %	0 %	50 %	0 %	449092591
34	NC_020239	AT	3	6	25657	25662	50 %	50 %	0 %	0 %	449092592
35	NC_020239	TG	3	6	26383	26388	0 %	50 %	50 %	0 %	449092593
36	NC_020239	TC	3	6	26637	26642	0 %	50 %	0 %	50 %	449092593
37	NC_020239	TA	3	6	26882	26887	50 %	50 %	0 %	0 %	449092593
38	NC_020239	AG	3	6	28311	28316	50 %	0 %	50 %	0 %	449092595
39	NC_020239	CT	4	8	29688	29695	0 %	50 %	0 %	50 %	449092596
40	NC_020239	GA	4	8	30388	30395	50 %	0 %	50 %	0 %	449092598
41	NC_020239	AT	3	6	30650	30655	50 %	50 %	0 %	0 %	449092598
42	NC_020239	AT	3	6	31471	31476	50 %	50 %	0 %	0 %	449092598
43	NC_020239	AG	3	6	31618	31623	50 %	0 %	50 %	0 %	449092598
44	NC_020239	AC	3	6	31785	31790	50 %	0 %	0 %	50 %	449092598
45	NC_020239	AG	4	8	32849	32856	50 %	0 %	50 %	0 %	449092599
46	NC_020239	GA	3	6	33196	33201	50 %	0 %	50 %	0 %	449092599
47	NC_020239	TG	3	6	33204	33209	0 %	50 %	50 %	0 %	449092599
48	NC_020239	TA	3	6	33401	33406	50 %	50 %	0 %	0 %	449092599
49	NC_020239	GA	3	6	34279	34284	50 %	0 %	50 %	0 %	449092599
50	NC_020239	GA	3	6	34911	34916	50 %	0 %	50 %	0 %	449092601
51	NC_020239	AT	3	6	35435	35440	50 %	50 %	0 %	0 %	449092602
52	NC_020239	GA	3	6	35734	35739	50 %	0 %	50 %	0 %	449092602
53	NC_020239	TA	3	6	35896	35901	50 %	50 %	0 %	0 %	449092602
54	NC_020239	AT	3	6	36341	36346	50 %	50 %	0 %	0 %	449092602
55	NC_020239	TA	3	6	36978	36983	50 %	50 %	0 %	0 %	449092602
56	NC_020239	TA	3	6	38171	38176	50 %	50 %	0 %	0 %	449092604
57	NC_020239	AT	3	6	38478	38483	50 %	50 %	0 %	0 %	449092604
58	NC_020239	TC	3	6	39032	39037	0 %	50 %	0 %	50 %	449092604
59	NC_020239	AG	3	6	39573	39578	50 %	0 %	50 %	0 %	449092604
60	NC_020239	GA	3	6	39889	39894	50 %	0 %	50 %	0 %	449092605
61	NC_020239	AT	3	6	39940	39945	50 %	50 %	0 %	0 %	449092605
62	NC_020239	TA	4	8	42521	42528	50 %	50 %	0 %	0 %	449092607
63	NC_020239	AT	4	8	43242	43249	50 %	50 %	0 %	0 %	449092608
64	NC_020239	AT	4	8	45024	45031	50 %	50 %	0 %	0 %	449092609
65	NC_020239	TA	3	6	45966	45971	50 %	50 %	0 %	0 %	449092610
66	NC_020239	AT	4	8	46127	46134	50 %	50 %	0 %	0 %	449092610
67	NC_020239	CT	3	6	46149	46154	0 %	50 %	0 %	50 %	449092610
68	NC_020239	TG	3	6	47037	47042	0 %	50 %	50 %	0 %	449092613
69	NC_020239	TA	3	6	47689	47694	50 %	50 %	0 %	0 %	449092614
70	NC_020239	TA	3	6	47742	47747	50 %	50 %	0 %	0 %	449092614
71	NC_020239	AT	3	6	48599	48604	50 %	50 %	0 %	0 %	449092615
72	NC_020239	AT	3	6	48935	48940	50 %	50 %	0 %	0 %	449092616
73	NC_020239	TA	3	6	49036	49041	50 %	50 %	0 %	0 %	449092616
74	NC_020239	GT	3	6	49091	49096	0 %	50 %	50 %	0 %	449092616
75	NC_020239	AT	3	6	49192	49197	50 %	50 %	0 %	0 %	449092616
76	NC_020239	TA	3	6	49265	49270	50 %	50 %	0 %	0 %	449092616
77	NC_020239	TA	3	6	49617	49622	50 %	50 %	0 %	0 %	449092617
78	NC_020239	AT	3	6	49667	49672	50 %	50 %	0 %	0 %	449092617
79	NC_020239	TA	3	6	50109	50114	50 %	50 %	0 %	0 %	449092618
80	NC_020239	AT	3	6	50132	50137	50 %	50 %	0 %	0 %	449092618
81	NC_020239	TA	3	6	50370	50375	50 %	50 %	0 %	0 %	449092618
82	NC_020239	TA	3	6	51013	51018	50 %	50 %	0 %	0 %	449092620
83	NC_020239	AT	3	6	51197	51202	50 %	50 %	0 %	0 %	449092620
84	NC_020239	AT	3	6	51316	51321	50 %	50 %	0 %	0 %	449092620
85	NC_020239	AT	3	6	51396	51401	50 %	50 %	0 %	0 %	449092620
86	NC_020239	AT	3	6	53899	53904	50 %	50 %	0 %	0 %	449092621
87	NC_020239	AT	3	6	54230	54235	50 %	50 %	0 %	0 %	449092622
88	NC_020239	CA	3	6	55272	55277	50 %	0 %	0 %	50 %	449092623
89	NC_020239	AG	3	6	55879	55884	50 %	0 %	50 %	0 %	449092624
90	NC_020239	AG	3	6	57309	57314	50 %	0 %	50 %	0 %	449092626
91	NC_020239	CT	3	6	57328	57333	0 %	50 %	0 %	50 %	449092626
92	NC_020239	TA	3	6	57971	57976	50 %	50 %	0 %	0 %	449092627
93	NC_020239	GT	3	6	58585	58590	0 %	50 %	50 %	0 %	449092629
94	NC_020239	AT	3	6	59239	59244	50 %	50 %	0 %	0 %	449092630
95	NC_020239	AT	3	6	60182	60187	50 %	50 %	0 %	0 %	449092632
96	NC_020239	AG	3	6	61091	61096	50 %	0 %	50 %	0 %	449092635
97	NC_020239	CT	3	6	61454	61459	0 %	50 %	0 %	50 %	449092635
98	NC_020239	AT	3	6	61773	61778	50 %	50 %	0 %	0 %	449092636
99	NC_020239	GT	3	6	62148	62153	0 %	50 %	50 %	0 %	449092637
100	NC_020239	AT	4	8	62488	62495	50 %	50 %	0 %	0 %	449092638
101	NC_020239	AT	3	6	63195	63200	50 %	50 %	0 %	0 %	449092640
102	NC_020239	GT	3	6	63390	63395	0 %	50 %	50 %	0 %	449092640
103	NC_020239	TA	3	6	64488	64493	50 %	50 %	0 %	0 %	449092643
104	NC_020239	TA	3	6	64522	64527	50 %	50 %	0 %	0 %	449092643
105	NC_020239	GA	3	6	64856	64861	50 %	0 %	50 %	0 %	449092644
106	NC_020239	TA	3	6	66565	66570	50 %	50 %	0 %	0 %	449092645
107	NC_020239	TA	3	6	66777	66782	50 %	50 %	0 %	0 %	449092645
108	NC_020239	AT	3	6	66821	66826	50 %	50 %	0 %	0 %	449092645
109	NC_020239	AT	3	6	67433	67438	50 %	50 %	0 %	0 %	449092646
110	NC_020239	AG	3	6	68277	68282	50 %	0 %	50 %	0 %	449092648
111	NC_020239	AG	3	6	68510	68515	50 %	0 %	50 %	0 %	449092649
112	NC_020239	CT	3	6	68529	68534	0 %	50 %	0 %	50 %	449092649
113	NC_020239	TC	3	6	68751	68756	0 %	50 %	0 %	50 %	449092649
114	NC_020239	CT	3	6	68812	68817	0 %	50 %	0 %	50 %	449092649
115	NC_020239	TA	3	6	68915	68920	50 %	50 %	0 %	0 %	449092649
116	NC_020239	AT	3	6	69081	69086	50 %	50 %	0 %	0 %	449092650
117	NC_020239	GT	4	8	70367	70374	0 %	50 %	50 %	0 %	449092652
118	NC_020239	GA	4	8	70510	70517	50 %	0 %	50 %	0 %	449092653
119	NC_020239	TA	3	6	70678	70683	50 %	50 %	0 %	0 %	449092653
120	NC_020239	TA	3	6	71322	71327	50 %	50 %	0 %	0 %	449092653
121	NC_020239	GA	3	6	71384	71389	50 %	0 %	50 %	0 %	449092653
122	NC_020239	TA	3	6	71704	71709	50 %	50 %	0 %	0 %	449092654
123	NC_020239	TA	3	6	72602	72607	50 %	50 %	0 %	0 %	449092654
124	NC_020239	AT	3	6	72950	72955	50 %	50 %	0 %	0 %	449092655
125	NC_020239	TC	3	6	73690	73695	0 %	50 %	0 %	50 %	449092656
126	NC_020239	AT	3	6	73880	73885	50 %	50 %	0 %	0 %	449092656
127	NC_020239	CT	3	6	73964	73969	0 %	50 %	0 %	50 %	449092656
128	NC_020239	AT	3	6	74816	74821	50 %	50 %	0 %	0 %	449092657

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.