MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73

Total Repeats: 365

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020238	CTATTA	2	12	1800	1811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020238	TTTCGT	2	12	10858	10869	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020238	TTTTCC	2	12	54288	54299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020238	TTATAT	2	12	81991	82002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020238	TATATT	2	12	82086	82097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020238	AGTCAA	2	12	87248	87259	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020238	AAGAGA	2	12	108169	108180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020238	CGAAAA	2	12	145375	145386	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020238	GTATGT	2	12	167100	167111	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020238	AAAATA	2	12	193947	193958	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020238	AAGGGG	2	12	195468	195479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020238	AGAGGT	2	12	198855	198866	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020238	AAAAGA	2	12	216394	216405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020238	TAAAAA	2	12	265697	265708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020238	CTTTTT	2	12	266753	266764	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020238	TATGTG	2	12	290825	290836	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020238	GAAAAA	2	12	293167	293178	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020238	TTTATT	2	12	296591	296602	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020238	AGAAGC	2	12	318646	318657	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020238	AGTATT	2	12	334330	334341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020238	TATAAA	2	12	371089	371100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020238	AAAAAT	2	12	387620	387631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020238	CTTTTT	2	12	406370	406381	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020238	ATTTGA	2	12	438415	438426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020238	GTGTAA	2	12	450534	450545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020238	AATGAT	2	12	457082	457093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020238	ATATCG	2	12	485736	485747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020238	TAAAAA	2	12	517183	517194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020238	AAAAAT	2	12	518550	518561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020238	ATTTTT	2	12	543202	543213	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020238	CCAATT	2	12	549152	549163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020238	AATGAA	2	12	578026	578037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020238	TGTATA	2	12	673725	673736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020238	ATTTAT	2	12	682131	682142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020238	ATGAAA	2	12	718045	718056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020238	GTTTTT	2	12	761399	761410	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020238	TATTAA	2	12	768339	768350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020238	TAAAAA	2	12	780818	780829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020238	ACTTAA	2	12	832539	832550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020238	CTTTTT	2	12	844239	844250	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020238	TTAAAA	2	12	854129	854140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020238	AACAAA	2	12	881176	881187	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020238	ATCAAT	2	12	905695	905706	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020238	GTATAT	2	12	913248	913259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020238	ATGTAA	2	12	936649	936660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020238	TTAAAG	2	12	951619	951630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020238	AATATT	2	12	961151	961162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020238	AAATGT	2	12	980937	980948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020238	ACGAGA	2	12	980986	980997	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020238	GTTTTT	2	12	986541	986552	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020238	GTATAT	2	12	997829	997840	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020238	ATTACC	2	12	1007883	1007894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020238	TATGAA	2	12	1020827	1020838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020238	GATGTG	2	12	1026171	1026182	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020238	TGGGAG	2	12	1034679	1034690	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020238	ATTTAA	2	12	1046392	1046403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020238	AAAAAG	2	12	1080783	1080794	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020238	TTTAAT	2	12	1081854	1081865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020238	TTTAAT	2	12	1084778	1084789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020238	TCTTTT	2	12	1088304	1088315	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020238	TACTTT	2	12	1088316	1088327	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020238	AAAATA	2	12	1094695	1094706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020238	TTATCT	2	12	1095754	1095765	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020238	CATATG	2	12	1098551	1098562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020238	TTTTTC	2	12	1098627	1098638	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020238	AATGAT	2	12	1101672	1101683	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020238	GCTAAG	2	12	1102122	1102133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020238	GCAATA	2	12	1130154	1130165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020238	ATTAAA	2	12	1131812	1131823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020238	TACTTT	2	12	1141116	1141127	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020238	TCTTTT	2	12	1166689	1166700	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020238	ATACAT	2	12	1178550	1178561	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020238	TGGAAT	2	12	1214057	1214068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020238	CTTTTC	2	12	1215686	1215697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020238	TAATAT	2	12	1222985	1222996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020238	TCCATT	2	12	1224278	1224289	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020238	AAATTC	2	12	1228960	1228971	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020238	GAAGTA	2	12	1268527	1268538	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020238	ATAGGA	2	12	1329629	1329640	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020238	AATTAA	2	12	1340795	1340806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020238	TTTTTA	2	12	1343094	1343105	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020238	TGTTTC	2	12	1353958	1353969	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_020238	AAATAT	2	12	1360296	1360307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020238	GAAATA	2	12	1367999	1368010	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020238	AGCGAA	2	12	1386664	1386675	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020238	TTGAAA	2	12	1389610	1389621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020238	AAGTAT	2	12	1397314	1397325	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020238	ATATTC	2	12	1447133	1447144	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020238	ATTTGA	2	12	1448554	1448565	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020238	AGAAAT	2	12	1449450	1449461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020238	GGAGAG	2	12	1451817	1451828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020238	AAATAA	2	12	1454236	1454247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020238	AAAGAA	2	12	1455042	1455053	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020238	GAAAAA	2	12	1483928	1483939	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020238	AATGAT	2	12	1504390	1504401	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020238	AGGATA	2	12	1510188	1510199	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020238	AAAAGT	2	12	1522272	1522283	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020238	AATAAA	2	12	1530890	1530901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020238	TCTTTT	2	12	1553438	1553449	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020238	ATACAA	2	12	1579142	1579153	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020238	GTATAT	2	12	1605804	1605815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020238	TTATCA	2	12	1615011	1615022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020238	AATAGG	2	12	1653178	1653189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020238	TCTTAT	2	12	1767239	1767250	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020238	ATAATT	2	12	1774778	1774789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020238	GCTTAT	2	12	1809646	1809657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020238	TATAAC	2	12	1820953	1820964	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020238	ACATTA	2	12	1829922	1829933	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020238	TTTATT	2	12	1842363	1842374	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020238	AATAGA	2	12	1853075	1853086	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020238	ATTTTT	2	12	1912899	1912910	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020238	GTATAC	2	12	1913423	1913434	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_020238	TTTTTA	2	12	1926735	1926746	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020238	TTCTTT	2	12	1943302	1943313	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020238	TATGGA	2	12	1965193	1965204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020238	ATTTAA	2	12	1970446	1970457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020238	AAAATC	2	12	1977829	1977840	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020238	ATATTT	2	12	1988530	1988541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020238	TTTTTA	2	12	2016427	2016438	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020238	AGTTTT	2	12	2022179	2022190	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020238	TTACTG	2	12	2028255	2028266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020238	TCATAC	2	12	2028298	2028309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020238	AAAGAG	2	12	2042195	2042206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020238	AAATAA	2	12	2046717	2046728	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020238	ACCATC	2	12	2050121	2050132	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020238	TAAAAA	2	12	2066459	2066470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020238	ATGTAA	2	12	2066642	2066653	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020238	TATGAA	3	18	2070502	2070519	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020238	ATATGA	2	12	2074192	2074203	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020238	TTTGTT	2	12	2097860	2097871	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020238	AATGAA	2	12	2110510	2110521	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020238	AAATTA	2	12	2119369	2119380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020238	ATTCTT	2	12	2123329	2123340	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_020238	TATTTT	2	12	2132209	2132220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020238	AAAATT	2	12	2135153	2135164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020238	CATATA	2	12	2135330	2135341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_020238	TTTAAT	2	12	2140221	2140232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020238	TAAAAA	2	12	2151900	2151911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020238	AAAAGA	2	12	2171695	2171706	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_020238	AGTAAA	2	12	2190233	2190244	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_020238	AAGAAA	2	12	2213236	2213247	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020238	TATATT	2	12	2274673	2274684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_020238	AAAAAT	2	12	2390994	2391005	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_020238	ATGAGG	2	12	2484927	2484938	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020238	TTATAA	2	12	2490184	2490195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020238	TTTTAC	2	12	2518930	2518941	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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161	NC_020238	TATAAA	2	12	2524704	2524715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_020238	AAGAAA	2	12	3626511	3626522	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
249	NC_020238	TTCTTT	2	12	3634143	3634154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_020238	ACTGCA	2	12	3647212	3647223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_020238	AGTTTG	2	12	3666833	3666844	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_020238	ATTCTC	2	12	3672523	3672534	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_020238	TCAATT	2	12	3672554	3672565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_020238	GTTAAA	2	12	3709682	3709693	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_020238	AGGGAT	2	12	3818741	3818752	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_020238	TAAAAA	2	12	3880047	3880058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_020238	TTTCAA	2	12	3900037	3900048	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
261	NC_020238	TACTTT	2	12	3921087	3921098	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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275	NC_020238	TAAAAA	2	12	4215723	4215734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_020238	AATATA	2	12	4384731	4384742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_020238	AGTATA	2	12	4418541	4418552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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365	NC_020238	TACCTC	2	12	5636666	5636677	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.