MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73

Total Repeats: 2163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020238	TCTTTG	2	12	3608	3619	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	449086674
2	NC_020238	TGGCGG	2	12	4863	4874	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	449086675
3	NC_020238	TGCACG	2	12	5688	5699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	449086675
4	NC_020238	CCGATG	2	12	6041	6052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	449086675
5	NC_020238	CAAGCG	2	12	7808	7819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086676
6	NC_020238	TGAAGA	2	12	8035	8046	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449086676
7	NC_020238	GGCAAT	2	12	17367	17378	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449086679
8	NC_020238	GAACTG	2	12	17697	17708	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449086679
9	NC_020238	AAAGAT	2	12	17977	17988	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449086679
10	NC_020238	CAGGAA	2	12	18924	18935	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	449086680
11	NC_020238	CAAGAT	2	12	24494	24505	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449086687
12	NC_020238	GGTATG	2	12	34964	34975	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	449086695
13	NC_020238	TGCACA	2	12	34999	35010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	449086695
14	NC_020238	CGTATA	2	12	35634	35645	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449086695
15	NC_020238	AGCTTT	2	12	37138	37149	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	449086697
16	NC_020238	AAATGA	2	12	37725	37736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449086698
17	NC_020238	TGTAGA	2	12	37830	37841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086698
18	NC_020238	TTGAAA	2	12	39955	39966	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449086702
19	NC_020238	TGGAAG	2	12	43025	43036	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	449086704
20	NC_020238	GCACGT	2	12	52282	52293	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	449086715
21	NC_020238	AAGCAA	2	12	54760	54771	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	449086720
22	NC_020238	ATTAAC	2	12	56676	56687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	449086720
23	NC_020238	TGCATA	2	12	57150	57161	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449086720
24	NC_020238	TTTCAT	2	12	59174	59185	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	449086722
25	NC_020238	TTTAGG	2	12	60423	60434	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	449086723
26	NC_020238	TATTGA	2	12	66278	66289	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449086729
27	NC_020238	CAGGTA	2	12	70044	70055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449086732
28	NC_020238	TGTCGG	2	12	70138	70149	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	449086732
29	NC_020238	AGCGTT	2	12	72395	72406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449086734
30	NC_020238	GGTGTT	2	12	72849	72860	0 %	50 %	50 %	0 %	449086734
31	NC_020238	AAAGTA	2	12	73044	73055	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449086734
32	NC_020238	CTGGTG	2	12	73911	73922	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	449086735
33	NC_020238	AAGGTG	2	12	77525	77536	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	449086739
34	NC_020238	GTATCT	2	12	79115	79126	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	449086742
35	NC_020238	ATATCA	2	12	80402	80413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	449086744
36	NC_020238	CAAATA	2	12	88128	88139	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	449086746
37	NC_020238	GTGAAG	2	12	89888	89899	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	449086748
38	NC_020238	ATGCAA	2	12	92221	92232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449086749
39	NC_020238	AGAGGC	2	12	94148	94159	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	449086750
40	NC_020238	AGAGGT	2	12	95163	95174	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	449086751
41	NC_020238	CAGATG	2	12	96722	96733	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449086753
42	NC_020238	GCAGTA	2	12	97776	97787	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449086754
43	NC_020238	GTAGAA	2	12	104276	104287	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449086762
44	NC_020238	TCTGGT	2	12	105106	105117	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	449086763
45	NC_020238	GAAGCT	2	12	105705	105716	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449086764
46	NC_020238	GCAAGA	2	12	117222	117233	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	449086773
47	NC_020238	AGTAGA	2	12	117327	117338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449086773
48	NC_020238	AGCGTG	2	12	118100	118111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	449086773
49	NC_020238	ATTCGA	2	12	118620	118631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449086773
50	NC_020238	AAGTTG	2	12	118874	118885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086773
51	NC_020238	GCTAAA	2	12	119260	119271	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449086774
52	NC_020238	GAAACT	2	12	119467	119478	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449086774
53	NC_020238	CAAGCT	2	12	120061	120072	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	449086774
54	NC_020238	AACTGA	2	12	121306	121317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449086777
55	NC_020238	TAAAGG	2	12	121528	121539	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449086777
56	NC_020238	GAAATC	2	12	122732	122743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449086779
57	NC_020238	ACAAGC	2	12	125081	125092	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	449086784
58	NC_020238	TTGAAG	2	12	128260	128271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086792
59	NC_020238	AAAGGT	2	12	128370	128381	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449086792
60	NC_020238	TAGTTG	2	12	128957	128968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	449086794
61	NC_020238	CTGAAA	2	12	131500	131511	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449086798
62	NC_020238	TAAACA	2	12	133187	133198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	449086801
63	NC_020238	TTAGGT	2	12	135108	135119	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	449086804
64	NC_020238	ATTTTT	2	12	137460	137471	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	449086808
65	NC_020238	TGCAGT	2	12	141564	141575	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449086814
66	NC_020238	AGCAAA	2	12	154827	154838	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	449086822
67	NC_020238	CAAAAT	2	12	155959	155970	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	449086822
68	NC_020238	AAGATA	2	12	155972	155983	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449086822
69	NC_020238	GATGGC	2	12	156770	156781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	449086823
70	NC_020238	CGCATC	2	12	158136	158147	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	449086824
71	NC_020238	ATCGTA	2	12	158516	158527	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449086824
72	NC_020238	TGAAAG	2	12	159965	159976	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449086825
73	NC_020238	CAAAAT	2	12	169875	169886	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	449086834
74	NC_020238	GTGGTT	2	12	177537	177548	0 %	50 %	50 %	0 %	449086842
75	NC_020238	AAGTTA	2	12	181249	181260	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449086844
76	NC_020238	TCTGGA	2	12	181261	181272	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449086844
77	NC_020238	ATTTAT	2	12	188795	188806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086851
78	NC_020238	TTAATC	2	12	191974	191985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086854
79	NC_020238	TATGAA	2	12	193726	193737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449086857
80	NC_020238	CTAATA	2	12	198310	198321	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	449086862
81	NC_020238	TATATT	2	12	198908	198919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086863
82	NC_020238	TTCATA	2	12	200615	200626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086865
83	NC_020238	TTATAT	2	12	205122	205133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086868
84	NC_020238	ATACGA	2	12	205299	205310	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449086868
85	NC_020238	GAAAGA	2	12	211748	211759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086875
86	NC_020238	TAAATG	2	12	212425	212436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449086875
87	NC_020238	GAGAAT	2	12	212809	212820	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449086876
88	NC_020238	TTTCTA	2	12	214204	214215	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	449086877
89	NC_020238	GAATTT	2	12	214801	214812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449086878
90	NC_020238	CCATAT	2	12	223028	223039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086888
91	NC_020238	TGAAAA	2	12	227762	227773	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449086891
92	NC_020238	CATCTC	2	12	228314	228325	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	449086892
93	NC_020238	ATATGA	2	12	228575	228586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449086892
94	NC_020238	TAAAGA	2	12	228744	228755	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449086892
95	NC_020238	AAAACA	2	12	230777	230788	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	449086895
96	NC_020238	GTAAGT	2	12	231182	231193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086895
97	NC_020238	CAGGGA	2	12	236445	236456	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	449086901
98	NC_020238	AGCTGA	2	12	244254	244265	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449086903
99	NC_020238	GGATAT	2	12	248551	248562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086907
100	NC_020238	GGCATG	2	12	252278	252289	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	449086911
101	NC_020238	CTTCTA	2	12	255558	255569	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	449086914
102	NC_020238	ATACAA	2	12	257168	257179	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	449086918
103	NC_020238	GATATG	2	12	271277	271288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086949
104	NC_020238	AGAACA	2	12	272737	272748	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	449086951
105	NC_020238	AAAATT	2	12	279131	279142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086959
106	NC_020238	TTGATA	2	12	281829	281840	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449086960
107	NC_020238	GTAAAA	2	12	282333	282344	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449086960
108	NC_020238	CATTTA	2	12	285695	285706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086961
109	NC_020238	TTACTG	2	12	286862	286873	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	449086961
110	NC_020238	ATTGAA	2	12	287002	287013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	449086961
111	NC_020238	CTTTCA	2	12	288113	288124	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	449086961
112	NC_020238	AAATTC	2	12	290258	290269	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	449086965
113	NC_020238	ATCATT	2	12	295856	295867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086969
114	NC_020238	GTTTTA	2	12	315733	315744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	449086977
115	NC_020238	CATCCG	2	12	325871	325882	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	449086982
116	NC_020238	TTAAAA	2	12	329253	329264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086986
117	NC_020238	TTATAT	2	12	331032	331043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086987
118	NC_020238	AAACAA	2	12	331198	331209	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	449086987
119	NC_020238	CATTTT	2	12	332271	332282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	449086989
120	NC_020238	TTTGCA	2	12	332321	332332	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	449086989
121	NC_020238	GTAATC	2	12	333155	333166	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449086989
122	NC_020238	TTTATT	2	12	339729	339740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	449086990
123	NC_020238	TGTACG	2	12	346473	346484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449086997
124	NC_020238	TTATGA	2	12	348710	348721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	449086998
125	NC_020238	CATCTT	2	12	353775	353786	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	449087003
126	NC_020238	GCAGGT	2	12	356519	356530	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	449087008
127	NC_020238	CAGAAG	2	12	356673	356684	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	449087008
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129	NC_020238	CAAATC	2	12	359445	359456	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	449087009
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131	NC_020238	TTAAAA	2	12	363384	363395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449087012
132	NC_020238	TTGCAA	2	12	364240	364251	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449087012
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135	NC_020238	TTGCTG	2	12	370318	370329	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	449087018
136	NC_020238	TGAGCA	2	12	374004	374015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449087023
137	NC_020238	AATGAC	2	12	377731	377742	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449087026
138	NC_020238	CAGCTT	2	12	382936	382947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	449087031
139	NC_020238	ACCAGC	2	12	383126	383137	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	449087031
140	NC_020238	AAATTC	2	12	385951	385962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	449087033
141	NC_020238	AATTGC	2	12	387406	387417	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449087034
142	NC_020238	AAATTA	2	12	388078	388089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449087035
143	NC_020238	ATCATT	2	12	390669	390680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449087037
144	NC_020238	CAATAT	2	12	390743	390754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	449087037
145	NC_020238	ACTTTA	2	12	393266	393277	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449087039
146	NC_020238	ATGGAT	2	12	402959	402970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449087067
147	NC_020238	ATGTTT	2	12	405309	405320	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	449087070
148	NC_020238	ATAAAG	2	12	407543	407554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449087075
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151	NC_020238	ATGTTT	2	12	413544	413555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	449087082
152	NC_020238	CCACAA	2	12	414801	414812	50 %	0 %	0 %	50 %	449087084
153	NC_020238	CTGAAA	2	12	421068	421079	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449087092
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221	NC_020238	GGAAGA	2	12	561821	561832	50 %	0 %	50 %	0 %	449087226
222	NC_020238	AGGGCA	2	12	563123	563134	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	449087228
223	NC_020238	TTTTCT	2	12	565281	565292	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	449087230
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225	NC_020238	ATTTAT	2	12	566395	566406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449087231
226	NC_020238	GCGATG	2	12	567971	567982	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	449087234
227	NC_020238	ATAGAG	2	12	568176	568187	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449087234
228	NC_020238	GAGATA	3	18	568941	568958	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449087234
229	NC_020238	GGCCAG	2	12	569761	569772	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	449087235
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231	NC_020238	AAAATT	2	12	571466	571477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449087237
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