MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium urealyticum DSM 7111

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020230	GTCGAC	2	12	8105	8116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020230	GGGGGT	2	12	23633	23644	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020230	GGCAGC	2	12	25012	25023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020230	GTGGCC	2	12	51440	51451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020230	AACCCG	2	12	91739	91750	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020230	CGACGG	2	12	119898	119909	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020230	AGCGAA	2	12	141554	141565	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020230	CCCGTA	2	12	142333	142344	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020230	GCCGGG	2	12	151161	151172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020230	AGGGTA	2	12	317010	317021	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020230	CACAAT	2	12	333198	333209	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020230	CGGTTG	2	12	334247	334258	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020230	CGTGGG	2	12	417110	417121	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020230	CTTACC	2	12	420200	420211	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020230	GGGAAC	2	12	425880	425891	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020230	AAAGGT	2	12	425901	425912	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020230	TTGCTA	2	12	435676	435687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020230	GTGGCC	2	12	435718	435729	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020230	GCAGGG	2	12	450035	450046	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020230	GAACGG	2	12	468208	468219	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020230	GGTTCG	2	12	504726	504737	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020230	CGACAA	2	12	581626	581637	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020230	CGGTGA	2	12	583186	583197	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020230	TTGCCG	2	12	583725	583736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020230	GCTGAT	2	12	632949	632960	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020230	GTTAAA	2	12	638969	638980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020230	AGGGGC	2	12	671534	671545	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020230	TGCCCA	2	12	682134	682145	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020230	GCACTT	2	12	737472	737483	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020230	GGGCCA	2	12	740012	740023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020230	AGCCGA	2	12	755408	755419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020230	AAGCAG	2	12	799282	799293	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020230	TTCGGT	2	12	802779	802790	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020230	CACCGC	2	12	831823	831834	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_020230	CGAGGA	2	12	872708	872719	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020230	CGCCAA	2	12	895670	895681	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020230	GGGTTT	2	12	949960	949971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020230	TGGCCC	2	12	1083977	1083988	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020230	CGTGGG	2	12	1140594	1140605	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020230	CAACCT	2	12	1182041	1182052	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020230	AAGTTC	2	12	1249088	1249099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020230	TTAACA	2	12	1249104	1249115	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020230	TACGGG	2	12	1286282	1286293	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020230	TTCGCT	2	12	1287061	1287072	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020230	CCACAA	2	12	1290190	1290201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020230	CTACCC	2	12	1292068	1292079	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_020230	CCCCAC	2	12	1419400	1419411	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
48	NC_020230	ACCCGA	2	12	1443373	1443384	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020230	CCCGAC	2	12	1496617	1496628	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_020230	CCCGAC	2	12	1496747	1496758	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_020230	CCCGAC	2	12	1496812	1496823	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020230	CCCGAC	2	12	1496896	1496907	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_020230	CCCAGC	2	12	1502126	1502137	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_020230	CGGCGT	2	12	1505388	1505399	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020230	CTTTTT	2	12	1516561	1516572	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020230	TCACCC	2	12	1519749	1519760	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_020230	CCGGGC	2	12	1620908	1620919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020230	TTCGGT	2	12	1646915	1646926	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020230	GGAGCT	2	12	1707891	1707902	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020230	TCGCAA	2	12	1747245	1747256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020230	CGCCCA	2	12	1769183	1769194	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020230	CTGCCG	2	12	1778790	1778801	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020230	TACGGG	2	12	1817794	1817805	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020230	TTCGCT	2	12	1818573	1818584	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020230	TCGGGC	2	12	1848342	1848353	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020230	AGAAAA	2	12	1883420	1883431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020230	GTTGGT	2	12	1886376	1886387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020230	GGCCTA	2	12	1909737	1909748	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020230	GTTTTT	2	12	1910382	1910393	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020230	CCCCTC	2	12	1951119	1951130	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
71	NC_020230	GCTTCG	2	12	1989238	1989249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020230	CCCCTC	2	12	2009830	2009841	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
73	NC_020230	CACCAA	2	12	2012822	2012833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020230	TGAGAG	2	12	2033415	2033426	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020230	GGCGCT	2	12	2056270	2056281	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020230	AGCGCC	2	12	2067528	2067539	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020230	CCGGGG	7	42	2113074	2113115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020230	GACGTC	2	12	2125873	2125884	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020230	GGGATG	2	12	2125939	2125950	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020230	ACTCCT	2	12	2157192	2157203	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020230	ATCGCC	2	12	2216190	2216201	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020230	GGGGCT	2	12	2217354	2217365	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_020230	CACAGC	2	12	2232276	2232287	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020230	ACCGCG	2	12	2232395	2232406	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020230	CTGCGC	2	12	2237768	2237779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020230	CGGGGC	2	12	2280605	2280616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020230	CGGCTT	2	12	2289204	2289215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020230	GTCCTT	2	12	2289255	2289266	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020230	GTCCTT	2	12	2289516	2289527	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020230	GTCCTT	2	12	2289778	2289789	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020230	GTGACG	2	12	2290362	2290373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020230	AACCTC	2	12	2290538	2290549	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020230	GTCCTT	2	12	2290874	2290885	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020230	GTGACA	2	12	2290998	2291009	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020230	TCCTTG	2	12	2291527	2291538	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020230	GTCCTT	2	12	2292237	2292248	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020230	CGTTCG	2	12	2292323	2292334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020230	GCCGTC	2	12	2292369	2292380	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020230	GTCACC	2	12	2292405	2292416	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.