MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 1978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020229	TACCG	2	10	2304	2313	20 %	20 %	20 %	40 %	448819526
2	NC_020229	AATGA	2	10	2908	2917	60 %	20 %	20 %	0 %	448819526
3	NC_020229	TTTTG	2	10	3507	3516	0 %	80 %	20 %	0 %	448819526
4	NC_020229	TATAA	2	10	3932	3941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020229	TCAGC	2	10	5011	5020	20 %	20 %	20 %	40 %	448819527
6	NC_020229	ACGCC	2	10	7752	7761	20 %	0 %	20 %	60 %	448819530
7	NC_020229	TTAAC	2	10	10439	10448	40 %	40 %	0 %	20 %	448819534
8	NC_020229	TCAGC	2	10	11311	11320	20 %	20 %	20 %	40 %	448819535
9	NC_020229	ACTTA	2	10	12358	12367	40 %	40 %	0 %	20 %	448819537
10	NC_020229	TCGTT	2	10	15454	15463	0 %	60 %	20 %	20 %	448819542
11	NC_020229	TAAAT	2	10	16185	16194	60 %	40 %	0 %	0 %	448819543
12	NC_020229	CATAT	2	10	17458	17467	40 %	40 %	0 %	20 %	448819544
13	NC_020229	CCATC	2	10	22613	22622	20 %	20 %	0 %	60 %	448819548
14	NC_020229	AATTA	2	10	22754	22763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020229	CCCAT	2	10	24140	24149	20 %	20 %	0 %	60 %	448819551
16	NC_020229	TCACT	2	10	24668	24677	20 %	40 %	0 %	40 %	448819551
17	NC_020229	TTATC	2	10	24953	24962	20 %	60 %	0 %	20 %	448819551
18	NC_020229	TAAAC	2	10	25934	25943	60 %	20 %	0 %	20 %	448819552
19	NC_020229	CTTAG	2	10	26231	26240	20 %	40 %	20 %	20 %	448819553
20	NC_020229	TATTC	2	10	29681	29690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020229	AATTG	2	10	30827	30836	40 %	40 %	20 %	0 %	448819558
22	NC_020229	ATTTA	2	10	31254	31263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020229	ACTTA	2	10	31739	31748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020229	GCACC	2	10	36115	36124	20 %	0 %	20 %	60 %	448819562
25	NC_020229	CACAT	2	10	36219	36228	40 %	20 %	0 %	40 %	448819562
26	NC_020229	CAACG	2	10	37249	37258	40 %	0 %	20 %	40 %	448819562
27	NC_020229	ACGCC	2	10	37798	37807	20 %	0 %	20 %	60 %	448819563
28	NC_020229	ATCCG	2	10	38800	38809	20 %	20 %	20 %	40 %	448819564
29	NC_020229	ATATA	2	10	41780	41789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020229	TAACC	2	10	44450	44459	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_020229	ACGAA	2	10	44553	44562	60 %	0 %	20 %	20 %	448819572
32	NC_020229	GCAAC	2	10	45695	45704	40 %	0 %	20 %	40 %	448819573
33	NC_020229	TGCTG	2	10	46130	46139	0 %	40 %	40 %	20 %	448819573
34	NC_020229	GACGT	2	10	49170	49179	20 %	20 %	40 %	20 %	448819574
35	NC_020229	CGGTA	2	10	49733	49742	20 %	20 %	40 %	20 %	448819574
36	NC_020229	AAAGT	2	10	50672	50681	60 %	20 %	20 %	0 %	448819575
37	NC_020229	AGCAA	2	10	51849	51858	60 %	0 %	20 %	20 %	448819576
38	NC_020229	TCAAG	2	10	53177	53186	40 %	20 %	20 %	20 %	448819578
39	NC_020229	TAATT	2	10	53904	53913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020229	CAACA	2	10	55705	55714	60 %	0 %	0 %	40 %	448819579
41	NC_020229	GTTTA	2	10	57104	57113	20 %	60 %	20 %	0 %	448819581
42	NC_020229	TGACC	2	10	57579	57588	20 %	20 %	20 %	40 %	448819581
43	NC_020229	GGGCC	2	10	62450	62459	0 %	0 %	60 %	40 %	448819588
44	NC_020229	GCCAC	2	10	64117	64126	20 %	0 %	20 %	60 %	448819590
45	NC_020229	AACTG	2	10	65309	65318	40 %	20 %	20 %	20 %	448819591
46	NC_020229	TAATT	2	10	70732	70741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020229	CACTT	2	10	71252	71261	20 %	40 %	0 %	40 %	448819598
48	NC_020229	ATCGA	2	10	71901	71910	40 %	20 %	20 %	20 %	448819600
49	NC_020229	AATTA	2	10	72506	72515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020229	CCATC	2	10	79767	79776	20 %	20 %	0 %	60 %	448819605
51	NC_020229	CGTAA	2	10	80560	80569	40 %	20 %	20 %	20 %	448819606
52	NC_020229	TTGCG	2	10	81872	81881	0 %	40 %	40 %	20 %	448819607
53	NC_020229	ATTAT	2	10	83178	83187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020229	GTGCT	2	10	84250	84259	0 %	40 %	40 %	20 %	448819611
55	NC_020229	TGAGC	2	10	85096	85105	20 %	20 %	40 %	20 %	448819612
56	NC_020229	TGATA	2	10	87059	87068	40 %	40 %	20 %	0 %	448819613
57	NC_020229	CACTT	2	10	90658	90667	20 %	40 %	0 %	40 %	448819617
58	NC_020229	GCCTC	2	10	91552	91561	0 %	20 %	20 %	60 %	448819617
59	NC_020229	CAAGT	2	10	91682	91691	40 %	20 %	20 %	20 %	448819617
60	NC_020229	CGTAC	2	10	91949	91958	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_020229	CCATG	2	10	93651	93660	20 %	20 %	20 %	40 %	448819618
62	NC_020229	AATCC	2	10	102518	102527	40 %	20 %	0 %	40 %	448819625
63	NC_020229	TTTAA	2	10	107158	107167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020229	TCAGT	2	10	108594	108603	20 %	40 %	20 %	20 %	448819631
65	NC_020229	GGCCC	2	10	109893	109902	0 %	0 %	40 %	60 %	448819632
66	NC_020229	ACCAA	2	10	110992	111001	60 %	0 %	0 %	40 %	448819632
67	NC_020229	ATTTG	2	10	114140	114149	20 %	60 %	20 %	0 %	448819635
68	NC_020229	ACGCA	2	10	116264	116273	40 %	0 %	20 %	40 %	448819636
69	NC_020229	CATAT	2	10	116375	116384	40 %	40 %	0 %	20 %	448819636
70	NC_020229	GGTTG	2	10	118157	118166	0 %	40 %	60 %	0 %	448819637
71	NC_020229	GTTGC	2	10	122769	122778	0 %	40 %	40 %	20 %	448819640
72	NC_020229	CTGGA	2	10	123869	123878	20 %	20 %	40 %	20 %	448819641
73	NC_020229	CACAT	2	10	124326	124335	40 %	20 %	0 %	40 %	448819641
74	NC_020229	CGTAC	2	10	125458	125467	20 %	20 %	20 %	40 %	448819643
75	NC_020229	TTTAA	2	10	128520	128529	40 %	60 %	0 %	0 %	448819645
76	NC_020229	CGTTC	2	10	129680	129689	0 %	40 %	20 %	40 %	448819646
77	NC_020229	TGTTA	2	10	130238	130247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020229	TAATA	2	10	130259	130268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020229	TCAAA	2	10	131102	131111	60 %	20 %	0 %	20 %	448819647
80	NC_020229	ATAAC	2	10	131625	131634	60 %	20 %	0 %	20 %	448819648
81	NC_020229	AACCA	2	10	132030	132039	60 %	0 %	0 %	40 %	448819648
82	NC_020229	CGTTA	2	10	133210	133219	20 %	40 %	20 %	20 %	448819649
83	NC_020229	GTTAA	2	10	134884	134893	40 %	40 %	20 %	0 %	448819651
84	NC_020229	TTGAA	2	10	135552	135561	40 %	40 %	20 %	0 %	448819652
85	NC_020229	ACTCG	2	10	136211	136220	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_020229	TTCAA	2	10	136715	136724	40 %	40 %	0 %	20 %	448819653
87	NC_020229	AAGGT	2	10	138551	138560	40 %	20 %	40 %	0 %	448819654
88	NC_020229	CCCCG	2	10	139769	139778	0 %	0 %	20 %	80 %	448819656
89	NC_020229	TCAAA	2	10	140932	140941	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020229	CATTA	2	10	141507	141516	40 %	40 %	0 %	20 %	448819658
91	NC_020229	GTAAC	2	10	146476	146485	40 %	20 %	20 %	20 %	448819662
92	NC_020229	TTGAA	2	10	146950	146959	40 %	40 %	20 %	0 %	448819662
93	NC_020229	ATCAA	2	10	151939	151948	60 %	20 %	0 %	20 %	448819666
94	NC_020229	ACTTA	2	10	153680	153689	40 %	40 %	0 %	20 %	448819667
95	NC_020229	CAAAC	2	10	154516	154525	60 %	0 %	0 %	40 %	448819667
96	NC_020229	AAATC	2	10	154912	154921	60 %	20 %	0 %	20 %	448819667
97	NC_020229	CACTT	2	10	155800	155809	20 %	40 %	0 %	40 %	448819668
98	NC_020229	TTATC	2	10	157872	157881	20 %	60 %	0 %	20 %	448819669
99	NC_020229	CTGAC	2	10	158863	158872	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_020229	AAACA	2	10	159463	159472	80 %	0 %	0 %	20 %	448819670
101	NC_020229	CATTA	2	10	161718	161727	40 %	40 %	0 %	20 %	448819672
102	NC_020229	ATGCG	2	10	162392	162401	20 %	20 %	40 %	20 %	448819672
103	NC_020229	AAAAC	2	10	163520	163529	80 %	0 %	0 %	20 %	448819672
104	NC_020229	AGTTT	2	10	164860	164869	20 %	60 %	20 %	0 %	448819673
105	NC_020229	CTTCA	2	10	165512	165521	20 %	40 %	0 %	40 %	448819674
106	NC_020229	AACTT	2	10	165619	165628	40 %	40 %	0 %	20 %	448819674
107	NC_020229	TTGTT	2	10	167161	167170	0 %	80 %	20 %	0 %	448819675
108	NC_020229	CTTTT	2	10	170342	170351	0 %	80 %	0 %	20 %	448819677
109	NC_020229	GACTA	2	10	170961	170970	40 %	20 %	20 %	20 %	448819679
110	NC_020229	AATAT	2	10	172386	172395	60 %	40 %	0 %	0 %	448819680
111	NC_020229	GATCA	2	10	173138	173147	40 %	20 %	20 %	20 %	448819680
112	NC_020229	TTCAT	2	10	173462	173471	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020229	TTAGT	2	10	174318	174327	20 %	60 %	20 %	0 %	448819682
114	NC_020229	ATTTT	2	10	177867	177876	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020229	TTAAT	2	10	181721	181730	40 %	60 %	0 %	0 %	448819688
116	NC_020229	AATGG	2	10	185174	185183	40 %	20 %	40 %	0 %	448819692
117	NC_020229	TGATA	2	10	185634	185643	40 %	40 %	20 %	0 %	448819692
118	NC_020229	ATATT	2	10	187299	187308	40 %	60 %	0 %	0 %	448819694
119	NC_020229	TGATA	2	10	187687	187696	40 %	40 %	20 %	0 %	448819694
120	NC_020229	ACTTT	2	10	189648	189657	20 %	60 %	0 %	20 %	448819696
121	NC_020229	CTAAT	2	10	190192	190201	40 %	40 %	0 %	20 %	448819696
122	NC_020229	AAGGT	2	10	190791	190800	40 %	20 %	40 %	0 %	448819697
123	NC_020229	ACTTT	2	10	192275	192284	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020229	GCTAT	2	10	192570	192579	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020229	AAACT	2	10	194651	194660	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020229	TTAAC	2	10	194676	194685	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020229	TAAAC	2	10	196904	196913	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_020229	CCAAT	2	10	196933	196942	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_020229	CAATC	2	10	198031	198040	40 %	20 %	0 %	40 %	448819706
130	NC_020229	AATTA	2	10	198670	198679	60 %	40 %	0 %	0 %	448819706
131	NC_020229	TAAGC	2	10	200258	200267	40 %	20 %	20 %	20 %	448819708
132	NC_020229	TTTAA	2	10	202633	202642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020229	CCGAC	2	10	206714	206723	20 %	0 %	20 %	60 %	448819712
134	NC_020229	TTAGC	2	10	208785	208794	20 %	40 %	20 %	20 %	448819713
135	NC_020229	AACTC	2	10	209330	209339	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_020229	TGCCA	2	10	209663	209672	20 %	20 %	20 %	40 %	448819714
137	NC_020229	TTTCT	2	10	214604	214613	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020229	TAATT	2	10	218075	218084	40 %	60 %	0 %	0 %	448819723
139	NC_020229	GGTTC	2	10	219514	219523	0 %	40 %	40 %	20 %	448819724
140	NC_020229	CATCA	2	10	220607	220616	40 %	20 %	0 %	40 %	448819724
141	NC_020229	GCTCA	2	10	226056	226065	20 %	20 %	20 %	40 %	448819730
142	NC_020229	CATGG	2	10	227247	227256	20 %	20 %	40 %	20 %	448819732
143	NC_020229	CCAAA	2	10	227392	227401	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_020229	TCAAA	2	10	232153	232162	60 %	20 %	0 %	20 %	448819738
145	NC_020229	TTAAC	2	10	232569	232578	40 %	40 %	0 %	20 %	448819739
146	NC_020229	TTAAT	2	10	233289	233298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020229	CGATC	2	10	233646	233655	20 %	20 %	20 %	40 %	448819740
148	NC_020229	ATCTT	2	10	234518	234527	20 %	60 %	0 %	20 %	448819740
149	NC_020229	ACCTT	2	10	236144	236153	20 %	40 %	0 %	40 %	448819741
150	NC_020229	ATACC	2	10	236840	236849	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_020229	GATTG	2	10	238605	238614	20 %	40 %	40 %	0 %	448819743
152	NC_020229	CATCC	2	10	240137	240146	20 %	20 %	0 %	60 %	448819745
153	NC_020229	CAAAA	2	10	241559	241568	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_020229	TAAAT	2	10	243785	243794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020229	GAAAC	2	10	244511	244520	60 %	0 %	20 %	20 %	448819751
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157	NC_020229	TATAA	2	10	247295	247304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_020229	CCTTG	2	10	256284	256293	0 %	40 %	20 %	40 %	448819761
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166	NC_020229	ATCTT	2	10	263093	263102	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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168	NC_020229	GGCGT	2	10	270015	270024	0 %	20 %	60 %	20 %	448819771
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171	NC_020229	GTATA	2	10	275169	275178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020229	TGATT	2	10	276217	276226	20 %	60 %	20 %	0 %	448819774
173	NC_020229	AAACA	2	10	276301	276310	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_020229	TTAGT	2	10	276381	276390	20 %	60 %	20 %	0 %	448819775
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223	NC_020229	TCATT	2	10	362084	362093	20 %	60 %	0 %	20 %	448819857
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233	NC_020229	GTTCA	2	10	373114	373123	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
234	NC_020229	TAATC	2	10	377983	377992	40 %	40 %	0 %	20 %	448819876
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241	NC_020229	TTGAC	2	10	387439	387448	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_020229	GCAAA	2	10	396388	396397	60 %	0 %	20 %	20 %	448819895
250	NC_020229	ACCGA	2	10	396571	396580	40 %	0 %	20 %	40 %	448819895
251	NC_020229	TTTTA	2	10	398308	398317	20 %	80 %	0 %	0 %	448819898
252	NC_020229	TATCT	2	10	400241	400250	20 %	60 %	0 %	20 %	448819900
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254	NC_020229	ATTGG	3	15	403745	403759	20 %	40 %	40 %	0 %	448819902
255	NC_020229	AAAAC	2	10	405473	405482	80 %	0 %	0 %	20 %	448819904
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258	NC_020229	GTTGT	2	10	406222	406231	0 %	60 %	40 %	0 %	448819904
259	NC_020229	AGGTC	2	10	407475	407484	20 %	20 %	40 %	20 %	448819905
260	NC_020229	GATCG	2	10	408360	408369	20 %	20 %	40 %	20 %	448819906
261	NC_020229	TTTAA	2	10	421115	421124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_020229	AATTG	2	10	421190	421199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_020229	ATATA	2	10	421246	421255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_020229	TTCGT	2	10	421831	421840	0 %	60 %	20 %	20 %	448819916
265	NC_020229	TCTGG	2	10	422014	422023	0 %	40 %	40 %	20 %	448819916
266	NC_020229	GGTTA	2	10	426455	426464	20 %	40 %	40 %	0 %	448819919
267	NC_020229	ATTAA	2	10	426769	426778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_020229	AACTG	2	10	428161	428170	40 %	20 %	20 %	20 %	448819920
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270	NC_020229	TGTGA	2	10	436096	436105	20 %	40 %	40 %	0 %	448819926
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282	NC_020229	TACGT	2	10	455300	455309	20 %	40 %	20 %	20 %	448819947
283	NC_020229	GTTTG	2	10	456420	456429	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020229	AAAAT	2	10	457581	457590	80 %	20 %	0 %	0 %	448819949
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396	NC_020229	CCAAG	2	10	636547	636556	40 %	0 %	20 %	40 %	448820131
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401	NC_020229	TTTAA	2	10	640404	640413	40 %	60 %	0 %	0 %	448820134
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