MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 8852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020229	CCAT	2	8	96	103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020229	CCGC	2	8	773	780	0 %	0 %	25 %	75 %	448819524
3	NC_020229	TTGC	2	8	1087	1094	0 %	50 %	25 %	25 %	448819524
4	NC_020229	CAAT	2	8	1136	1143	50 %	25 %	0 %	25 %	448819524
5	NC_020229	TAAT	2	8	1750	1757	50 %	50 %	0 %	0 %	448819525
6	NC_020229	GAAA	2	8	2401	2408	75 %	0 %	25 %	0 %	448819526
7	NC_020229	TGAT	2	8	2509	2516	25 %	50 %	25 %	0 %	448819526
8	NC_020229	TGGC	2	8	2750	2757	0 %	25 %	50 %	25 %	448819526
9	NC_020229	TGAT	2	8	2848	2855	25 %	50 %	25 %	0 %	448819526
10	NC_020229	CCGG	2	8	2920	2927	0 %	0 %	50 %	50 %	448819526
11	NC_020229	ACAA	2	8	3165	3172	75 %	0 %	0 %	25 %	448819526
12	NC_020229	CCAA	2	8	3426	3433	50 %	0 %	0 %	50 %	448819526
13	NC_020229	TGAA	2	8	4059	4066	50 %	25 %	25 %	0 %	448819527
14	NC_020229	AACA	2	8	4425	4432	75 %	0 %	0 %	25 %	448819527
15	NC_020229	TAGC	2	8	4735	4742	25 %	25 %	25 %	25 %	448819527
16	NC_020229	CGCC	2	8	4924	4931	0 %	0 %	25 %	75 %	448819527
17	NC_020229	ACGT	2	8	4992	4999	25 %	25 %	25 %	25 %	448819527
18	NC_020229	TGAC	2	8	5200	5207	25 %	25 %	25 %	25 %	448819527
19	NC_020229	ATTT	2	8	5591	5598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020229	TTGA	2	8	6191	6198	25 %	50 %	25 %	0 %	448819528
21	NC_020229	CAAT	2	8	6480	6487	50 %	25 %	0 %	25 %	448819528
22	NC_020229	TAAC	2	8	6690	6697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020229	ACAA	2	8	6843	6850	75 %	0 %	0 %	25 %	448819529
24	NC_020229	CGAC	2	8	6951	6958	25 %	0 %	25 %	50 %	448819529
25	NC_020229	GTAA	2	8	7461	7468	50 %	25 %	25 %	0 %	448819530
26	NC_020229	GAAT	2	8	7893	7900	50 %	25 %	25 %	0 %	448819530
27	NC_020229	CTTG	2	8	8043	8050	0 %	50 %	25 %	25 %	448819530
28	NC_020229	TAGT	2	8	8736	8743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020229	ACTA	2	8	8746	8753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020229	AAGT	2	8	8823	8830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020229	TTGC	2	8	8913	8920	0 %	50 %	25 %	25 %	448819532
32	NC_020229	CTTG	2	8	9310	9317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020229	ATTA	2	8	9364	9371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020229	TCAA	2	8	10623	10630	50 %	25 %	0 %	25 %	448819535
35	NC_020229	CTGA	2	8	11135	11142	25 %	25 %	25 %	25 %	448819535
36	NC_020229	AACA	2	8	11918	11925	75 %	0 %	0 %	25 %	448819536
37	NC_020229	TGCC	2	8	12382	12389	0 %	25 %	25 %	50 %	448819537
38	NC_020229	TCGC	2	8	13011	13018	0 %	25 %	25 %	50 %	448819538
39	NC_020229	GACC	2	8	13184	13191	25 %	0 %	25 %	50 %	448819538
40	NC_020229	CCGA	2	8	13217	13224	25 %	0 %	25 %	50 %	448819538
41	NC_020229	AAAT	2	8	13271	13278	75 %	25 %	0 %	0 %	448819538
42	NC_020229	ATGG	2	8	13807	13814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020229	ATCG	2	8	14003	14010	25 %	25 %	25 %	25 %	448819540
44	NC_020229	TTAC	2	8	14373	14380	25 %	50 %	0 %	25 %	448819541
45	NC_020229	ATTA	3	12	14915	14926	50 %	50 %	0 %	0 %	448819541
46	NC_020229	TAAC	2	8	15041	15048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020229	GCAA	2	8	15508	15515	50 %	0 %	25 %	25 %	448819542
48	NC_020229	ACGC	2	8	15585	15592	25 %	0 %	25 %	50 %	448819542
49	NC_020229	GATT	2	8	15616	15623	25 %	50 %	25 %	0 %	448819542
50	NC_020229	CCCG	2	8	15678	15685	0 %	0 %	25 %	75 %	448819542
51	NC_020229	ACCA	2	8	15713	15720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020229	CAAT	2	8	16205	16212	50 %	25 %	0 %	25 %	448819543
53	NC_020229	CCAA	2	8	16218	16225	50 %	0 %	0 %	50 %	448819543
54	NC_020229	CATC	2	8	16319	16326	25 %	25 %	0 %	50 %	448819543
55	NC_020229	TAAT	2	8	16827	16834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020229	TTAA	2	8	16854	16861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020229	GCCC	2	8	17033	17040	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_020229	TGAA	2	8	17210	17217	50 %	25 %	25 %	0 %	448819544
59	NC_020229	CATC	2	8	17835	17842	25 %	25 %	0 %	50 %	448819544
60	NC_020229	GTTT	2	8	17843	17850	0 %	75 %	25 %	0 %	448819544
61	NC_020229	GCTC	2	8	17886	17893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020229	TTAA	2	8	17905	17912	50 %	50 %	0 %	0 %	448819545
63	NC_020229	AGAA	2	8	18646	18653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020229	TTCA	2	8	18997	19004	25 %	50 %	0 %	25 %	448819546
65	NC_020229	CGAA	2	8	19163	19170	50 %	0 %	25 %	25 %	448819546
66	NC_020229	GTGC	2	8	19796	19803	0 %	25 %	50 %	25 %	448819546
67	NC_020229	AATT	2	8	19922	19929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020229	CTGA	2	8	20543	20550	25 %	25 %	25 %	25 %	448819547
69	NC_020229	TGGC	2	8	20942	20949	0 %	25 %	50 %	25 %	448819547
70	NC_020229	AACT	2	8	21295	21302	50 %	25 %	0 %	25 %	448819547
71	NC_020229	TTCA	2	8	21325	21332	25 %	50 %	0 %	25 %	448819547
72	NC_020229	AACT	2	8	21448	21455	50 %	25 %	0 %	25 %	448819547
73	NC_020229	AAGT	2	8	22127	22134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020229	CATC	2	8	22492	22499	25 %	25 %	0 %	50 %	448819548
75	NC_020229	ATTA	2	8	23305	23312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020229	TACA	2	8	23873	23880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020229	TGGT	2	8	25139	25146	0 %	50 %	50 %	0 %	448819551
78	NC_020229	TTGC	2	8	25480	25487	0 %	50 %	25 %	25 %	448819551
79	NC_020229	ACTA	2	8	25510	25517	50 %	25 %	0 %	25 %	448819551
80	NC_020229	CGAT	2	8	25576	25583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020229	ATAA	2	8	25684	25691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020229	CTGG	2	8	25895	25902	0 %	25 %	50 %	25 %	448819552
83	NC_020229	CAAT	2	8	26157	26164	50 %	25 %	0 %	25 %	448819553
84	NC_020229	AAGC	2	8	26251	26258	50 %	0 %	25 %	25 %	448819553
85	NC_020229	AAGT	2	8	26600	26607	50 %	25 %	25 %	0 %	448819554
86	NC_020229	ATCC	2	8	27523	27530	25 %	25 %	0 %	50 %	448819555
87	NC_020229	ACCG	2	8	27671	27678	25 %	0 %	25 %	50 %	448819555
88	NC_020229	GACC	2	8	27681	27688	25 %	0 %	25 %	50 %	448819555
89	NC_020229	GCCA	2	8	27771	27778	25 %	0 %	25 %	50 %	448819555
90	NC_020229	AGTT	2	8	28233	28240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020229	TTAA	2	8	28284	28291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020229	AATC	2	8	29347	29354	50 %	25 %	0 %	25 %	448819556
93	NC_020229	CCAA	2	8	30219	30226	50 %	0 %	0 %	50 %	448819557
94	NC_020229	AACT	2	8	30402	30409	50 %	25 %	0 %	25 %	448819557
95	NC_020229	ACTT	2	8	30485	30492	25 %	50 %	0 %	25 %	448819557
96	NC_020229	GGGT	2	8	30527	30534	0 %	25 %	75 %	0 %	448819557
97	NC_020229	ATAA	2	8	30551	30558	75 %	25 %	0 %	0 %	448819557
98	NC_020229	CCGC	2	8	30565	30572	0 %	0 %	25 %	75 %	448819557
99	NC_020229	CCCG	2	8	31487	31494	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_020229	TGCC	2	8	31626	31633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020229	AGCA	2	8	31672	31679	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020229	ACCA	2	8	32138	32145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020229	TAAC	2	8	32861	32868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020229	ACCA	2	8	33469	33476	50 %	0 %	0 %	50 %	448819561
105	NC_020229	CCTT	2	8	33551	33558	0 %	50 %	0 %	50 %	448819561
106	NC_020229	TTGC	2	8	33846	33853	0 %	50 %	25 %	25 %	448819561
107	NC_020229	ATCA	2	8	33988	33995	50 %	25 %	0 %	25 %	448819561
108	NC_020229	CAAT	2	8	33999	34006	50 %	25 %	0 %	25 %	448819561
109	NC_020229	CAGT	2	8	34040	34047	25 %	25 %	25 %	25 %	448819561
110	NC_020229	TAAC	2	8	34194	34201	50 %	25 %	0 %	25 %	448819561
111	NC_020229	AGCC	2	8	34318	34325	25 %	0 %	25 %	50 %	448819561
112	NC_020229	TCTG	2	8	34597	34604	0 %	50 %	25 %	25 %	448819561
113	NC_020229	TTAG	2	8	35414	35421	25 %	50 %	25 %	0 %	448819561
114	NC_020229	TGAT	2	8	35895	35902	25 %	50 %	25 %	0 %	448819562
115	NC_020229	CAAT	2	8	36624	36631	50 %	25 %	0 %	25 %	448819562
116	NC_020229	CAAA	2	8	36864	36871	75 %	0 %	0 %	25 %	448819562
117	NC_020229	CCGC	2	8	37974	37981	0 %	0 %	25 %	75 %	448819563
118	NC_020229	ATTT	2	8	39563	39570	25 %	75 %	0 %	0 %	448819564
119	NC_020229	CAAC	2	8	39792	39799	50 %	0 %	0 %	50 %	448819565
120	NC_020229	TCAA	2	8	39999	40006	50 %	25 %	0 %	25 %	448819565
121	NC_020229	CCGT	2	8	40323	40330	0 %	25 %	25 %	50 %	448819565
122	NC_020229	CTTA	2	8	40497	40504	25 %	50 %	0 %	25 %	448819566
123	NC_020229	TCGT	2	8	40776	40783	0 %	50 %	25 %	25 %	448819566
124	NC_020229	ATCA	2	8	40883	40890	50 %	25 %	0 %	25 %	448819566
125	NC_020229	AAGT	2	8	41043	41050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020229	GGAG	2	8	41139	41146	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020229	GTTG	2	8	41428	41435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020229	TCAA	2	8	41651	41658	50 %	25 %	0 %	25 %	448819567
129	NC_020229	TCCA	2	8	41761	41768	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020229	TTTA	2	8	41821	41828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020229	ATAA	2	8	42335	42342	75 %	25 %	0 %	0 %	448819568
132	NC_020229	TCCA	2	8	42384	42391	25 %	25 %	0 %	50 %	448819568
133	NC_020229	AGCA	2	8	42802	42809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020229	AAAC	2	8	42909	42916	75 %	0 %	0 %	25 %	448819569
135	NC_020229	CAGC	2	8	43231	43238	25 %	0 %	25 %	50 %	448819569
136	NC_020229	TAGC	2	8	44024	44031	25 %	25 %	25 %	25 %	448819571
137	NC_020229	ATTT	2	8	44321	44328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020229	TCAA	2	8	45244	45251	50 %	25 %	0 %	25 %	448819572
139	NC_020229	TCAA	2	8	45395	45402	50 %	25 %	0 %	25 %	448819572
140	NC_020229	AATC	2	8	45502	45509	50 %	25 %	0 %	25 %	448819572
141	NC_020229	ATAA	2	8	46362	46369	75 %	25 %	0 %	0 %	448819573
142	NC_020229	CTAG	2	8	47326	47333	25 %	25 %	25 %	25 %	448819573
143	NC_020229	AAAC	2	8	47600	47607	75 %	0 %	0 %	25 %	448819573
144	NC_020229	TGTC	2	8	47655	47662	0 %	50 %	25 %	25 %	448819573
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259	NC_020229	ACCA	2	8	89520	89527	50 %	0 %	0 %	50 %	448819615
260	NC_020229	ATTG	2	8	89739	89746	25 %	50 %	25 %	0 %	448819615
261	NC_020229	TTTA	2	8	90106	90113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_020229	CTAA	2	8	90128	90135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
263	NC_020229	GTTG	2	8	90335	90342	0 %	50 %	50 %	0 %	448819616
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278	NC_020229	GTTT	2	8	95679	95686	0 %	75 %	25 %	0 %	448819620
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282	NC_020229	CGTT	2	8	97014	97021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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