MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Serratia marcescens WW4

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020211	AGAGCG	2	12	27332	27343	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020211	AAGAGG	2	12	60179	60190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020211	AAACCT	2	12	138510	138521	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020211	AGGTTT	2	12	138556	138567	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020211	TGGCTT	2	12	203533	203544	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020211	TAGTGA	2	12	269827	269838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020211	TAAGAC	2	12	298668	298679	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020211	TAGCTG	2	12	308923	308934	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020211	GAAGTT	2	12	309156	309167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020211	TAAGAC	2	12	340867	340878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020211	TCATTT	2	12	347757	347768	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020211	TGCAAA	2	12	363416	363427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020211	TTTTTA	2	12	423786	423797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020211	GGCAGT	2	12	467666	467677	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020211	TGGCGG	2	12	545690	545701	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020211	TTATCA	2	12	680727	680738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020211	TATTTT	2	12	827982	827993	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020211	CCGGAT	2	12	839814	839825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020211	TAAGAC	2	12	958493	958504	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020211	CTTTCT	2	12	981534	981545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020211	TGAGCT	2	12	1027278	1027289	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020211	AGTGAC	2	12	1028182	1028193	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020211	CTTTTG	2	12	1036227	1036238	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020211	GTTTGT	2	12	1064332	1064343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020211	TGATAA	2	12	1084776	1084787	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020211	CCGCAG	2	12	1267992	1268003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020211	ACCCTA	2	12	1283292	1283303	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020211	ACGCCG	2	12	1348885	1348896	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020211	GATGTT	2	12	1361214	1361225	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020211	GAAAGG	2	12	1450446	1450457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020211	CCTCCC	2	12	1494966	1494977	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
32	NC_020211	CGTTAT	2	12	1509008	1509019	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020211	ATTAAT	2	12	1566266	1566277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020211	GTTATG	2	12	1605025	1605036	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020211	GGACGT	2	12	1673197	1673208	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020211	CAATAT	2	12	1703639	1703650	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020211	TAATTT	2	12	1727539	1727550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020211	GTGATG	2	12	1761652	1761663	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020211	TTTTCA	2	12	1776962	1776973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020211	TTAAAA	2	12	1790757	1790768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020211	TTTTGT	2	12	1791312	1791323	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020211	TGCGTC	2	12	1841499	1841510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020211	AAAGGG	2	12	1920588	1920599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020211	ACCTTT	2	12	1935785	1935796	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020211	CTGTCA	2	12	1951536	1951547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020211	GCCGGT	2	12	2006787	2006798	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020211	TTTATC	2	12	2035078	2035089	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020211	TTAGGG	2	12	2039448	2039459	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020211	TTTTTA	2	12	2090225	2090236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020211	TTATCG	2	12	2099518	2099529	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020211	AGTCAA	2	12	2142476	2142487	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020211	GCGGCC	2	12	2153085	2153096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020211	TTTCCG	2	12	2176061	2176072	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020211	ATTGTT	2	12	2238227	2238238	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020211	CGATAA	2	12	2242529	2242540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020211	CTGATG	2	12	2264245	2264256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020211	CAGAAA	2	12	2265478	2265489	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020211	GAGGTT	2	12	2265746	2265757	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020211	GTTAAC	2	12	2277963	2277974	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020211	GTTAAC	2	12	2278027	2278038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020211	GCGTTC	2	12	2284208	2284219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020211	ATTTTT	2	12	2287344	2287355	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020211	GGTGGC	2	12	2291638	2291649	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020211	AAATGA	2	12	2335819	2335830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020211	TATCAA	2	12	2335832	2335843	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020211	AGAGGA	2	12	2352086	2352097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020211	TATAAA	2	12	2359316	2359327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020211	TCAAAT	2	12	2389295	2389306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020211	TGGCGC	2	12	2489922	2489933	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020211	TCATTT	2	12	2496847	2496858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020211	ATCGGC	2	12	2595589	2595600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020211	ATCATA	2	12	2596295	2596306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020211	TCATGC	2	12	2597202	2597213	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020211	CGAGAC	2	12	2597333	2597344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020211	CTCGGC	2	12	2602596	2602607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020211	TCATCC	2	12	2623005	2623016	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020211	GGATGA	2	12	2629087	2629098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020211	CGCCAG	2	12	2650406	2650417	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020211	GTCCCT	2	12	2733991	2734002	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020211	GAAGCT	2	12	2768849	2768860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020211	ATCATT	2	12	2788519	2788530	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020211	TGTCAC	2	12	2803401	2803412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020211	AATGAC	2	12	2821821	2821832	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020211	GGCGAT	2	12	2873509	2873520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020211	GACGTG	2	12	2873786	2873797	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020211	TTATCG	2	12	2874715	2874726	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020211	TTTACC	2	12	2884692	2884703	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020211	CCCCGC	2	12	2892452	2892463	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
89	NC_020211	TTGGTT	2	12	2914211	2914222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020211	TGCAAA	2	12	2918516	2918527	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020211	GACAGC	2	12	2921893	2921904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020211	CCGCAA	2	12	2952766	2952777	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020211	TAAAGC	2	12	2957121	2957132	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020211	GCCGTC	2	12	2982593	2982604	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020211	CAGGCG	2	12	3052955	3052966	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020211	AACAAA	2	12	3132933	3132944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020211	TCACTT	2	12	3134691	3134702	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020211	TGGCTT	2	12	3230838	3230849	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020211	TTGCAA	2	12	3282228	3282239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020211	CTTGCA	2	12	3282285	3282296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020211	TACAAC	2	12	3312918	3312929	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020211	CGGCTT	2	12	3364730	3364741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020211	TATTAA	2	12	3410568	3410579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020211	TAAAGC	2	12	3410991	3411002	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020211	AAAATA	2	12	3411680	3411691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020211	ATGTGC	2	12	3415310	3415321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020211	TATTTA	2	12	3492621	3492632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020211	AATGGC	2	12	3543484	3543495	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020211	CCGCCC	2	12	3550087	3550098	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
110	NC_020211	GAAAAG	2	12	3569095	3569106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020211	ATTATC	2	12	3576179	3576190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020211	AAACAC	2	12	3671835	3671846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020211	CCATCG	2	12	3709713	3709724	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020211	AGAAAA	2	12	3723944	3723955	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020211	CAAAGC	2	12	3763890	3763901	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020211	CGATAA	2	12	3857619	3857630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020211	ATTGTT	2	12	3863396	3863407	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020211	TGTACA	2	12	3870459	3870470	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020211	AGGCGC	2	12	3888097	3888108	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020211	CTCGGC	2	12	3911119	3911130	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020211	ATTAAA	2	12	3932782	3932793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020211	TCGCTG	2	12	3939650	3939661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020211	AATCAG	2	12	4028957	4028968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_020211	GCCACA	2	12	4129883	4129894	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020211	GTCTTA	2	12	4174982	4174993	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020211	AGTATT	2	12	4218469	4218480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020211	GAAAGC	2	12	4295253	4295264	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_020211	CAGCGC	2	12	4334931	4334942	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020211	AGTTTG	2	12	4573323	4573334	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020211	CCAGCC	2	12	4595964	4595975	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_020211	GTTTTT	2	12	4635308	4635319	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020211	TTCATT	2	12	4645127	4645138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_020211	CGAGAA	2	12	4702029	4702040	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_020211	CGCCCG	2	12	4760095	4760106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_020211	ATCGCT	2	12	4772460	4772471	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020211	AAAAAT	2	12	4811670	4811681	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020211	CCATTT	2	12	4840247	4840258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020211	GTCTTA	2	12	4842327	4842338	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_020211	GACCAG	2	12	4860195	4860206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020211	CAGACC	2	12	4863013	4863024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020211	ACGCTA	2	12	4934972	4934983	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020211	GCCGCG	2	12	4944104	4944115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020211	GATAAT	2	12	4947009	4947020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020211	ATTGAA	2	12	4988217	4988228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020211	TTTTCC	2	12	5026461	5026472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_020211	AATGAC	2	12	5060206	5060217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_020211	AAAGGA	2	12	5072498	5072509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020211	GTTGGC	2	12	5073461	5073472	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_020211	GTCTTA	2	12	5092463	5092474	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_020211	TTCTAA	2	12	5111077	5111088	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_020211	AAATAA	2	12	5192703	5192714	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020211	GCCCAC	2	12	5201235	5201246	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_020211	GTCTTA	2	12	5217642	5217653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.