MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. GHH01

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020210	CGAAGG	2	12	10359	10370	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020210	AAGCGA	2	12	21804	21815	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020210	CGAAGG	2	12	29525	29536	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020210	TGCGTC	2	12	31949	31960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020210	CGAAGG	2	12	35406	35417	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020210	ATTTTT	2	12	50147	50158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020210	TTTGCG	2	12	57880	57891	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020210	TGCGTC	2	12	92782	92793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020210	CGAAGG	2	12	96321	96332	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020210	AGTAAG	2	12	96756	96767	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020210	AGTCAA	2	12	96777	96788	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020210	GTTCCG	2	12	116886	116897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020210	TGCGTC	2	12	157435	157446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020210	CGAAGG	2	12	160813	160824	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020210	GCAGGG	2	12	182370	182381	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020210	GAAAAT	2	12	205565	205576	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020210	TTTTGT	2	12	236091	236102	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020210	CGAAGG	2	12	248918	248929	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020210	CTTTTT	2	12	249238	249249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020210	TTCTTT	2	12	259969	259980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020210	CGAAGG	2	12	273593	273604	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020210	TGCGTC	2	12	273948	273959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020210	CGAAGG	2	12	277403	277414	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020210	GGAAAC	2	12	277841	277852	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020210	TTTCAT	2	12	339878	339889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020210	GATGAA	2	12	340412	340423	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020210	GCAACA	2	12	348493	348504	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020210	CAAAAA	2	12	353561	353572	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020210	TTGAAC	2	12	356435	356446	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020210	TTTGCG	2	12	370863	370874	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020210	AAAGAA	2	12	379895	379906	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020210	TTAACG	2	12	402760	402771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020210	GCCGCT	2	12	440041	440052	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020210	CTTTAC	2	12	459800	459811	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020210	GAAGCG	2	12	474354	474365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020210	GTTCCA	2	12	478958	478969	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020210	ATGGAT	2	12	487923	487934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020210	TGCGTC	2	12	506734	506745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020210	CGAAGG	2	12	509869	509880	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020210	GAAGAG	2	12	511145	511156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020210	GAAGAG	2	12	511293	511304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020210	GAAGAG	2	12	512666	512677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020210	ACTAGA	2	12	522031	522042	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020210	GAAAAT	2	12	534971	534982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020210	GAAAAA	2	12	584568	584579	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020210	TTTCGT	2	12	628967	628978	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020210	GAAAGA	2	12	636625	636636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020210	CTTTTT	2	12	701250	701261	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020210	GAAAGG	2	12	704866	704877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020210	CTTTTC	2	12	742938	742949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020210	GAGAAA	2	12	763416	763427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020210	GCGGAT	2	12	772825	772836	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020210	GGTTAT	2	12	778419	778430	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020210	TACGGC	2	12	778434	778445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020210	CTCGAT	2	12	787769	787780	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020210	AGCTCG	2	12	788589	788600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020210	TTCTTT	2	12	802425	802436	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020210	TTTATT	2	12	802465	802476	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020210	TTGGTT	2	12	806938	806949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020210	GAAAAG	2	12	829990	830001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020210	AAGATC	2	12	873252	873263	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020210	GTATCC	2	12	873418	873429	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020210	GAAAAA	2	12	879811	879822	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020210	TTTGAC	2	12	882192	882203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020210	GTATCC	2	12	935566	935577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020210	GCTTGA	2	12	958446	958457	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020210	CTATCG	2	12	964314	964325	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020210	CTTTTT	2	12	967380	967391	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020210	GGCCTT	2	12	971302	971313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020210	CCAATT	2	12	972155	972166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020210	GGTGGA	2	12	981255	981266	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020210	TCCATT	2	12	1160434	1160445	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020210	TTTCTT	2	12	1178127	1178138	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020210	GTTTTT	2	12	1252591	1252602	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020210	TGCTCG	2	12	1256680	1256691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020210	GACGGC	2	12	1257879	1257890	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020210	TTTATA	2	12	1281315	1281326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020210	TGGATT	2	12	1307534	1307545	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020210	TTTTTC	2	12	1314689	1314700	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020210	TTTCAA	2	12	1338614	1338625	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020210	TTTTAT	2	12	1356901	1356912	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020210	TGCGTC	2	12	1368330	1368341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020210	TGCGTC	2	12	1368417	1368428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020210	TTTGTT	2	12	1371852	1371863	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020210	TAGAAC	2	12	1373311	1373322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020210	CCTTTT	2	12	1378867	1378878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020210	TGTTTT	2	12	1406603	1406614	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020210	CTTTTC	2	12	1440436	1440447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020210	TGCGGC	2	12	1526587	1526598	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020210	CATATA	2	12	1543442	1543453	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020210	AGCGCG	2	12	1546826	1546837	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020210	TTTATT	2	12	1548750	1548761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020210	CAAAAA	2	12	1585656	1585667	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020210	CCGGAA	2	12	1590403	1590414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020210	TTGATT	2	12	1646223	1646234	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020210	ATCGCC	2	12	1657704	1657715	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020210	TTGTTT	2	12	1657832	1657843	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020210	AATCGT	2	12	1666691	1666702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020210	AAAAAC	2	12	1690090	1690101	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020210	AAATAA	2	12	1705971	1705982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020210	ATCATT	2	12	1706043	1706054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_020210	AAAATA	2	12	1714416	1714427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020210	ATGACA	2	12	1736416	1736427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020210	TTCCTT	2	12	1760290	1760301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020210	TGAAAA	2	12	1775608	1775619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020210	ACGCAA	2	12	1794730	1794741	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020210	AATTCA	2	12	1818890	1818901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020210	TTTTGG	2	12	1846221	1846232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020210	ATTTAT	2	12	1896120	1896131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020210	GGTAAA	2	12	1896945	1896956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020210	AGCCAA	2	12	1904070	1904081	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020210	CTCCTT	2	12	1922282	1922293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020210	TAGTAA	2	12	1922553	1922564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020210	TTTCAT	2	12	1957766	1957777	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020210	ATTGTT	2	12	2032345	2032356	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020210	TATCTT	2	12	2033976	2033987	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020210	TTGCTT	2	12	2044902	2044913	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020210	ACCTCC	2	12	2075260	2075271	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_020210	CGCCCC	2	12	2134818	2134829	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
120	NC_020210	ATTACC	2	12	2138106	2138117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020210	ACCGCA	2	12	2141469	2141480	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020210	AATATA	2	12	2149283	2149294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020210	AAGTAA	2	12	2211013	2211024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020210	TTCGAT	2	12	2211070	2211081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_020210	TTTTCT	2	12	2232532	2232543	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020210	TTCCAT	2	12	2237704	2237715	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020210	AGACGC	2	12	2254357	2254368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020210	TTTGTT	2	12	2263905	2263916	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020210	AAAAGA	2	12	2272539	2272550	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020210	GCAAAA	2	12	2392551	2392562	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_020210	TACGTT	2	12	2431576	2431587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_020210	CGATGG	2	12	2450729	2450740	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_020210	TCCCCT	2	12	2508207	2508218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_020210	CGGCCG	2	12	2518419	2518430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020210	AACGTT	2	12	2544977	2544988	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_020210	AAGAAA	2	12	2553032	2553043	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020210	TGACTT	2	12	2569882	2569893	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_020210	GGCGAG	2	12	2619245	2619256	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_020210	CGGAAA	2	12	2743075	2743086	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_020210	ACTATA	2	12	2760587	2760598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_020210	AAAGGA	2	12	2826842	2826853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020210	TAAATA	2	12	2836089	2836100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020210	CTTTTG	2	12	2858681	2858692	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_020210	ATTTTT	2	12	2873407	2873418	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_020210	TATAAA	2	12	2982156	2982167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020210	TTATAT	2	12	2982519	2982530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020210	AGACGC	2	12	2990581	2990592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_020210	AGACGC	2	12	2990668	2990679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_020210	CCTTCG	2	12	2992517	2992528	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020210	CAAAAG	2	12	3001383	3001394	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_020210	AAATCA	2	12	3018757	3018768	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_020210	TACATT	2	12	3018840	3018851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_020210	GCAAAA	2	12	3030315	3030326	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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156	NC_020210	CTCATT	2	12	3058659	3058670	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_020210	ATTTTT	2	12	3063280	3063291	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020210	TGAAAA	2	12	3064145	3064156	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020210	CATATT	2	12	3099833	3099844	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_020210	AAAGGA	2	12	3114913	3114924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_020210	AGTTAA	2	12	3255867	3255878	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.