MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020208	TTCATC	2	12	976	987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020208	TTTATT	2	12	1581	1592	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	447914118
3	NC_020208	ATCTTC	2	12	1629	1640	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	447914118
4	NC_020208	TTTTTC	2	12	3630	3641	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020208	AATTTA	2	12	8163	8174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020208	ATACTT	2	12	16728	16739	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020208	ATTTTT	2	12	19144	19155	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020208	CTGTTG	2	12	19804	19815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020208	AGAAGC	2	12	27840	27851	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	447914135
10	NC_020208	AGAAGC	2	12	27972	27983	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	447914135
11	NC_020208	TTTGAT	2	12	28808	28819	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020208	ATATTT	2	12	29109	29120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020208	TAAAAA	2	12	29678	29689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	447914136
14	NC_020208	ACTTCT	2	12	36840	36851	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020208	GAATAA	2	12	36962	36973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020208	AATTTT	2	12	37271	37282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020208	ATTCAT	2	12	38208	38219	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	447914145
18	NC_020208	TGTTCT	2	12	40631	40642	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	447914149
19	NC_020208	GTAAAA	2	12	41330	41341	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020208	AAAATA	2	12	44683	44694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020208	AAAATC	2	12	46010	46021	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	447914156
22	NC_020208	AAAGAT	2	12	48033	48044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020208	AAAATG	2	12	48504	48515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020208	CCGTTG	2	12	49422	49433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	447914159
25	NC_020208	GAAAAC	2	12	56526	56537	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	447914167
26	NC_020208	TGATAT	2	12	56863	56874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	447914167
27	NC_020208	TTTTTC	2	12	57673	57684	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	447914168
28	NC_020208	AATATA	2	12	60598	60609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020208	CAAAAA	2	12	61435	61446	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	447914172
30	NC_020208	ATTAAA	2	12	62281	62292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020208	ATGGAT	2	12	64495	64506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	447914176
32	NC_020208	CAGGTT	2	12	66347	66358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	447914179
33	NC_020208	AACGTG	2	12	72328	72339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	447914185
34	NC_020208	AAAAGA	2	12	73252	73263	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	447914187
35	NC_020208	AAAAAG	2	12	74238	74249	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	447914187
36	NC_020208	TGGGGA	2	12	77483	77494	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	447914189
37	NC_020208	TGATTT	2	12	77827	77838	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	447914189
38	NC_020208	ACTGGA	2	12	78170	78181	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	447914189
39	NC_020208	TGAAAA	2	12	79307	79318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	447914189
40	NC_020208	CTTTTT	2	12	79922	79933	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020208	GATTCA	2	12	83138	83149	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	447914193
42	NC_020208	CAAAAG	2	12	84444	84455	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	447914194
43	NC_020208	TAAGAA	2	12	87555	87566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	447914199
44	NC_020208	GAAAGA	2	12	91245	91256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	447914204
45	NC_020208	AGAGAA	2	12	92575	92586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	447914204
46	NC_020208	AGAATA	2	12	92645	92656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	447914204
47	NC_020208	CATGAA	2	12	94333	94344	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	447914205
48	NC_020208	ACCGCC	2	12	99727	99738	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_020208	GACAAG	2	12	99905	99916	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020208	CCTTGT	2	12	99938	99949	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020208	GAATTA	2	12	101827	101838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	447914217
52	NC_020208	ATGTCC	2	12	108574	108585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	447914223
53	NC_020208	TTCATA	2	12	111868	111879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	447914226
54	NC_020208	TATGGT	2	12	112865	112876	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	447914227
55	NC_020208	TTCTAC	2	12	113372	113383	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020208	TGGAAA	2	12	120621	120632	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	447914233
57	NC_020208	GCATTA	2	12	124394	124405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	447914235
58	NC_020208	AAAATA	2	12	133122	133133	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020208	AAATTT	2	12	142717	142728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020208	AGCACC	2	12	148917	148928	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	447914258
61	NC_020208	TAAAAT	2	12	152784	152795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	447914262
62	NC_020208	TTCATC	2	12	159031	159042	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	447914266
63	NC_020208	GCCTTT	2	12	159712	159723	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	447914266
64	NC_020208	AAAGGT	2	12	163675	163686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	447914270
65	NC_020208	TTGATA	2	12	165210	165221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020208	TATATC	2	12	169676	169687	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	447914276
67	NC_020208	TTTTTC	2	12	171346	171357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	447914279
68	NC_020208	ACTTAA	2	12	172536	172547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020208	TTTTTC	2	12	173744	173755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	447914282
70	NC_020208	TTCTTT	2	12	175992	176003	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	447914285
71	NC_020208	GGTGAA	2	12	183226	183237	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	447914292
72	NC_020208	CTACCA	2	12	184150	184161	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	447914294
73	NC_020208	CAAAAG	2	12	190998	191009	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020208	GCTGGG	2	12	194934	194945	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	447914303
75	NC_020208	TCTTGT	2	12	198674	198685	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020208	TGAACC	2	12	207734	207745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	447914312
77	NC_020208	GAAAAC	2	12	210182	210193	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	447914315
78	NC_020208	TGATAT	2	12	210519	210530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	447914315
79	NC_020208	TGCTTC	2	12	213346	213357	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	447914317

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.