MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020208	TTTATT	2	12	1581	1592	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	447914118
2	NC_020208	ATCTTC	2	12	1629	1640	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	447914118
3	NC_020208	AGAAGC	2	12	27840	27851	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	447914135
4	NC_020208	AGAAGC	2	12	27972	27983	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	447914135
5	NC_020208	TAAAAA	2	12	29678	29689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	447914136
6	NC_020208	ATTCAT	2	12	38208	38219	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	447914145
7	NC_020208	TGTTCT	2	12	40631	40642	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	447914149
8	NC_020208	AAAATC	2	12	46010	46021	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	447914156
9	NC_020208	CCGTTG	2	12	49422	49433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	447914159
10	NC_020208	GAAAAC	2	12	56526	56537	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	447914167
11	NC_020208	TGATAT	2	12	56863	56874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	447914167
12	NC_020208	TTTTTC	2	12	57673	57684	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	447914168
13	NC_020208	CAAAAA	2	12	61435	61446	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	447914172
14	NC_020208	ATGGAT	2	12	64495	64506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	447914176
15	NC_020208	CAGGTT	2	12	66347	66358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	447914179
16	NC_020208	AACGTG	2	12	72328	72339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	447914185
17	NC_020208	AAAAGA	2	12	73252	73263	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	447914187
18	NC_020208	AAAAAG	2	12	74238	74249	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	447914187
19	NC_020208	TGGGGA	2	12	77483	77494	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	447914189
20	NC_020208	TGATTT	2	12	77827	77838	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	447914189
21	NC_020208	ACTGGA	2	12	78170	78181	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	447914189
22	NC_020208	TGAAAA	2	12	79307	79318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	447914189
23	NC_020208	GATTCA	2	12	83138	83149	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	447914193
24	NC_020208	CAAAAG	2	12	84444	84455	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	447914194
25	NC_020208	TAAGAA	2	12	87555	87566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	447914199
26	NC_020208	GAAAGA	2	12	91245	91256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	447914204
27	NC_020208	AGAGAA	2	12	92575	92586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	447914204
28	NC_020208	AGAATA	2	12	92645	92656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	447914204
29	NC_020208	CATGAA	2	12	94333	94344	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	447914205
30	NC_020208	GAATTA	2	12	101827	101838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	447914217
31	NC_020208	ATGTCC	2	12	108574	108585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	447914223
32	NC_020208	TTCATA	2	12	111868	111879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	447914226
33	NC_020208	TATGGT	2	12	112865	112876	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	447914227
34	NC_020208	TGGAAA	2	12	120621	120632	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	447914233
35	NC_020208	GCATTA	2	12	124394	124405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	447914235
36	NC_020208	AGCACC	2	12	148917	148928	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	447914258
37	NC_020208	TAAAAT	2	12	152784	152795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	447914262
38	NC_020208	TTCATC	2	12	159031	159042	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	447914266
39	NC_020208	GCCTTT	2	12	159712	159723	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	447914266
40	NC_020208	AAAGGT	2	12	163675	163686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	447914270
41	NC_020208	TATATC	2	12	169676	169687	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	447914276
42	NC_020208	TTTTTC	2	12	171346	171357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	447914279
43	NC_020208	TTTTTC	2	12	173744	173755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	447914282
44	NC_020208	TTCTTT	2	12	175992	176003	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	447914285
45	NC_020208	GGTGAA	2	12	183226	183237	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	447914292
46	NC_020208	CTACCA	2	12	184150	184161	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	447914294
47	NC_020208	GCTGGG	2	12	194934	194945	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	447914303
48	NC_020208	TGAACC	2	12	207734	207745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	447914312
49	NC_020208	GAAAAC	2	12	210182	210193	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	447914315
50	NC_020208	TGATAT	2	12	210519	210530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	447914315
51	NC_020208	TGCTTC	2	12	213346	213357	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	447914317

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.