MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020208	ATTTA	2	10	140	149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020208	TAAAT	2	10	438	447	60 %	40 %	0 %	0 %	447914115
3	NC_020208	TTGTT	2	10	1526	1535	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020208	GCCCG	2	10	1958	1967	0 %	0 %	40 %	60 %	447914118
5	NC_020208	TGATT	2	10	4329	4338	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020208	GAAAA	2	10	4624	4633	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020208	GAATC	2	10	5382	5391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020208	ATTTA	2	10	5977	5986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020208	TCGCT	2	10	7894	7903	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_020208	TAAAT	2	10	9770	9779	60 %	40 %	0 %	0 %	447914123
11	NC_020208	ATTAT	2	10	10503	10512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020208	GATTT	2	10	12099	12108	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020208	CATCT	2	10	12228	12237	20 %	40 %	0 %	40 %	447914125
14	NC_020208	ACTAA	2	10	14354	14363	60 %	20 %	0 %	20 %	447914126
15	NC_020208	CTAAT	2	10	17005	17014	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020208	ATTAA	2	10	21258	21267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020208	AGAAT	2	10	24441	24450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020208	TTTTC	2	10	25852	25861	0 %	80 %	0 %	20 %	447914133
19	NC_020208	AAATA	2	10	27095	27104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020208	AGGAA	2	10	28796	28805	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020208	TATTT	2	10	29044	29053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020208	AACCT	2	10	29849	29858	40 %	20 %	0 %	40 %	447914137
23	NC_020208	CCATA	2	10	29947	29956	40 %	20 %	0 %	40 %	447914137
24	NC_020208	AAGTC	2	10	31187	31196	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020208	TTTAT	2	10	32300	32309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020208	GAAGA	2	10	32557	32566	60 %	0 %	40 %	0 %	447914139
27	NC_020208	TTTGA	2	10	32660	32669	20 %	60 %	20 %	0 %	447914139
28	NC_020208	AGTTT	2	10	33047	33056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020208	AGGAT	2	10	33866	33875	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020208	GACAA	2	10	37683	37692	60 %	0 %	20 %	20 %	447914144
31	NC_020208	AAAAC	2	10	39483	39492	80 %	0 %	0 %	20 %	447914147
32	NC_020208	ATGTA	2	10	40552	40561	40 %	40 %	20 %	0 %	447914149
33	NC_020208	AACGA	2	10	41700	41709	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_020208	AACAG	2	10	41830	41839	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020208	GACTT	2	10	42625	42634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020208	TAAAC	2	10	42679	42688	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020208	GAATA	2	10	42971	42980	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020208	ATCAA	2	10	43346	43355	60 %	20 %	0 %	20 %	447914152
39	NC_020208	TATTT	2	10	45243	45252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020208	TATTT	2	10	45500	45509	20 %	80 %	0 %	0 %	447914155
41	NC_020208	AAATC	2	10	47085	47094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020208	TGATT	2	10	51638	51647	20 %	60 %	20 %	0 %	447914162
43	NC_020208	TTTAC	2	10	53541	53550	20 %	60 %	0 %	20 %	447914164
44	NC_020208	TAAAT	2	10	55464	55473	60 %	40 %	0 %	0 %	447914165
45	NC_020208	TCATC	2	10	56991	57000	20 %	40 %	0 %	40 %	447914167
46	NC_020208	TCCAT	2	10	58463	58472	20 %	40 %	0 %	40 %	447914169
47	NC_020208	ATTTC	2	10	59486	59495	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020208	GTTAT	2	10	59628	59637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020208	CAAAA	2	10	60263	60272	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020208	TTTAT	2	10	63057	63066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020208	ATCAA	2	10	65176	65185	60 %	20 %	0 %	20 %	447914178
52	NC_020208	ATCCA	2	10	69681	69690	40 %	20 %	0 %	40 %	447914183
53	NC_020208	ACAAA	2	10	70842	70851	80 %	0 %	0 %	20 %	447914183
54	NC_020208	TAAAA	2	10	71642	71651	80 %	20 %	0 %	0 %	447914183
55	NC_020208	CGAAA	2	10	73121	73130	60 %	0 %	20 %	20 %	447914187
56	NC_020208	ATTTT	2	10	76607	76616	20 %	80 %	0 %	0 %	447914188
57	NC_020208	AAGAA	2	10	86140	86149	80 %	0 %	20 %	0 %	447914197
58	NC_020208	GAAAT	2	10	86172	86181	60 %	20 %	20 %	0 %	447914197
59	NC_020208	GAATG	2	10	88019	88028	40 %	20 %	40 %	0 %	447914200
60	NC_020208	GGAAT	2	10	89346	89355	40 %	20 %	40 %	0 %	447914201
61	NC_020208	AAGTA	2	10	89823	89832	60 %	20 %	20 %	0 %	447914201
62	NC_020208	GAAAA	2	10	91019	91028	80 %	0 %	20 %	0 %	447914204
63	NC_020208	ACAAA	2	10	91600	91609	80 %	0 %	0 %	20 %	447914204
64	NC_020208	AATGG	2	10	93076	93085	40 %	20 %	40 %	0 %	447914205
65	NC_020208	AAAAG	2	10	95251	95260	80 %	0 %	20 %	0 %	447914206
66	NC_020208	TTTGC	2	10	96136	96145	0 %	60 %	20 %	20 %	447914206
67	NC_020208	ATCCA	2	10	96305	96314	40 %	20 %	0 %	40 %	447914206
68	NC_020208	GAAAA	2	10	96632	96641	80 %	0 %	20 %	0 %	447914206
69	NC_020208	AAGAA	2	10	96653	96662	80 %	0 %	20 %	0 %	447914206
70	NC_020208	ATTTC	2	10	97251	97260	20 %	60 %	0 %	20 %	447914208
71	NC_020208	ATGAA	2	10	97385	97394	60 %	20 %	20 %	0 %	447914208
72	NC_020208	GAAAT	2	10	97483	97492	60 %	20 %	20 %	0 %	447914208
73	NC_020208	AAATT	2	10	97880	97889	60 %	40 %	0 %	0 %	447914209
74	NC_020208	CATTT	2	10	98301	98310	20 %	60 %	0 %	20 %	447914209
75	NC_020208	CTTTA	2	10	99399	99408	20 %	60 %	0 %	20 %	447914212
76	NC_020208	ACACA	2	10	100255	100264	60 %	0 %	0 %	40 %	447914214
77	NC_020208	CGAAA	2	10	100842	100851	60 %	0 %	20 %	20 %	447914215
78	NC_020208	AAACT	2	10	101647	101656	60 %	20 %	0 %	20 %	447914217
79	NC_020208	AGAAA	2	10	102299	102308	80 %	0 %	20 %	0 %	447914219
80	NC_020208	GACTT	2	10	103726	103735	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020208	AAGCA	2	10	105632	105641	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020208	AAAGA	2	10	105877	105886	80 %	0 %	20 %	0 %	447914220
83	NC_020208	TTTTA	2	10	106002	106011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020208	ACAAA	2	10	108051	108060	80 %	0 %	0 %	20 %	447914223
85	NC_020208	ACAGA	2	10	115332	115341	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020208	AGAGA	2	10	116337	116346	60 %	0 %	40 %	0 %	447914230
87	NC_020208	CATTT	2	10	118426	118435	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020208	ATTTT	2	10	118518	118527	20 %	80 %	0 %	0 %	447914232
89	NC_020208	CTATT	2	10	120354	120363	20 %	60 %	0 %	20 %	447914233
90	NC_020208	CACTT	2	10	121012	121021	20 %	40 %	0 %	40 %	447914233
91	NC_020208	ATTTA	2	10	121350	121359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020208	AAGTC	2	10	122086	122095	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020208	AATCA	2	10	123956	123965	60 %	20 %	0 %	20 %	447914234
94	NC_020208	AAGAA	2	10	124083	124092	80 %	0 %	20 %	0 %	447914234
95	NC_020208	TCTCT	2	10	124601	124610	0 %	60 %	0 %	40 %	447914235
96	NC_020208	AGCTT	2	10	127348	127357	20 %	40 %	20 %	20 %	447914237
97	NC_020208	AAATG	2	10	127498	127507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020208	GGATT	2	10	128039	128048	20 %	40 %	40 %	0 %	447914239
99	NC_020208	AAAAC	2	10	128744	128753	80 %	0 %	0 %	20 %	447914241
100	NC_020208	ACGAA	2	10	129711	129720	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_020208	AATAT	2	10	129816	129825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020208	CAACG	2	10	131159	131168	40 %	0 %	20 %	40 %	447914244
103	NC_020208	GAAAT	2	10	132611	132620	60 %	20 %	20 %	0 %	447914244
104	NC_020208	CAATG	2	10	133281	133290	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020208	ATGAA	2	10	136412	136421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020208	AATCA	2	10	137817	137826	60 %	20 %	0 %	20 %	447914251
107	NC_020208	AAGCT	2	10	141022	141031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_020208	TCTCT	2	10	142195	142204	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_020208	AATTA	2	10	142703	142712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020208	TAAAT	2	10	143086	143095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020208	TCTTT	2	10	144490	144499	0 %	80 %	0 %	20 %	447914255
112	NC_020208	TTTCT	2	10	144760	144769	0 %	80 %	0 %	20 %	447914255
113	NC_020208	AGCAC	2	10	146184	146193	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_020208	ACTAC	2	10	147394	147403	40 %	20 %	0 %	40 %	447914256
115	NC_020208	GAAAA	2	10	148820	148829	80 %	0 %	20 %	0 %	447914258
116	NC_020208	GACTT	2	10	157155	157164	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020208	CAATC	2	10	158422	158431	40 %	20 %	0 %	40 %	447914266
118	NC_020208	ATTAA	2	10	159878	159887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020208	TTCAT	2	10	159949	159958	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020208	TGAAT	2	10	162165	162174	40 %	40 %	20 %	0 %	447914270
121	NC_020208	TTGGG	2	10	162366	162375	0 %	40 %	60 %	0 %	447914270
122	NC_020208	ATTAA	2	10	163117	163126	60 %	40 %	0 %	0 %	447914270
123	NC_020208	TTTTA	2	10	165438	165447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020208	CAAAA	2	10	166811	166820	80 %	0 %	0 %	20 %	447914273
125	NC_020208	ATTTT	2	10	167226	167235	20 %	80 %	0 %	0 %	447914273
126	NC_020208	CATTG	2	10	167658	167667	20 %	40 %	20 %	20 %	447914273
127	NC_020208	TAAAT	2	10	168829	168838	60 %	40 %	0 %	0 %	447914275
128	NC_020208	AATCC	2	10	171994	172003	40 %	20 %	0 %	40 %	447914280
129	NC_020208	ACCAT	2	10	172303	172312	40 %	20 %	0 %	40 %	447914280
130	NC_020208	ATAAA	2	10	177946	177955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020208	AGTAA	2	10	181203	181212	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020208	GATTC	2	10	181979	181988	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_020208	GATTA	2	10	183764	183773	40 %	40 %	20 %	0 %	447914294
134	NC_020208	TAGGT	2	10	188342	188351	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020208	AAATG	2	10	189125	189134	60 %	20 %	20 %	0 %	447914298
136	NC_020208	AAAGA	2	10	190288	190297	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020208	TTTGT	2	10	193018	193027	0 %	80 %	20 %	0 %	447914301
138	NC_020208	CCATT	2	10	194416	194425	20 %	40 %	0 %	40 %	447914303
139	NC_020208	TTACT	2	10	196598	196607	20 %	60 %	0 %	20 %	447914306
140	NC_020208	CTATA	2	10	196651	196660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_020208	AAAAT	2	10	198157	198166	80 %	20 %	0 %	0 %	447914307
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143	NC_020208	TGCTT	2	10	201784	201793	0 %	60 %	20 %	20 %	447914309
144	NC_020208	ATTTA	2	10	202047	202056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020208	AAATA	2	10	202195	202204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020208	GCTTC	2	10	202533	202542	0 %	40 %	20 %	40 %	447914310
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155	NC_020208	CTTTT	2	10	214289	214298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.