MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020208	ATTTA	2	10	140	149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020208	TTGTT	2	10	1526	1535	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020208	TGATT	2	10	4329	4338	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020208	GAAAA	2	10	4624	4633	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020208	GAATC	2	10	5382	5391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020208	ATTTA	2	10	5977	5986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020208	TCGCT	2	10	7894	7903	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_020208	ATTAT	2	10	10503	10512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020208	GATTT	2	10	12099	12108	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020208	CTAAT	2	10	17005	17014	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020208	ATTAA	2	10	21258	21267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020208	AGAAT	2	10	24441	24450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020208	AAATA	2	10	27095	27104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020208	AGGAA	2	10	28796	28805	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020208	TATTT	2	10	29044	29053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020208	AAGTC	2	10	31187	31196	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020208	TTTAT	2	10	32300	32309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020208	AGTTT	2	10	33047	33056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020208	AGGAT	2	10	33866	33875	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020208	AACGA	2	10	41700	41709	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020208	AACAG	2	10	41830	41839	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020208	GACTT	2	10	42625	42634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020208	TAAAC	2	10	42679	42688	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020208	GAATA	2	10	42971	42980	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020208	TATTT	2	10	45243	45252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020208	AAATC	2	10	47085	47094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020208	ATTTC	2	10	59486	59495	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020208	GTTAT	2	10	59628	59637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020208	CAAAA	2	10	60263	60272	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020208	TTTAT	2	10	63057	63066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020208	GACTT	2	10	103726	103735	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020208	AAGCA	2	10	105632	105641	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020208	TTTTA	2	10	106002	106011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020208	ACAGA	2	10	115332	115341	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020208	CATTT	2	10	118426	118435	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020208	ATTTA	2	10	121350	121359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020208	AAGTC	2	10	122086	122095	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020208	AAATG	2	10	127498	127507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020208	ACGAA	2	10	129711	129720	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020208	AATAT	2	10	129816	129825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020208	CAATG	2	10	133281	133290	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020208	ATGAA	2	10	136412	136421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020208	AAGCT	2	10	141022	141031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020208	TCTCT	2	10	142195	142204	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_020208	AATTA	2	10	142703	142712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020208	TAAAT	2	10	143086	143095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020208	AGCAC	2	10	146184	146193	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_020208	GACTT	2	10	157155	157164	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020208	ATTAA	2	10	159878	159887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020208	TTCAT	2	10	159949	159958	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020208	TTTTA	2	10	165438	165447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020208	ATAAA	2	10	177946	177955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020208	AGTAA	2	10	181203	181212	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020208	GATTC	2	10	181979	181988	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020208	TAGGT	2	10	188342	188351	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020208	AAAGA	2	10	190288	190297	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020208	CTATA	2	10	196651	196660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020208	ATTTA	2	10	202047	202056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020208	AAATA	2	10	202195	202204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020208	TTGAA	2	10	210884	210893	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020208	TTTTA	2	10	212633	212642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020208	CTTTT	2	10	214289	214298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.