MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020208	TAAAT	2	10	438	447	60 %	40 %	0 %	0 %	447914115
2	NC_020208	GCCCG	2	10	1958	1967	0 %	0 %	40 %	60 %	447914118
3	NC_020208	TAAAT	2	10	9770	9779	60 %	40 %	0 %	0 %	447914123
4	NC_020208	CATCT	2	10	12228	12237	20 %	40 %	0 %	40 %	447914125
5	NC_020208	ACTAA	2	10	14354	14363	60 %	20 %	0 %	20 %	447914126
6	NC_020208	TTTTC	2	10	25852	25861	0 %	80 %	0 %	20 %	447914133
7	NC_020208	AACCT	2	10	29849	29858	40 %	20 %	0 %	40 %	447914137
8	NC_020208	CCATA	2	10	29947	29956	40 %	20 %	0 %	40 %	447914137
9	NC_020208	GAAGA	2	10	32557	32566	60 %	0 %	40 %	0 %	447914139
10	NC_020208	TTTGA	2	10	32660	32669	20 %	60 %	20 %	0 %	447914139
11	NC_020208	GACAA	2	10	37683	37692	60 %	0 %	20 %	20 %	447914144
12	NC_020208	AAAAC	2	10	39483	39492	80 %	0 %	0 %	20 %	447914147
13	NC_020208	ATGTA	2	10	40552	40561	40 %	40 %	20 %	0 %	447914149
14	NC_020208	ATCAA	2	10	43346	43355	60 %	20 %	0 %	20 %	447914152
15	NC_020208	TATTT	2	10	45500	45509	20 %	80 %	0 %	0 %	447914155
16	NC_020208	TGATT	2	10	51638	51647	20 %	60 %	20 %	0 %	447914162
17	NC_020208	TTTAC	2	10	53541	53550	20 %	60 %	0 %	20 %	447914164
18	NC_020208	TAAAT	2	10	55464	55473	60 %	40 %	0 %	0 %	447914165
19	NC_020208	TCATC	2	10	56991	57000	20 %	40 %	0 %	40 %	447914167
20	NC_020208	TCCAT	2	10	58463	58472	20 %	40 %	0 %	40 %	447914169
21	NC_020208	ATCAA	2	10	65176	65185	60 %	20 %	0 %	20 %	447914178
22	NC_020208	ATCCA	2	10	69681	69690	40 %	20 %	0 %	40 %	447914183
23	NC_020208	ACAAA	2	10	70842	70851	80 %	0 %	0 %	20 %	447914183
24	NC_020208	TAAAA	2	10	71642	71651	80 %	20 %	0 %	0 %	447914183
25	NC_020208	CGAAA	2	10	73121	73130	60 %	0 %	20 %	20 %	447914187
26	NC_020208	ATTTT	2	10	76607	76616	20 %	80 %	0 %	0 %	447914188
27	NC_020208	AAGAA	2	10	86140	86149	80 %	0 %	20 %	0 %	447914197
28	NC_020208	GAAAT	2	10	86172	86181	60 %	20 %	20 %	0 %	447914197
29	NC_020208	GAATG	2	10	88019	88028	40 %	20 %	40 %	0 %	447914200
30	NC_020208	GGAAT	2	10	89346	89355	40 %	20 %	40 %	0 %	447914201
31	NC_020208	AAGTA	2	10	89823	89832	60 %	20 %	20 %	0 %	447914201
32	NC_020208	GAAAA	2	10	91019	91028	80 %	0 %	20 %	0 %	447914204
33	NC_020208	ACAAA	2	10	91600	91609	80 %	0 %	0 %	20 %	447914204
34	NC_020208	AATGG	2	10	93076	93085	40 %	20 %	40 %	0 %	447914205
35	NC_020208	AAAAG	2	10	95251	95260	80 %	0 %	20 %	0 %	447914206
36	NC_020208	TTTGC	2	10	96136	96145	0 %	60 %	20 %	20 %	447914206
37	NC_020208	ATCCA	2	10	96305	96314	40 %	20 %	0 %	40 %	447914206
38	NC_020208	GAAAA	2	10	96632	96641	80 %	0 %	20 %	0 %	447914206
39	NC_020208	AAGAA	2	10	96653	96662	80 %	0 %	20 %	0 %	447914206
40	NC_020208	ATTTC	2	10	97251	97260	20 %	60 %	0 %	20 %	447914208
41	NC_020208	ATGAA	2	10	97385	97394	60 %	20 %	20 %	0 %	447914208
42	NC_020208	GAAAT	2	10	97483	97492	60 %	20 %	20 %	0 %	447914208
43	NC_020208	AAATT	2	10	97880	97889	60 %	40 %	0 %	0 %	447914209
44	NC_020208	CATTT	2	10	98301	98310	20 %	60 %	0 %	20 %	447914209
45	NC_020208	CTTTA	2	10	99399	99408	20 %	60 %	0 %	20 %	447914212
46	NC_020208	ACACA	2	10	100255	100264	60 %	0 %	0 %	40 %	447914214
47	NC_020208	CGAAA	2	10	100842	100851	60 %	0 %	20 %	20 %	447914215
48	NC_020208	AAACT	2	10	101647	101656	60 %	20 %	0 %	20 %	447914217
49	NC_020208	AGAAA	2	10	102299	102308	80 %	0 %	20 %	0 %	447914219
50	NC_020208	AAAGA	2	10	105877	105886	80 %	0 %	20 %	0 %	447914220
51	NC_020208	ACAAA	2	10	108051	108060	80 %	0 %	0 %	20 %	447914223
52	NC_020208	AGAGA	2	10	116337	116346	60 %	0 %	40 %	0 %	447914230
53	NC_020208	ATTTT	2	10	118518	118527	20 %	80 %	0 %	0 %	447914232
54	NC_020208	CTATT	2	10	120354	120363	20 %	60 %	0 %	20 %	447914233
55	NC_020208	CACTT	2	10	121012	121021	20 %	40 %	0 %	40 %	447914233
56	NC_020208	AATCA	2	10	123956	123965	60 %	20 %	0 %	20 %	447914234
57	NC_020208	AAGAA	2	10	124083	124092	80 %	0 %	20 %	0 %	447914234
58	NC_020208	TCTCT	2	10	124601	124610	0 %	60 %	0 %	40 %	447914235
59	NC_020208	AGCTT	2	10	127348	127357	20 %	40 %	20 %	20 %	447914237
60	NC_020208	GGATT	2	10	128039	128048	20 %	40 %	40 %	0 %	447914239
61	NC_020208	AAAAC	2	10	128744	128753	80 %	0 %	0 %	20 %	447914241
62	NC_020208	CAACG	2	10	131159	131168	40 %	0 %	20 %	40 %	447914244
63	NC_020208	GAAAT	2	10	132611	132620	60 %	20 %	20 %	0 %	447914244
64	NC_020208	AATCA	2	10	137817	137826	60 %	20 %	0 %	20 %	447914251
65	NC_020208	TCTTT	2	10	144490	144499	0 %	80 %	0 %	20 %	447914255
66	NC_020208	TTTCT	2	10	144760	144769	0 %	80 %	0 %	20 %	447914255
67	NC_020208	ACTAC	2	10	147394	147403	40 %	20 %	0 %	40 %	447914256
68	NC_020208	GAAAA	2	10	148820	148829	80 %	0 %	20 %	0 %	447914258
69	NC_020208	CAATC	2	10	158422	158431	40 %	20 %	0 %	40 %	447914266
70	NC_020208	TGAAT	2	10	162165	162174	40 %	40 %	20 %	0 %	447914270
71	NC_020208	TTGGG	2	10	162366	162375	0 %	40 %	60 %	0 %	447914270
72	NC_020208	ATTAA	2	10	163117	163126	60 %	40 %	0 %	0 %	447914270
73	NC_020208	CAAAA	2	10	166811	166820	80 %	0 %	0 %	20 %	447914273
74	NC_020208	ATTTT	2	10	167226	167235	20 %	80 %	0 %	0 %	447914273
75	NC_020208	CATTG	2	10	167658	167667	20 %	40 %	20 %	20 %	447914273
76	NC_020208	TAAAT	2	10	168829	168838	60 %	40 %	0 %	0 %	447914275
77	NC_020208	AATCC	2	10	171994	172003	40 %	20 %	0 %	40 %	447914280
78	NC_020208	ACCAT	2	10	172303	172312	40 %	20 %	0 %	40 %	447914280
79	NC_020208	GATTA	2	10	183764	183773	40 %	40 %	20 %	0 %	447914294
80	NC_020208	AAATG	2	10	189125	189134	60 %	20 %	20 %	0 %	447914298
81	NC_020208	TTTGT	2	10	193018	193027	0 %	80 %	20 %	0 %	447914301
82	NC_020208	CCATT	2	10	194416	194425	20 %	40 %	0 %	40 %	447914303
83	NC_020208	TTACT	2	10	196598	196607	20 %	60 %	0 %	20 %	447914306
84	NC_020208	AAAAT	2	10	198157	198166	80 %	20 %	0 %	0 %	447914307
85	NC_020208	ATTTC	2	10	200989	200998	20 %	60 %	0 %	20 %	447914309
86	NC_020208	TGCTT	2	10	201784	201793	0 %	60 %	20 %	20 %	447914309
87	NC_020208	GCTTC	2	10	202533	202542	0 %	40 %	20 %	40 %	447914310
88	NC_020208	AATCA	2	10	202687	202696	60 %	20 %	0 %	20 %	447914310
89	NC_020208	TGATT	2	10	205071	205080	20 %	60 %	20 %	0 %	447914310
90	NC_020208	CATAT	2	10	205927	205936	40 %	40 %	0 %	20 %	447914311
91	NC_020208	TCTTT	2	10	207093	207102	0 %	80 %	0 %	20 %	447914312
92	NC_020208	ATACA	2	10	209097	209106	60 %	20 %	0 %	20 %	447914313
93	NC_020208	TCATC	2	10	210647	210656	20 %	40 %	0 %	40 %	447914315

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.