MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium NRRL B-2354

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020207	ATAAAA	2	12	24837	24848	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020207	AATAAA	2	12	51397	51408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020207	GGAATG	2	12	53638	53649	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020207	AATAAA	2	12	69674	69685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020207	CGGATA	2	12	77345	77356	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020207	TTCTTG	2	12	83451	83462	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020207	CTTGTT	2	12	109706	109717	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020207	ACAGGT	2	12	109967	109978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020207	TAATTA	2	12	115025	115036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020207	TAAAAA	2	12	121239	121250	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020207	TTTTAT	2	12	165001	165012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020207	TAGGTG	2	12	247709	247720	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020207	CAAATA	2	12	258936	258947	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020207	GTTTTT	2	12	267869	267880	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020207	GAAAAA	2	12	286040	286051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020207	AAAACA	2	12	290974	290985	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020207	TGCTTC	2	12	365691	365702	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020207	TGATAG	2	12	385532	385543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020207	TATCTT	2	12	385625	385636	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020207	TCCTTT	2	12	403068	403079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020207	AAAAAG	2	12	403356	403367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020207	CATTTT	2	12	421758	421769	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020207	ACTTAA	2	12	454079	454090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020207	ATTTAG	2	12	479398	479409	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020207	CATTCT	2	12	482667	482678	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020207	TAAAAT	2	12	487321	487332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020207	TGTTTT	2	12	544530	544541	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020207	AAATCC	2	12	575701	575712	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020207	ACAGAA	3	18	577382	577399	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020207	TTTTGG	2	12	578227	578238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020207	TTAGTA	2	12	598091	598102	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020207	TAGTAA	2	12	604400	604411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020207	CATTTT	2	12	621838	621849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020207	TTTTTA	2	12	626051	626062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020207	TAAAAA	2	12	640760	640771	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020207	TGCTTT	2	12	763112	763123	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020207	AGAATC	2	12	775951	775962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020207	TCCTTC	2	12	779651	779662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020207	GAAGCA	2	12	784737	784748	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020207	AAGACA	2	12	793161	793172	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020207	CTTTAT	2	12	793389	793400	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020207	CGATTG	2	12	818086	818097	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020207	TTTTAG	2	12	818134	818145	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020207	TATAAA	2	12	842676	842687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020207	AAAAGC	2	12	862060	862071	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020207	TTAGAA	2	12	890746	890757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020207	ATCGAA	2	12	892268	892279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020207	AACTGG	2	12	892282	892293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020207	TTTCTT	2	12	898483	898494	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020207	TAGTGA	2	12	900201	900212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020207	ATTTGT	2	12	905366	905377	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020207	CGATTT	2	12	921515	921526	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020207	ATATTT	2	12	943927	943938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020207	ATTTGT	2	12	945902	945913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020207	TTATAC	2	12	946976	946987	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020207	CGATTC	2	12	950015	950026	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020207	ATGAAT	2	12	961960	961971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020207	AAAATA	2	12	972805	972816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020207	AAAAAG	2	12	973121	973132	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020207	AAAAAG	2	12	983992	984003	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020207	AAAATA	2	12	1019857	1019868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020207	TTTCTA	2	12	1052121	1052132	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020207	AAAAGA	2	12	1062091	1062102	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020207	TGAACT	2	12	1065521	1065532	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020207	TGCTTC	2	12	1067596	1067607	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020207	CTTTTT	2	12	1082670	1082681	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020207	AGTTTT	2	12	1084985	1084996	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020207	CTTTTT	2	12	1127798	1127809	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020207	TTTTTA	2	12	1134649	1134660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020207	CAATAA	2	12	1173637	1173648	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020207	ACATTT	2	12	1240365	1240376	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020207	CTTTTT	2	12	1254297	1254308	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020207	TGCTTC	2	12	1262774	1262785	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020207	TAAAAA	2	12	1265730	1265741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020207	AAGAAA	2	12	1265823	1265834	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020207	TTGAAG	2	12	1271807	1271818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020207	TAAAAA	2	12	1274540	1274551	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020207	TGATAG	2	12	1291898	1291909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020207	TTGATT	2	12	1329102	1329113	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020207	TGATCA	2	12	1330174	1330185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020207	TAAATT	2	12	1332938	1332949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020207	TTAAAA	2	12	1333275	1333286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020207	AGGGTA	2	12	1341087	1341098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020207	TTTTTA	2	12	1353022	1353033	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020207	TAAAAA	2	12	1353082	1353093	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020207	AAAGGA	2	12	1361761	1361772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020207	TTTAAA	2	12	1374469	1374480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020207	TCATTA	2	12	1374947	1374958	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020207	TTTAAG	2	12	1378504	1378515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020207	TGGTGC	2	12	1395137	1395148	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020207	GCAGCG	2	12	1395925	1395936	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020207	TTTATA	2	12	1403606	1403617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020207	TAAAAA	2	12	1404629	1404640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020207	TTAAGT	2	12	1406302	1406313	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020207	TAACTC	2	12	1456697	1456708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020207	AAAAGA	2	12	1468929	1468940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020207	TTCACT	2	12	1489584	1489595	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020207	TGCAAA	2	12	1507641	1507652	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020207	AAAATA	2	12	1553386	1553397	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020207	AGTACC	2	12	1599726	1599737	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020207	TAAACT	2	12	1630370	1630381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_020207	GAAAAC	2	12	1636013	1636024	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020207	TGCTTC	2	12	1659022	1659033	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020207	AAAAGA	2	12	1663724	1663735	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020207	AGAAGT	2	12	1672330	1672341	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020207	TTTTGG	2	12	1673551	1673562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020207	ACATTG	2	12	1674609	1674620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020207	TTTTCG	2	12	1678720	1678731	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020207	TCGGAT	2	12	1707414	1707425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_020207	TAATAG	2	12	1708098	1708109	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020207	TTCTTT	2	12	1712596	1712607	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020207	AGAATG	2	12	1741214	1741225	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020207	ACCAAA	2	12	1758112	1758123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020207	AGTTGT	2	12	1758697	1758708	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020207	TTTCTG	3	18	1758951	1758968	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020207	TGGATT	2	12	1760638	1760649	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020207	AAAGAA	2	12	1795873	1795884	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020207	ATTTTT	2	12	1803672	1803683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020207	CTCTTT	2	12	1806499	1806510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020207	GTATTT	2	12	1861280	1861291	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020207	AAACTC	2	12	1868492	1868503	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020207	TAAATA	2	12	1881888	1881899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020207	TTTTAT	2	12	1883865	1883876	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020207	TTTCCA	2	12	1885192	1885203	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020207	ACTAGG	2	12	1885322	1885333	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020207	GGCATT	2	12	1903294	1903305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_020207	GATTTT	2	12	1909015	1909026	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020207	GTATAA	2	12	1921208	1921219	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020207	CACAAA	2	12	1924881	1924892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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131	NC_020207	GCTTTT	2	12	1969804	1969815	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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133	NC_020207	TTTTAT	2	12	1974731	1974742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.