MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Blatta orientalis) str. Tarazona

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020195	ATTTT	2	10	3328	3337	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020195	AAATT	2	10	23814	23823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020195	GAAAA	2	10	35189	35198	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020195	GTTTT	2	10	36666	36675	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020195	TCATT	2	10	44882	44891	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020195	ATATA	2	10	52010	52019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020195	AGAAA	2	10	62835	62844	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020195	AAAAT	2	10	101198	101207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020195	TAATT	2	10	115306	115315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020195	TTTAG	2	10	118012	118021	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020195	TTCTT	2	10	120840	120849	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020195	AATAA	2	10	134235	134244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020195	ATTTA	2	10	153323	153332	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020195	TTTCA	2	10	153692	153701	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020195	TATTT	2	10	156830	156839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020195	ATTCT	2	10	159636	159645	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020195	CGGGA	2	10	171998	172007	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020195	ATAAA	2	10	179404	179413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020195	TATAA	2	10	202436	202445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020195	AATAT	2	10	210104	210113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020195	ATGGA	2	10	215218	215227	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020195	ACATC	2	10	225983	225992	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_020195	TTTGA	2	10	265573	265582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020195	ATTCA	2	10	268374	268383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020195	GAAAA	2	10	268561	268570	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020195	ATAAA	2	10	270664	270673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020195	TAACA	2	10	281500	281509	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020195	TATAA	2	10	292543	292552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020195	TAACA	2	10	294148	294157	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020195	ATGTT	2	10	297098	297107	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020195	TATAA	2	10	319074	319083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020195	AAAAG	2	10	320886	320895	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020195	TTGAA	2	10	321011	321020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020195	CTATT	2	10	321091	321100	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020195	ATTTT	2	10	323897	323906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020195	TCCTA	2	10	329990	329999	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_020195	TTAGT	2	10	333088	333097	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020195	ATAAA	2	10	338551	338560	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020195	ATGAA	2	10	338562	338571	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020195	TTTCA	2	10	344006	344015	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020195	AGATA	2	10	345553	345562	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020195	ATGAA	2	10	350229	350238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020195	ATGAA	2	10	354624	354633	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020195	TAAAG	2	10	361432	361441	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020195	ATTTT	2	10	371584	371593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020195	AGAAA	2	10	371662	371671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020195	CAAGG	2	10	371741	371750	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020195	AGAAA	2	10	373386	373395	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020195	ATTTT	2	10	375305	375314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020195	AAGAA	2	10	403931	403940	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020195	GGAAT	2	10	405988	405997	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020195	AATAA	2	10	406026	406035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020195	TAAGT	2	10	406119	406128	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020195	TTTAT	2	10	406565	406574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020195	CATTT	2	10	406589	406598	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020195	TTGAT	2	10	406600	406609	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020195	TTTTA	2	10	413766	413775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020195	ATTTT	2	10	416405	416414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020195	TGGAA	2	10	417422	417431	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020195	ATTGA	2	10	417476	417485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020195	GGAAA	2	10	419036	419045	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020195	TAAAA	2	10	430151	430160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020195	CTAAT	2	10	442971	442980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_020195	TTATT	2	10	463803	463812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020195	TAAAT	2	10	476265	476274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020195	AATAA	2	10	501033	501042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020195	GGATT	2	10	506279	506288	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020195	GAAAA	2	10	515272	515281	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020195	TTTTA	2	10	517462	517471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020195	ATTGT	2	10	525175	525184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020195	CTATT	2	10	536923	536932	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020195	CATTA	2	10	552183	552192	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020195	ATTCT	2	10	567819	567828	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020195	TTGAA	2	10	567867	567876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020195	AGAAT	2	10	572804	572813	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.