MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Enterobacter aerogenes EA1509E plasmid pEA1509_A

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020180	CGGAG	2	10	3541	3550	20 %	0 %	60 %	20 %	444324189
2	NC_020180	AAAGT	2	10	3735	3744	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020180	GTCAT	2	10	4645	4654	20 %	40 %	20 %	20 %	444324192
4	NC_020180	ACCAA	2	10	5289	5298	60 %	0 %	0 %	40 %	444324193
5	NC_020180	TTCCC	2	10	6288	6297	0 %	40 %	0 %	60 %	444324195
6	NC_020180	GCTGA	2	10	6505	6514	20 %	20 %	40 %	20 %	444324196
7	NC_020180	CAAAG	2	10	6669	6678	60 %	0 %	20 %	20 %	444324196
8	NC_020180	GTCAG	2	10	6889	6898	20 %	20 %	40 %	20 %	444324196
9	NC_020180	TCTGT	2	10	10214	10223	0 %	60 %	20 %	20 %	444324201
10	NC_020180	AGGTT	2	10	12311	12320	20 %	40 %	40 %	0 %	444324206
11	NC_020180	AGCAA	2	10	12940	12949	60 %	0 %	20 %	20 %	444324207
12	NC_020180	CTTTG	2	10	14040	14049	0 %	60 %	20 %	20 %	444324210
13	NC_020180	TCAGA	2	10	14520	14529	40 %	20 %	20 %	20 %	444324211
14	NC_020180	AGCAA	2	10	18110	18119	60 %	0 %	20 %	20 %	444324219
15	NC_020180	GAAAA	2	10	19913	19922	80 %	0 %	20 %	0 %	444324222
16	NC_020180	TGAGC	2	10	23754	23763	20 %	20 %	40 %	20 %	444324229
17	NC_020180	TTCCC	2	10	23937	23946	0 %	40 %	0 %	60 %	444324230
18	NC_020180	CAGAG	2	10	24294	24303	40 %	0 %	40 %	20 %	444324230
19	NC_020180	ACAGT	2	10	26743	26752	40 %	20 %	20 %	20 %	444324235
20	NC_020180	GGCAA	2	10	27793	27802	40 %	0 %	40 %	20 %	444324239
21	NC_020180	CACGA	2	10	30801	30810	40 %	0 %	20 %	40 %	444324245
22	NC_020180	CGATG	2	10	32404	32413	20 %	20 %	40 %	20 %	444324247
23	NC_020180	TGACT	2	10	33774	33783	20 %	40 %	20 %	20 %	444324250
24	NC_020180	GAAAA	2	10	34671	34680	80 %	0 %	20 %	0 %	444324251
25	NC_020180	TGACA	2	10	37463	37472	40 %	20 %	20 %	20 %	444324257
26	NC_020180	AGGGG	2	10	38934	38943	20 %	0 %	80 %	0 %	444324261
27	NC_020180	GATCA	2	10	42290	42299	40 %	20 %	20 %	20 %	444324267
28	NC_020180	TGAAT	2	10	42516	42525	40 %	40 %	20 %	0 %	444324267
29	NC_020180	AGCTC	2	10	42872	42881	20 %	20 %	20 %	40 %	444324268
30	NC_020180	TTTCC	2	10	43218	43227	0 %	60 %	0 %	40 %	444324269
31	NC_020180	AGGGG	2	10	44464	44473	20 %	0 %	80 %	0 %	444324269
32	NC_020180	TGGTT	2	10	44489	44498	0 %	60 %	40 %	0 %	444324269
33	NC_020180	GCAAA	2	10	47820	47829	60 %	0 %	20 %	20 %	444324272
34	NC_020180	ATCTG	2	10	50511	50520	20 %	40 %	20 %	20 %	444324273
35	NC_020180	CCCAG	2	10	51051	51060	20 %	0 %	20 %	60 %	444324273
36	NC_020180	AGAGC	2	10	51150	51159	40 %	0 %	40 %	20 %	444324273
37	NC_020180	AGCTG	2	10	51321	51330	20 %	20 %	40 %	20 %	444324274
38	NC_020180	CGAAA	2	10	52764	52773	60 %	0 %	20 %	20 %	444324276
39	NC_020180	CCGAA	2	10	55804	55813	40 %	0 %	20 %	40 %	444324284
40	NC_020180	GAAGC	2	10	57408	57417	40 %	0 %	40 %	20 %	444324285
41	NC_020180	ATCGC	2	10	57661	57670	20 %	20 %	20 %	40 %	444324285
42	NC_020180	CCAAC	2	10	59117	59126	40 %	0 %	0 %	60 %	444324288
43	NC_020180	CCTAT	2	10	59702	59711	20 %	40 %	0 %	40 %	444324288
44	NC_020180	GGAAG	2	10	60387	60396	40 %	0 %	60 %	0 %	444324288
45	NC_020180	GGATG	2	10	61098	61107	20 %	20 %	60 %	0 %	444324288
46	NC_020180	TCATT	2	10	65254	65263	20 %	60 %	0 %	20 %	444324289
47	NC_020180	CGTTC	2	10	65275	65284	0 %	40 %	20 %	40 %	444324289
48	NC_020180	TGTTC	2	10	65592	65601	0 %	60 %	20 %	20 %	444324290
49	NC_020180	CCAAG	2	10	68356	68365	40 %	0 %	20 %	40 %	444324292
50	NC_020180	GATCA	2	10	68627	68636	40 %	20 %	20 %	20 %	444324292
51	NC_020180	GAAAG	2	10	68753	68762	60 %	0 %	40 %	0 %	444324293
52	NC_020180	GAAGA	2	10	69372	69381	60 %	0 %	40 %	0 %	444324293
53	NC_020180	CGACC	2	10	71073	71082	20 %	0 %	20 %	60 %	444324295
54	NC_020180	TCAGG	2	10	72593	72602	20 %	20 %	40 %	20 %	444324296
55	NC_020180	GGTTT	2	10	79237	79246	0 %	60 %	40 %	0 %	444324303
56	NC_020180	ATCTC	2	10	82832	82841	20 %	40 %	0 %	40 %	444324307
57	NC_020180	CGAGG	2	10	83380	83389	20 %	0 %	60 %	20 %	444324307
58	NC_020180	TCGAT	2	10	86224	86233	20 %	40 %	20 %	20 %	444324311
59	NC_020180	GTCTG	2	10	86241	86250	0 %	40 %	40 %	20 %	444324311
60	NC_020180	ACGAA	2	10	91128	91137	60 %	0 %	20 %	20 %	444324322
61	NC_020180	CAAAG	2	10	93171	93180	60 %	0 %	20 %	20 %	444324324
62	NC_020180	GTTGG	2	10	95712	95721	0 %	40 %	60 %	0 %	444324327
63	NC_020180	TTCGG	2	10	96502	96511	0 %	40 %	40 %	20 %	444324327
64	NC_020180	TAACC	2	10	97378	97387	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_020180	AATCC	2	10	98319	98328	40 %	20 %	0 %	40 %	444324329
66	NC_020180	CTTGG	2	10	99108	99117	0 %	40 %	40 %	20 %	444324332
67	NC_020180	GAGAA	2	10	102341	102350	60 %	0 %	40 %	0 %	444324336
68	NC_020180	AAGGG	2	10	105483	105492	40 %	0 %	60 %	0 %	444324342
69	NC_020180	ATCAC	2	10	106101	106110	40 %	20 %	0 %	40 %	444324342
70	NC_020180	ATAGG	2	10	111866	111875	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020180	CGGCA	2	10	114735	114744	20 %	0 %	40 %	40 %	444324351
72	NC_020180	CAAAG	2	10	114894	114903	60 %	0 %	20 %	20 %	444324351
73	NC_020180	CCAAA	2	10	115886	115895	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_020180	GCGCG	2	10	115948	115957	0 %	0 %	60 %	40 %	444324354
75	NC_020180	GGCCT	2	10	116921	116930	0 %	20 %	40 %	40 %	444324356
76	NC_020180	AACCG	2	10	119093	119102	40 %	0 %	20 %	40 %	444324358
77	NC_020180	AGGAT	2	10	119685	119694	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020180	GCCAA	2	10	120974	120983	40 %	0 %	20 %	40 %	444324363
79	NC_020180	GCATC	2	10	121465	121474	20 %	20 %	20 %	40 %	444324363
80	NC_020180	CGCGC	2	10	122644	122653	0 %	0 %	40 %	60 %	444324363
81	NC_020180	TGATC	2	10	124137	124146	20 %	40 %	20 %	20 %	444324365
82	NC_020180	TCAGA	2	10	126263	126272	40 %	20 %	20 %	20 %	444324366
83	NC_020180	CGGTT	2	10	126475	126484	0 %	40 %	40 %	20 %	444324366
84	NC_020180	TTTAA	2	10	127863	127872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020180	GTTCG	2	10	130199	130208	0 %	40 %	40 %	20 %	444324370
86	NC_020180	CGCGG	2	10	132477	132486	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_020180	ATTTT	2	10	132736	132745	20 %	80 %	0 %	0 %	444324374
88	NC_020180	CAGCG	2	10	133328	133337	20 %	0 %	40 %	40 %	444324375
89	NC_020180	GGGAT	2	10	133471	133480	20 %	20 %	60 %	0 %	444324375
90	NC_020180	TGCCA	2	10	135318	135327	20 %	20 %	20 %	40 %	444324377
91	NC_020180	GCTGC	2	10	140653	140662	0 %	20 %	40 %	40 %	444324383
92	NC_020180	TGGCG	2	10	142044	142053	0 %	20 %	60 %	20 %	444324384
93	NC_020180	GTCCG	2	10	142699	142708	0 %	20 %	40 %	40 %	444324385
94	NC_020180	AGGCC	2	10	142761	142770	20 %	0 %	40 %	40 %	444324385
95	NC_020180	GGCCG	2	10	142834	142843	0 %	0 %	60 %	40 %	444324385
96	NC_020180	GCGCC	2	10	143592	143601	0 %	0 %	40 %	60 %	444324387
97	NC_020180	TGGAT	2	10	143786	143795	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020180	CCCCA	2	10	145658	145667	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
99	NC_020180	AATCT	2	10	145760	145769	40 %	40 %	0 %	20 %	444324390
100	NC_020180	CCAAA	2	10	150081	150090	60 %	0 %	0 %	40 %	444324394
101	NC_020180	GAAGC	2	10	150101	150110	40 %	0 %	40 %	20 %	444324394
102	NC_020180	AATGA	2	10	151053	151062	60 %	20 %	20 %	0 %	444324395
103	NC_020180	CAACA	2	10	151064	151073	60 %	0 %	0 %	40 %	444324395
104	NC_020180	GCAAA	2	10	152538	152547	60 %	0 %	20 %	20 %	444324396
105	NC_020180	GCCGC	2	10	154707	154716	0 %	0 %	40 %	60 %	444324396
106	NC_020180	CAGGT	2	10	154966	154975	20 %	20 %	40 %	20 %	444324396
107	NC_020180	CTGAA	2	10	155170	155179	40 %	20 %	20 %	20 %	444324396
108	NC_020180	CCATT	2	10	156475	156484	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_020180	CTTTT	2	10	159351	159360	0 %	80 %	0 %	20 %	444324402
110	NC_020180	AAAAG	2	10	161670	161679	80 %	0 %	20 %	0 %	444324405
111	NC_020180	GCCCT	2	10	161977	161986	0 %	20 %	20 %	60 %	444324406

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.