MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli APEC O78

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020163	GCGTAA	2	12	19520	19531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020163	GGGAGT	2	12	45007	45018	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020163	ATAAAA	2	12	60288	60299	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020163	ATTTTT	2	12	122554	122565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020163	TCATTT	2	12	189989	190000	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020163	CTTTTA	2	12	211300	211311	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020163	GTCTTT	2	12	268776	268787	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020163	AATATC	2	12	294689	294700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020163	GGGAGA	2	12	304482	304493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020163	TCTCCC	2	12	308259	308270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_020163	TCTCCC	2	12	313556	313567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_020163	CTGATA	2	12	330465	330476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020163	TTTTTA	2	12	382095	382106	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020163	TTTAAT	2	12	414043	414054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020163	TTTCAC	2	12	471173	471184	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020163	AATAAA	2	12	477644	477655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020163	TTCTGC	2	12	517396	517407	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020163	TTGTTC	2	12	534751	534762	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020163	ATATAG	2	12	534857	534868	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020163	AACAGG	2	12	565442	565453	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020163	TTTTCA	2	12	615404	615415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020163	AATGAT	2	12	625147	625158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020163	TTATCA	2	12	625240	625251	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020163	AGTAAA	2	12	690336	690347	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020163	GAAAAT	2	12	711875	711886	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020163	AAAGGA	2	12	720098	720109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020163	TTTCAC	2	12	720860	720871	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020163	AAGGGA	2	12	786067	786078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020163	TCTCCC	2	12	866171	866182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020163	TCACCC	2	12	866222	866233	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_020163	GTAGTG	2	12	900963	900974	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020163	TAAGGG	2	12	1023846	1023857	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020163	TGTGGA	2	12	1024993	1025004	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020163	TTTTCT	2	12	1034702	1034713	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020163	CTATTT	2	12	1035738	1035749	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020163	TTTATT	2	12	1058467	1058478	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020163	TATTGA	2	12	1096729	1096740	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020163	AACAAT	2	12	1119121	1119132	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020163	TATTGA	2	12	1121968	1121979	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020163	TTTTCA	2	12	1184228	1184239	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020163	CAGGCG	2	12	1203071	1203082	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020163	TTCCTG	2	12	1243269	1243280	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020163	AATATG	2	12	1294178	1294189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020163	TGCAAA	2	12	1332448	1332459	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020163	GCGCCC	2	12	1401575	1401586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_020163	ATTTTT	2	12	1428872	1428883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020163	TTTACC	2	12	1439786	1439797	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020163	GAATAA	2	12	1457044	1457055	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020163	TAAAAA	2	12	1457219	1457230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020163	TTTTCT	2	12	1512934	1512945	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020163	AATAAA	2	12	1535376	1535387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020163	CTGTCA	2	12	1538534	1538545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020163	TGTAAC	2	12	1547292	1547303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020163	AATATT	2	12	1562618	1562629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020163	CAGAAA	2	12	1574849	1574860	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020163	AAAAAG	2	12	1638858	1638869	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020163	TAACCG	2	12	1678052	1678063	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020163	AAATAA	2	12	1741679	1741690	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020163	AAAGAT	2	12	1774209	1774220	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020163	TGTCCA	2	12	1795008	1795019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020163	TAAGGA	2	12	1817288	1817299	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020163	ATAATG	2	12	1818702	1818713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020163	CAAAAA	2	12	1907283	1907294	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020163	TTTTGT	2	12	1990386	1990397	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020163	ACGCTT	2	12	2012359	2012370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020163	ACTCGA	2	12	2012379	2012390	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020163	CAGGCT	2	12	2012511	2012522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020163	CTTATT	2	12	2063560	2063571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020163	CAAAAG	2	12	2069455	2069466	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020163	CTGATC	2	12	2079933	2079944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020163	AAAGTT	2	12	2084187	2084198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020163	CTATAA	2	12	2124161	2124172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020163	AAAAAC	2	12	2293267	2293278	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020163	ACCGTT	2	12	2308144	2308155	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020163	TGGTTA	2	12	2316974	2316985	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020163	CAAAAA	2	12	2377990	2378001	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020163	TAAATA	2	12	2379790	2379801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020163	TGACAG	2	12	2390282	2390293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020163	ATACTT	2	12	2499077	2499088	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020163	AAAATA	2	12	2512731	2512742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020163	TGTTTT	2	12	2513363	2513374	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020163	AAGACT	2	12	2513623	2513634	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_020163	CCAGAT	2	12	2519200	2519211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020163	TATTAC	2	12	2620614	2620625	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020163	TTTCTT	2	12	2638854	2638865	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020163	ATAACC	2	12	2642798	2642809	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020163	ACTGTC	2	12	2686448	2686459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020163	AATTCA	2	12	2734788	2734799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020163	TTCTGA	2	12	2736374	2736385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020163	TCTTAT	2	12	2748606	2748617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020163	ATATTT	2	12	2785041	2785052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020163	ATCTGG	2	12	2798303	2798314	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020163	CCCTTT	2	12	2799458	2799469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020163	TTATAT	2	12	2802804	2802815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020163	ATTTTT	2	12	2822162	2822173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020163	TTTTGT	2	12	2875432	2875443	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020163	TCCCCC	2	12	2905842	2905853	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
98	NC_020163	ACGCAG	2	12	2985787	2985798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020163	CGCAGC	2	12	3007731	3007742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020163	TCTTCC	2	12	3015560	3015571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020163	AGAAAT	2	12	3046068	3046079	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020163	CCACTA	2	12	3115503	3115514	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020163	TAAATG	2	12	3167923	3167934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020163	TGTCAC	2	12	3181557	3181568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020163	AGAAAA	2	12	3191837	3191848	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020163	GTTAAC	2	12	3230276	3230287	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020163	GTTAAC	2	12	3230340	3230351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020163	CTGATG	2	12	3249101	3249112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020163	TACTCA	2	12	3256677	3256688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020163	GCAGAA	2	12	3257903	3257914	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020163	TCACGC	2	12	3258062	3258073	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020163	ACGCCG	2	12	3258200	3258211	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020163	CGCTGT	2	12	3258306	3258317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020163	GTTATG	2	12	3266941	3266952	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020163	CAAGTG	2	12	3284053	3284064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020163	TCCTTC	2	12	3384419	3384430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020163	TGGACA	2	12	3434077	3434088	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020163	CAGTTT	2	12	3448661	3448672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020163	GGTTTT	2	12	3650222	3650233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020163	ATTCTC	2	12	3740826	3740837	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020163	ATCGCG	2	12	3785230	3785241	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020163	GTAAGG	2	12	3800804	3800815	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020163	GTAAGG	2	12	3801196	3801207	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020163	ACTGAG	2	12	3829320	3829331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_020163	TTTTCG	2	12	3874541	3874552	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020163	AATAAA	2	12	3928111	3928122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020163	TTATAT	2	12	3946720	3946731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020163	AGTTGT	2	12	3971021	3971032	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020163	CTTTTT	2	12	3975698	3975709	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_020163	AATGAT	2	12	3976533	3976544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020163	TCTCCC	2	12	3999155	3999166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_020163	GTAACC	2	12	4032397	4032408	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020163	AGACAA	2	12	4034017	4034028	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_020163	TGCATT	2	12	4043155	4043166	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_020163	TTTTAT	2	12	4045052	4045063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020163	ATATAA	2	12	4055820	4055831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020163	CTTTCT	2	12	4079922	4079933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020163	AGCGTT	2	12	4179795	4179806	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_020163	AATTTA	2	12	4307823	4307834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020163	GAAATA	2	12	4408692	4408703	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020163	AGATGC	2	12	4409582	4409593	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_020163	TGAAAA	2	12	4424454	4424465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020163	AGGGAG	2	12	4431197	4431208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020163	TTTGCC	2	12	4462610	4462621	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020163	GCCAGC	2	12	4464688	4464699	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020163	TTTATC	2	12	4531699	4531710	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_020163	CTTTTT	2	12	4706299	4706310	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_020163	AGGGAG	2	12	4724479	4724490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.