MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli APEC O78

Total Repeats: 2673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020163	TCCAC	2	10	81	90	20 %	20 %	0 %	60 %	443615331
2	NC_020163	CAAAA	2	10	833	842	80 %	0 %	0 %	20 %	443615332
3	NC_020163	GCCAG	2	10	3576	3585	20 %	0 %	40 %	40 %	443615336
4	NC_020163	AGTGG	2	10	5114	5123	20 %	20 %	60 %	0 %	443615337
5	NC_020163	ATCTT	2	10	6136	6145	20 %	60 %	0 %	20 %	443615339
6	NC_020163	GTTTG	2	10	8314	8323	0 %	60 %	40 %	0 %	443615339
7	NC_020163	CGTCA	2	10	11478	11487	20 %	20 %	20 %	40 %	443615343
8	NC_020163	GCCGC	2	10	13016	13025	0 %	0 %	40 %	60 %	443615345
9	NC_020163	AAGCC	2	10	14481	14490	40 %	0 %	20 %	40 %	443615346
10	NC_020163	GCCCG	2	10	14555	14564	0 %	0 %	40 %	60 %	443615346
11	NC_020163	GCGCC	2	10	14971	14980	0 %	0 %	40 %	60 %	443615346
12	NC_020163	TATTT	2	10	15579	15588	20 %	80 %	0 %	0 %	443615347
13	NC_020163	ACTTC	2	10	17107	17116	20 %	40 %	0 %	40 %	443615348
14	NC_020163	TGCGC	2	10	18556	18565	0 %	20 %	40 %	40 %	443615349
15	NC_020163	TCAGG	2	10	20955	20964	20 %	20 %	40 %	20 %	443615351
16	NC_020163	ATTCC	2	10	22091	22100	20 %	40 %	0 %	40 %	443615352
17	NC_020163	ATAAA	2	10	24614	24623	80 %	20 %	0 %	0 %	443615354
18	NC_020163	CGAGT	2	10	24660	24669	20 %	20 %	40 %	20 %	443615354
19	NC_020163	CCATA	2	10	24824	24833	40 %	20 %	0 %	40 %	443615354
20	NC_020163	CAGGC	2	10	25623	25632	20 %	0 %	40 %	40 %	443615355
21	NC_020163	TGTGA	2	10	26301	26310	20 %	40 %	40 %	0 %	443615355
22	NC_020163	CCCCG	2	10	26456	26465	0 %	0 %	20 %	80 %	443615356
23	NC_020163	GCGGT	2	10	28629	28638	0 %	20 %	60 %	20 %	443615357
24	NC_020163	CGCGA	2	10	35888	35897	20 %	0 %	40 %	40 %	443615364
25	NC_020163	ACGCG	2	10	36722	36731	20 %	0 %	40 %	40 %	443615366
26	NC_020163	AGCGC	2	10	39226	39235	20 %	0 %	40 %	40 %	443615370
27	NC_020163	TGCAG	2	10	39708	39717	20 %	20 %	40 %	20 %	443615371
28	NC_020163	TCAGC	2	10	40011	40020	20 %	20 %	20 %	40 %	443615371
29	NC_020163	CGGCG	2	10	40239	40248	0 %	0 %	60 %	40 %	443615371
30	NC_020163	AGCCC	2	10	40883	40892	20 %	0 %	20 %	60 %	443615372
31	NC_020163	TCAGC	2	10	41275	41284	20 %	20 %	20 %	40 %	443615373
32	NC_020163	GCAAT	2	10	41463	41472	40 %	20 %	20 %	20 %	443615373
33	NC_020163	GCGCT	2	10	42496	42505	0 %	20 %	40 %	40 %	443615374
34	NC_020163	CCAGC	2	10	42644	42653	20 %	0 %	20 %	60 %	443615374
35	NC_020163	GCGAT	2	10	44547	44556	20 %	20 %	40 %	20 %	443615375
36	NC_020163	TGGCG	2	10	46558	46567	0 %	20 %	60 %	20 %	443615377
37	NC_020163	GGCGA	2	10	47460	47469	20 %	0 %	60 %	20 %	443615378
38	NC_020163	CAGGC	2	10	48047	48056	20 %	0 %	40 %	40 %	443615378
39	NC_020163	GAGCA	2	10	49043	49052	40 %	0 %	40 %	20 %	443615379
40	NC_020163	CGGTT	2	10	50307	50316	0 %	40 %	40 %	20 %	443615380
41	NC_020163	TATGG	2	10	51363	51372	20 %	40 %	40 %	0 %	443615380
42	NC_020163	CCGCC	2	10	55329	55338	0 %	0 %	20 %	80 %	443615385
43	NC_020163	GGCGA	2	10	55454	55463	20 %	0 %	60 %	20 %	443615385
44	NC_020163	GTGAT	2	10	56330	56339	20 %	40 %	40 %	0 %	443615386
45	NC_020163	CTGGC	2	10	57006	57015	0 %	20 %	40 %	40 %	443615387
46	NC_020163	CGCAG	2	10	64671	64680	20 %	0 %	40 %	40 %	443615395
47	NC_020163	GATCA	2	10	68545	68554	40 %	20 %	20 %	20 %	443615398
48	NC_020163	CGTAT	2	10	68913	68922	20 %	40 %	20 %	20 %	443615399
49	NC_020163	CGTGG	2	10	73820	73829	0 %	20 %	60 %	20 %	443615406
50	NC_020163	TCATC	2	10	74999	75008	20 %	40 %	0 %	40 %	443615407
51	NC_020163	CGCAG	2	10	76528	76537	20 %	0 %	40 %	40 %	443615408
52	NC_020163	CAATG	2	10	76606	76615	40 %	20 %	20 %	20 %	443615408
53	NC_020163	TTCAC	2	10	78420	78429	20 %	40 %	0 %	40 %	443615411
54	NC_020163	CCGGA	2	10	79678	79687	20 %	0 %	40 %	40 %	443615412
55	NC_020163	GTATT	2	10	83406	83415	20 %	60 %	20 %	0 %	443615416
56	NC_020163	TTGCC	2	10	85106	85115	0 %	40 %	20 %	40 %	443615416
57	NC_020163	GGCAA	2	10	85526	85535	40 %	0 %	40 %	20 %	443615416
58	NC_020163	GCCCG	2	10	86323	86332	0 %	0 %	40 %	60 %	443615418
59	NC_020163	GCCGC	2	10	87046	87055	0 %	0 %	40 %	60 %	443615419
60	NC_020163	TGACC	2	10	87924	87933	20 %	20 %	20 %	40 %	443615419
61	NC_020163	CGCAC	2	10	88241	88250	20 %	0 %	20 %	60 %	443615419
62	NC_020163	GAATG	2	10	90189	90198	40 %	20 %	40 %	0 %	443615419
63	NC_020163	GAGCA	2	10	95527	95536	40 %	0 %	40 %	20 %	443615427
64	NC_020163	TTTGC	2	10	96678	96687	0 %	60 %	20 %	20 %	443615428
65	NC_020163	GCTTC	2	10	103745	103754	0 %	40 %	20 %	40 %	443615435
66	NC_020163	AGCGG	2	10	115235	115244	20 %	0 %	60 %	20 %	443615444
67	NC_020163	AGTTC	2	10	115984	115993	20 %	40 %	20 %	20 %	443615444
68	NC_020163	TTCCT	2	10	124784	124793	0 %	60 %	0 %	40 %	443615450
69	NC_020163	GTTTT	2	10	125081	125090	0 %	80 %	20 %	0 %	443615450
70	NC_020163	CGTAC	2	10	125685	125694	20 %	20 %	20 %	40 %	443615451
71	NC_020163	CTGTT	2	10	130232	130241	0 %	60 %	20 %	20 %	443615455
72	NC_020163	CGGAA	2	10	131097	131106	40 %	0 %	40 %	20 %	443615456
73	NC_020163	GATGA	2	10	131560	131569	40 %	20 %	40 %	0 %	443615456
74	NC_020163	GAAGC	2	10	132926	132935	40 %	0 %	40 %	20 %	443615457
75	NC_020163	CCGTT	2	10	145860	145869	0 %	40 %	20 %	40 %	443615465
76	NC_020163	TTCCG	2	10	148173	148182	0 %	40 %	20 %	40 %	443615468
77	NC_020163	TCCGT	2	10	149374	149383	0 %	40 %	20 %	40 %	443615468
78	NC_020163	GTGCT	2	10	150943	150952	0 %	40 %	40 %	20 %	443615468
79	NC_020163	GTACT	2	10	152533	152542	20 %	40 %	20 %	20 %	443615469
80	NC_020163	GTCTG	2	10	154128	154137	0 %	40 %	40 %	20 %	443615469
81	NC_020163	ACTGA	2	10	155059	155068	40 %	20 %	20 %	20 %	443615469
82	NC_020163	GAAAA	2	10	156963	156972	80 %	0 %	20 %	0 %	443615470
83	NC_020163	CCAGT	2	10	158602	158611	20 %	20 %	20 %	40 %	443615471
84	NC_020163	GGCGC	2	10	159638	159647	0 %	0 %	60 %	40 %	443615474
85	NC_020163	GTTTG	2	10	160565	160574	0 %	60 %	40 %	0 %	443615475
86	NC_020163	TGGCG	2	10	165945	165954	0 %	20 %	60 %	20 %	443615480
87	NC_020163	ATGAA	2	10	169377	169386	60 %	20 %	20 %	0 %	443615485
88	NC_020163	CGATG	2	10	172130	172139	20 %	20 %	40 %	20 %	443615487
89	NC_020163	GCAGT	2	10	183595	183604	20 %	20 %	40 %	20 %	443615492
90	NC_020163	TGACG	2	10	184613	184622	20 %	20 %	40 %	20 %	443615493
91	NC_020163	CTGGT	2	10	184806	184815	0 %	40 %	40 %	20 %	443615493
92	NC_020163	TGGTC	2	10	185712	185721	0 %	40 %	40 %	20 %	443615494
93	NC_020163	TGGTG	2	10	192456	192465	0 %	40 %	60 %	0 %	443615497
94	NC_020163	CTGAT	2	10	192551	192560	20 %	40 %	20 %	20 %	443615497
95	NC_020163	TGGTG	2	10	192750	192759	0 %	40 %	60 %	0 %	443615497
96	NC_020163	CGTGG	2	10	193144	193153	0 %	20 %	60 %	20 %	443615497
97	NC_020163	GTCGC	2	10	195252	195261	0 %	20 %	40 %	40 %	443615498
98	NC_020163	GGACG	2	10	195676	195685	20 %	0 %	60 %	20 %	443615498
99	NC_020163	AGCGT	2	10	195860	195869	20 %	20 %	40 %	20 %	443615499
100	NC_020163	CAGGA	2	10	198138	198147	40 %	0 %	40 %	20 %	443615502
101	NC_020163	AGCCC	2	10	198859	198868	20 %	0 %	20 %	60 %	443615502
102	NC_020163	GCGCC	2	10	199562	199571	0 %	0 %	40 %	60 %	443615503
103	NC_020163	TGACC	2	10	200278	200287	20 %	20 %	20 %	40 %	443615504
104	NC_020163	TTTGC	2	10	200376	200385	0 %	60 %	20 %	20 %	443615505
105	NC_020163	ATTAT	2	10	207069	207078	40 %	60 %	0 %	0 %	443615512
106	NC_020163	AAAAC	2	10	207141	207150	80 %	0 %	0 %	20 %	443615512
107	NC_020163	ATGAA	2	10	209555	209564	60 %	20 %	20 %	0 %	443615514
108	NC_020163	TACGC	2	10	212263	212272	20 %	20 %	20 %	40 %	443615516
109	NC_020163	GCTTA	2	10	213246	213255	20 %	40 %	20 %	20 %	443615518
110	NC_020163	CTGGG	2	10	213694	213703	0 %	20 %	60 %	20 %	443615518
111	NC_020163	ACGAA	2	10	214412	214421	60 %	0 %	20 %	20 %	443615518
112	NC_020163	ATGAC	2	10	215288	215297	40 %	20 %	20 %	20 %	443615518
113	NC_020163	GCGAC	2	10	218409	218418	20 %	0 %	40 %	40 %	443615523
114	NC_020163	CAGAG	2	10	226948	226957	40 %	0 %	40 %	20 %	443615531
115	NC_020163	CCCTG	2	10	228154	228163	0 %	20 %	20 %	60 %	443615532
116	NC_020163	TGGAG	2	10	228612	228621	20 %	20 %	60 %	0 %	443615533
117	NC_020163	AGTTG	2	10	230411	230420	20 %	40 %	40 %	0 %	443615534
118	NC_020163	CGGCC	2	10	231036	231045	0 %	0 %	40 %	60 %	443615534
119	NC_020163	CCGTG	2	10	231515	231524	0 %	20 %	40 %	40 %	443615534
120	NC_020163	GTTCC	2	10	232817	232826	0 %	40 %	20 %	40 %	443615536
121	NC_020163	CCGTT	2	10	233461	233470	0 %	40 %	20 %	40 %	443615537
122	NC_020163	GGCGC	2	10	233771	233780	0 %	0 %	60 %	40 %	443615537
123	NC_020163	TATCT	2	10	234447	234456	20 %	60 %	0 %	20 %	443615537
124	NC_020163	AACCA	2	10	237325	237334	60 %	0 %	0 %	40 %	443615541
125	NC_020163	TGCAT	2	10	238406	238415	20 %	40 %	20 %	20 %	443615543
126	NC_020163	GGTTT	2	10	238553	238562	0 %	60 %	40 %	0 %	443615543
127	NC_020163	AAATG	2	10	239260	239269	60 %	20 %	20 %	0 %	443615545
128	NC_020163	TAACT	2	10	239505	239514	40 %	40 %	0 %	20 %	443615545
129	NC_020163	CTTCG	2	10	240294	240303	0 %	40 %	20 %	40 %	443615546
130	NC_020163	TAAAT	2	10	240732	240741	60 %	40 %	0 %	0 %	443615546
131	NC_020163	ACCTT	2	10	241175	241184	20 %	40 %	0 %	40 %	443615547
132	NC_020163	CAGGG	2	10	242283	242292	20 %	0 %	60 %	20 %	443615548
133	NC_020163	TAATT	2	10	245624	245633	40 %	60 %	0 %	0 %	443615551
134	NC_020163	ACAAA	2	10	246480	246489	80 %	0 %	0 %	20 %	443615551
135	NC_020163	GTTTT	2	10	246505	246514	0 %	80 %	20 %	0 %	443615551
136	NC_020163	GTCAG	2	10	246635	246644	20 %	20 %	40 %	20 %	443615551
137	NC_020163	GCACT	2	10	250510	250519	20 %	20 %	20 %	40 %	443615555
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139	NC_020163	GTTCA	2	10	251801	251810	20 %	40 %	20 %	20 %	443615557
140	NC_020163	AATTC	2	10	255002	255011	40 %	40 %	0 %	20 %	443615560
141	NC_020163	GCCAT	2	10	258130	258139	20 %	20 %	20 %	40 %	443615563
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145	NC_020163	GCACG	2	10	269714	269723	20 %	0 %	40 %	40 %	443615574
146	NC_020163	GTTTG	2	10	270923	270932	0 %	60 %	40 %	0 %	443615575
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149	NC_020163	CATTT	2	10	281301	281310	20 %	60 %	0 %	20 %	443615583
150	NC_020163	CGGGC	2	10	281461	281470	0 %	0 %	60 %	40 %	443615583
151	NC_020163	CTGGG	2	10	282966	282975	0 %	20 %	60 %	20 %	443615584
152	NC_020163	GCCGT	2	10	283200	283209	0 %	20 %	40 %	40 %	443615584
153	NC_020163	GTCGA	2	10	284901	284910	20 %	20 %	40 %	20 %	443615586
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168	NC_020163	TGATC	2	10	309558	309567	20 %	40 %	20 %	20 %	443615610
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234	NC_020163	ATTGA	2	10	415005	415014	40 %	40 %	20 %	0 %	443615714
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251	NC_020163	TCGGA	2	10	448432	448441	20 %	20 %	40 %	20 %	443615749
252	NC_020163	GCGAA	2	10	449119	449128	40 %	0 %	40 %	20 %	443615749
253	NC_020163	TTCCG	2	10	451073	451082	0 %	40 %	20 %	40 %	443615750
254	NC_020163	TTGTT	2	10	451445	451454	0 %	80 %	20 %	0 %	443615751
255	NC_020163	TCGGT	2	10	452325	452334	0 %	40 %	40 %	20 %	443615752
256	NC_020163	AGCGC	2	10	456543	456552	20 %	0 %	40 %	40 %	443615756
257	NC_020163	GTAAA	2	10	458225	458234	60 %	20 %	20 %	0 %	443615757
258	NC_020163	AATCA	2	10	458442	458451	60 %	20 %	0 %	20 %	443615758
259	NC_020163	GACCA	2	10	460790	460799	40 %	0 %	20 %	40 %	443615759
260	NC_020163	CATGC	2	10	462095	462104	20 %	20 %	20 %	40 %	443615760
261	NC_020163	CCAGA	2	10	463403	463412	40 %	0 %	20 %	40 %	443615761
262	NC_020163	GTCAC	2	10	465128	465137	20 %	20 %	20 %	40 %	443615762
263	NC_020163	CGGCA	2	10	466815	466824	20 %	0 %	40 %	40 %	443615763
264	NC_020163	TATCT	2	10	473405	473414	20 %	60 %	0 %	20 %	443615772
265	NC_020163	AATGC	2	10	475757	475766	40 %	20 %	20 %	20 %	443615775
266	NC_020163	AGCGC	2	10	480086	480095	20 %	0 %	40 %	40 %	443615779
267	NC_020163	TCATC	2	10	483276	483285	20 %	40 %	0 %	40 %	443615781
268	NC_020163	TGGCA	2	10	484829	484838	20 %	20 %	40 %	20 %	443615782
269	NC_020163	GCACT	2	10	485056	485065	20 %	20 %	20 %	40 %	443615782
270	NC_020163	GAACT	2	10	485205	485214	40 %	20 %	20 %	20 %	443615782
271	NC_020163	GCGCA	2	10	485762	485771	20 %	0 %	40 %	40 %	443615783
272	NC_020163	ATCTG	2	10	486145	486154	20 %	40 %	20 %	20 %	443615783
273	NC_020163	GCGTA	2	10	486412	486421	20 %	20 %	40 %	20 %	443615783
274	NC_020163	CATCG	2	10	488717	488726	20 %	20 %	20 %	40 %	443615785
275	NC_020163	ACACC	2	10	489625	489634	40 %	0 %	0 %	60 %	443615786
276	NC_020163	GCACC	2	10	494062	494071	20 %	0 %	20 %	60 %	443615790
277	NC_020163	TGGCA	2	10	495186	495195	20 %	20 %	40 %	20 %	443615791
278	NC_020163	GAAGC	2	10	497036	497045	40 %	0 %	40 %	20 %	443615792
279	NC_020163	GGCAA	2	10	500185	500194	40 %	0 %	40 %	20 %	443615796
280	NC_020163	CTCTT	2	10	501836	501845	0 %	60 %	0 %	40 %	443615797
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293	NC_020163	TCACC	2	10	512381	512390	20 %	20 %	0 %	60 %	443615811
294	NC_020163	GCGGT	2	10	512812	512821	0 %	20 %	60 %	20 %	443615811
295	NC_020163	GTGAT	2	10	514259	514268	20 %	40 %	40 %	0 %	443615814
296	NC_020163	CCACT	2	10	515496	515505	20 %	20 %	0 %	60 %	443615816
297	NC_020163	CAGTG	2	10	515602	515611	20 %	20 %	40 %	20 %	443615816
298	NC_020163	GAAAA	2	10	517766	517775	80 %	0 %	20 %	0 %	443615820
299	NC_020163	TGGCA	2	10	523113	523122	20 %	20 %	40 %	20 %	443615826
300	NC_020163	CTTAG	2	10	526700	526709	20 %	40 %	20 %	20 %	443615831
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302	NC_020163	ATCTG	2	10	528767	528776	20 %	40 %	20 %	20 %	443615832
303	NC_020163	TTTTC	2	10	529243	529252	0 %	80 %	0 %	20 %	443615833
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324	NC_020163	TTCGC	2	10	573267	573276	0 %	40 %	20 %	40 %	443615877
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329	NC_020163	CCCGC	2	10	581619	581628	0 %	0 %	20 %	80 %	443615886
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331	NC_020163	CCGCG	2	10	589084	589093	0 %	0 %	40 %	60 %	443615894
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343	NC_020163	CAGCG	2	10	612341	612350	20 %	0 %	40 %	40 %	443615913
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371	NC_020163	AAAAC	2	10	650891	650900	80 %	0 %	0 %	20 %	443615962
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373	NC_020163	GTTCT	2	10	658078	658087	0 %	60 %	20 %	20 %	443615973
374	NC_020163	AAAGG	2	10	658440	658449	60 %	0 %	40 %	0 %	443615973
375	NC_020163	TGGCG	2	10	659876	659885	0 %	20 %	60 %	20 %	443615974
376	NC_020163	GACAG	2	10	662220	662229	40 %	0 %	40 %	20 %	443615976
377	NC_020163	GATGG	2	10	662489	662498	20 %	20 %	60 %	0 %	443615977
378	NC_020163	ACTGA	2	10	663984	663993	40 %	20 %	20 %	20 %	443615979
379	NC_020163	CCACT	2	10	666890	666899	20 %	20 %	0 %	60 %	443615984
380	NC_020163	CAGTG	2	10	666996	667005	20 %	20 %	40 %	20 %	443615984
381	NC_020163	CGTAC	2	10	671111	671120	20 %	20 %	20 %	40 %	443615989
382	NC_020163	AGGTG	2	10	675839	675848	20 %	20 %	60 %	0 %	443615994
383	NC_020163	AATGA	2	10	678054	678063	60 %	20 %	20 %	0 %	443615997
384	NC_020163	GTGAA	2	10	681755	681764	40 %	20 %	40 %	0 %	443616001
385	NC_020163	TTACC	2	10	682818	682827	20 %	40 %	0 %	40 %	443616003
386	NC_020163	GCGCC	2	10	683622	683631	0 %	0 %	40 %	60 %	443616003
387	NC_020163	GCTGG	2	10	685196	685205	0 %	20 %	60 %	20 %	443616005
388	NC_020163	GCCAA	2	10	685482	685491	40 %	0 %	20 %	40 %	443616005
389	NC_020163	GCAGT	2	10	685697	685706	20 %	20 %	40 %	20 %	443616006
390	NC_020163	CCGCG	2	10	686604	686613	0 %	0 %	40 %	60 %	443616006
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392	NC_020163	GGCAG	2	10	691057	691066	20 %	0 %	60 %	20 %	443616009
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