MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.02

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020157	AATACC	2	12	4700	4711	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	443329700
2	NC_020157	ATGTTA	2	12	4882	4893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	443329700
3	NC_020157	GCATTG	2	12	4972	4983	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	443329700
4	NC_020157	GGTGCG	2	12	8652	8663	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	443329703
5	NC_020157	TCTTGC	2	12	9665	9676	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	443329704
6	NC_020157	TTGTGT	2	12	10389	10400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020157	GACTAG	2	12	10788	10799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	443329705
8	NC_020157	TTGAAG	2	12	15680	15691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443329710
9	NC_020157	AGCCGC	2	12	17029	17040	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	443329712
10	NC_020157	GCAAAA	2	12	26784	26795	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	443329719
11	NC_020157	CTAACT	2	12	27066	27077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443329719
12	NC_020157	AAAAAC	2	12	27436	27447	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020157	GAAATC	2	12	27666	27677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	443329720
14	NC_020157	GAAAGT	2	12	28410	28421	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	443329721
15	NC_020157	ATCGTT	2	12	28671	28682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	443329721
16	NC_020157	ATTTTA	2	12	30128	30139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020157	TAATCA	2	12	33113	33124	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	443329724
18	NC_020157	CTTGTT	2	12	36482	36493	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	443329725
19	NC_020157	TTTAGC	2	12	37248	37259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	443329725
20	NC_020157	AGCTTG	2	12	37440	37451	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	443329725
21	NC_020157	TGGTAA	2	12	38943	38954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443329726
22	NC_020157	AATTAA	2	12	41199	41210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	443329729
23	NC_020157	ATGCGG	2	12	43492	43503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	443329732
24	NC_020157	ACATTG	2	12	43841	43852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020157	AAAGAA	2	12	44116	44127	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	443329733
26	NC_020157	TGTGTT	2	12	46157	46168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	443329734
27	NC_020157	AAAATC	2	12	52791	52802	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	443329738
28	NC_020157	AACTGG	2	12	57073	57084	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	443329742
29	NC_020157	CATAAA	2	12	57836	57847	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	443329742
30	NC_020157	CTTAGG	2	12	62247	62258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020157	ACCTGA	2	12	70121	70132	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	443329751
32	NC_020157	TTGAGG	2	12	70376	70387	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	443329751
33	NC_020157	TTGTAG	2	12	71593	71604	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	443329751
34	NC_020157	TTTTCT	2	12	76813	76824	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	443329753
35	NC_020157	TTTTTG	2	12	77994	78005	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	443329753
36	NC_020157	AGGGGG	2	12	78983	78994	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	443329754
37	NC_020157	CCAAAG	2	12	81670	81681	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	443329756
38	NC_020157	TTCCAT	2	12	82233	82244	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	443329757
39	NC_020157	TTTGCG	2	12	83789	83800	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	443329759
40	NC_020157	ATTGAT	3	18	84033	84050	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	443329759
41	NC_020157	CAAATA	2	12	86243	86254	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	443329760
42	NC_020157	TTTCTT	2	12	87184	87195	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	443329760
43	NC_020157	CTAATC	2	12	87427	87438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443329760
44	NC_020157	CGACCA	2	12	99437	99448	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	443329770
45	NC_020157	TTGCGC	2	12	99969	99980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	443329770
46	NC_020157	TGTTTT	2	12	100063	100074	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	443329770
47	NC_020157	CTACTG	2	12	100153	100164	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	443329770
48	NC_020157	TAGCTG	2	12	101584	101595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	443329770
49	NC_020157	GTTGCT	2	12	102044	102055	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020157	ATTGTT	2	12	105009	105020	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020157	TTTCAC	2	12	108076	108087	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	443329777
52	NC_020157	CAGAAA	2	12	108367	108378	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	443329777
53	NC_020157	TAGTTC	2	12	108599	108610	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	443329778
54	NC_020157	GAAAAA	2	12	110240	110251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	443329779
55	NC_020157	AAATTT	2	12	112208	112219	50 %	50 %	0 %	0 %	443329781
56	NC_020157	TGAGTC	2	12	114193	114204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	443329782
57	NC_020157	AAAATC	2	12	114887	114898	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	443329782
58	NC_020157	GTTAAT	2	12	120162	120173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	443329788
59	NC_020157	GAATGT	2	12	122981	122992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443329791
60	NC_020157	TTTTTG	2	12	123706	123717	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	443329793
61	NC_020157	CTATTT	2	12	124434	124445	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020157	ATTGTT	2	12	131062	131073	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	443329797
63	NC_020157	AACTTT	2	12	133882	133893	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	443329800
64	NC_020157	ACTTCC	2	12	134180	134191	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	443329800
65	NC_020157	TGTTCT	2	12	135116	135127	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	443329800
66	NC_020157	CACCTG	2	12	137535	137546	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	443329802
67	NC_020157	TTTTAG	2	12	141337	141348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020157	CTTCAG	2	12	143048	143059	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	443329806
69	NC_020157	TTGTGA	2	12	151169	151180	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	443329813
70	NC_020157	CTGCTA	2	12	152788	152799	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	443329815
71	NC_020157	TAAGTT	2	12	152957	152968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	443329816
72	NC_020157	TAGCCA	2	12	153425	153436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020157	CAATTA	2	12	159640	159651	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	443329821
74	NC_020157	TTGGGC	2	12	165129	165140	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020157	AGAGAA	2	12	165243	165254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020157	TTCTGG	2	12	165985	165996	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	443329825
77	NC_020157	TTGATG	2	12	166950	166961	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	443329826
78	NC_020157	ATTTTT	2	12	167152	167163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020157	TTTAAT	2	12	172487	172498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	443329831
80	NC_020157	AAAACC	2	12	175202	175213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.