MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Uzinura diaspidicola str. ASNER

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020135	CAGTAG	2	12	6642	6653	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	442743034
2	NC_020135	TATTTT	2	12	8588	8599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442743036
3	NC_020135	TTGTGA	2	12	12383	12394	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	442743039
4	NC_020135	TGAACA	2	12	18624	18635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	442743048
5	NC_020135	AAGATA	2	12	18935	18946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442743048
6	NC_020135	AGGATT	2	12	22080	22091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442743048
7	NC_020135	AAAGTT	2	12	23836	23847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442743049
8	NC_020135	TAAAAG	2	12	35895	35906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442743059
9	NC_020135	CAAAAA	2	12	37480	37491	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	442743061
10	NC_020135	TGAAGG	2	12	40839	40850	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	442743065
11	NC_020135	TAGAAG	2	12	47845	47856	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	442743066
12	NC_020135	AATATT	2	12	48378	48389	50 %	50 %	0 %	0 %	442743066
13	NC_020135	TTCTAG	2	12	50322	50333	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442743068
14	NC_020135	ATTTTT	2	12	55004	55015	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442743070
15	NC_020135	AGGATG	2	12	56601	56612	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	442743071
16	NC_020135	GCTACT	2	12	56656	56667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442743071
17	NC_020135	TTTTTC	2	12	57546	57557	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	442743071
18	NC_020135	TTTTTC	2	12	57831	57842	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	442743071
19	NC_020135	TTATAT	2	12	60129	60140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442743074
20	NC_020135	CTTAAA	2	12	60919	60930	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	442743075
21	NC_020135	ATTTCT	2	12	62591	62602	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442743076
22	NC_020135	TAAATA	2	12	62638	62649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442743076
23	NC_020135	ATTGGA	2	12	64400	64411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442743076
24	NC_020135	TCTACA	2	12	64679	64690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442743076
25	NC_020135	TATAAA	2	12	67138	67149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442743077
26	NC_020135	CTTATA	2	12	67271	67282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	442743078
27	NC_020135	TGGAAG	2	12	72796	72807	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	442743085
28	NC_020135	TAAAAT	2	12	75950	75961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442743086
29	NC_020135	TGGAGC	2	12	76472	76483	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	442743086
30	NC_020135	CAAATC	2	12	76744	76755	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	442743086
31	NC_020135	AAATTA	2	12	78313	78324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442743087
32	NC_020135	TGAAAA	2	12	81210	81221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442743089
33	NC_020135	TAAATA	2	12	81413	81424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442743089
34	NC_020135	CTCCTA	2	12	81939	81950	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	442743090
35	NC_020135	TACCTT	2	12	82435	82446	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	442743090
36	NC_020135	ATAGGA	2	12	87114	87125	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	442743094
37	NC_020135	AGCTTC	3	18	87962	87979	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442743094
38	NC_020135	AAAGAT	2	12	90769	90780	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442743095
39	NC_020135	AAAATT	2	12	93620	93631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442743099
40	NC_020135	TATTTA	2	12	94759	94770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442743099
41	NC_020135	TGGTTC	2	12	96371	96382	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	442743101
42	NC_020135	GAAAGA	2	12	98493	98504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442743103
43	NC_020135	AATATA	2	12	98539	98550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442743103
44	NC_020135	AGAAAA	2	12	100038	100049	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743103
45	NC_020135	TGAAGG	2	12	100740	100751	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	442743105
46	NC_020135	TTTTAG	2	12	111874	111885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	442743115
47	NC_020135	TATATT	2	12	114570	114581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442743118
48	NC_020135	CCTTTT	2	12	117738	117749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442743121
49	NC_020135	TTTCCT	2	12	117969	117980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442743121
50	NC_020135	TTAACT	2	12	118236	118247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	442743121
51	NC_020135	TAAAAC	2	12	118333	118344	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	442743121
52	NC_020135	AGAAAA	2	12	119411	119422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743123
53	NC_020135	AAAGGA	2	12	121407	121418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442743124
54	NC_020135	TTTATA	2	12	121498	121509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442743124
55	NC_020135	TAAAAC	2	12	122575	122586	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	442743126
56	NC_020135	AACTAT	2	12	128501	128512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	442743129
57	NC_020135	TTATAG	2	12	128741	128752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442743129
58	NC_020135	TAAAGG	2	12	135535	135546	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	442743135
59	NC_020135	GTAATA	2	12	139955	139966	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442743139
60	NC_020135	GAAAAA	2	12	140256	140267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743140
61	NC_020135	GAAAAA	2	12	141922	141933	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743142
62	NC_020135	AAGAAC	2	12	141944	141955	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	442743142
63	NC_020135	ATTACT	2	12	142105	142116	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	442743142
64	NC_020135	CAAGAA	2	12	143984	143995	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	442743146
65	NC_020135	TATAAC	2	12	144001	144012	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	442743146
66	NC_020135	GTAGAG	2	12	146214	146225	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	442743147
67	NC_020135	AAAGGA	2	12	146584	146595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442743148
68	NC_020135	GAAAAG	2	12	150199	150210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442743155
69	NC_020135	GAAAAA	2	12	156183	156194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743169
70	NC_020135	AAAAGA	2	12	157572	157583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743172
71	NC_020135	AGTAAA	2	12	159628	159639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442743174
72	NC_020135	AAGATG	2	12	161285	161296	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	442743175
73	NC_020135	TTCTAC	2	12	167843	167854	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	442743182
74	NC_020135	TCTAGA	2	12	174457	174468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442743189
75	NC_020135	CTGCAC	2	12	179235	179246	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	442743193
76	NC_020135	AAGTAT	2	12	179572	179583	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442743193
77	NC_020135	TTAAGT	2	12	179982	179993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442743193
78	NC_020135	TATAGA	2	12	186322	186333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442743199
79	NC_020135	TGGCAA	2	12	186723	186734	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	442743199
80	NC_020135	ATGAGA	2	12	187248	187259	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	442743200
81	NC_020135	GAAAAA	2	12	192320	192331	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743203
82	NC_020135	AAAAGA	2	12	192444	192455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743203
83	NC_020135	AAGAAA	2	12	196995	197006	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743205
84	NC_020135	GAAGTA	2	12	197911	197922	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	442743207
85	NC_020135	TTTTTA	2	12	201643	201654	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442743209
86	NC_020135	TACAGA	2	12	205407	205418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	442743212
87	NC_020135	TCAGGA	2	12	211475	211486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	442743217
88	NC_020135	ATAGAA	2	12	216487	216498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442743219
89	NC_020135	GAAAAA	2	12	221847	221858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743224
90	NC_020135	TTCTAG	2	12	224225	224236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442743224
91	NC_020135	TTTTCT	2	12	224304	224315	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	442743224
92	NC_020135	GAAAAA	2	12	236406	236417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442743234
93	NC_020135	TTTCTA	2	12	237274	237285	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442743235
94	NC_020135	TTTCAT	2	12	245076	245087	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442743239
95	NC_020135	ATTCTA	2	12	253490	253501	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	442743246
96	NC_020135	TATGTG	2	12	253584	253595	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	442743246
97	NC_020135	TTAATA	2	12	253678	253689	50 %	50 %	0 %	0 %	442743246
98	NC_020135	CTAATA	2	12	256144	256155	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	442743250
99	NC_020135	TAGATT	2	12	257293	257304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442743251
100	NC_020135	ATTTTT	2	12	262541	262552	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442743255

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.